10XKlenTaqMutantBufferisoptimalforbetterperformanceofourdifferentKlenTaqmutantenzymes(truncatedversionoffull-lengthTaq).ThebuffersofpH7.9alsoavailableforbetterfidelityuponrequest.
DataSheet:10X KlenTaqMutantBuffer
VitaNaviTechnolog是华盛顿大学BarnesWayne教授创办的一家专门从事Taq酶及其相关产品研发与销售的生物公司。BarnesWayne教授是国际上著名的Taq酶专家,也是长片段基因PCR扩增技术的发明人和专利所有人(1993,PNAS;U.S.Patent5,436,149)。20多年来,BarnesWayne教授始终致力于PCR聚合酶,研发了系列TaqDNA聚合酶产品,远销全球40多个国家,是目前国际上生产PCR聚合酶的主要供应商之一。美国VitaNaviTechnology公司研发的新型高耐受性DNA聚合酶为基因检测技术带来了根本性的革新,彻底解决了依赖于纯化的核酸DNA为模板进行PCR扩增这一瓶颈问题。 产品简介 Omni酶是从文库中筛选出来的具有极高耐受性的Taq或者Klentaq突变体,可以直接以全血、血清、土壤、牛奶、巧克力或奶酪等材料为模板一步扩增目的基因,避免了繁琐的核酸DNA提取过程 产品特征:1.对全血、血清、血浆、土壤、植物、巧克力、奶酪和牛奶中的抑制因子具极高的耐受性,可直接对样品进行PCR检测,无需DNA分离。2.可以耐受高达40%的全血,20%的血浆或血清。3.可以从人血液中一步扩增疟疾基因。4.Omni酶节省时间、降低成本.5.直接从微量样品中的扩增,避免样品提取而丢失或污染DNA。
一、Klentaq1/KlentaqLA?实例1:用KelntaqLA扩增大于20kb的大片段基因。??二、高耐受性(Inhibitor-Resistant)聚合酶:OmniTaq/OmniKlentaq产品特征:1.对全血、血清、血浆、土壤、植物、巧克力、奶酪和牛奶中的抑制因子具极高的耐受性,可直接对样品进行PCR检测,无需进行DNA分离纯化。2.可以耐受高达40%的全血,20%的血浆或血清,已应用于多种遗传病的分子诊断和临床检验。3.可用于法医、环境监测、农业、动植物检疫和临床诊断等领域。4.可以从人血液中一步扩增疟疾基因。5.与PCR增强剂结合使用时,其耐受性将进一步提高。6.使用Omni酶不仅节省时间、降低成本,而且实现了从微量样品中的扩增,避免因提取过程所致的DNA丢失或污染。实例2:用OmniTaq(OT)和OmniKlentaq(OKT)从肝素抗凝血液中一步扩增乙肝病毒基因。?实例3:用新突变的Omni酶从富含腐殖酸的人基因组中扩增1.1kb的CCR5基因。?实例4:用新突变的Omni酶从巧克力和黑胡椒中直接扩增基因。?三、热启动聚合酶(Hot-start)聚合酶:CesiumTaq/CesiumKlentaq产品特征:1.CesiumTaq和CesiumKlentaq是一种冷敏感的突变体,在室温条件下聚合酶的活性很低,当升高温度进入PCR循环时聚合酶的活性就全部释放出来,因而具有内置式热启动功能。2.与现有化学修饰或抗体封阻的热启动聚合酶相比,CesiumTaq和CesiumKlentaq的聚合酶活性更高,扩增效果更好。3.CesiumKlentaq具有热启动和高耐受性双重效果。实例5:用CesiumKlentaq扩增基因热启动效果比较?四、PCR增强剂(PCRenhancingcocktails,PEC)产品特征:1.联合使用PEC-1或PEC-2与高耐受性Taq酶(OmniTaqandOmniKlentaq)可以更好的克服样品中各种物质对PCR反应的抑制作用,进一步提高PCR扩增效率,简化PCR操作流程提高。2.PEC有助于从基因组中扩增GC含量高达80%的基因。3.PEC也可用于qPCR(SYBR和Taqmanprobe)。4.新研发的PCR增强剂PEC-3andPEC-4有助于从食品中扩增基因。?实例6:联合使用OmniTaqorOmniKlentaq及PCR增强剂(PEC)从不同类型的牛奶中检测沙门氏杆菌Inv基因。??实例7:联合使用OmniTaqorOmniKlentaq及PCR增强剂(PEC)从人的基因组DNA或全血中直接扩增3个高GC含量的基因。?五、各种特异性一步PCR试剂盒VitaNaviTech公司开发了系列一步法PCR和qPCR试剂盒,可以直接从样品中扩增目的基因。1.DirectBloodPCRKit:从血液中直接扩增目的基因实例8:使用DirectBloodPCRKit从全血中一步扩增CCR5基因
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价格上第一种如果是几百万个SNP位点的一般是1000元左右,如果是单基因或少数几个基因的也就几十块钱。第二种全基因组测序的一般测序深度30X以上,90G左右数据,测序费用大概在8000左右,分析snp和Indel的变异费用在1000左右。
但是,目前完全不建议做。因为SNP的变异与疾病和表型的研究完全不够充分。单基因的遗传疾病根本不用测序自己就看出来了,多基因的复杂疾病基因遗传因素所占比例有限,只是一个相关概率问题,而且即便知道了也没什么手段,早点拿到的数据也是一堆ATCG和SNP变异和所谓风险值。
还有测序和数据分析费用在飞速下降,目前上万的全基因组测序同样的数据可能1年后只用几百块,真正有效的解读也还要等到几年后,没必要花这个冤枉钱。
但是以下人群有这个切实需要:肿瘤的突变分型(目前并没有特别靠谱的高通量测序产品,主要还是基于荧光定量PCR的检测试剂盒),新生儿的遗传病筛查(看个人接受程度)
抗体检测
抗体检测
血清中HIV抗体是判断HIV感染的间接指标。根据其主要的适用范围,可将现有HIV抗体检测方法分为筛检试验和确证试验。
确证试剂
筛检实验阳性血清的确证最常用的是Western blot(WB),由于该法相对窗口期较长,灵敏度稍差,而且成本高昂,因此只适合作为确证实验。随着第三代和第四代HIV诊断试剂灵敏度的提高,WB已越来越满足不了对其作为确证实验的要求。
FDA批准的另一类筛检确证试剂是-免疫荧光-试验(IFA)。IFA比WB的成本低,而且操作也相对简单,整个过程在1-1.5小时内即可结束。此法的主要缺点是需要昂贵的荧光检测仪和有经验的专业人员来观察评判结果,而且实验结果无法长期保存。现在FDA推荐在向WB不能确定的供血员发布最终结果时以IFA的阴性或阳性为准,但不作为血液合格的标准。
筛检试验
筛检试验主要用于对供血员进行筛查,因此要求操作简便,成本低廉,而且灵敏、特异。2012年,世界上主要的筛检方法仍然是ELISA,还有少数的颗粒凝集试剂和快速ELISA试剂。ELISA有很高的灵敏度和特异性,操作简单,仅需要实验室配备酶标仪和洗板机即可应用,特别适合于试验室大规模筛检使用。
颗粒凝集实验是另一种操作简单方便,成本低廉的检测方法,该方法结果可通过肉眼判定,灵敏度很高,特别适合发展中国家或大量筛选供血员时使用,缺点是必须使用新鲜样品,特异性较差。
80年代后期发展起来的斑点印迹检测(Dot-blot assay)是一种快速ELISA(Rapid ELISA)方法,这种方法操作极为简便,过程短暂,整个过程多数在5-10分钟内甚至3分钟内即可结束,但该法比ELISA和颗粒凝集试剂昂贵得多。
人类免疫缺陷病毒抗体口腔粘膜渗出液检测试剂盒(胶体金法)就属于侧向免疫层析法(金免疫)类别,基于免疫层析技术通过手工操作、肉眼读取结果、20分钟即可定性得出检测结果的快速诊断试剂,用于检测口腔粘膜渗出液样本中的HIV-1型和HIV-2型抗体。可用于自愿咨询检测、不愿采血、晕针患者的初筛。该方法适用于初筛检测,凡由该试剂测定为阳性者,需进行进一步筛查确认。[3]
【HIV阴性】说明从人体内检测不到HIV抗体,阴性符号以(-)表示。不能说没有感染HIV, 要看是什么时候检测的,在窗口期内,感染者的体内还没有产生HIV抗体,或还没有产生足量的HIV抗体,这时HIV检测是阴性结果,如果在窗口期之后检测的,可以排除感染HIV的可能。
【HIV阳性】说明从人体内检测到了HIV抗体,阳性符号以(+)表示。
【检测结果不定因素】
感染还处于窗口期:从HIV进入体内到检测这段时间还不够长,因此血清还没有形成典型的抗体反应
艾滋病进展到终末期,抗体水平下降
其他非病毒蛋白抗体的交叉反应:自身免疫性疾病、某些恶性疾病、怀孕、输血或器官移植等情况下,身体可以产生一些抗体,其反应与HIVP24核心蛋白抗体引起的反应很相似
抗原检测
病原检测主要指用病毒分离培养、电镜形态观察、病毒抗原检测和基因测定等方法从宿主标本中直接检测病毒或病毒基因。由于前两种方法难度大,且需要特殊设备和专业技术人员。因此仅抗原检测和RT-PCR(反转录-PCR)可用于临床诊断。HIV-1P24抗原检测可用于HIV-1抗体不确定或窗口期的辅助诊断;HIV-1抗体阳性母亲所生婴儿早期的辅助鉴别诊断;第四代HIV-1抗原/抗体ELISA试剂检测呈阳性,但HIV-1抗体确认阴性者的辅助诊断。P24抗原检测一般用ELISA双抗体夹心法试剂,试剂必须经过SDA批准注册、在有效期内,其阳性结果必须依据试剂说明书经中和试验确认。HIV-1P24抗原检测的敏感性为30-90%,该结果仅作为HIV感染的辅助诊断依据,不能据此确诊;HIV-1 P24抗原检测阴性只表示在本试验中无反应,不能排除HIV感染,临床中一般不作为常规诊断项目。
核酸检测
HIV核酸检测可用于HIV感染的辅助诊断、病程监控、指导治疗方案及疗效判定、预测疾病进展等。常用的HIV病毒载量检测方法包括逆转录PCR实验(RT-PCR)、核酸序列扩增实验(NASBA)、分支DNA杂交实验(bDNA)以及实时荧光定量PCR技术。值得注意的是,每一种HIVRNA定量系统都有其最低检测限,即可以测出的最低拷贝数或国际单位,RNA定量检测时未测出不等于样品中不含有病毒RNA,因此HIV核酸定性检测阴性,只可报告本次实验结果阴性,但不能排除HIV感染;HIV核酸检测阳性,可作为诊断HIV感染的辅助指标,不能单独用于HIV感染的诊断。报告HIV核酸定量检测结果时应按照仪器读数报告结果,注明使用的实验方法、样品种类和样品量,当测定结果小于最低检测限时,应注明最低检测限水平。
HIV核酸定性检测也可用于HIV感染的辅助诊断,在分析HIV基因亚型和变异等基础研究中应用。通常使用PCR或RT-PCR技术,使用分子生物学实验室通用的扩增试剂,引物可来自文献或自行设计,应尽量覆盖所有或常见的毒株,也可使用复合引物。报告定性检测结果时应注明反应条件和所使用的引物序列。此外,利用核酸检测方法的高度敏感性,使用集合核酸扩增检测技术和方法,对高度怀疑感染人群且抗体阴性的样品进行集合核酸检测,可及时发现窗口期感染者。该方法较单份样品的核酸检测具有更高的成本效益。aware天猫展开
价格上第一种如果是几百万个SNP位点的一般是1000元左右,如果是单基因或少数几个基因的也就几十块钱。第二种全基因组测序的一般测序深度30X以上,90G左右数据,测序费用大概在8000左右,分析snp和Indel的变异费用在1000左右。
但是,目前完全不建议做。因为SNP的变异与疾病和表型的研究完全不够充分。单基因的遗传疾病根本不用测序自己就看出来了,多基因的复杂疾病基因遗传因素所占比例有限,只是一个相关概率问题,而且即便知道了也没什么手段,早点拿到的数据也是一堆ATCG和SNP变异和所谓风险值。
还有测序和数据分析费用在飞速下降,目前上万的全基因组测序同样的数据可能1年后只用几百块,真正有效的解读也还要等到几年后,没必要花这个冤枉钱。
但是以下人群有这个切实需要:肿瘤的突变分型(目前并没有特别靠谱的高通量测序产品,主要还是基于荧光定量PCR的检测试剂盒),新生儿的遗传病筛查(看个人接受程度)
该仪器采用集成Twister?机械臂的TaqMan?微流体芯片,可以轻松进行数百次实时定量PCR反应。QuantStudio? 7 Flex系统可助您最大限度提高自动化输出能力。
兼容各类应用
优化的实验方案和试剂与直观的软件相结合,兼容最广泛的应用。
获得值得信赖的结果
OptiFlexTM系统拥有六组分离的激发与发射滤片和21片滤片组合,能够确保最高的多重分析能力和化学反应灵活性,提高孔与孔之间、仪器与仪器之间的数据精确性。
1. 主要技术要求
1.1 *内置96孔模块,可升级96孔快速模块及384孔模块;
1.2 *开放5通道检测,连续波长检测,另外可以升级至6色激发光通道和6色检测光通道及21色荧光;
1.3采用检测光滤光片分光,荧光通道开放,用户可自行添加荧光种类;
1.4 *冷CCD检测器96孔/384同步成像;
1.5 *最高升降温速率均可达到:6.5°C/秒;
1.6 *温控范围:4~99.9°C;
1.7动力学线性范围:检测10个起始拷贝,101~109九个数量级,致信度99.7%。区分度要有装机试剂盒验证:能分辨1250、2500、5000、10000、20000拷贝数的初始模板标准品各4个重复验证线性准确度,36个重复的5000拷贝和36个重复的10000拷贝能以99.7%的置信度加以区;
1.8 *有防系统误差方法可供用户选择:内参比荧光Rox,校正加样误差和管间差异;
1.9可分辨单位细胞起始拷贝数1~5拷贝之间的样本99.7%置信度;
1.10 *可分辨起始拷贝数200与300的样本(0.5倍差异);可实现单拷贝起始模板的区分;
1.11 *高能量合金卤素灯激发,单个光源寿命不低于2000小时;
1.12可升级HRM(高分辨率熔解曲线)分析系统,用于高通量筛选分析单核酸多态性位点(SNP), 高分辨熔解曲线分辨率: 低至 0.04°C;
1.13支持35分钟以内完成40循环的快速荧光定量PCR实验;
1.14软件组成:
1.14.1配备完备的定量PCR软件,等位基因分析软件。原厂的探针及引物设计软件,可用于PCR引物,巢式PCR,多重PCR引物,RT-PCR引物和Taqman探针的设计和自动测试;
1.14.2可配备相对定量基因表达软件,可同时对无限个数据进行自动的分析、比对、作出柱状图,用于基因表达,药物疗效考核等相对定量分析;
1.14.3配备完备的定量PCR软件,等位基因(SNP)分析软件和阴阳性结果自动判定软件;
1.15试剂耗材开放;
1.15.1可提供原厂人类、大鼠、小鼠、果蝇和拟南芥等多种模式生物全基因组范围表达试剂盒基因表达试剂盒(试剂盒包含:正/反向引物,TaqMan探针,)且同一PCR条件;
1.15.2可提供原厂人类、大鼠、小鼠、果蝇和拟南芥等模式生物microRNA检测试剂盒(试剂盒包含:正/反向引物,TaqMan探针,)且同一PCR条件;
1.15.3支持耗材:国际标准96孔 (0.2 mL) 反应板与光学盖膜,0.2 mL八连管,0.2mL单管;
1.16内置触摸屏电脑:触摸屏电脑可备份还原超过100次的实验数据,可快速地设置多种应用;
*1.17原装进口。
做的实验以及解决的问题远比五年前多了,因此利用过年的时间,写点荧光定量PCR实验中的一些注意事项及感想,无论对错,都是希望对相关的人
员有些参考价值。
荧光定量PCR原理等大家都已经很熟了,我就不细说了,主要是写一些有人问过的事,希望写的内容是大家都关心的。
普通PCR与荧光定量PCR技术区别?
简单的讲PCR技术最早是用于扩增一段特异的PCR片段,用于克隆、测序等实验,后来也将其用于样本中特异的PCR片段有无或非很粗的相对定量,而
荧光定量PCR技术则是为了测定样本中特异的PCR片段相对及绝对量,是一种测定特异的PCR片段含量的方式。如测定病人样本中病原体的含量、实验
样本中某一特定的mRNA的含量等。
前些年有人讲过普通PCR后,通过电泳也可以进行定量,其实是将PCR产物的定量与PCR样本中模板定量相混了。近两年没有人再讲这类的话了。
SybrGreen、Taqman、Molecularbeacon、LUX这些方法如何选择?
从实验成本来讲,SybrGreen是最好的,基本上就是普通PCR加上一点SybrGreenI荧光染料即可,其信号强度也很好,还可以进行融解曲线分析等
,但缺点是只能在一个反应管内进行一种PCR反应的检测,另一个问题是非特异性扩增会影响实验结果,当然也有一些技术解决这些问题,后面会讲
到。对于研究人员来讲,如果需要检测的基因很多,而每个反应管中进行一种PCR反应的检测可以满足实验要求,则SybrGreen是最好的选择。
如果需要进行多通道实验,即在一个反应管中进行2种或以上的反应,则要选择其他的方法,最常用的是Taqman、Molecularbeacon,这两种都是探
针的方式,由于增加了探针的特异性,因此其扩增曲线反映的就是特异性产物的扩增曲线,不含有非特异性扩增的成分。因此商业用途的检测试剂盒
大都采用这一技术,以减少非特异性产物造成错误结论的可能性。其缺点在于探针成本较高,有时设计的探针并不合适,有造成损失的可能性。并且
要进行较多的实验条件的优化。这两种探针技术用于商业目的时都有专利问题,据说取得Molecularbeacon的许可权的成本相对较低,但只是据说。
另一种值得一提的是LUX探针,它也可进行多通道实验,但它没有Taqman和Molecularbeacon方法的增加探针特异性的功能,因此只能是一种折中的
方案,如果不考虑多通道实验,则不如SybrGreen法
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