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asuragen/AmplideX® PCR/CE FMR1 Reagents/24/49442
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asuragen/AmplideX® PCR/CE FMR1 Reagents/24/49442
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asuragen
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49442
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AmplideX® PCR/CE FMR1 Reagents

AmplideX FMR1AmplideX PCR/CE FMR1 Reagents* are market-leading research tools for the detection of CGG repeats in the fragile X mental retardation (FMR1) gene. These reagents provide a PCR-only approach based on Triplet Repeat Primed PCR (TP-PCR) design to reliably amplify and detect all alleles including Full Mutations.

Features & Benefits

AmplideX PCR/CE FMR1 Reagents* have created an easy-to-use, accessible, high performance method for laboratories to reliably analyze CGG repeats and detect interrupting AGG sequences in the FMR1 gene.

Reduced ComplexityEase-of-analysis of the FMR1 gene has been simplified through:

  • Implementation of proprietary PCR solution for amplifying GC-rich regions
  • Automation of result calling using AmplideX PCR/CE FMR1 Reporter* 

Optimized WorkflowValuable operator hands-on time has been significantly reduced through:

  • Direct injection of PCR products (no PCR clean up) in to Capillary Electrophoresis platforms
  • Decreased need for Southern blot analysis (up to 50 fold)
  • End-to-end solution for FMR1 analysis including all necessary reagents and software

Quality PerformancePerforming FMR1 Analysis with Greater Sensitivity and Accuracy:

  • Detection of all allele expansions, including low abundance full mutation size mosaics with up to at least 1300 CGG repeats
  • Up to 875 fold more sensitive than Southern blot1
  • Resolution of female homozygous and heterozygous samples and indication of interrupting AGG sequences
  • Proven performance as indicated by more than 30 peer reviewed publications

*For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

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Product Description

Analytical Characteristics of AmplideX PCR/CE FMR1 Reagents*:

  • Detects all alleles including low abundance full mutations (Figure 1)
  • Accurately sizes any repeat up to 200 CGG repeats (Figure 2)
  • Resolves female zygosity (Figure 3)
  • Detects presence of AGG interruptions (Figure 4)

Figure 1: Amplification of Asuragen’s Methylation and Sensitivity Control which has a 5% full mutation in a background of 95% Normal

AmplideX Methylation and Sensitivity Control

Figure 2. Female premutation sample with accurate sizing of Normal (30 CGG) and Pre mutation allele (56 CGG)

AmplideX Female premutation sample

Figure 3: The difference in the “stutter” peak patterns of homozygous and heterozygous female provides a clear resolution of zygosity

AmplideX resolves female zygosity

Figure 4. Female Full Mutation sample with AGG interruptions as indicated by sudden decrease in peak heights of the “stutter” peak profile

AmplideX Female Full Mutation sample

Ordering

Product NameNumber of ReactionsCatalog Number
AmplideX PCR/CE FMR1 Control24 UL49513
AmplideX mPCR FMR1 Control24 UL49514
AmplideX PCR/CE FMR1 Reagents10049402
AmplideX mPCR FMR1 Kit2449442
AmplideX PCR/CE FMR1 ReporterN/A49576

T 1-877-777-1874; 512-681-5200 F 512-681-5202 E orders@asuragen.com

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References

  1. Referenced in over 30 peer reviewed publications and used in over 200 laboratories, the AmplideX® PCR/CE FMR1 Reagents* are globally recognized as best-in-class for assessment of CGG repeats in the FMR1 gene.
    • Key resources
    • Videos

AmplideX® PCR/CE FMR1 Kit

AmplideX FMR1AmplideX PCR/CE FMR1 Kit is an in vitro diagnostic (IVD) device for use in clinical laboratories for detection of the CGG repeats in the fragile X mental retardation (FMR1) gene. The device is intended to aid in the diagnosis of fragile X syndrome and fragile X associated disorders, e.g. tremor and ataxia syndrome (FX-TAS) and primary ovarian insufficiency (FXPOI), through determination of CGG repeat length up to 200 CGG and detection of alleles greater than 200 CGG. The kit provides a PCR-only approach based on Triplet Repeat Primed PCR (TP-PCR) design to reliably amplify and detect all alleles including Full Mutations.

Features & Benefits

AmplideX PCR/CE FMR1 Kit has created an easy-to-use, accessible, high performance method for laboratories to reliably analyze CGG repeats and detect interrupting AGG sequences in the FMR1 gene.

Reduced ComplexityEase-of-analysis of the FMR1 gene has been simplified through:

  • Implementation of proprietary PCR solution for amplifying GC-rich regions
  • Automation of result calling using AmplideX PCR/CE FMR1 Reporter 

Optimized WorkflowValuable operator hands-on time has been significantly reduced through:

  • Direct injection of PCR products (no PCR clean up) in to Capillary Electrophoresis platforms
  • Decreased need for Southern blot analysis (up to 50 fold)
  • End-to-end solution for FMR1 analysis including all necessary reagents and software

Quality PerformancePerforming FMR1 Analysis with Greater Sensitivity and Accuracy:

  • Detection of all allele expansions, including low abundance full mutation size mosaics with up to at least 1300 CGG repeats
  • Up to 875 fold more sensitive than Southern blot1
  • Resolution of female homozygous and heterozygous samples and indication of interrupting AGG sequences
  • Proven performance as indicated by more than 30 peer reviewed publications

Product Description

Analytical Characteristics of AmplideX PCR/CE FMR1 Kit:

  • Proven clinical accuracy compared to Southern Blot (Table 1)
  • Detects all alleles including low abundance full mutations (Figure 1)
  • Accurately sizes all alleles up to 200 CGG repeats (Figure 2)
  • Resolves female zygosity (Figure 3)
  • Detects presence of AGG interruptions (Figure 4)

Table 1: Diagnostic Sensitivity of 100%; Diagnostic Specificity of 98.4% and Overall Accuracy of 99%AmplideX has proven clinical accuracy compared to Southern Blot*These 2 samples presented premutation alleles by both methods and low intensity full mutation alleles detected only by the AmplideX PCR/CE FMR1 Kit

Figure 1: Amplification of Asuragen’s Methylation and Sensitivity Control which has a 5% full mutation in a background of 95% Normal

AmplideX Methylation and Sensitivity Control

Figure 2. Female Pre-mutation sample with accurate sizing of Normal (30 CGG) and Pre-mutation allele (56 CGG)

AmplideX Female premutation sample

Figure 3: The difference in the “stutter” peak patterns of homozygous and heterozygous female provides a clear resolution of zygosity

AmplideX resolves female zygosity

Figure 4. Female Full Mutation sample with AGG interruptions as indicated by sudden decrease in peak heights of the “stutter” peak profile

AmplideX Female Full Mutation sample

Ordering

Product NameNumber of ReactionsCatalog Number
AmplideX PCR/CE FMR1 Control*24 UL49513
AmplideX mPCR FMR1 Control*24 UL49514
AmplideX PCR/CE FMR1 Reagents*10049402
AmplideX PCR/CE FMR1 Kit10076008
AmplideX mPCR FMR1 Kit*2449442
AmplideX PCR/CE FMR1 Reporter*N/A49576

T 1-877-777-1874; 512-681-5200 F 1-512-681-5202 E orders@asuragen.com

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References

  1. Referenced in over 30 peer reviewed publications and used in over 200 laboratories, the AmplideX® PCR/CE FMR1 Reagents* are globally recognized as best-in-class for assessment of CGG repeats in the FMR1 gene.
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B 【解析】E·coliDNA连接酶只能缝合黏性末端,T4DNA连接酶黏性末端与平末端都可以缝合,但对平末端的作用效率较低。练习册系列答案 1... 查看更多>
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上海杰美基因医药科技有限公司在发布的寡核苷酸探针非同位素HRP-DAB显色法RNA供应信息,浏览与寡核苷酸探针非同位素HRP-DAB显色法RNA相关的产品或在搜索更多与寡核苷酸探针非同位素HRP-DAB显色法RNA相关的内容。 查看更多>
此法系可用于从低熔点琼脂糖凝胶中回收 DNA 的放射性标记 ( Feinberg 和 Vogelstein 1983,1984)。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。 查看更多>
PCR常见问题 一.没有扩增产物 1.循环温度:变性温度、退火温度 2.引物设计 3.DNA聚合酶活性 4.抑制性成份(蛋白酶、核酸酶、其它抑制聚合 酶活性的成份) 5、DNA样品 二.非特异产物及电泳呈涂布状 1.Mg2 浓度 2.调整引物、模板、聚合酶的用量 3.适当减少循环数 4.适当提高退火温度,缩短退火或延 查看更多>
关键词:寡核苷酸;优化设计中图分类号:Q524 在核酸分子杂交、DNA序列测定和通过PCR放大DNA片段等实验中,都需要使用寡核苷酸作为探针或引物,而对这些反应的质量起最重要影响作用的,就是这些寡核苷酸探针或引物。用优化的寡核苷酸进行实验能够很快得到好的结果,而用不够合适的寡核苷酸时, 查看更多>
一、 材料准备:1.细胞爬片:细胞爬片经固定液-4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.0-7.6),含有1/1000 DEPC,固定15min。经无水乙醇、95%、85%和75%乙醇各2min脱水。2.探针: 多聚寡核苷酸探针-FITC     2ug/ml二、 FISH操作流程 暴露mRNA 核酸片段:细胞爬片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3% 柠檬酸加2 滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃消化5 分钟。 ... 查看更多>
天根生化科技(北京)有限公司在发布的T4 多聚合核苷酸激酶(NG206)供应信息,浏览与T4 多聚合核苷酸激酶(NG206)相关的产品或在搜索更多与T4 多聚合核苷酸激酶(NG206)相关的内容。 查看更多>
鸟嘌呤核苷酸结合蛋白9抗体NARF57532北京博奥森生物技术有限公司鸟嘌呤核苷酸结合蛋白9抗体 查看更多>
核酸杂交技术是根据两条互补的核苷酸单链可以杂交结合成双链的原理所建立,用一段已知序列的放射性或非放射性标记的核苷酸单链做探针,与待检标本中的DNA杂交来探查待检标本中有无与之相互补的核酸。该方法特异性高,但敏感性低于PCR方法。  本实验学习用非放射性标记物-地高辛(DIG)标记DNA片 查看更多>
大鼠5核苷酸酶(5-NT)ELISA实验代测是由上海远慕生物科技有限公司代理或销售的上海远慕品牌的试剂,产品来源于上海。上海远慕生物科技有限公司是中国最权威的大鼠5核苷酸酶(5-NT)ELISA实验代测试剂销售服务商之一,在上海等地方销售大鼠5核苷酸酶(5-NT)ELISA实验代测试剂已经多年。生物在线为您提供众多企业大鼠5核苷酸酶(5-NT)ELISA实验代测仪器产品及图片,以便挑选到性价比高,合适的大鼠5核苷酸酶(5-NT)ELISA实验代测产品 查看更多>
B 族链球菌正常寄居于阴道和直肠,属于条件致病菌。早在 20 世纪 70 年代,GBS 已被证实为围产期母婴感染的主要致病菌之一,在围产医学中占有不可忽视的地位,同时它也是婴幼儿败血症和脑膜炎最常见的原因。据美国疾病控制中心(CDC)统计,大概 10%—30% 的孕妇感染 GBS,其中 40% ~ 70% 在生产过程中会传递给孩子。带菌的婴儿中有相当部分 (1% ~3%) 早期出现侵入性感染, 查看更多>
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FISH检测(9p24.3+cep9共2个探针)哪里能做检测啊?能做请回复一下,谢谢!
我用获得的线粒体全基因组序列在网上预测tRNA,预测用的软件为tRNAscan-SE1.21(http://lowelab.ucsc.edu/tRNAscan-SE/)。
我是这样进行预测的:在“SearchMode:”中选择“rRNAscanonly:”,在“sorce”中选择“mito/chloroplast”,粘贴序列,运行程序。得到了21个tRNA,而鱼中应该是22个tRNA,我觉得很奇怪,在“SearchMode:”和“rRNAscanonly:”中进行其它的设置,都不能得到22个tRNA.
我看的一篇文献“CompletemitochondrialDNAsequenceoftheJapanese
flyingfishCypselurushiraii”中也是说22个tRNA,但是我把文章提交的序列(Genbank号为AB182653.)拿到网上提交,只有21个tRNA,我觉得很奇怪。
不知道是怎么回事?请高手指点,那个软件好像是比较权威的。
遗传密码 123
jiangu88002021-07-25
我看trna的测序结果,第一个数字的不同会导致trna序列的不同,第二个数字不同序列和二级结构却一样,而且网上的数据库中会给出后两个数字,那这两个数字到底代表了什么含义?
mRNA
中文名为信使RNA,是由DNA的一条链作为模板转录而来的、携带遗传信息的能指导蛋白质合成的一类单链核糖核酸。mRNA作为蛋白质合成的模板,决定肽链的排列顺序。
tRNA
中文名为转运RNA,是具有携带并转运氨基酸功能的一类小分子核糖核酸。
rRNA
中文名为核糖体RNA,是最多的一类RNA,也是3类RNA(tRNA,mRNA,rRNA)中相对分子质量最大的一类RNA,它与蛋白质结合而形成核糖体,其功能是作为mRNA的支架,使mRNA分子在其上展开,形成肽链的合成。rRNA占RNA总量的82%左右。rRNA单独存在时不执行其功能,它与多种蛋白质结合成核糖体,作为蛋白质生物合成的“装配机”。
probe英[prəʊb]美[proʊb]
n.[医] (对伤处等的) 针探,探查; [医] 探针,取样器; 探测仪;探头;
vt.探索,调查; 用探针(或探测器等)探查,探测;
vt.盘问; (用试探性袭击等)侦察(敌情) ; 用尖物刺穿(物件); 用力使向前推进;
The more they probed into his background, the more inflamed their suspicions would become
他们越调查他的背景,疑团就越多。
eve如何移动扫描探针 123
dem01234567892021-08-01
在恒星星图里完全没有什么圈啊,方向啊那些
没法移动,也没有办法看信号强度啊?
【求助】siRNA转染讨论123
心碎在黄昏3822017-11-04
三到五小时。
siRNA (Small interfering RNA),是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。

PNA是一种人工合成的核酸的类似物,与核酸相似,它也是由携带ATGC四种碱基的四种单体首尾相连所构成的链状结构,从而保证这种物质能够像核酸一样靠碱基堆积力形成Watson-Crick碱基对,与DNA、RNA形成杂交分子PNA/DNA或PNA/RNA这就是PNA作为杂交探针的理论基础。所不同的是构成PNA骨架的单体不是通常的带负电的磷酸核糖而是N-(2-氨已基)-甘氨酸,单体之间靠酰胺键连接成长链。这种电中性的骨架结构赋予肽核酸探针优良的杂交特性。

首先PNA/DNA杂交分子的性质很稳定,从化学动力学角度看,PNA/DNA的结合常数有明显提高,一旦形成了双链,即使加入上百倍的寡核苷酸也不能使它解离。据报道,对于含有高度反向重复序列的超螺旋DNA,PNA/DNA杂交分子比DNA/DNA双链的结合常数提高了五万倍;从热力学角度看,PNA/DNA杂交分子的Tm也高于相同序列的DNA/DNA双链,通常,在100mmol/L的NaCl溶液中,PNA/DNA杂合子与相应的DNA/DNA双链相比,每个碱基对的Tm值要高出1℃。也就是说,15个碱基对的PNA/DNA平均Tm值约为70℃,比同样的DNA/DNA要高出15℃。从而使检测过程中的灵敏度大为提高。此外,中性骨架还使PNA与DNA的杂交摆脱了对杂交液盐度的依赖,这一重要性质不仅意味着杂交过程中省去了提高盐浓度的操作,更有意义的是,只要保证杂交体系足够低的离子强度,就能抑制非特异性的杂交和靶DNA序列的自身复性对灵敏度的损害。

不但如此,这种高度的灵敏度并没有像其他种类的探针一样引起特异性的下降,相反它对于碱基错配的容纳力更小。在16bp的PNA/DNA杂合子中,一个碱基的错配会导致Tm值下降15℃,而对于同样的DNA双链,Tm值只下降11℃

原文地址:http://tahepna.com/file_news_read.asp?id=59&class=%D1%D0%BE%BF%BD%F8%D5%B9&fo=4&flag=

各位大神,想求解下关于siRNA和shRNA的区别。了解到shRNA是构建到载体转染细胞,也可以构建好了包慢病毒。但是不知道siRNA设计合成后,可不可以包到慢病毒上?如果可以的话,那么这两个都可以包到慢病毒上,效果有什么区别?

大家好,近期在用lipo2000做悬浮细胞HL-60的siRNA转染,siRNA是由公司合成的三个siRNA,但是敲除效率很低,并且每次qPCR后做出来的结果都不一样:有时是第一个siRNA敲除作用好点,但有时是第二个或第三个siRNA效果好。由于结果不稳,并且细胞不好转我就将细胞换成了A549,但是换成了贴壁细胞后发现每次转染后进行qPCR检测时结果还是不稳,另外,我还设置了不同siRNA的组合,有时结果显示siRNA1+siRNA3效果好,但有时显示siRNA1+2+3效果好。光做这个siRNA转染已经几个月了,到现在都没有确定具体哪个片段起作用或效果最好,也没有一个稳定的趋势。请问造成这种敲除效率不稳定的原因到底是为什么?急切等待回复,谢谢!

rRNA(核糖体RNA)是核糖体的组成成分,它和蛋白质共同组成了核糖体。
tRNA(转运RNA)可以转运氨基酸。
mRNA(信使RNA)是由细胞核内的DNA转录来的,相当于蛋白质的设计图纸。

翻译的过程:核糖体附着在mRNA上,然后tRNA搬运氨基酸,运往到核糖体上,从而拼合成蛋白质。
求助:
编码线虫的氨基酰tRNA合成酶是否和编码大鼠的氨基酰tRNA合成酶的基因相同?