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  2024-05-13
  
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SUMO 蛋白酶 FUG1、组蛋白阅读器 AL3 和 PRC1 复合物是拟南芥中重复扩增诱导表观遗传沉默的组成部分发表时间:2023 年 12 月摘要:表观遗传基因沉默诱导重复序列的扩展可导致多种表型,从植物的严重生长缺陷到人类的弗里德赖希共济失调等遗传病 1。重复扩展的分子机制-...阅读更多»染色质分析将转录通读识别为蚊子 piRNA 生物发生的保守机制。发表时间:2023 年 3 月摘要:蚊子中的 piRNA 通路与其他模式生物有很大不同,具有扩展的 PIWI 基因家庭和抗病毒防御功能。在这里,我们将核心 piRNA 簇定义为在 bo 中显示无处不在的 piRNA 表达的基因组位点……阅读更多 »表观遗传剂量确定了两个主要且功能不同的 beta cells ubtypes。发布时间:2023 年 3 月摘要:指定和稳定细胞亚型的机制仍然知之甚少。在这里,我们根据组蛋白标记异质性(β HI 和β LO)确定了两种主要的胰腺β 细胞亚型。 Beta HI 细胞表现出高 4 倍...阅读更多»缺陷型胃癌的综合分子表型揭示了普遍的表观基因组重编程和治疗机会。发表时间:2023 年 3 月摘要:目的:胃癌 (GC) 是癌症死亡率的主要原因,是 GC 中第二个最频繁突变的驱动基因。我们试图破译特定的 GC 监管网络并检查由损失引起的治疗漏洞……阅读更多»H3.3G34 中的单次替换改变 DNMT3A 招募以导致进行性神经变性。发表时间:2023 年 3 月摘要:种系组蛋白 H3.3 氨基酸替换,包括 H3.3G34R/V,导致严重的神经发育综合征。了解这些突变如何影响大脑发育,我们生成了 H3.3G34R/V/W 敲入小鼠并鉴定出明显不同的……阅读更多 »RNA m5C 甲基化酶 NSUN2 调节角膜上皮伤口愈合。发布时间:2023 年 3 月摘要:目的:新兴表观转录组学提供了对各种 RNA 修饰的病理生理作用的见解。 RNA 甲基化酶 NOP2/Sun 结构域家族成员 2 (NSUN2) 催化 mRNA 的 5-甲基胞嘧啶 (m5C) 修饰。然而,...阅读更多»低亲和力 CTCF 结合驱动转录调控,而高亲和力结合包含结构功能发布时间:2023 年 2 月摘要:CTCF 是一种 DNA 结合蛋白,在染色质结构组织和转录调控中起着关键作用;然而,关于不同 CTCF 结合位点 (CBS) 的功能决定因素知之甚少。使用有条件的老鼠……阅读更多»针对心脏高葡萄糖诱导的表观遗传修饰交流水平:SGLT2 和 SGLT2 抑制剂的作用。发表时间:2023 年 2 月摘要:背景:钠-葡萄糖协同转运蛋白 (SGLT) 抑制剂 (SGLT2i) 在心血管水平显示出许多有益作用。已经确定了几种作用机制。然而,没有关于它们通过表观遗传机制发挥作用的能力的数据……阅读更多»骨髓增生异常综合征相关的 TET2 突变会影响 NK 细胞功能和基因组甲基化。发表时间:2023 年 2 月摘要:骨髓增生异常综合征 (MDS) 是克隆性造血疾病,代表高风险进展为急性髓性白血病,并且经常与体细胞突变相关,特别是在表观遗传调节因子 TET2 中。 Natural Killer (NK) cel...阅读更多 »JPX/FTX orthologs 对 XIST 的物种特异性调节。发表时间:2023 年 2 月摘要:X 染色体失活 (XCI) 是一个必不可少的过程,但它以各种显着多样性启动哺乳动物物种。 XIST,主要触发器XCI 在小鼠中由 lncRNA 基因 (LRG) 的相互作用控制,其中一些基因进化……阅读更多 »淀粉样蛋白-β 1-42 在阿尔茨海默病中对印记基因 Igf2 的非规范调节。发表时间:2023 年 2 月摘要:减少阿尔茨海默病 (AD) 中的胰岛素样生长因子 2 (IGF2) 水平可能是与年龄相关的代谢紊乱与痴呆相关的机制。由于 Igf2 是一个印迹基因,我们检查了年龄和性别之间关系的差异……阅读更多 »猪 IPECJ2 和鸡 SL-29 细胞系的详细分子和表观遗传特征发表时间:2023 年 2 月摘要:猪 IPECJ2 和鸡 SL- 29 种细胞系因其未转化的性质和在功能研究中的广泛应用而受到关注。这些细胞系的分子特征对于深入了解可能的分子畸变非常重要。 ...阅读更多 »共转录去甲基化诱导拟南芥活性基因中 H3K4me2 的全局丢失Published:2023 年 2 月摘要:基于对动物和酵母的研究,组蛋白 H3 赖氨酸 4 的甲基化(H3K4me1/2/3,分别用于单甲基化、二甲基化和三甲基化)被认为是转录的关键表观遗传修饰活性基因。然而,在植物中,H3K4m...阅读更多 »组蛋白重塑反映了牛和人类植入前发育的保守机制。发表时间:2023 年 2 月摘要:在任何物种的植入前发育过程中,组蛋白修饰如何调节基因表达的变化仍然知之甚少。使用 CUT&Tag 来克服有限数量的生物材料,我们分析了两个激活 (H3K4me3 ...阅读更多 »大卫星 DXZ4 和转录调节因子 CHD4 对 plastin 3 表达的表观遗传调控。发表时间:2023 年 2 月摘要:失调的 Plastin 3 (PLS3 ) 水平与广泛的骨骼和神经肌肉疾病以及最常见的实体和造血类型有关癌症。最重要的是,PLS3 过表达可防止脊髓性肌萎缩症。 D...阅读更多 »信号诱导的增强子激活需要 Ku70 来读取拓扑异构酶 1-DNA 共价复合物。发表时间:2023 年 2 月摘要:增强子激活是调节信号依赖性转录程序的主要机制,确保细胞可塑性,但核心问题仍然存在他们的激活机制。在这里,通过成功映射拓扑异构酶...阅读更多»糖皮质激素受体外显子 1 变体和 FKBP5 在青少年自杀完成者中的甲基化和表达。发表时间:2023 年 2 月摘要:下丘脑-垂体-肾上腺 (HPA) 轴失调已被反复证明在精神疾病和自杀中发挥重要作用,但这种失调背后的机制尚不清楚。表达减少......阅读更多»桥接生物 cfDNA 特征和机器学习方法。发布:February, 2023 摘要:液体活检 (LB),特别是使用循环肿瘤 DNA (ctDNA),有望彻底改变精准肿瘤学和基于血液的癌症筛查。最近的技术改进,结合对 ce 的不断增长的理解……阅读更多»H3K9/14ac 和 H3K4me3 组蛋白标记的时间修饰介导杨树适应过程中的机械响应基因表达发表时间:2023 年 2 月摘要:植物可以减弱其分子对重复机械刺激的反应作为其机械历史的函数。例如,茎的单次弯曲足以将杨树植物中的基因表达减弱到随后的……阅读更多»肾细胞癌风险位点的表观基因组图表和功能注释。发表时间:2023 年 1 月摘要:虽然突变和转录肾细胞癌 (RCC) 的景观是众所周知的,但表观基因组却知之甚少。我们描述了透明细胞 (ccRCC)、乳头状细胞 (pRCC) 和嫌色细胞 RCC (chRCC) 的表观基因组,使用 ChIP-...阅读更多 »生长素诱导 degron 2 系统破译 CTCF 域转录调控的功能。发布时间:2023 年 1 月摘要:背景:CTCF 是一种成熟的染色质结构蛋白,在转录调控中也发挥着多种作用。虽然 CTCF 生物学已得到广泛研究,但 CTCF 的功能域如何调节转录仍然存在……阅读更多»甲基转移酶抑制使 Tgf 驱动的和 in 癌细胞的诱导。发表时间:2023 年 1 月摘要:缺失或沉默在人类癌症中很常见,加强绕过其肿瘤抑制在癌症形成或进展中的普遍重要性。在横纹肌肉瘤 (RMS) 和神经母细胞瘤中,两种常见的儿童癌症,三种 tra...阅读更多»骨髓的年龄决定了动脉粥样硬化斑块中平滑肌衍生细胞的克隆性。Pub发布时间:2023 年 1 月摘要:衰老是动脉粥样硬化的主要危险因素,动脉粥样硬化是导致死亡的主要原因。罕见的平滑肌细胞 (SMC) 祖细胞克隆扩增,产生高达约 70% 的动脉粥样硬化斑块细胞;然而,年龄对 SMC 克隆性的影响……阅读更多»DNA 双加氧酶 Tet2/3 调节谱系特异性基因座中的基因启动子可及性和染色质拓扑结构以控制上皮细胞分化。发表时间:2023 年 1 月摘要:谱系特异性分化程序的执行需要严格许多监管机构之间的协调,包括十一易位 (TET) 家族酶,催化 DNA 中的 5-甲基胞嘧啶氧化。在这里,通过使用 g 的 --driven 消融...阅读更多 »使用 iDEMS 量化 DNA 甲基化和羟甲基化的传播。发布时间:2023 年 1 月摘要:DNA 甲基化是哺乳动物细胞中的一个关键表观遗传标记。 DNA 甲基化维持的许多方面已被表征;然而,复制后甲基化维持的确切动力学仍然是争论的主题。在这里,我们开发...阅读更多 »表观遗传学通过阴茎包皮 DNA 甲基化改变在尿道下裂病因学中的作用。发表时间:2023 年 1 月摘要:尿道下裂的阴茎包皮异常发育是男性儿童中最常见的生殖器畸形,在男性儿童中急剧增加近几十年来。许多环境因素已被证明与尿道下裂有关……阅读更多»通过表观遗传重编程体外产生猫限制性弓形虫性前阶段发布时间:2023 年 1 月摘要:有性繁殖仅限于小肠猫科动物,由于围绕使用猫作为模式生物的伦理问题,记录很少。染色质修饰剂决定了寄生虫在 durin 期间的发育命运……阅读更多 »Lamina 相关域的基因调控相互作用发布时间:2023 年 1 月 A摘要:核层在核外围提供抑制染色质的环境。然而,虽然层相关结构域 (LAD) 中的大多数基因处于非活动状态,但超过 10% 的基因驻留在局部常染色质环境中并被表达。如何...阅读更多 »前列腺癌中一致的 DNA 低甲基化。发表时间:2022 年 12 月摘要:全世界每年约有 140 万男性被诊断患有前列腺癌 (PCa),PCa 仍然是对生命的可怕威胁和毁灭性发病率的来源。近几十年来,年龄特异性 PCa 死亡率显着下降……阅读更多 »组蛋白乙酰转移酶 KAT6A 通过 DNA 结合翼螺旋结构域被募集到未甲基化的 CpG 岛。发表时间:2022 年 12 月摘要:赖氨酸乙酰转移酶 KAT6A(MOZ , MYST3) 属于染色质调节因子 MYST 家族,促进组蛋白乙酰化。 KAT6A 的失调与发育综合征和可爱的髓性白血病(AM...阅读更多 »KMT2D 缺陷会导致肺鳞状细胞癌和对 RTK-RAS 抑制的超敏反应。发表时间:2022 年 12 月摘要:肺鳞状细胞癌 (LUSC) 是肺癌的一种主要亚型,治疗选择有限。 KMT2D 是 LUSC 中最常见的突变基因之一 (>20%),但它在 LUSC 肿瘤发生中的作用仍然未知。在这里,我们确定……阅读更多在脑中线神经胶质瘤中。发表时间:2022 年 12 月摘要:典型 (H3.1/H3.2) 和非典型 (H3.3) 组蛋白 3 K27M 突变神经胶质瘤具有独特的时空分布、伴侣改变和分子谱。细胞的贡献这些差异的起源对你来说一直是一个挑战……阅读更多»具有高抗 LSD1 活性的含杂环的反苯环丙胺衍生物。发表时间:2022 年 12 月摘要:作为区域异构体rs/bioisosteres of , 4-phenylbenzamide tranylcypromine (TCP) derivative previously discovered by us, we report here the synthesis and biological evaluation of some (hetero)arylbenzoylamino TCP derivatives -, in which the 4-phenyl moi...阅读更多»木霉根系定植触发茉莉酸和水杨酸途径相关基因的表观遗传变化。发表时间:2022 年 12 月摘要:植物根系与木霉属之间的有益相互作用。通过称为启动防御的机制导致植物免疫系统的局部和系统增强。在最近的报告中,我们概述了一系列基因和蛋白质……阅读更多 »在哮喘小鼠模型中鼻内施用洛氏不动杆菌可诱导 IL-6 介导的与盲肠微生物变化相关的保护作用。发表时间:2022 年 12 月摘要:背景:早期-生活中接触某些环境细菌,包括 Acinetobacter lwoffii (AL) 与预防慢性病有关c 炎症性疾病,包括晚年的哮喘。然而,我的潜在机制……阅读更多 »不一致同卵双胞胎身体活动和生理参数的全表观基因组关联研究。发表时间:2022 年 11 月摘要:对来自口腔细胞的全表观基因组关联研究 (EWAS)同卵双胞胎 (MZ) 在儿童时期一起抚养,但在成年后分开居住。双胞胎队列被用来研究邻里 walkab 之间的关联……阅读更多 »自噬和细胞死亡之间的平衡由 Polycomb 介导的干细胞分化过程中的调节来维持。发表时间:2022 年 11 月摘要:自噬是一种保守的细胞保护过程,异常在导致许多退化性疾病。虽然自噬的细胞质成分已被广泛研究,但自噬基因的表观遗传调控,尤其是在……阅读更多»雌酮,主要的绝经后雌激素,结合 ERa 以诱导 SNAI2、上皮-间质转化和 ER+ 乳腺癌转移。发表时间:2022 年 11 月摘要:最近的研究表明,占主导地位的绝经后雌激素雌酮与核因子 κB (NF-κB) 协同刺激炎症,而绝经前的 17β-雌二醇则对抗 NF-κB。在这里,我们表明绝经后……阅读更多»DNA 序列和染色质修饰剂协同作用,在印记控制区赋予表观遗传稳定性。发表时间:2022 年 11 月摘要:基因组印记受印记控制区(ICR)的亲本特异性 DNA 甲基化调节).尽管 DNA 序列相同,但 ICR 可以存在于两种不同的表观遗传状态中,这些状态在无限的细胞分裂中被记忆...阅读更多»RNA 5-甲基胞嘧啶修饰调节拟南芥中与 H3K27 三甲基化相关的植物发育。发表时间:2022 年 11 月摘要:甲基化 RNA 后-转录正在成为真核生物基因调控的重要机制。 RNA 甲基化和组蛋白修饰之间的串扰对于哺乳动物的染色质状态和基因表达至关重要。然而,……阅读更多 »转录因子 DDIT3/CHOP 的基因组结合位点和直接靶基因的鉴定。发布时间:2022 年 11 月摘要:DDIT3 是一种受到严格调控的碱性亮氨酸拉链 (bZIP) 转录因子和细胞应激反应的关键调节因子.它参与多种病理状态,并可能引起细胞周期阻滞和细胞凋亡。这也牵连……阅读更多»检查青春期化疗的世代影响:异环磷酰胺和表观遗传跨代遗传的潜力发表时间:2022 年 11 月摘要:当前的研究旨在使用啮齿动物模型来确定青春期是否接触化疗药物异环磷酰胺可以在世博会的后代中诱导改变的表型和疾病sed 个体通过表观遗传转基因……阅读更多 »VEGF 信号基因的心脏表观遗传变化与实验性慢性肾脏病中的心肌微血管稀疏相关。发表时间:2022 年 11 月摘要:背景:慢性肾脏病 (CKD) 在心力衰竭患者中很常见, 并且经常导致左心室舒张功能障碍 (LVDD)。然而,导致 CKD-LVDD 心脏损伤的机制仍有待阐明。 Epig...阅读更多 »癌细胞适应性和增殖所需的增强剂的系统发现和功能剖析。发表时间:2022 年 11 月摘要:人类基因组中功能验证增强剂的缺乏对理解这些顺式调控元件的贡献构成了重大障碍对人类疾病。我们进行高度复用的基于 CRISPR 的扰动和测序……阅读更多»组蛋白去乙酰化酶 1 和 2 肾单位的靶基因调控网络ors 来控制肾发生。发布时间:2022 年 11 月摘要:我们的研究证明了组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 在肾发生调节中的关键作用。为了更好地了解 HDAC1/2 在早期肾发生中调节的关键通路,我们进行了染色质免疫沉淀测序……阅读更多 »选择性组蛋白脱乙酰酶 6 抑制在铜绿假单胞菌感染小鼠模型中的功效:减少囊性纤维化炎症和感染的新视角. 发布时间:2022 年 10 月摘要:最新研究确定组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 类酶是囊性纤维化 (CF) 炎症的复杂分子机制的战略组成部分。为 HDAC6 同种型提供了令人信服的新支持,因为...阅读更多»端粒蛋白 TERF2/TRF2 损害 HMGB1 驱动的自噬。发表时间:2022 年 10 月摘要:TERF2/TRF2 是一种多效性端粒蛋白,在肿瘤形成中起着至关重要的作用和通过几个端粒依赖和独立机制的进展。在这里,我们发现了这种蛋白质在调节宏观方面的新功能……阅读更多»类风湿性关节炎成纤维细胞样滑膜细胞的系统生物学分析涉及细胞系特异性转录因子功能。发表时间:2022 年 10 月摘要:类风湿性关节炎 (RA)是一种影响动关节的免疫介导疾病,尽管治疗有所改进,但仍未满足医疗需求。这种局限性可能反映了 RA 致病途径的多样性,个体患者……阅读更多»原发性人类淋巴瘤 B 细胞的病毒转导揭示了 NOTCH 介导的免疫逃逸机制。发表时间:2022 年 10 月摘要:PEST 域中的热点突变NOTCH1 和 NOTCH2 在 B 细胞恶性肿瘤中反复发现。为了解决 NOTCH 突变如何导致不良预后,我们从患有梭状芽胞杆菌的患者中生成了同基因原代人肿瘤细胞。.阅读更多 »维生素 C 增强 NF-κB 驱动的表观基因组重编程并增强树突状细胞的免疫原性。发表时间:2022 年 10 月摘要:树突状细胞 (DC) 是最有效的抗原呈递细胞,对于有效激活幼稚 T 细胞是必需的细胞。 DC 的免疫学特性会根据各种刺激进行调节。活性 DNA 去甲基化对 DC d 至关重要……阅读更多 »卫星 Eupsilia transversa (Hufnagel,1766) 的基因组序列发表时间:2022 年 10 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Eupsilia transversa(卫星;节肢动物)的基因组组装;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)。基因组序列跨度为 467 兆碱基。整个程序集 (100%) 被搭建成 32 条染色体 ps...阅读更多 »常见黄燕尾凤蝶的基因组序列(林奈,1758 年)发布时间:2022 年 10 月摘要:我们展示了来自个体的基因组组装雌性凤蝶 (the常见的黄色燕尾鱼;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;凤蝶科)。基因组序列跨度为 252 兆碱基。大多数组件 (99.97%) 是脚手架……阅读更多»小鼠卵子发生晚期的过渡阶段影响早期胚胎的 DNA 甲基化。发表时间:2022 年 10 月摘要:精心策划的卵母细胞生长和分化程序导致具有发育能力的卵母细胞。在晚期卵子发生中,生发泡卵母细胞 (GVO) 经历染色质重塑,伴随着 NSN 的转录沉默(n...阅读更多 »使用分泌的荧光素酶监测小鼠体细胞 CRISPR 基因编辑诱导的原地肺肿瘤。发布时间:2022 年 10 月摘要:背景:使用 CRISPR 核酸酶对体细胞进行体内基因编辑促进了小鼠本土肿瘤的产生,这些肿瘤是由与人类疾病相关的基因改变引发的,并沿着自然时间线进展为……阅读更多 »训练有素的我免疫力提供针对斑点鲶鱼细菌感染的长期保护。发布时间:2022 年 10 月摘要:β 葡聚糖暴露在斑点鲶鱼中诱导训练有素的免疫力,从而在暴露一个月后提供针对细菌感染的长期保护。流式细胞术分析表明,孤立的巨噬细胞和嗜中性粒细胞被吞噬得更高……阅读更多»链接阅读全基因组测序解决了多发性骨髓瘤中常见和私有的结构变异。发表时间:2022 年 9 月摘要:多发性骨髓瘤 (MM) 是一种无法治愈的侵袭性血浆细胞恶性肿瘤的特征是具有多个结构变异 (SV) 和拷贝数变异 (CNV) 的复杂核型。链接读取全基因组测序 (lrWGS) 允许重新...阅读更多»抑制和 3D 重组解决了基因组进化重新排列的监管冲突。发布时间:2022 年 9 月摘要:监管环境驱动复杂的发育基因表达,但它尚不清楚在进化过程中结合新基因和功能时如何保持它们的完整性。在这里,我们研究了胎盘哺乳动物特异性基因,...阅读更多»核体增强苏门化的探索揭示了 PML 抑制胚胎干细胞的 2 细胞特征。发表时间:2022 年 9 月摘要:无膜细胞器是凝结物形成的通过相分离,其功能往往仍然是个谜。在氧化应激下,PML 支架核体 (NB) 来调节衰老或代谢适应。 PML NBs 招募了许多合作伙伴保护……阅读更多»DNA 甲基化对 H3K9me3 对内胚层 IAP 沉默的主导作用。发表时间:2022 年 9 月摘要:内源性逆转录病毒 (ERV) 的沉默主要由抑制性染色质修饰 H3K9me3 和 DNA 甲基化介导。在 ERVs 上,这些修饰主要由组蛋白甲基转移酶 Setdb1 和维护 DNA 沉积……阅读更多»A complex epigenome-splicing 串扰控制着转移和大脑发育中的上皮-间质转化。发表时间:2022 年 8 月摘要:上皮-间质转化 (EMT) 呈现上皮细胞迁移特性。虽然 EMT 涉及表观遗传和剪接变化,但控制它们串扰的机制仍然知之甚少。我们在这里发现……阅读更多 »维生素 D 受体和 STAT6 相互作用组控制食管上皮屏障对 IL-13 信号的反应。发表时间:2022 年 8 月摘要:目的:维生素 D (VD) 缺乏对过敏性疾病发病机制的影响仍然存在难以捉摸。我们旨在确定 VD 对食管过敏性炎症的影响。设东癌死亡率和目前的研究发现组蛋白去甲基化酶,KDM2A,表达与乳腺癌转移呈负相关。 KDM2A 敲低极大地促进了乳腺的迁移和侵袭……阅读更多»不同的消音器状态产生异染色质的表观遗传状态。发表时间:2022 年 8 月摘要:异染色质位点可以在基因相同的细胞中表现出不同的转录状态。一个流行的模型假设修饰组蛋白的遗传足以遗传沉默状态。然而,沉默遗传 ...阅读更多 »来自克隆胚胎的 bESC 不保留来自体细胞供体细胞的转录组学或表观遗传记忆。发表时间:2022 年 8 月摘要:胚胎干细胞 (ESC) 无限期地维持囊胚外胚层的多能状态。干细胞对于研究发育和谱系承诺非常宝贵,在家畜中,它们构成了基因组改进和……阅读更多和raquo;组蛋白赖氨酸去甲基化酶抑制重编程前列腺癌代谢和力学。发布时间:2022 年 8 月摘要:目的:雄激素受体 (AR) 的异常活性是前列腺癌 (PCa) 和去势抵抗性前列腺癌 (CRPC) 发展和进展的主要原因.雄激素信号调节基因转录和脂质代谢,...阅读更多»拟南芥 APOLO 和人类 UPAT 序列无关的长非编码 RNA 可以调节植物中的 DNA 和组蛋白甲基化机制。发表时间:2022 年 8 月摘要:背景:RNA-DNA 杂交(R-环)相关的长非编码 RNA(lncRNA),包括拟南芥 lncRNA 生长素调节启动子环(APOLO),正在成为三维染色质构象和基因转录的重要调节因子……阅读更多 »组蛋白 H3K36me2 和 H3K36me3 形成一个小鼠卵母细胞中 DNMT3A 依赖性 DNA 甲基化必不可少的染色质平台。发布时间:2022 年 8 月摘要:建立由 DNMT3A-DNMT3L 复合物介导的哺乳动物卵母细胞的 DNA 甲基化景观对于繁殖和发育至关重要。在小鼠卵母细胞中,高水平的 DNA 甲基化仅发生在转录过程中……阅读更多»下游增强子区域的表观遗传重塑与分化的人角质形成细胞中 IL1F10 基因的选择性表达有关。发表时间:2022 年 8 月摘要:白细胞介素 (IL)-由 IL1F10 基因编码的 38 是 IL-1 细胞因子家族的成员。 IL-38 在健康人的上皮细胞中组成型表达,特别是在皮肤的表皮角质形成细胞中。 IL-38 的表达与...阅读更多»延长的 FOS 活性通过改变原代肌肉祖细胞中的 3D 染色质结构来破坏全球肌源性转录程序。发表时间:2022 年 8 月摘要:背景:AP-1 转录因子,FBJ 骨肉瘤致癌基因( FOS), 在成人肌肉卫星细胞 (SCs) 中被诱导在肌肉损伤后的数小时内,是有效的干细胞激活和肌肉修复所必需的。然而,为什么 FO...阅读更多 »启动子 DNA 甲基化的大规模操作揭示了特定于上下文的转录反应和稳定性。发表时间:2022 年 7 月摘要:背景:胞嘧啶 DNA 甲基化被广泛描述为具有沉默能力的转录抑制标记发起人。表观基因组工程技术能够直接测试诱导 DNA 甲基化对内源性前体的影响……阅读更多 »HOTAIR 与 PRC2 复合体相互作用,调节区域前脂肪细胞转录组和人体脂肪分布。发表时间:2022 年 7 月摘要:区域人体脂肪组织的管理机制(AT ) 发展仍未定义。在这里,我们表明长链非编码 RNA HOTAIR(HOX 转录物反义 RNA)仅在臀股骨 AT 中表达,它对脂肪细胞至关重要……阅读更多 »小鸡胚胎热调节通过调节元件的甲基化诱导跨代热/免疫弹性。发布时间:2022 年 7 月摘要:关于行为特征是否可遗传的问题正在争论中。证明哺乳动物跨代遗传的一个障碍源于母体环境对后代表型的影响。在这里,我们在 ovo 胚胎中使用...阅读更多 »外胚层诱导剂在体外捕获小鼠滋养外胚层干细胞,并在子宫内植入母细胞。发表时间:2022 年 7 月摘要:胚胎指导细胞状态的分配以空间调节功能。在囊胚中,滋养层 (TR) 细胞的图案化可确保成功着床和胎盘发育。在这里,我们定义了一组最佳分子秒...阅读更多»Nox4 通过染色质重塑促进内皮分化。发表时间:2022 年 7 月摘要:基本原理:Nox4 是一种组成型活性 NADPH 氧化酶,不断产生低水平的 ofHO。因此,Nox4 有助于细胞稳态和长期过程,例如分化。 Nox4 在内皮细胞中的高表达……阅读更多»基于 CRISPR 的转录激活剂的系统比较揭示了增强子-启动子相互作用的基因调控特征。发表时间:2022 年 7 月摘要:基于核酸酶灭活的 CRISPR/Cas(dCas-基于)的系统已经成为综合重塑人类表观基因组和基因表达的强大技术。尽管越来越多地采用这些平台,但它们的相对效力和机制……阅读更多»表观基因组分析揭示了与先天免疫激活和耐受相关的动态和特定背景的巨噬细胞增强剂景观。发布时间:2022 年 6 月摘要:背景:染色质状态和增强剂关联基因表达、细胞身份和疾病。在这里,我们根据人类巨噬细胞增强子活性系统地描述了对内毒素的急性先天免疫反应并与 endot 形成对比……阅读更多 »核受体 RORγ 反向激动剂/拮抗剂通过改变染色质可及性和主调节器 SREBP2 占用的不同活动显示组织和基因背景选择性。发表时间:2022 年 6 月摘要:核受体 RORγ 是主要驱动因素由于其在 T 辅助 17 (Th17) 细胞分化和肿瘤胆固醇代谢中的异常功能,自身免疫性疾病和某些类型的癌症。复合筛选使用 t...阅读更多»组蛋白脱乙酰酶 15 和 MOS4 相关复合亚基 3A/3B 共同调节 ABA 反应基因的内含子保留。发表时间:2022 年 6 月摘要:组蛋白脱乙酰酶 (HDAs) 在多种转录调控中发挥重要作用生物过程。在这项研究中,我们研究了 HDA15 在脱落酸 (ABA) 反应中的功能。我们使用免疫纯化结合质量……阅读更多 »NSUN2-mediated RNA mC modification modulates uv黑色素瘤细胞增殖和迁移。发表时间:2022 年 6 月摘要:RNA 5-甲基胞嘧啶 (mC) 是一种广泛的转录后修饰,通过控制 RNA 代谢参与多种生物过程。然而,它在葡萄膜黑色素瘤 (UM) 中的作用仍然未知。在这里,我们描述了生物学作用……阅读更多 »TRF2 与 CTCF 合作控制结直肠癌中的 oncomiR-193b-3p。发表时间:2022 年 5 月摘要:端粒重复结合因子 2 (TRF2),一种参与端粒的关键蛋白完整性,在几种人类癌症中过度表达并促进肿瘤形成和进展。最近,TRF2 也被发现在端粒外,在那里它可以……阅读更多»动物母体 mRNA 的 massivemC 修饰的发育 mRNA mC 景观和监管创新。发表时间:2022 年 5 月摘要:mC 是已知最长的 RNA 修饰之一然而,它在 mRNA 中的发育动力学、功能和进化仍然很大你不知道。在这里,我们在 6 种脊椎动物和 inv 的不同发育阶段生成定量 mRNA mC 图……阅读更多 »HIRA 支持乙型肝炎病毒微染色体在受感染的肝细胞中的建立和转录活性。发表时间:2022 年 5 月摘要:背景& 目的:关于肝炎B 病毒 (HBV) 感染,部分双链病毒 DNA 转化为共价闭合环状染色质游离结构 (cccDNA)。这种形式代表了长寿基因组库的反应……阅读更多 »UHRF1 在潜伏 HIV-1 的表观遗传抑制中的新作用。发表时间:2022 年 5 月摘要:背景:人类免疫缺陷的多样性、异质性和动态性质1 型病毒 (HIV-1) 潜伏机制反映在目前缺乏针对 HIV-1 的功能性治愈。因此,所有类别的潜伏期逆转剂……阅读更多»MiR-129-5p 在肝细胞癌中发挥 Wnt 信号依赖性肿瘤抑制功能通过直接靶向肝细胞瘤衍生生长因子 HDGF 来治疗肝癌。发表时间:2022 年 5 月摘要:背景:在肝细胞癌 (HCC) 中,组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 经常过度表达。这导致染色质压缩和肿瘤相关基因和 microRNA 的沉默。 microRNA 表达的调节是一种潜在的 tr...阅读更多»PHF13 表观遗传激活 TGFβ 驱动的上皮细胞向间充质转化发表时间:2022 年 5 月摘要:表观遗传改变是肿瘤转移的关键因素。 PHD 指蛋白 13 (PHF13) 是最近发现的 H3K4me2/3 的表观遗传阅读器,可作为转录共调节因子。在这项研究中,我们证明 PHF13 是必需的……阅读更多 »中性粒细胞增强子 PU.1 结合和染色质环的变化影响自身免疫性疾病易感性发表时间:2022 年 5 月摘要:中性粒细胞在先天炎症反应、适应性免疫形成和适应性免疫中发挥基础作用已经确定了一个这是一种潜在的因果细胞类型,支持与免疫系统特征和疾病的遗传关联 2,3 大多数……阅读更多 »GSK-J4 对小鼠前列腺癌异种移植物中 JMJD3 组蛋白去甲基化酶的影响发表时间:2022 年 5 月摘要:背景/目标:组蛋白甲基化状态是控制基因表达所必需的。 H3K27me3 是组蛋白 H3 的表观遗传三甲基化修饰,由去甲基化酶 JMJD3 控制。 JMJD3 在多种癌症中失调,并且……阅读更多 »介导软骨细胞细胞状态转变的表观遗传机制发表时间:2022 年 5 月摘要:表观遗传修饰在调节细胞谱系分化中起着关键作用,但表观遗传机制在一个细胞内指导特定分化步骤细胞谱系很少被研究。为了破译这些机制,我们使用了……阅读更多»巨噬细胞编程受脂肪酸结合蛋白 5 和过氧化物酶之间的协同作用调节增殖物激活受体γ。发表时间:2022 年 5 月摘要:炎症的消退是一个受到严格调控以实现修复和组织稳态的活跃过程。在没有解决方案的情况下,持续性炎症是慢性肺部疾病(如慢性阻塞性肺病)发病机制的基础……阅读更多 » 荠菜 (L.) 初级和次级休眠种子中的全球 DNA 甲基化和细胞 5-甲基胞嘧啶和 H4 乙酰化模式医生。 (荠菜)。发表时间:2022 年 5 月摘要:尽管休眠和休眠循环对于植物的适应性和生命周期物候学具有重要意义,但缺乏对不同种子休眠状态下跨时空的全局和细胞表观遗传模式的全面表征。 ..阅读更多 »生长素反应因子 16 (StARF16) 在马铃薯感染坏死性病原体后调节防御基因 StNPR1。发布时间:2022 年 4 月摘要:我们在 t 中展示了一种新的调节机制茉莉酸 (JA) 和水杨酸 (SA) 介导的马铃薯防御反应串扰,其中,miR160 靶向 StARF16(一种参与生长发育的基因)与 StNPR1 的启动子结合(……阅读更多 »ACTL6a 坐标轴突口径周围神经的识别和髓鞘形成。发表时间:2022 年 4 月摘要:细胞根据外部信号制定转录程序。在周围神经中,雪旺细胞 (SC) 对给定口径的轴突进行分类,并开始将它们的膜包裹在轴突周围的过程。我们识别肌动蛋白样蛋白 6a(ACT...阅读更多 »CpG 岛结合蛋白 SAMD1 有助于 HepG2 肝细胞癌细胞中的不利基因特征。发表时间:2022 年 4 月摘要:未甲基化的 CpG 岛结合蛋白 SAMD1 在许多人类中上调癌症类型,但其与癌症相关的作用尚未得到研究。在这里,我们使用肝细胞癌细胞系 HepG2 作为癌症模型并进行研究ed t...阅读更多 »MLL-AF4 及其鼠化 pSer 变体正在开启核仁应激通路。发表时间:2022 年 4 月摘要:背景:最近对 MLL-AF4 融合蛋白的病理分子研究表明,MLL 的鼠化版本-AF4,MLL-Af4 融合蛋白,在小鼠或人类造血干细胞/祖细胞中表达时能够诱导白血病(……阅读更多»评估 TET1 基因表达、DNA 甲基化和 H3K27me3 其在位子宫内膜启动子区域的水平子宫内膜异位症和不孕症女性的研究。发表时间:2022 年 4 月摘要:子宫内膜异位症是不孕症的原因。子宫内膜异位症女性的在位子宫内膜表现出多种基因的异常表达模式。TET1 蛋白在子宫内膜异位症和相关不孕症发病机制中的作用尚不清楚s...阅读更多»在层相关域中的局部常染色质富集预期它们在脂肪形成谱系中的重新定位。发布时间:4 月, 2022 摘要:背景:染色质通过层相关结构域 (LAD) 与核层的相互作用赋予基因组结构稳定性。分化过程中 LAD 定位的动态,以及 LAD 如何影响发育基因前……阅读更多 »ZWC 复合物介导的 SPT5 磷酸化抑制活性基因启动子处的 divergentantisense RNA 转录。发表时间:2022 年 4 月摘要:人类基因组编码大量数据非编码 RNA,包括转录起始位点 (TSS) 处的不同反义转录本。然而,尚未详细说明调节不同反义转录的分子机制……阅读更多»免疫疾病变异调节调节性 CD4T 细胞中的基因表达。发表时间:2022 年 4 月摘要:识别因疾病相关变异而失调的细胞功能可能涉及细胞疗法中药物靶向或调节的新途径。然而,后续研究可能会受到质疑如果与疾病相关的细胞类型是困难的...阅读更多»SMYD5 是一种组蛋白 H3 特异性甲基转移酶,介导组蛋白 H3 赖氨酸 36 和 37 的单甲基化。发表时间:2022 年 4 月摘要:尽管翻译后修饰 (-PTM)尽管一些组蛋白 H3 赖氨酸残基得到了很好的研究,但哺乳动物细胞中组蛋白 H3 赖氨酸 37 的 PTM 在很大程度上仍然未知。在这项研究中,我们提供证据表明 SMYD 家族成员 5...阅读更多»环境诱导的跨代遗传影响疾病病因学中的系统表观遗传学。发表时间:2022 年 4 月摘要:环境毒物已被证明可通过以下方式促进疾病的表观遗传跨代遗传暴露种系中特定的表观遗传改变。目前的研究检查了碳氢化合物喷气燃料、二恶英、pe……阅读更多»白血病保护性种系变异体通过转录因子成核介导染色质模块形成。发表时间:4 月,2022 摘要:非编码变异协调转录因子 (TF) 结合和染色质标记富集在跨越 >100kb 的区域发生变化。这些分子协调的区域被命名为\"可变染色质模块”(VCM),提供了一个概念……阅读更多»KRAB-dCas9 + DNMT3 和 Ezh2-dCas9 + DNMT3 即时表观基因组编辑的可遗传基因沉默的决定因素。已发布: 2022 年 4 月摘要:作为一种在不改变遗传信息的情况下调节基因表达的方法,精准的表观基因组编辑受到了广泛关注。然而,一个主要的限制因素是基因表达的变化通常是短暂的,不像 l...阅读更多 »CREBBP/EP300 乙酰转移酶抑制破坏 FOXA1 结合的增强子以抑制 ER+ 乳腺癌细胞的增殖。发表时间:3 月, 2022 摘要:雌激素受体 (ER) 的治疗靶向是一种经过临床验证的治疗雌激素受体阳性乳腺癌 (ER+ BC) 的方法,但持续的反应受到获得性抵抗的限制。针对转录共激活因子需要……阅读更多»GBS-MeDIP:一种用于并行识别同一基因组减少部分中个体遗传和表观遗传变异的协议。发布时间:2022 年 3 月摘要:GBS-MeDIP 协议结合了先前描述的两种技术,基因分型测序 (GBS) 和甲基化 DNA 免疫沉淀 (MeDIP)。我们的方法允许对...中的遗传和甲基组学变异进行并行且具有成本效益的审讯……阅读更多»H3K9 二甲基化保护癌细胞免受干扰素通路的激活。发表时间:2022 年 3 月摘要:干扰素基因的激活构成了一个重要的抗癌通路,能够限制癌细胞的增殖。在这里,我们证明 H3K9me3 组蛋白甲基转移酶 (HMT) 抑制器的杂色 3-9 同系物 1 (SUV39H1) 是 r...阅读更多 »N6-腺嘌呤 DNA 免疫沉淀的评估真核生物中基于 n 的基因组分析发布时间:2022 年 3 月摘要:低丰度 DNA N6-甲基腺嘌呤 (DNA-m6A) 的检测仍然具有挑战性,限制了我们对真核生物中这种新型碱基的理解。为了解决这个问题,我们引入了一种系统地验证选择性和敏感性的方法……阅读更多»早产颊细胞表观遗传生物标志物以促进预防医学。发布时间:2022 年 3 月摘要:早产是影响新生儿和婴儿死亡率的主要原因每十个活产中就有一个。目前的研究旨在开发一种表观遗传生物标志物,用于使用来自母亲的口腔细胞进行早产易感性……阅读更多»禽流感病毒通过 SSU72 诱导反转录阅读来抑制先天免疫。发布时间:2022 年 3 月摘要:先天免疫发挥作用关键的抗病毒作用。高毒力禽流感病毒 (AIV) H5N1、H7N9 和 H5N6 可以更好地逃逸宿主比毒性较低的季节性 H1N1 病毒更能产生天然免疫反应。在这里,我们报告了一种机制,通过该机制……阅读更多 »ERK1/2 在小鼠受精卵中调节父本 5mC 氧化和 H3K9me2 不对称性。发表时间:2022 年 3 月摘要:背景:细胞外信号调节激酶 (ERK) 直接决定细胞命运在早期开发过程中。 H3K9me2、从头 5mC 及其氧化物的沉积之间错综复杂的相互作用影响合子表观基因的重塑……阅读更多»反义非编码转录抑制 PHO5 模型 genevia 启动子染色质结构重塑发布时间:2022 年 2 月摘要:普遍转录真核基因组产生具有调节潜力的非编码转录物。我们检测了非编码反义转录对酵母 PHO5 基因表达调控的影响,这是一个典型案例……阅读更多 »根木质部相邻细胞层中的细胞类型特异性转录网络 Published:2022 年 2 月摘要:通过木质部导管将水、离子和信号从根部输送到叶片对植物生命至关重要,需要严格监管。在进入枝条之前,蒸腾流的最终组成由 xy 控制……阅读更多»筛选 ETO2-GLIS2 诱导的超级增强剂确定急性巨核细胞白血病中可靶向的合作依赖性。发表时间:2022 年 2 月摘要:超级增强剂(SEs ) 是与细胞身份和疾病相关的调控元件簇。然而,这些元素是否由致癌基因诱导并可以调节基因模块合作进行癌细胞转化或维持 r...阅读更多»父本印记的表观遗传完整性增强了雄激素单倍体胚胎干细胞的发育潜力。发表时间:2022 年 2 月摘要:The使用 Mek1/2 和 Gsk3β (2i) 的两种抑制剂促进小鼠二倍体和单倍体胚胎的产生分别来自双亲和单亲胚泡的内细胞团的干细胞 (ESC)。然而,一个系统能够实现长 t...阅读更多»在删除酰化 pleckstrin 同源结构域蛋白后,对 Plasmodiumyoelii 中 MTRAP 和 AMA1 分泌的不同影响。发表时间:2022 年 2 月摘要:疟原虫是疟疾的病原体,是专性细胞内生物。在人类中,发病机制是由血液阶段寄生虫引起的,它在红细胞内繁殖,因此红细胞入侵是必不可少的发育步骤。 M...阅读更多 »多发性骨髓瘤表观遗传景观的综合表征发表时间:2022 年 1 月摘要:背景:人类多发性骨髓瘤 (MM) 细胞系 (HMCL) 已被广泛用于了解驱动 MM 生物学的分子过程。表观遗传修饰参与 MM 的发展、进展和耐药性。一个全面的 ...阅读更多 »斯特拉调节通过调节染色质结构和 DNA 甲基化开发女性生殖系干细胞。发布时间:2022 年 1 月摘要:女性生殖系干细胞 (FGSC) 具有自我更新和分化为卵母细胞的能力。 ,由母体效应基因编码,在卵子发生和早期胚胎发育中起着重要作用。然而,它在 FGSC 中的功能仍然未知……阅读更多»GSK-J4 对小鼠前列腺癌异种移植物中 JMJD3 组蛋白去甲基化酶的影响。发表时间:2022 年 1 月摘要:背景/目的:组蛋白甲基化状态是控制基因表达所必需的。 H3K27me3 是组蛋白 H3 的表观遗传三甲基化修饰,由去甲基化酶 JMJD3 控制。 JMJD3 在多种癌症中失调,并且具有 b...阅读更多 »多发性骨髓瘤表观遗传景观的综合表征发表时间:2022 年 1 月摘要:背景:人类多发性骨髓瘤 (MM) 细胞系 (HMCL) 已被广泛用于了解分子p驱动 MMbiology 的过程。表观遗传修饰参与 MM 的发展、进展和耐药性。综合……阅读更多»人类着丝粒的形成激活转录并打开染色质纤维结构发布时间:2022 年 1 月摘要:人类着丝粒在有丝分裂染色体上表现为收缩,并形成有丝分裂中动粒组装的平台。生物物理实验表明,着丝粒区域的重复 DNA 形成一个紧凑的支架,对于……阅读更多 »用组蛋白修饰预配置染色质结构指导小鼠胚胎中的造血干细胞形成。发表时间:2022 年 1 月摘要:基础基因活动细胞分化受多种转录因子 (TF)、组蛋白修饰、染色质结构等的调节。尽管已知最终的造血干细胞 (HSC) 是通过 endot 出现的……阅读更多»NuA4 和 H2A.Z 控制环境al 拟南芥中的反应和自养生长 发表时间:2022 年 1 月摘要:H4 的核小体乙酰转移酶 (NuA4) 是真核生物中必不可少的转录共激活因子,但在植物中的特征仍然很差。在这里,我们描述了多梳样 1 的 NuA4 支架蛋白增强子的拟南芥同系物(AtE……阅读更多»DNMT1 以酶活性依赖性方式调节小鼠胚胎干细胞中 DNMT3 的 DNA 甲基化时间。发表时间:1 月, 2022 摘要:DNA 甲基化(DNAme;5-甲基胞嘧啶,5mC)在哺乳动物发育中起着重要作用,而 5mC 分布受相反酶活性平衡的调节:DNA 甲基转移酶 (DNMT) 和十一易位双氧酶……阅读更多 »协调的糖皮质激素受体和 MAFB 作用诱导树突状细胞的耐受发生和表观基因组重塑发表时间:2022 年 1 月摘要:摘要糖皮质激素 (GCs) 在 i 中发挥有效的抗炎作用免疫细胞通过糖皮质激素受体 (GR)。树突状细胞 (DC),协调免疫反应的核心参与者,获得致耐受性以响应……阅读更多 »黑腹果蝇核糖体蛋白中的单个氨基酸突变:对 uL11 转录活性的洞察。发表时间:2022 年 1 月摘要:核糖体蛋白 uL11 位于核糖体 P-stalk 的基础上,在翻译效率中起着至关重要的作用。此外,没有可用的 uL11 突变体表明该基因与许多其他核糖体一样是单倍体不足的……阅读更多 »Mod (mdg4) 变体通过阻断亚端粒增强子来抑制端粒逆转录转座子 HeT-A 发表时间:2022 年 1 月摘要:果蝇中的端粒是由连续的非 LTR 反转录转座子组成:HeT-A、TART 和 TAHRE。尽管它们在种系中受到 piRNA 通路的抑制,但人们对这些反转录转座子在体细胞中的调节方式知之甚少……阅读更多和raquo;癌症相关成纤维细胞亚群中由 TGF-β1 调节的趋化因子开关决定了化学免疫疗法的功效。发表时间:2022 年 1 月摘要:结合免疫原性细胞死亡诱导化疗和 PD-1 阻断可以产生显着的肿瘤反应。现在已经确定,TGF-β1 信号是治疗耐药性的主要组成部分,并有助于癌症再发生……阅读更多 »27-羟基胆固醇,雌激素受体调节剂,改变乳腺癌中的 DNA 甲基化。发表时间:2022 年 1 月摘要:27-羟基胆固醇 (27-HC) 是第一个已知的内源性选择性雌激素受体调节剂 (SERM),其高于正常水平的升高与乳腺癌密切相关。大量证据表明异常的表观遗传信号……阅读更多 »KMT2C 的缺失会重新编程 hPSC 中的表观基因组景观,导致 NODAL 过度表达和造血内皮规范化失败。发布时间:2022 年 1 月Abstract:KMT2 赖氨酸甲基转移酶家族的种系或体细胞变异与多种先天性疾病和癌症有关。值得注意的是,-融合在 70% 的婴儿白血病中普遍存在,但未能对短潜伏期进行表型复制……阅读更多 »雄激素受体和 MYC 平衡集中在发育超级增强子上发布时间:2021 年 12 月摘要:雄激素受体 (AR) 在前列腺癌 (PCa) 中的作用) 可以驱动包括 MYC 在内的多个基因的转录抑制,超生理雄激素对某些患者有效。在这里,我们表明这种抑制与 AR 染色质无关……阅读更多 »长链非编码 RNA H19 调节神经内分泌前列腺癌中的肿瘤可塑性发表时间:2021 年 12 月摘要:神经内分泌 (NE) 前列腺癌 (NEPC) 是一种致命的阉割亚型-抗性前列腺癌 (PCa) 从头发生或由雄激素剥夺治疗后的转分化前列腺腺癌引起(ADT)。广泛的计算机...阅读更多»在散发性阿尔茨海默氏病的早期阶段,人类眶额皮质中 OR 和 TAS2R 基因表达的表观遗传沉默发表时间:2021 年 12 月摘要:最近在神经系统疾病中报道了大脑嗅觉 (OR) 和味觉受体 (TASR) 表达的调节.我们探索了散发性 Alz 的人眶额皮质中选定的 OR 和 TASR 基因的可能表达和调控……阅读更多 »热休克转录因子程序胰岛素样信号通路的基因书签。发表时间:2021 年 12 月摘要:母体压力可以对后代具有持久的表观遗传效应。为了研究压力如何触发表观遗传变化,我们研究了激活通用应激反应热休克转录因子 HSF-1 在 ge 中的作用……阅读更多 »Epromoters 作为一个枢纽来招募炎症所需的关键转录因子回复发布时间:11 月 2 日021 摘要:基因表达受基因近端(启动子)和远端(增强子)调控元件的参与控制。我们之前的结果表明,基因启动子的一个子集,称为 Epromoters,作为真正的增强子和调节器工作……阅读更多»比较用来自快速/糖酵解和慢速/氧化肌肉的 PCM1 抗体纯化的肌核中的表观遗传景观。已发布: 2021 年 11 月摘要:肌肉细胞具有适应不同用途的不同表型,大致可分为快速/糖酵解和慢速/氧化类型。虽然大多数肌肉含有此类纤维类型的混合物,但我们的目标是提供全基因组分析……阅读更多 »转录激酶 Ctk1 和 Bur1 的条件性消耗以及对共转录剪接体组装和前 mRNA 剪接的影响。已发布: 2021年11月摘要:从酵母到人类,pre-mRNA剪接主要发生在共转录上,具有剪接和转录功能盟友耦合,使他们相互影响。共转录剪接的招募模型提出核心成员 ...阅读更多 »ATRX 调节 IDH 突变神经胶质瘤中的神经胶质特性和肿瘤微环境发表时间:2021 年 11 月摘要:背景 最近的单细胞转录组学研究报告说,IDH 突变神经胶质瘤共享一个细胞表型的共同层次结构,独立于遗传亚型。然而,IDH 突变神经胶质瘤亚型之间的遗传差异具有预后意义……阅读更多»短链脂肪酸校准 RARα 活性调节食物致敏发布时间:2021 年 10 月摘要:肠道微生物群失调与过敏性疾病有关。肠道菌群失调导致食物过敏加重的机制尚不清楚。视黄酸受体 α (RARα) 信号的调节对肠道免疫至关重要……阅读更多 »从血吸虫感染中自我治愈的恒河猴可以显示对 c 的完全免疫hallenge 发表时间:2021 年 10 月摘要:恒河猴提供了针对血吸虫获得性免疫的独特模型,血吸虫在全球范围内折磨着 2 亿人。通过监测寄生虫-肠道衍生抗原的血流水平,我们表明从第 10 周开始建立……阅读更多 »Rett 综合征与小鼠模型中形成 MeCP2/Rbfox/LASR 复合体的缺陷有关发表时间:2021 年 10 月摘要:Rett 综合征(RTT) 是一种严重的神经系统疾病,是年轻女性智力障碍的主要原因。 RTT 主要是由编码甲基-CpG 结合蛋白 2 (MeCP2) 的 X 连锁基因中发现的突变引起的。尽管有广泛的研究……阅读更多»SETD2 介导的非经典 Wnt5A 在破骨细胞生成过程中的表观遗传调控发布时间:2021 年 10 月摘要:图形摘要为了定义 SETD2 在破骨细胞生成背景下 WNT5a 信号传导中的作用,我们利用了两种不同的模型:体外破骨细胞差异化和 K/BxN血清诱导的关节炎模型。我们发现 SETD2 和 WNT5...阅读更多 »p300 抑制骨髓增生异常综合征向急性髓性白血病的转变发布时间:2021 年 10 月摘要:骨髓增生异常综合征 (MDS) 是造血干细胞和祖细胞 (HSPC) 的恶性肿瘤,其特征是造血无效和风险增加白血病转化。表观遗传调节因子在 MDS 中反复发生突变,直接...阅读更多»追踪原始生殖细胞从双层盘兔胚胎和多能干细胞的出现。发表时间:2021 年 10 月摘要:兔胚胎在原肠胚形成时发育为双层盘,就像人类和大多数人一样其他哺乳动物,而啮齿类动物发育成蛋筒。根据对 m 的许多系统研究,原始生殖细胞 (PGC) 似乎起源于原肠胚形成过程……阅读更多 »NR4A1 调节即刻早期基因的表达,抑制癌症中的复制应激。发表时间:2021 年 10 月摘要:癌症中致癌信号的失调会触发复制压力。立即早期基因 (IEG) 在压力信号后快速和瞬时表达,有助于综合反应。在这里,我们发现孤儿核 ...阅读更多 »Vav1、Syk 和 β-catenin 之间的调节相互作用发生在肺癌细胞中。发表时间:2021 年 10 月摘要:Vav1 作为衔接蛋白和细胞骨架调节剂表现出两种信号转导特性通过其鸟嘌呤核苷酸交换因子模块进行组织。尽管 Vav1 的表达仅限于造血谱系,但我……阅读更多 »MICAL1 调节肌动蛋白细胞骨架组织、定向细胞迁移和人乳腺癌细胞作为原位异种移植肿瘤的生长。发表时间:2021 年 10 月摘要:与 CasL 相互作用的分子1 (MICAL1) 单加氧酶已通过肌动蛋白氧化成为细胞骨架组织的重要调节剂。虽然灯丝美国肌动蛋白 (F-actin) 增加 MICAL1 单加氧酶活性、过氧化氢 (H2O...阅读更多 »小鼠小脑和皮质星形胶质细胞区域特异性转录程序的表观遗传控制。发表时间:2021 年 9 月摘要:来自大脑皮层 (CTX) 的星形胶质细胞and cerebellum (CB) share basic molecular programs, but also form distinct spatial and functional subtypes. The regulatory epigenetic layers controlling such regional diversity have not been comprehensive...阅读更多»增强子或启动子对组蛋白修饰基因表达预测的差异贡献。发布时间:2021 年 9 月摘要:启动子组蛋白修饰的 ChIP-seq 信号是不同细胞环境中基因表达的良好预测因子,但增强子是否也是如此尚不清楚。为了解决这个问题,我们开发了定量模型来字符……阅读更多 »SUV39 SET 域介导异色组蛋白标记的串扰。发布:S2021 年 9 月摘要:SUV39 类甲基转移酶沉积组蛋白 H3 赖氨酸 9 二甲基化和三甲基化 (H3K9me2/3),这是组成型异染色质的标志。这些酶如何被调节以标记特定的基因组区域,因为异染色质很差……阅读更多»EZH2 和 SOX2 的协调指定了人类神经命运的决定。发表时间:2021 年 9 月摘要:Polycomb 抑制复合物 (PRCs) 在小鼠原肠胚形成中必不可少,并指定人胚胎干细胞 (hESC) 中的神经外胚层,但潜在的分子基础仍不清楚。在本研究中,通过采用一系列不同的 ...阅读更多 »人​​类 Th17 细胞中 FOSL1 和 FOSL2 的相互作用组网络。发表时间:2021 年 9 月摘要:Th17 细胞功能失调对免疫缺陷和自身免疫性疾病有影响。 Th17 细胞分化由复杂的转录因子网络精心策划,包括激活蛋白的几个成员 (AP-1)...阅读更多 »脯氨酰异构酶 PIN1 对于核 Lamin-B 的结构和功能至关重要,并在机械应力下保护异染色质。发表时间:2021 年 9 月摘要:染色质组织在组织稳态中起着至关重要的作用。异染色质松弛和随之而来的转座因子 (TE) 的计划外动员正在成为衰老和衰老相关病理学的关键因素,包括……阅读更多»DOT1L O-GlcNAcylation 促进其蛋白质稳定性和 MLL 融合白血病细胞增殖。发布时间:9 月, 2021 摘要:组蛋白赖氨酸甲基化在细胞外环境和细胞内基因表达的界面发挥作用。 DOT1L 是一种多功能组蛋白 H3K79 甲基转移酶,在 MLL 融合白血病中起着重要作用,但人们对……了解甚少 »WT1 以双向方式调节 HOXB9 基因表达。发表时间:2021 年 9 月摘要:同源框 B9 (HOXB9) 基因对sp是必要的胚胎发育过程中前后体轴的具体化,并在各种类型的癌症中表达。在这里,我们表明 Wilms 肿瘤转录因子 WT1 调节 HOXB9 ge...阅读更多 »INTS11 通过促进 PRC2 功能调节造血功能。发表时间:2021 年 9 月摘要:INTS11,整合子 (INT) 复合物的催化亚基,对于小核 RNA 和增强子 RNA 的生物合成。然而,INTS11 在造血干细胞和祖细胞 (HSPC) 生物学中的作用尚不清楚。在这里,我们报告 ...阅读更多 »组蛋白去乙酰化酶 4 缺失广泛影响心脏表观遗传抑制并通过 H3K9 甲基化调节转录易感性。发表时间:2021 年 9 月摘要:组蛋白去乙酰化酶 4 (HDAC4) 是 IIa 类组蛋白去乙酰化酶(IIa 类 HDAC)的成员并且被认为具有低的内在脱乙酰酶活性。然而,HDAC4 足以抑制不同的转录因子 (TF),例如m...阅读更多 »使用 ChOR-seq 和 SCAR-seq 对复制染色质中蛋白质占据的全基因组和姐妹染色单体解析分析发表时间:2021 年 9 月摘要:阐明基因组复制后染色质维持的潜在机制对于理解基因表达程序和细胞身份如何在细胞分裂中得以保存。在这里,我们描述了最近开发的两种 t...阅读更多»增强剂的表观遗传重塑以响应雌激素剥夺和再刺激。发表时间:2021 年 9 月摘要:雌激素与大多数乳腺癌和雌激素受体 α (ER) 有关,介导雌激素信号传导的主要核因子,协调尚未完全阐明的复杂分子回路。在这里,我们调查……阅读更多 »激活的组蛋白乙酰转移酶 p300/CBP 相关信号通路介导糖尿病肾 P 中 NADPH 氧化酶、炎症和纤维化的上调发表时间:2021 年 8 月摘要:越来越多的证据表明,基于组蛋白乙酰化的表观遗传机制与糖尿病相关的微血管/大血管并发症的病理学有关。糖尿病肾病 (DKD) 是一种进行性慢性炎症微血管……阅读更多 »Aiolos 调节嗜酸性粒细胞迁移到组织中。发表时间:2021 年 8 月摘要:Ikaros 家族转录因子 IKZF3 (Aiolos) 的表达在小鼠嗜酸性粒细胞谱系定型和成熟过程中增加。在此,我们研究了 Aiolos 在成熟的人和小鼠嗜酸性粒细胞中的表达和功能。小鼠嗜酸性粒细胞……阅读更多 »建立两个纯合子 CRISPR 干扰 (CRISPRi) 敲入人诱导多能干细胞 (hiPSC) 系,用于可滴定的内源性基因抑制。发布时间:2021 年 8 月摘要:使用核酸酶缺陷型死 (d)Cas9 无与转录抑制剂 (CRISPRi) 融合的酶活性允许转录干扰和 r结果是阐明发育、稳态和疾病机制的有力工具……阅读更多 »X 染色体的二分法破坏了秀丽隐杆线虫减数分裂过程中染色体沉默的启动发表时间:2021 年 8 月摘要:减数分裂期间,基因表达被沉默在异常未突触的染色质和异配性染色体中。在具有性染色体-常染色体易位的性母细胞中,性染色体沉默的启动被破坏。确定是否...阅读更多 »改变的染色质状态驱动衰老哺乳动物干细胞中的隐蔽转录。发表时间:2021 年 8 月摘要:抑制性染色质状态以组蛋白 H3 (H3K36me3) 上的三甲基化赖氨酸 36 和 DNA 甲基化抑制胚胎干细胞中的隐蔽转录为特征.酵母和线虫中的隐蔽转录随着年龄的增长而升高,并减少我……阅读更多»相分离驱动异常染色质环化和癌症发展。发布时间:2021 年 7 月Abstract:癌症的发展与针对具有固有无序区域 (IDR) 的蛋白质的遗传异常密切相关。在人类血液恶性肿瘤中,核孔蛋白(NUP98 或 NUP)的复发性染色体易位……阅读更多 »使用 dCas9-DNMT3A3L 增强 CMV 和内源性启动子的靶向 DNA 甲基化,导致 CHO 细胞发生明显的后续组蛋白修饰变化。发表时间:2021 年 7 月摘要:随着新的 CRISPR/dCas9 工具的出现,使 DNA 甲基化和组蛋白修饰的位点特异性调节成为可能,更详细地研究表观遗传调控对培养细胞精确表型的贡献,……阅读更多 »长期关联的证据病毒体递送的 HBV 核心蛋白与 cccDNA 独立于病毒蛋白的产生 发表时间:2021 年 7 月摘要:背景目标 HBV 作为共价闭合环状 DNA (cccDNA) 持续存在于受感染的肝细胞核中构成病毒 RNA 和蛋白质合成模板的附加体。 HBx 和 HBc(核心)病毒蛋白都与……阅读更多 »用于评估环境影响和表观遗传的精子细胞和胚胎的 ChIP-seq 协议发表时间:2021 年 6 月摘要:在表观遗传领域,描绘了与很难将父系环境条件转移给后代。该协议详细说明了如何代际跟踪精子染色质。我们 de...阅读更多 »生活在富含硫化氢的泉水中的鱼类 DNA 甲基化变化的表观遗传遗传。发表时间:2021 年 6 月摘要:环境因素可以通过表观基因组的改变促进表型变异,并促进生物体适应环境。虽然硫化氢对大多数生物体有毒,但鱼已经适应了在环境中生存……阅读更多 »E2F6 启动种系 g 的稳定表观遗传沉默enes duringembryonic development 发表时间:2021 年 6 月摘要:在小鼠发育过程中,CpG 岛 DNA 甲基化导致的长期沉默专门针对种系基因;然而,这种特异性的分子机制仍不清楚。在这里,我们证明了转录因子 E2F6,一个我……阅读更多»全基因组 CRISPR 屏幕识别调节神经元中 tau 蛋白水平的蛋白质途径发表时间:2021 年 6 月摘要:过度磷酸化 tau 蛋白的聚集体是 20 多种不同的病理标志神经退行性疾病,包括阿尔茨海默病、进行性核上性麻痹和额颞叶痴呆。虽然确切的机制……阅读更多»环境富集在老年小鼠海马体中保留了年轻的 DNA 甲基化景观发布时间:2021 年 6 月摘要:衰老过程中大脑功能的下降与表观遗传变化有关,包括 DNA 甲基化。生活方式干预可以改善大脑在衰老过程中发挥作用,但它们对与年龄相关的表观遗传变化的影响尚不清楚。使用 g...阅读更多 »胃癌 CpG 岛甲基化表型和炎症的高复发性突变发表时间:2021 年 6 月摘要:背景 CIMP(CpG 岛甲基化表型)是一种表观遗传分子亚型,在多种恶性肿瘤中观察到并与肿瘤抑制因子的表观遗传沉默相关.目前,对于包括胃癌 (GC) 在内的大多数癌症,m...阅读更多 »圆形精子细胞中的 LINE-1 转录与其开放阅读框中 5-羧基胞嘧啶的增加有关 发表时间:2021 年 6 月摘要:雄性和雌性配子的染色质经历在从生殖细胞到胚胎发育程序的转变过程中发生的一些重编程事件。虽然受精卵中发生的 DNA 甲基化模式的重排已经扩展……阅读更多»Lasp1 调节粘附连接动力学和成纤维细胞转化破坏性关节炎发布时间:2021 年 6 月摘要:LIM 和 SH3 结构域蛋白 1 (Lasp1) 最初是从转移性乳腺癌中克隆出来的,其特征是与肿瘤发生和癌细胞侵袭相关的衔接分子。然而,Lasp1 的调节及其在...中的功能阅读更多 »HOTAIR lncRNA 通过在调节染色质区域重新分配 LSD1 促进上皮-间质转化。发表时间:2021 年 5 月摘要:上皮-间质转化 (EMT) 描述了正常细胞在发育过程中和肿瘤细胞在癌症转移过程中的上皮特征和间充质特征的获得。长非编码 RNA HOTAIR 触发 EMT,在 p...阅读更多»lncRNA 和转录因子 WRKY42 靶向常见细胞壁 EXTENSIN 编码基因以触发根毛细胞伸长。发表时间:2021 年 5 月摘要:植物长非编码 RNA (lncRNA) 是关键染色质动力学调节器,指导转录程序它推动了各种各样的发展成果。最近,我们发现了 lncRNA () 如何直接识别编码 ...阅读更多 »25(OH) 维生素 D 的胎盘摄取和代谢决定了它在胎盘单位内的活性发表时间:2021 年 5 月摘要:妊娠期 25-羟基维生素 D (25 (OH)D) 浓度与母婴健康结果相关,但其潜在机制尚未阐明。使用生理人胎盘灌注方法和完整的绒毛探索...阅读更多»染色质可及性控制癌症和 T 细胞对精氨酸饥饿的差异反应。发表时间:2021 年 5 月摘要:耗尽精氨酸等重要营养素的微环境是一项关键策略用于癌细胞的免疫逃避。许多肿瘤过度表达精氨酸酶,但尚不清楚这些癌症(而非 T 细胞)如何耐受精氨酸耗竭。 ...阅读更多 »肌节功能激活 p53 依赖性 DNA da促进多倍体化和限制体内细胞植入的法师反应。发表时间:2021 年 5 月摘要:人类心脏再生受到心肌细胞复制率低和机制不明的渐进多倍体化的限制。为了研究这个过程,我们设计了一个人类心肌细胞模型来跟踪使用流感的复制和多倍体化……阅读更多 »PPARɣ 驱动 IL-33 依赖性 ILC2 促肿瘤功能。发表时间:2021 年 5 月摘要:第 2 组先天性淋巴样细胞 (ILC2s) ) 通过响应可溶性因子(例如通常在癌症中过度表达的 alarmin IL-33),在预防蠕虫和多种炎症性疾病中发挥关键作用。尽管如此,regulat...阅读更多»识别 PadR 型调节器对细胞内发病机制至关重要已发表:2021 年 5 月摘要:类鼻疽伯克霍尔德氏菌 (Bp) 是类鼻疽病的病原体,类鼻疽是热带地区特有的一种疾病。类鼻疽表现在各种方面,从 ac将皮肤损伤发展为肺炎,在极少数情况下,还会感染中枢神经系统……阅读更多»灵长类淋巴母细胞系的表观基因组分析揭示了基因调控结构中表观遗传活动的进化模式发表时间:2021 年 5 月摘要:表观遗传调控的变化基因表达在进化中起着核心作用。在这里,我们广泛地分析了一组人类、黑猩猩、大猩猩、猩猩和猕猴类淋巴母细胞系 (LCL),使用 ChIP-seq 检测五个组蛋白……阅读更多 »GATA6 通过在人类分化过程中控制染色质可及性来定义内胚层命运-诱导多能干细胞发布时间:2021 年 5 月摘要:摘要:除了驱动特定的基因表达谱外,转录调节因子还因其调节染色质结构的能力而受到越来越多的认可。 GATA6 对定形内胚层的形成至关重要; howe...阅读更多 »The SAM domain-contai宁蛋白 1 (SAMD1) 在未甲基化的 CpG 岛充当抑制性染色质调节剂发布时间:2021 年 5 月摘要:CpG 岛 (CGI) 是大多数启动子的关键调节 DNA 元件,但它们如何影响染色质状态和转录仍然难以捉摸。在这里,我们将 SAMD1(含 SAM 结构域的蛋白质 1)识别并表征为未甲基化的 CGI-...阅读更多 »MeCP2 通过 miR-199a 介导的 BMP-Smad 信号抑制来控制神经干细胞命运规范。发表时间:2021 年 5 月摘要: Rett 综合征 (RTT) 是一种严重的神经系统疾病,MECP2 突变导致大脑发育受损;然而,潜在的机制仍然难以捉摸。我们从以前的工作中知道,MeCP2 有助于处理特定的 ...阅读更多 »牛胚胎干细胞培养条件的简化和无饲养层扩增发表时间:2021 年 5 月摘要:牛胚胎干细胞 (bESCs) 延长了瞬态细胞的寿命多能的体外牛内细胞团。经过多年的研究,稳定的 bESC 的推导直到最近才被报道。虽然成功,但 bESC 文化依赖于 compl...阅读更多»雄激素和糖皮质激素受体通过受体特异性和共享 DNA 结合位点指导不同的转录程序。发表时间:2021 年 4 月摘要:糖皮质激素 (GR) 和雄激素 (AR) 受体执行独特体内功能,但具有几乎相同的 DNA 结合特异性。为了确定促进这些转录因子旁系同源物功能多样化的机制,...阅读更多»USP22 抑制急性结肠炎和炎症相关结直肠癌中的表达。发表时间:2021 年 4 月摘要:作为 11 基因\"癌症死亡”的成员\" 基因表达特征,泛素特异性蛋白酶 22 (USP22) 被认为是各种人类恶性肿瘤的致癌基因,包括结直肠癌 (CRC)。我们最近发现了一个意想不到的……阅读更多»Sens使用合成掺入对照进行主动且可重复的无细胞甲基化组定量发表时间:2021 年 4 月摘要:背景。无细胞甲基化 DNA 免疫沉淀测序 (cfMeDIP-seq) 使用适用于低输入 DNA 样本和无细胞 DNA (cfDNA) 的方案来识别具有 DNA 甲基化的基因组区域。这种方法允许 D...阅读更多 »KAT8 的复杂依赖性组蛋白乙酰转移酶活性决定了它在转录和细胞稳态中的作用。发表时间:2021 年 4 月摘要:组蛋白乙酰转移酶 KAT8 催化组蛋白 H4 (H4K16ac) 上赖氨酸 16 的乙酰化并且可以在体外防止染色质压实。尽管在果蝇中进行了广泛研究,但 H4K16ac 和两种含 KAT8 蛋白的功能……阅读更多 »抗炎细胞因子 interleukin-37 是训练免疫的抑制剂。发表时间:2021 年 4 月摘要:训练免疫 (TI) 是一种 de单核细胞诱导的事实先天免疫记忆程序tes/巨噬细胞通过暴露于病原体或疫苗而进化为针对感染的保护。 TI 的特点是免疫代谢变化和组蛋白后……阅读更多»H3K64 三甲基化标记与编码恶性疟原虫中输出蛋白的基因的动态关联。发表时间:2021 年 4 月摘要:表观遗传修饰已成为毒力基因和特定阶段的关键调节因子恶性疟原虫中的基因表达。然而,组蛋白核心表观遗传修饰在调节阶段特异性基因中的具体作用……阅读更多 »Chd8 通过 Xist 表达的微调控制来调节小鼠 X 染色体失活。发表时间:2021 年 4 月摘要:雌性哺乳动物通过以下方式实现剂量补偿在发育过程中使两条 X 染色体中的一条失活,这一过程完全依赖于 Xist,一种 X 连锁的长非编码 RNA (lncRNA)。在 X 染色体失活 (XCI) 开始时,Xist 是……阅读更多 »比较对牛胚泡和体细胞组织之间组蛋白 H3K4me3 修饰的分析。发表时间:2021 年 4 月摘要:在早期发育阶段,周围环境引起的表观遗传变化不仅会产生短期影响,还会对整个生命产生长期影响。这个概念构成了\"健康和疾病的发展起源”(D...阅读更多»中性粒细胞增强剂 PU.1 结合和染色质环的遗传扰动与自身免疫性疾病相关。发表时间:2021 年 4 月摘要:中性粒细胞在先天免疫中发挥基础作用反应, 塑造适应性免疫, 并且是一种潜在的因果细胞类型, 支持与免疫系统特征和疾病的遗传关联。在这里, 我们描述了骨髓主的结合 ...阅读更多 »人​​类结直肠癌的表观基因组景观揭示了泛-的异常核心由 YAP/TAZ 精心策划的癌症增强剂。发布时间:2021 年 4 月摘要:癌症的特点是普遍存在具有增强子功能障碍的表观遗传改变协调异常的癌症转录程序和转录依赖性。在这里,我们在表观遗传学上表征人类结直肠癌 (CRC) u...阅读更多 »Polycomb 抑制复合物 2 和 KRYPTONITE 调节拟南芥中病原体诱导的程序性细胞死亡。发表时间:2021 年 4 月摘要:Polycomb 抑制复合物 2 (PRC2) 很好-以其通过抑制关键发育调节因子的过早表达来控制发育转变的作用而闻名。以前的工作表明,PRC2 还控制 senes 的开始……阅读更多»Fra-1 通过结合远程增强子来调节其靶基因,而不会对三阴性乳腺癌的染色质结构施加主要控制。发布时间:2021 年 3 月摘要:无处不在的家族二聚体转录因子AP-1由Fos和Jun家族蛋白组成。长期以来,人们一直认为它主要作用于基因启动子以及如何它控制转录仍然不为人知。 Fos 家族保护...阅读更多»SETD1B 的缺失导致基因组 H3K4me3 在卵母细胞中的重新分布发布时间:2021 年 3 月摘要:组蛋白 3 赖氨酸 4 三甲基化 (H3K4me3) 是在基因启动子和 CpG 岛发现的表观遗传标记。 H3K4me3 对哺乳动物发育至关重要,但对其基因组靶向的潜在机制知之甚少。 H3K4me3 甲基转移... 阅读更多 » 单个增强子丢失引起的 Pitx1 调控景观激活的细胞特异性改变发表时间:2021 年 3 月摘要:大多数发育基因在胚胎发生过程中都依赖于多个转录增强子才能准确表达。因为增强子可能有部分冗余的活动,其中之一的丢失通常会导致基因表达的部分丢失……阅读更多»使用基于 CRISPR 的系统进行体内表观基因组编辑的转基因小鼠发布时间:2021 年 3 月摘要:发现、表征n,以及 RNA 引导的成簇规则散布短回文重复序列 (CRISPR)-Cas9 系统的适应性大大提高了基因组和表观基因组编辑的易用性。 chr 的融合……阅读更多 »H3K4me3 和 H3K27me3 在 2 细胞样胚胎干细胞中的独特模式。发表时间:2021 年 3 月摘要:一小部分胚胎干细胞 (ESC) 表现出类似于双细胞干细胞的分子特征胚胎 (2C)。然而,2C 样细胞和 2C 胚胎是否具有相似的表观遗传特征仍然难以捉摸。在这里,我们绘制了全基因组图……阅读更多»表观基因组张量预测疾病亚型并揭示受限的肿瘤进化。发表时间:2021 年 3 月摘要:从复杂的患者数据中了解疾病亚型的表观基因组进化和特异性仍然是一个主要的生物医学问题。我们在这里介绍 DeCET(表观基因组张量的分解和分类),一种综合计算方法……阅读更多 »Transcriptional programming drives Ibrutinib-resistance evolution in mantlecell lymphoma. Published: March, 2021Abstract: Ibrutinib 是一种布鲁顿氏酪氨酸激酶 (BTK) 抑制剂,在侵袭性套细胞淋巴瘤 (MCL) 中引起强烈的临床反应,但许多患者因致命的 Ibrutinib 耐药而复发(IR) 疾病。在这里,使用基因组学、化学蛋白质组学和……阅读更多»3q21.1 的调节变异增加了高血糖和改变骨矿物质密度的多效性风险。发表时间:2021 年 3 月摘要:骨骼和血糖特征具有共同的病因,但潜在的遗传因素在很大程度上仍然未知。为了确定可能具有多效性效应的基因位点,我们研究了全基因组关联研究 (GWASs) 的骨密度和……阅读更多 »三种家畜基因组的功能注释为比较和农业研究提供了重要资源。发表时间:3 月, 2021 摘要:基因调控元件是表型变异,因此对于理解复杂性状的遗传学至关重要。动物基因组功能注释联盟的成立是为了协同注释……阅读更多 »H3K27 的组蛋白修饰动力学与稻瘟病菌中植物诱导基因的转录改变有关。发表时间:2021 年 2 月摘要:转录动态响应环境和发育线索是生物学的基础,但许多机制方面却知之甚少。一个这样的例子是真菌植物病原体,它使用分泌的蛋白质和小分子......阅读更多»组蛋白修饰 H3K4me3 在阿尔茨海默病大脑的基因座处发生改变。发表时间:2021 年 2 月摘要:DNA 甲基化的几项表观基因组范围的关联研究强调了阿尔茨海默病 (AD) 大脑样本中基因的 DNA 甲基化改变。然而,没有研究专门检查组蛋白修饰疾病。我们使用 ...阅读更多 »使用正变构调节剂重新编程 CBX8-PRC1 功能发布时间:2021 年 2 月摘要:Polycomb 抑制复合物 1 (PRC1) 的规范靶向抑制发育基因是由细胞类型特异性的旁系同源染色体 (CBX) 蛋白介导的(CBX2、4、6、7 和 8)。基于它们在沉默中的核心作用和它们的错误调节……阅读更多»热休克因子 HSF-1 的种系活性对秀丽隐杆线虫中的胰岛素受体 daf-2 进行编程发布时间:2021 年 2 月摘要:母体压力改变后代的机制表型仍然知之甚少。在这里,我们报告热休克转录因子 HSF-1,在应激时在秀丽隐杆线虫母体种系中激活,对 ins 进行表观遗传编程……阅读更多 »G2 期富集的 lncRNA SNHG26 是适当的细胞周期进程和增殖所必需的已发表: 2021 年 2 月摘要:长链非编码 RNA (lncRNA) 参与调控的细胞周期,虽然只有少数在功能上得到了表征。通过结合细胞周期同步的 HaCaT 细胞的 RNA 测序和 ChIP 测序,我们之前已经确定了……阅读更多»STAG 蛋白促进 R-loops 上的粘连蛋白环加载发表时间:2021 年 2 月摘要:大多数关于粘连蛋白功能的研究都考虑了基质蛋白抗原(STAG/ SA) 蛋白质作为核心复合体成员,因为它们与粘连蛋白环相互作用无处不在。在这里,我们提供功能数据来支持 SA 亚基不是……阅读更多»限制性成核和 piRNA 介导的异染色质在果蝇 miranda 胚胎发生过程中的建立发表时间:2021 年 2 月摘要:异染色质是真核基因组的一个关键结构特征,对于重复元件的沉默和维持基因组稳定性至关重要。异染色质显示着丝粒和重复序列周围的刻板富集模式……阅读更多 »表观遗传景观来自快肌和慢肌的纯化肌核中的 pe 发布时间:2021 年 2 月摘要:肌肉细胞具有适应不同用途的不同表型,大致可分为快/糖酵解和慢/氧化类型。虽然大多数肌肉含有此类纤维类型的混合物,但我们的目标是提供对 c 的全基因组分析……阅读更多 »Environmental enrichment induces epigenomic and genome organization changesrelevant for cognitive functionPublished: February, 2021Abstract: In early development, the environment触发助记表观基因组程序,从而产生记忆和学习经验,从而将认知表型赋予成年期。揭示环境刺激如何影响表观基因组和基因组器官……阅读更多 »与头颈部鳞状细胞癌 NSD1 突变相关的染色质失调。发表时间:2021 年 2 月摘要:染色质失调已成为肿瘤发生的重要机制。开发有针对性的治疗方法,了解染色质修饰基因突变的转录组学后果很重要。最近,组蛋白中的突变...阅读更多»Kmt2c 突变增强 HSC 自我更新能力并在化疗后传递选择性优势。发表时间:2021 年 2 月摘要:髓样肿瘤抑制因子 KMT2C 在骨髓增生异常综合征 (MDS) 和急性髓样细胞中反复缺失白血病 (AML),特别是与治疗相关的 MDS/AML (t-MDS/t-AML),作为较大的 7 号染色体缺失的一部分。在这里,我们表明 KMT2C de...阅读更多»糖皮质激素受体招募 COMPASS 复合物来调节巨噬细胞增强子的炎症转录。发表时间:2021 年 2 月摘要:糖皮质激素 (GCs) 是有效的抗炎药;然而,人们对它们的作用机制知之甚少。 GCs 与糖皮质激素受体 (GR) 结合,这是一种配体门控转录因子,在多种细胞类型中控制基因表达……阅读更多 »肿瘤抑制因子PTEN 在 T 细胞发育和白血病中的增强子发布时间:2021 年 1 月摘要:长程致癌增强子在癌症中发挥着重要作用。然而,肿瘤抑制基因的类似调节是否相关仍不清楚。 PTEN 的表达缺失与各种癌症的发病机制有关,包括 T-...阅读更多 »与标准皮内接种疫苗相比,粘膜 BCG 或 MTBVAC 疫苗接种对训练免疫力的诱导作用更强。发表时间:2021 年 1 月摘要:BCG 疫苗接种可以加强通过诱导先天免疫细胞的表观遗传和代谢重编程来抵御病原体,这一过程称为训练免疫。我们和其他人最近证明粘膜或静脉内……阅读更多»减数分裂过程中 SETDB1 在同源染色体配对和突触中的基本功能。发布时间:2021 年 1 月摘要:SETDB1 是一种对种系发育至关重要的组蛋白-赖氨酸 N-甲基转移酶。然而,它的功能早期减数分裂前期 I 的变化仍然未知。在这里,我们报告 Setdb1 null 精母细胞在 lepto 期间显示异常的着丝粒聚集……阅读更多 »在 DNA 和 RNA 的碱基对分辨率下检测遗传变异和碱基修饰。发表时间:2021 年 1 月摘要:核酸变异的准确解码是对于了解基因组功能的复杂性和调控至关重要。在这里,我们使用单分子磁性镊子 (MT) 平台来识别序列变异并绘制一系列重要的表观基因……阅读更多 »KAP1 在骨髓谱系中抑制 HIV-1 基因转录。发表时间:2021 年 1 月摘要:HIV -1 潜伏期生成阻止当前疗法根除病毒的储库。为了找到治愈 HIV 的策略,详细了解储存库建立和持久性的分子机制是 n...阅读更多 »术后腹部败血症诱导选择性和持续性 chaCTCF 在人类单核细胞的 MHC-II 区域内结合。发表时间:2021 年 1 月摘要:背景:术后腹部感染是全世界重症监护病房中脓毒症和感染性休克最常见的诱因。虽然单核细胞在介导宿主对感染的初始反应中起着核心作用,但败血症诱导……阅读更多»热带珊瑚在漂白时显示出一种不寻常的染色质结构并显示石蛋白 H3 剪裁可塑性。发表时间:2021 年 1 月摘要:是一种 hermatypic 珊瑚,具有强大的生态重要性。人为干扰和全球变暖是导致珊瑚漂白的主要威胁,破坏珊瑚宿主与其内共生藻类之间的共生关系……阅读更多»通过调节组蛋白缺氧诱导的 lncRNA 诱导上皮-间质转化 (EMT) 4 赖氨酸 16 乙酰化 (H4K16Ac) 标记。发表时间:2021 年 1 月摘要:缺氧激活各种长非编码RNA (lncRNA) 诱导上皮-间质转化 (EMT) 和肿瘤转移。缺氧/HIF-1α 调节的 lncRNAs 也调节特定的组蛋白标记并促进 EMT 和转移……阅读更多 »WAPL 维持粘连蛋白加载周期以保持细胞类型特异性远端基因调节。发表时间:2020 年 12 月摘要:The cohesin 复合物在维持基因组组织中具有重要作用。然而,它在基因调控中的作用在很大程度上仍未得到解决。在这里,我们报告内聚蛋白释放因子 WAPL 在一个已知的过程中产生了一个游离内聚蛋白池……阅读更多 »启动子相互作用的表达数量性状位点丰富了功能性遗传变异。发表时间:2020 年 12 月摘要:表达数量性状位点(eQTLs) 研究提供了遗传变异与基因表达的关联,但未能精确定位功能上重要的 eQTLs。在这里,使用 H3K27ac HiChIP 检测,我们绘制了重叠活性 ci 的 eQTLs-...阅读更多»长期核苷类似物治疗患者中乙型肝炎共价闭合环状 DNA 残留池的定量和表观遗传评估。发表时间:2020 年 12 月摘要:乙型肝炎病毒 (HBV) 共价闭合环状 (ccc) DNA是导致停药后病毒持续存在和病毒学复发的关键基因组形式。长时间后残留肝内 cccDNA 水平和活性的评估……阅读更多»组蛋白 H3.3G34-突变中间神经元祖细胞共同选择 PDGFRA 进行胶质瘤生成。发表时间:2020 年 12 月摘要:组蛋白 H3.3 甘氨酸 34 至精氨酸/缬氨酸(G34R /V) 突变驱动致命的神经胶质瘤并表现出精致的区域和时间特异性,表明发育背景允许其影响。在这里,我们显示 50% 的 G34R/V 肿瘤(n&nbs...阅读更多 »S-腺苷-l-同型半胱氨酸水解酶将甲硫氨酸代谢与生物钟和染色质重塑联系起来。发布时间:2020 年 12 月Abstract:由转录激活因子 CLOCK 和 BMAL1 驱动的昼夜节律基因表达与动态染色质重塑密切相关。然而,细胞代谢如何指导昼夜节律染色质重塑几乎未被探索。我们报告 tha...阅读更多 »EZH2 和 KDM6B 表达与非小细胞肺癌 EMT 期间的特定表观遗传学特征相关。发表时间:2020 年 12 月摘要:最近出现了表观遗传学在上皮间充质转化 (EMT) 中的作用。两种具有矛盾作用的表观遗传酶以前与 EMT、EZH2(Zeste 2 Polycomb 抑制复合物 2 (PRC2) 亚基的增强子)有关,...阅读更多 »TGFβ 促进广泛的增强子染色质开放并操作基因组调控域。发表时间:12 月, 2020 摘要:转化生长因子-β (TGFβ) 信号通路通过调节增强子活性来控制转录。如何选择 TGFβ 调节的增强子d 什么染色质变化与 TGFβ 依赖性增强子相关...阅读更多 »PRC2 和 EHMT1 调节整个合子基因组中 H3K27me2 和 H3K27me3 的建立。发表时间:2020 年 12 月摘要:合子的形成是哺乳动物生命的开始,动态表观遗传修饰是哺乳动物正常发育所必需的。 H3K27 二甲基化 (H3K27me2) 和 H3K27 三甲基化 (H3K27me3) 是兼性 het 的标记...阅读更多 »壳聚糖纳米载体作为生物相容性递送工具,用于癌症和炎症治疗中的新 Ag (I) 类姜黄素-Gboxin 模拟复合物已发布: 2020 年 12 月摘要:成功合成了一种基于杂化类姜黄素-Gboxin 类似物 (FLLL49-GbA) 及其大分子银 (I) 络合物 (Ag(I)FLLL49-GbA) 的新型抗癌抗炎药。此外,壳聚糖纳米颗粒 (CNP) 用于……阅读更多 »Kaposi 肉瘤相关疱疹病毒进程因子,ORF59,与 Canonical 结合和接头组蛋白及其羧基末端对于病毒 DNA 合成是可有可无的 发表时间:2020 年 12 月摘要:卡波氏肉瘤相关疱疹病毒 (KSHV) 是一种致癌病毒,是潜在致命恶性肿瘤的病原体。 KSHV 的裂解复制是病毒生命周期的重要组成部分,允许病毒在 t 内传播……阅读更多 »肠促胰岛素药物对表观遗传机制的影响:预防血管性糖尿病并发症的新潜在治疗意义。发表时间:2020 年 12 月摘要:效果评估了 GLP-1R 激动剂对暴露于高葡萄糖的人主动脉内皮细胞中 NF-κB 和 SOD2 基因的 DNA 甲基化水平以及接受治疗但未接受肠促胰岛素药物治疗的糖尿病患者的影响。甲基化水平,...阅读更多»符合原始生殖细胞规范的中间多能干细胞的推导。发布时间:2020 年 11 月摘要:动态多能干细胞 (PSC) 状态是 inv体内多能性连续体的 Itro 改编。以前的研究已经产生了许多具有不同特性的 PSC。然而,迄今为止,还没有已知的 PSC 表现出双重补偿……阅读更多 »表观遗传调节因子 RINF (CXXC5) 在人类未成熟红细胞中维持 SMAD7 表达并维持红细胞扩张。发布时间:2020 年 11 月摘要:基因 CXXC5,编码维甲酸诱导核因子 (RINF),位于 5q31.2 区域,通常在骨髓增生异常综合征 (MDS) 和成人急性髓性白血病 (AML) 中缺失。 RINF 可能充当表观遗传调节剂,并且已经……阅读更多 »Firre 对失活 X 染色体表观遗传特征的反式和顺式作用。发表时间:2020 年 11 月摘要:Firre 编码参与核组织的 lncRNA。在这里,我们表明从活性 X 染色体表达的 Firre RNA 在体细胞的非活性 X 染色体 (Xi) 上维持组蛋白 H3K27me3 富集。这种反式肌动蛋白g 效应涉及……阅读更多 »ΔNp63 是结合不可接近的染色质和诱导染色质重塑的先驱因子 发布时间:2020 年 11 月摘要:背景:ΔNp63 是一种主要的转录调节因子,在表皮发育和其他细胞过程中发挥着关键作用。最近的研究表明,ΔNp63 作为先驱因子发挥作用,可以通过... 阅读更多»增强子劫持决定了神经母细胞瘤中染色体外环状 MYCN 扩增结构。发表时间:2020 年 11 月摘要:MYCN 扩增导致六分之一的神经母细胞瘤病例。超数基因拷贝通常存在于高度重排的染色体外环状 DNA (ecDNA) 上。到目前为止尚未描述确切的扩增子结构和功能……阅读更多»杀虫剂(氯菊酯和避蚊胺)诱导的特定跨代疾病的 DNA 甲基化外突变生物标志物的表观基因组关联研究。发表于:November, 2020 摘要:背景:氯菊酯和 N,N-二乙基间甲苯酰胺 (DEET) 是人类最常用的杀虫剂和驱虫剂。这些杀虫剂已被证明可促进大鼠疾病的表观遗传跨代遗传。 cur...阅读更多»在 RNA 水平上剖析单纯疱疹病毒 1 诱导的宿主关闭。发表时间:2020 年 11 月摘要:单纯疱疹病毒 1 (HSV-1) 在裂解性感染期间引起严重的宿主关闭。病毒粒子宿主关闭 () 蛋白通过有效切割宿主和病毒 mRNA,在此过程中发挥关键作用。此外,病毒 DNA 复制的开始……阅读更多 »H3K4me3 甲基化增加和 miR-7113-5p 表达减少导致 PTSD 患者免疫细胞中 Wnt/β-连环蛋白信号增强,从而导致炎症表型。发表时间:2020 年 11 月摘要:背景: 创伤后应激障碍 (PTSD) 是一种伴有慢性外周炎症的精神疾病。什么触发目前尚不清楚 PTSD 中的 gers 炎症。在本研究中,我们发现了信号传导中的潜在缺陷……阅读更多»小鼠组蛋白 H3.3K36M 突变导致组蛋白修饰失衡和软骨细胞分化缺陷。发表时间:2020 年 11 月摘要:组蛋白赖氨酸转蛋氨酸(K -to-M) 突变已被确定为人类癌症的驱动突变。有趣的是,这些\"肿瘤组蛋白”突变会抑制组蛋白甲基转移酶的活性。因此,它们可能被用作……阅读更多 »BCG 疫苗接种可诱导人类嗜中性粒细胞的长期功能重编程。发布时间:2020 年 11 月摘要:结核病疫苗卡介苗 (BCG) 可能通过诱导来预防某些异源感染单核细胞和自然杀伤 (NK) 细胞中的非特异性先天免疫记忆,这一过程被称为训练有素的免疫……阅读更多»TRF2 介导人类端粒内的复制启动以防止端粒功能障碍。发布日期:2020 年 11 月摘要:端粒遮蔽蛋白端粒重复结合因子 2 (TRF2) 将起点识别复合物 (ORC) 蛋白(DNA 复制起点的基本组成部分)招募到端粒。我们试图确定 TRF2 招募的 ORC 是否...阅读更多 »MEAF6 对细胞增殖至关重要,并在 KAT7 复合物的组装中发挥作用。发表时间:2020 年 11 月摘要:Myst 家族基因编码赖氨酸乙酰转移酶,主要介导组蛋白乙酰化以控制转录、DNA 复制和 DNA 损伤反应。它们与 PHD 指蛋白(Brpfs 或 Jades)和小的非 ca 形成四聚体复合物……阅读更多 »CDK4/6 抑制通过刺激 AP-1 转录活性重新编程乳腺癌增强子景观发布时间:2020 年 11 月摘要:细胞周期蛋白的药理学抑制剂依赖性激酶 4 和 6 (CDK4/6) 旨在诱导癌细胞周期停滞。最近的研究表明,这些药物还发挥其他作用,影响癌细胞免疫原性、凋亡恢复……阅读更多»ZNF354C 是一种抑制内皮血管生成发芽的转录抑制因子。发表时间:2020 年 11 月摘要:锌指蛋白 (ZNF) 是一大类具有不同功能的转录因子。我们最近发现内皮细胞具有限制 ZNF354C 作用的特定机制,ZNF354C 在内皮细胞中的功能未知……阅读更多 »哺乳动物干细胞中与年龄相关的隐性转录与隐性启动子处的允许染色质有关发表时间:2020 年 10 月摘要: 通过以组蛋白 H3 (H3K36me3) 上的三甲基化赖氨酸 36 和 DNA 甲基化为特征的抑制性基因内染色质状态抑制虚假的隐蔽转录,对于维持小鼠胚胎干细胞的自我更新能力至关重要。我……阅读更多 »HER2 需要组蛋白 H2B 泛素连接酶 RNF40-drivenmammary tumorigenesis。发布时间:2020 年 10 月摘要:HER2 阳性乳腺癌亚型 (HER2-BC) 表现出特别的侵袭性行为。抗 HER2 疗法显着改善了 HER2-BC 患者的生存期。然而,大量患者对目前的治疗方法产生了耐药性……阅读更多 »StE(z)2,一种多梳组甲基转移酶,H3K27me3 和 H3K4me3 的沉积调节马铃薯结核基因的表达。发表时间:2020 年 10 月摘要:多梳抑制复合物(PRC) 组蛋白通过 H3K27 三甲基化抑制靶基因来调节植物的各种发育过程,而它们的功能被 Trithorax 组蛋白介导的 H3K4 三甲基化所拮抗……阅读更多 »增强 ARGONAUTE2 激活的启动伴随着对黄瓜花叶病毒的诱导抗性在拟南芥中。发表时间:2020 年 10 月摘要:系统获得性抗性 (SAR) 是一种广谱抗病性 r可在病原体感染或通过化学处理(例如苯并-(1,2,3)-噻二唑-7-硫代甲酸 S-甲酯 (BTH))引起的反应。 SAR invo...阅读更多 »深入研究乳腺癌表观遗传学:组蛋白乙酰转移酶 TIP60 化学抑制的见解。发布时间:2020 年 10 月摘要:由于多种因素,乳腺癌通常是散发性的。其中,可能涉及表观遗传蛋白的失调。 TIP60 或 KAT5 是一种乙酰转移酶,可通过染色质结构调节基因转录。这种多效性 ...阅读更多 »NSD1 沉积的 H3K36me2 指导小鼠雄性生殖系的从头甲基化并抵消 Polycomb 相关的沉默。发表时间:2020 年 10 月摘要:哺乳动物生殖细胞中的从头 DNA 甲基化 (DNAme) 依赖于 DNMT3A 和 DNMT3L .然而,卵母细胞和精子显示出不同的 DNAme 模式。在小鼠卵母细胞中,de novo DNAme 需要赖氨酸甲基转移酶 (KMTase) SETD2,其中...阅读更多»MITF 是肾血管平滑肌脂肪瘤肿瘤的驱动癌基因和潜在治疗靶点,通过 CYR61 的转录调节。发表时间:2020 年 10 月摘要:结节性硬化症复合体 (TSC) 是一种常染色体显性肿瘤抑制综合征,其特征是由多个器官的肿瘤发展引起,包括肾血管平滑肌脂肪瘤。 TSC1 或 TSC2 的双等位基因丢失是血管平滑肌脂肪瘤的已知遗传驱动因素……阅读更多 »训练有素的免疫促进纳米生物疗法抑制肿瘤生长并加强检查点抑制。发表时间:2020 年 10 月摘要:训练有素的免疫力是骨髓细胞的一种功能状态,已经被提议作为一个引人注目的免疫肿瘤学靶点。其有效诱导需要骨髓中的骨髓祖细胞直接参与。为此,我们开发了一种骨……阅读更多»通过 DNMT3b 介导的 DNA 甲基化对海马 SOD2 的表观遗传阻断:对轻度创伤性脑损伤的影响-I诱导的持久性氧化损伤。发布时间:2020 年 10 月摘要:轻度创伤的反复发作加剧了创伤后应激障碍的脆弱性;然而,基本的分子机制却鲜为人知。反复轻度创伤性脑损伤 (rMTBI) 扰乱了氧化还原稳态,从而...阅读更多 »p53 直接抑制人类 LINE1 转座子。发布时间:2020 年 10 月摘要:p53 是一种有效的肿瘤抑制因子,通常在人类癌症中发生突变。最近,我们证明了 p53 基因在苍蝇和鱼的种系组织中起到限制逆转录转座子的作用,但这种活性是否在人类体细胞中是保守的,我……阅读更多»鳞翅目中 CenH3 缺陷全着丝粒的形成避免了活性染色质。发布时间:10 月, 2020 摘要:尽管忠实的染色体分离是必不可少的,但真核生物的着丝粒结构是多种多样的,并且体现了两种主要配置:单着丝粒和全着丝粒,参考,尊重ively,局部或不受限制地分布 o...阅读更多»UTX/KDM6A 在人类多能干细胞的神经分化过程中抑制 AP-1 和神经胶质生成程序。发布时间:2020 年 9 月摘要:背景:已知 UTX/KDM6A 会相互作用和影响多种不同的染色质修饰剂促进开放的染色质环境以促进基因激活,但其在发育基因调控中的分子活性仍不清楚。 R...阅读更多 »克隆蜗牛的代间表型和表观遗传稳定性。发布时间:2020 年 9 月摘要:表观遗传变异可能通过支持代内发育可塑性、环境的持续亲本效应,在产生适应性表型中发挥重要作用(例如,跨代可塑性),或可遗传的表观......阅读更多»双重 ARID1A/ARID1B 损失导致 BAF 复合物的快速癌变和破坏性再分布发布时间:2020 年 9 月摘要:SWI/SNF 染色质重塑剂在发育和癌症中发挥着关键作用。 SWI/SNF 复合物分解与致癌作用之间的因果关系被旁系同源成分之间的冗余所掩盖。 Canonical BAF (cBAF)-specific paralogs AR...阅读更多 »Frataxin 基因编辑挽救了背根神经节类器官衍生的感觉神经元中 Friedreich 的共济失调病理学。发表时间:2020 年 8 月摘要:Friedreich 的共济失调 (FRDA) 是一种常染色体隐性神经退行性和心脏疾病当 FXN 基因的转录因 GAA 重复扩增到其第一个内含子中而被沉默时发生的疾病。在这里,我们产生背侧……阅读更多»与 CBP 和 BET 抑制剂联合治疗可逆转 DIPG 细胞中有害超级增强子程序的无意激活。发表时间:2020 年 8 月摘要:弥漫性脑桥脑胶质瘤 (DIPG) 是儿童中最具侵袭性的脑肿瘤5 年生存率仅为 2%。大约 85% 的 DIPG 是 ch以组蛋白 3 中的赖氨酸到甲硫氨酸取代为特征,这会导致全局 H3K……阅读更多 »使用 dCas9-VPR 介导的转录激活进行遗传性失明的基因治疗发表时间:2020 年 8 月摘要:催化失活的 dCas9 与转录激活因子融合( dCas9-VPR) 能够激活沉默基因。许多疾病基因都有对应物,它们具有相似的功能,但在不同的细胞类型中表达。一个有吸引力的选择……阅读更多 »转录因子 SOX 家族成员在衰竭人类心脏中的差异表达发表时间:2020 年 8 月摘要:背景:与 Sry 相关的高迁移率族箱 (SOX) 基因家族,具有 20 个已知转录人类的因素,在发育过程和许多疾病过程中起着重要作用。几种 SOX 蛋白,例如 SOX4、SOX11 和 SOX9,重新……阅读更多 »转录因子 scleraxis 差异调节不同分离的肌腱细胞中的基因表达租金发展阶段。发布时间:2020 年 8 月摘要:转录因子硬化症 (SCX) 在整个肌腱发育过程中表达,并在指导肌腱伤口愈合中发挥关键作用。然而,人们对其在胎儿或年轻产后肌腱中的作用知之甚少,这些发育阶段……阅读更多»抑制 SET8 通路甚至通过成纤维细胞去分化改善肺纤维化发表时间:2020 年 8 月摘要:特发性肺纤维化 (IPF) 是致命的病因不明的肺部疾病。产生细胞外基质 (ECM) 的肌成纤维细胞的激活在纤维化组织重塑中起着关键作用。肌成纤维细胞的去分化 ...阅读更多 »PR-DUB 通过 FOXK1/2 和 ASXL1/2/3 依赖性募集到染色质和 H2AK119ub1 去泛素化来维持关键基因的表达。发表时间:2020 年 8 月摘要:Polycomb 组蛋白对于维持基因表达很重要met 中的模式和细胞身份偶氮生物。哺乳动物多梳抑制去泛素化酶 (PR-DUB) 复合物催化去除组蛋白 H2A 赖氨酸 119 上的单泛素化……阅读更多 »综合组学分析揭示糖尿病肾细胞中的表观遗传记忆调节与肾功能障碍相关的基因。发布时间:2020 年 8 月摘要: 糖尿病肾病 (DKD) 是糖尿病的主要并发症,也是终末期肾功能衰竭的主要原因。表观遗传学与代谢记忆有关,其中高血糖的前期会增加未来发展的风险……阅读更多»探索人类疟疾寄生虫中 CRISPR/dCas9 的毒力基因相互作用组。发布时间:2020 年 8 月摘要:互斥表达var 多基因家族是恶性疟原虫免疫逃避和发病机制的关键,但很少有因素显示出直接作用。我们采用了基于 CRISPR 的蛋白质组学方法来识别新的 fa...阅读更多»不同的和暂时的y 限制性表观遗传机制调节人类 αβ 和 γδ T 细胞发育 发表时间:2020 年 7 月摘要:TCRαβ 和 TCRγδ T 细胞的发育包括一个逐步过程,其中调节事件控制分化和谱系结果。为了阐明这些机制,我们采用了 RNA 测序、ATAC 测序和 Ch...阅读更多 »OxLDL 介导的内皮细胞免疫记忆。发布时间:2020 年 7 月摘要:训练有素的先天免疫描述了代谢重编程和长期促炎激活先天免疫细胞对不同病原体或损伤相关分子模式的反应,例如氧化低密度脂蛋白 (oxLD...阅读更多 »CDK4/6-EZH2 通路是银屑病的潜在治疗靶点。发表时间:2020 年 7 月摘要:银屑病是一种常见的炎症性皮肤病,其特征是角质形成细胞过度增殖和与疾病相关的免疫细胞浸润。在这里,我们确定ied 了一种由细胞周期蛋白依赖性 ki 驱动的新型促炎信号通路……阅读更多 »人​​类整合复合体通过新生转录物的内切核酸切割促进转录延长。发表时间:2020 年 7 月摘要:RNA 聚合酶 II (RNAPII) 的转录是普遍存在于人类基因组中。然而,控制启动子和增强子转录的机制仍然是个谜。在这里,我们证明了整合子亚基 11 (INTS11),催化 su...阅读更多 »前列腺癌在转移过程中重新激活发育表观基因组程序。发表时间:2020 年 7 月摘要:表观遗传过程控制前列腺癌 (PCa) 生物学,如PCa 细胞对雄激素受体 (AR) 的依赖性,AR 是一种前列腺主转录因子。我们生成了 268 个跨越两个状态转换的表观基因组数据集——从……阅读更多»MeCP2 通过识别 H3K27me3 调节基因表达。发布时间:2020 年 7 月摘要:MeCP2 在基因表达调控和染色质组织中起着多方面的作用。 MeCP2 与甲基化 DNA 之间在基因表达调控中的相互作用已得到充分证实。然而,MeCP2 的广泛分布表明……阅读更多 »暴露于低水平电离辐射的水蚤的表观遗传、转录和表型反应发表时间:2020 年 7 月摘要:已知电离辐射会引起氧化应激和 DNA 损伤以及表观遗传对水生生物的影响。表观遗传变化可能是保护生物体免受辐射引起的损伤的适应性反应的一部分,或充当驱动因素……阅读更多 »周围神经系统髓鞘形成需要 Egr2 引导的组蛋白 H2B 单泛素化。发布时间:2020 年 7 月摘要:雪旺细胞是周围神经系统的神经鞘细胞。雪旺细胞或其髓鞘的缺失、丢失和功能障碍会导致周围神经病,例如 Charcot-Mar即人类的牙病。在 Schwann ce 期间...阅读更多 »基因中的过早终止密码子会导致局部 mRNA 合成减少。发布时间:2020 年 7 月摘要:杜氏肌营养不良症 (DMD) 是由导致过早终止密码子 (PTC) 存在的基因突变引起的.先前的转录研究表明,DMD 患者和动物模型肌肉中的 DMD 转录水平降低了……阅读更多 »人​​类 Th17 细胞新型分子标记的鉴定。发表时间:2020 年 7 月摘要:Th17 细胞是宿主防御病原体的重要参与者,例如作为 、 和 。 Th17 细胞介导的炎症,在免疫系统平衡被破坏的某些条件下,是某些 au 的潜在致病机制……阅读更多»FiTAc-seq:用于 H3K27ac 分析和超级增强子的固定组织 ChIP-seq FFPE 组织分析。发布时间:2020 年 6 月摘要:用于 H3K27 乙酰化 (H3K27ac) 分析 (FiTAc-s) 的固定组织 ChIP-seqeq) 是一种表观遗传学方法,用于分析福尔马林固定、石蜡包埋 (FFPE) 组织中的活性增强子和启动子。我们之前开发了一种改良的 ChIP-seq 原型……阅读更多 »IVF/ICSI 胎盘样品中印记基因的低甲基化与组蛋白修饰的伴随变化有关。发布时间:2020 年 6 月摘要:尽管越来越多的孩子出生于辅助生殖技术 (ART),ART 的安全性尚未得到充分论证。值得注意的是,ART 可能会干扰植入的微妙步骤,并引发与胎盘相关的不良后果……阅读更多»使用无浆细胞 DNA 甲基化组检测和辨别颅内肿瘤。发表时间:2020 年 6 月摘要:颅内肿瘤的明确诊断肿瘤依赖于通过侵入性手术获得的组织标本。非侵入性诊断方法提供了避免手术和减轻患者不必要风险的机会。在本研究中,我们展示...阅读更多»使用血浆和尿液无细胞 DNA 甲基化组检测肾细胞癌。发布时间:2020 年 6 月摘要:改进早期癌症检测有可能大幅降低癌症相关死亡率。无细胞甲基化 DNA 免疫沉淀和高通量测序 (cfMeDIP-seq) 是一种高度敏感的检测方法,能够检测早期 s...阅读更多 »Dppa2 和 4 在多能性中的表观遗传启动促进了多谱系承诺。发布时间:6 月, 2020 摘要:表观遗传图景如何在发育过程中建立尚待阐明。在这里,我们发现发育多能性相关 2 和 4 (DPPA2/4) 作为表观遗传启动因子,在亚细胞处建立一个允许的表观遗传景观……阅读更多»耐药性 EML4-ALK 重排肺癌对转录抑制的脆弱性。已发布: 2020 年 6 月摘要:肺腺癌的一个子集是由 EML4-ALK 易位驱动的。尽管 ALK 抑制临床上的 ors 导致出色的初始反应,由于靶向突变或平行通路改变而对这些抑制剂产生耐药性……阅读更多 »PRMT5 的基因组失调支持慢性淋巴细胞白血病的生长和应激耐受性。发布时间:2020 年 6 月摘要:患有慢性淋巴细胞白血病 (CLL) 的患者表现出高度多样化的临床过程,从惰性病例到侵袭性疾病,具有类似于这种多样性的遗传和表观遗传特征。在这里,我们开发了一个全面的……阅读更多»DNA 甲基化动力学是非洲爪蟾蝌蚪大脑变质基因调控程序的基础。发表时间:2020 年 6 月摘要:DNA 中胞嘧啶残基的甲基化影响染色质结构和基因转录,其调控对于大脑发育。越来越多的证据表明,DNA 甲基化可以通过激素信号进行调节。我们分析了……阅读更多 »优化的染色质免疫沉淀本塞姆氏烟草淀粉叶离子 (ChIP) 方法研究异源四倍体植物的组蛋白修饰发布时间:2020 年 6 月摘要:所有开花植物在整个进化过程中都经历了多轮多倍体进化。预计多倍体植物中亚基因组之间的基因组间相互作用会诱导染色质修饰,例如组蛋白修饰……阅读更多»雌激素诱导动态 ERα 和 RING1B 募集以控制管腔乳腺癌中的基因和增强子活性发布时间:2020 年 6 月摘要:RING1B,一个核心 Polycomb抑制复合物 1 亚基,是一种组蛋白 H2A 泛素连接酶,对发育至关重要。 RING1B 在管腔乳腺癌 (BC) 患者中过度表达,并被招募到积极转录的基因和增强子共同发生……阅读更多人类迪拉ted cardiomyopathy。发布时间:2020 年 6 月摘要:背景:组蛋白的乙酰化和甲基化会改变染色质结构和可及性,从而影响转录调节因子与增强子和启动子的结合。转录调节因子的结合使两者之间能够相互作用……阅读更多 »异染色质的扩散和表观遗传遗传所需的保守 RNA 降解复合物。发表时间:2020 年 6 月摘要:含有组蛋白 H3 赖氨酸 9 甲基化 (H3K9me) 的异染色质结构域可以表观遗传独立于底层 DNA 序列。为了深入了解介导表观遗传的机制,我们使用了可诱导的 hete...阅读更多 »代际维持的组蛋白 H4 赖氨酸 16 乙酰化对未来基因激活具有指导意义。发布时间:2020 年 6 月摘要:在合子基因组激活 (ZGA) 之前,静止基因组经历重新编程以转变为转录活性状态。如何曾经,早期胚胎发生过程中常染色质建立的潜在机制仍然很差……阅读更多 »IVF/ICSI 胎盘样本中印记基因的低甲基化与组蛋白修饰的伴随变化有关。发布时间:2020 年 6 月摘要:尽管越来越多的儿童由辅助生殖技术 (ART) 诞生,ART 的安全性尚未得到充分论证。值得注意的是,ART 可能会扰乱植入的微妙步骤,并引发与胎盘相关的不良后果……阅读更多»AXR1 影响 DNA 甲基化,与其在调节减数分裂交叉定位中的作用无关。发表时间:2020 年 6 月摘要:减数分裂交叉 (COs)对重组同源染色体之间的遗传信息很重要,它们对于它们的正确分离是必不可少的。 CO 沿染色体分布不均匀,潜在机制控制着……阅读更多»20S 蛋白酶体激活剂 PA28γ 控制 compaction of chromatin 发表时间:2020 年 5 月摘要:已知核 PA28γ 可激活 20S 蛋白酶体,但其确切的细胞功能仍不清楚。在这里,我们将 PA28γ 确定为构建异染色质的关键因素。我们发现在人类细胞中,一小部分 PA28&gam...阅读更多»高通量报告分析的整合确定了 Ikzf1 基因的关键增强子。发表时间:2020 年 5 月摘要:Ikzf1 基因座编码淋巴特异性转录因子 Ikaros,它在 T 细胞和 B 细胞分化中起着重要作用,而 IKZF1/Ikzf1 的失调或突变与白血病有关。组织特异性和细胞身份...阅读更多 »测量人类寄生虫曼氏血吸虫中的组蛋白修饰 发表时间:2020 年 5 月摘要:DNA 结合蛋白在曼氏血吸虫的发育和性生物学等许多主要过程中发挥着关键作用,并且非常重要用于血吸虫病的发病机制。 C染色质免疫沉淀 (ChIP) 实验,然后进行……阅读更多 »Silene latifolia X 和 Y 染色体中的组蛋白翻译后修饰表明存在类似哺乳动物的剂量补偿系统发表时间:2020 年 5 月摘要:Silene latifolia 是研究进化年轻异形的模式生物植物性染色体的进化。先前的研究表明 Y 等位基因退化和剂量补偿系统已经在运行。在这里,我们提出了一种 epi...阅读更多 »AP-1 控制 p11 依赖性抗抑郁反应。发布时间:2020 年 5 月摘要:选择性 5-羟色胺再摄取抑制剂 (SSRIs) 是治疗情绪障碍最广泛使用的处方药。虽然 SSRI 的作用机制尚不清楚,但 SSRI 被认为通过提高细胞外血清素水平发挥治疗作用……阅读更多 »2,4-二烯酰辅酶 A 还原酶调节难治性前列腺癌的脂质稳态。发表时间:5 月, 2020摘要:尽管诊所尽管雄激素受体 (AR) 靶向治疗取得了成功,但 AR 信号的重新激活仍然是去势抵抗性前列腺癌 (CRPC) 进展的主要驱动因素。在这项研究中,我们表现出全面的无偏见特征……阅读更多»肌肉干细胞坏死性凋亡的减弱表观遗传抑制是营养不良性肌肉的有效再生所必需的。发表时间:2020 年 5 月摘要:体细胞干细胞在组织再生过程中大量扩张,这可能需要控制细胞适应性,允许消除非竞争性、潜在有害的细胞。如何或是否去除这些细胞以恢复器官功能尚不完全...阅读更多»β-葡聚糖诱导针对结核分枝杆菌感染的保护性训练免疫:IL-1 的关键作用。发布时间:2020 年 5 月摘要:β-葡聚糖是先天免疫细胞表观遗传和功能重编程的有效诱导剂,这一过程称为\"训练免疫”,导致宿主对 s 的反应增强继发感染。我们调查 β-葡聚糖 exp...阅读更多 »DNA 甲基化酶和 PRC1 限制 B 细胞爱泼斯坦-巴尔病毒癌蛋白表达。发表时间:2020 年 5 月摘要:为了完成终身感染的非凡任务,爱泼斯坦-巴尔病毒 ( EBV) 在四​​种病毒基因组潜伏期和裂解程序之间切换,以导航 B 细胞区室并逃避免疫反应。改造计划,consis...阅读更多»与差异行为模式相关的蛋鸡大脑中的 DNA 甲基化变异发布时间:2020 年 5 月摘要:家养动物在研究遗传和非遗传因素对特定表型的贡献方面是独一无二的。参与表型形成的非遗传因素包括表观遗传机制。在这里,我们旨在确定是否相关……阅读更多»TET3 在神经承诺过程中控制 H3K27me3 去甲基化酶 Kdm6b 的表达。发布时间:2020 年 5 月摘要:收购细胞身份的变化与细胞组蛋白甲基化特征的发育调节变化有关。例如,对神经分化的承诺依赖于 H3K27me3 的严格控制增益或损失,h...阅读更多 »Homer1a 接受 CREB ​​和生物钟的双峰转录调控。发布时间:2020 年 5 月摘要:积累的证据表明一个重要的昼夜节律紊乱和神经元功能障碍之间存在联系,尽管这种联系背后的分子机制实际上尚未被探索。转录本 Homer1a,一个立即早期基因 ...阅读更多 »重温人类巨细胞病毒立即早期蛋白 1 靶向的早幼粒细胞白血病蛋白。发表时间:2020 年 5 月摘要:早幼粒细胞白血病 (PML) 体是与内在和先天抗病毒防御有关的核细胞器.同名的 PML 蛋白,PML 体自组织的核心,以及在这些蛋白中发现的其他限制因素细胞器 ar...阅读更多 »体外捕获和表征幼稚和初发状态之间的胚胎玫瑰花结阶段多能性。发表时间:2020 年 5 月摘要:植入后,小鼠囊胚的幼稚多能外胚层产生玫瑰花结,经历流腔发生并形成启动的多能卵筒,能够产生胚胎组织。多能性进展如何……阅读更多 »驯化转座酶 ALP2 通过与 MSI1 的直接相互作用介导新型 Polycomb 蛋白复合物的形成,MSI1 是 Polycomb 抑制复合物 2 (PRC2) 的核心亚基。发布时间:2020 年 5 月摘要:大部分植物基因组由转座因子 (TE) 组成,它通过\"驯化”提供了新基因的潜在来源——由 TE 编码的蛋白质在序列上发生分歧的过程,失去了催化能力……阅读更多 »ALAP 基因组分析-Seq 通过 PML 体揭示转录调控h DNMT3A Exclusion。发布时间:2020 年 4 月摘要:早幼粒细胞白血病 (PML) 体是一种与染色质物理相关的相分离核结构,暗示其在基因组功能中的关键作用。然而,其在转录调控中的作用在很大程度上是未知的。我们开发了 APE...阅读更多 »表观遗传景观的生态位特异性重编程驱动非酒精性脂肪性肝炎中的髓样细胞多样性。发表时间:2020 年 4 月摘要:组织驻留和募集的巨噬细胞有助于宿主防御和病理学。多种巨噬细胞表型存在于病变组织中,但我们对控制多样化的机制缺乏深入了解。在这里,我们研究……阅读更多 »SETDB2 通过与 ΔNp63α 蛋白的相互作用和稳定来促进乳腺癌干细胞的维持发表时间:2020 年 4 月摘要:组蛋白 H3K9 甲基转移酶 SETDB2 参与急性白血病的细胞周期失调,并在 g 中具有致癌作用胃癌。在我们的研究中,我们发现 SETDB2 在乳腺癌干细胞维持中起着重要作用。耗尽...阅读更多»老化调节的抗凋亡长链非编码 RNA Sarrah 增强了急性心肌梗塞的恢复。发表时间:2020 年 4 月摘要:长链非编码 RNA (lncRNA) 有助于心脏(病理)生理学。衰老是心血管疾病的主要危险因素,心肌细胞凋亡是一个根本原因。在这里,我们报告了衰老调节的 lncRN 的鉴定……阅读更多 »非编码体细胞突变聚集在卵巢癌的 PAX8 通路上。发表时间:2020 年 4 月摘要:卵巢癌体细胞非编码突变的功能后果(OC) 未知。为了识别受获得性非编码变异扰动的调控元件 (RE) 和基因,我们在这里建立了……的表观基因组学和转录组学景观。阅读更多»疟疾寄生虫从宿主到载体发育的表观遗传图谱。发布d:2020 年 4 月摘要:疟原虫在其脊椎动物宿主的红细胞中无性复制,利用表观遗传机制调节基因表达以响应其环境的变化。我们使用染色质免疫沉淀,然后进行测序……阅读更多 »TGF-β 促纤维化级联以近端小管上皮细胞中的 ecto-5\'-核苷酸酶基因为靶点,是进行性糖尿病肾病的可追踪标志物。发表时间:2020 年 4 月摘要:进行性糖尿病肾病 (DN) 和肾功能丧失与肾纤维化相关。 TGF-β 和腺苷能信号之间的串扰有助于细胞的表型转变和 DN 模型中的肾纤维化。我们评估...阅读更多 »Abo1 是异染色质中 H3K9me2 到 H3K9me3 转变所必需的。发布时间:2020 年 4 月摘要:异染色质调节对于基因组稳定性至关重要。已发现不同的 H3K9 甲基化状态,具有不同的作用n 异染色质形成和沉默。然而,如何控制从 H3K9me2 到 H3K9me3 的转变……阅读更多 »内源性逆转录病毒是急性髓性白血病中具有致癌潜力的增强子的来源发表时间:2020 年 4 月摘要:急性髓性白血病 (AML) 是一种高度侵袭性的造血系统恶性肿瘤,定义为通过一系列遗传和表观遗传改变,导致转录网络失调。一个未被充分研究但重要的转录源……阅读更多»TET 介导的高甲基化引发 SDH 缺陷细胞,用于 HIF2α 驱动的间充质转化。发表时间:2020 年 3 月摘要:琥珀酸脱氢酶 SDHB 亚基的功能丧失突变使患者易患以假性缺氧和高甲基化表型为特征的侵袭性肿瘤。导致 DNA 高甲基化及其持续时间的机制……阅读更多 »wo Jurkat 细胞模型。发布时间:2020 年 3 月摘要:治愈 HIV-1 的主要障碍是尽管接受了抗逆转录病毒药物治疗,但潜在基因组仍然存在。为了研究促进 HIV-1 潜伏期的宿主因素,我们在 HI 中使用 CRISPR-Cas9 进行了全基因组功能性敲除筛选……阅读更多 »用于前列腺癌治疗的雄激素受体的差异调节取决于 DNA 反应元件。发布时间:2020 年 3 月摘要:雄激素受体 (AR) 作用是前列腺癌 (PCa) 的标志,雄激素剥夺是标准疗法。然而,耐药性的出现和异常的 AR 信号促进了疾病。我们寻找抑制驱动癌症的基因的化合物,但 n...阅读更多»高密度未修复的基因组核糖核苷酸导致拓扑异构酶 1 介导的严重生长缺陷,在没有核糖核苷酸还原酶的情况下。发表时间:2020 年 3 月摘要:三磷酸核糖核苷 (rNTPs) 的细胞水平) 远高于 deo木糖核苷三磷酸 (dNTP),从而影响 DNA 聚合酶 (Pol) 掺入核糖核苷单磷酸 (rNMP) 的频率,我...阅读更多 »Alu 反转录转座子通过芳烃受体通过区域染色质构象的动态变化调节 Nanog 表达。发表: 2020 年 3 月摘要:Nanog 的转录抑制是干细胞分化的重要标志。染色质修饰与 Nanog 基因的表观遗传特征有关,但染色质组织是否真的在 Nan 中起因果作用……阅读更多 »LXR 激活在人类单核细胞中诱导促炎训练的先天免疫表型发表时间:2020 年 3 月摘要:The受过训练的先天免疫的概念描述了先天免疫细胞中的长期促炎记忆。训练有素的先天免疫通过重新编程细胞代谢途径(包括胆固醇和脂肪酸合成)来调节。 H...阅读更多 »CDK7 抑制作用对所有乳腺癌亚型均有效:EGFR 抑制作用的反应和协同作用的决定因素。发布时间:2020 年 3 月摘要:CDK7 是一种转录细胞周期蛋白依赖性激酶,正在成为一种新的癌症靶点。据报道,三阴性乳腺癌 (TNBC) 而不是雌激素受体阳性 (ER+) 乳腺癌对 CDK7 抑制剂特别敏感……阅读更多 »ChromID 识别染色质标记处的蛋白质相互作用组。发表时间:2020 年 3 月摘要: 染色质修饰通过将蛋白质募集到基因组来调节基因组功能。然而,不同染色质修饰处的蛋白质组成尚未完全表征。在这项研究中,我们使用天然蛋白质结构域作为模量……阅读更多 »HDAC3 在 Notch 信号转导中起正调节作用。发表时间:2020 年 2 月摘要:异常 Notch 信号在 T 细胞急性淋巴细胞白血病 (T) 中起着关键作用-ALL) 和慢性 l淋巴细胞白血病 (CLL)。 Notch 反应的幅度和持续时间由 N 的泛素依赖性蛋白酶体降解控制……阅读更多»MORC 驱动的转录开关控制弓形虫发育轨迹和性承诺。发布时间:2020 年 2 月摘要:弓形虫生活复杂以发生在脊椎动物中的无性发育和只发生在猫科动物中的有性生殖为代表的周期,因此研究较少。发育转变依赖于 ch...阅读更多 »转铁蛋白受体 1 调节棕色/米色脂肪细胞的生热能力和细胞命运发表时间:2020 年 2 月摘要:铁稳态对于维持多种细胞类型的细胞功能至关重要。然而,铁是否影响脂肪细胞的产热特性目前尚不清楚。使用多组学数据的综合分析,转铁蛋白……阅读更多»重组可能发生在缺席的情况下免疫球蛋白重链重组中心转录的 ce。发布时间:2020 年 2 月摘要:发育中的 B 细胞进行 V(D)J 重组以产生大量 Ig 分子。 V(D)J 重组由重组中心 (RC) 中的 RAG1/RAG2 复合体启动,复合体可访问基因片段。是否...阅读更多 »CTCF 相关染色质邻域的改变会抑制 TAL1 驱动的致癌转录程序和白血病发生。发表时间:2020 年 2 月摘要:TAL1 的异常激活与高达 60% 的 T-ALL 病例相关,并且参与 TAL1 基因座内 CTCF 介导的基因组组织,表明 CTCF 边界在 T-ALL 中起致病作用。在这里,我们展示了 -31-Kb CTCF ...阅读更多 »通过 CRISPR 引导的 5-甲基胞嘧啶切除进行 DNA 甲基化编辑。发布时间:2020 年 2 月摘要:需要主动靶向 DNA 去甲基化的工具来增加我们对这种重要的表观遗传修饰的调节和特定功能。哺乳动物的 DNA 去甲基化涉及 TET 介导的 5-甲基胞嘧啶氧化……阅读更多 »星形胶质细胞和神经元中沉默表观遗传标记 H3K9me3 的广泛缺失以及 C9orf72 BAC 转基因小鼠的海马依赖性认知障碍。发布时间:2020 年 2 月摘要:背景:C9ORF72 基因非编码区 GC 基序的六核苷酸重复扩增是肌萎缩侧索硬化症 (ALS) 和额颞叶痴呆 (FTD) 最常见的遗传原因。来自 C9ALS/FTD 患者的组织和……阅读更多 »抑制 zeste 2 增强子的甲基转移酶活性导致斑马鱼脂质积累增强和染色质状态改变。发表时间:2020 年 2 月摘要:背景:最近的研究表明,暴露于环境化学品可能会增加对代谢性疾病的易感性。这种敏感性可能部分是因为被表观遗传景观的变化所使用,从而影响 g...阅读更多 »将巨噬细胞组蛋白 H3 修饰作为利什曼原虫策略来抑制 NF-κB/NLRP3 介导的炎症反应。发表时间:2020 年 2 月摘要:细胞内巨噬细胞异常激活感染会产生可导致严重人类发病的免疫病理学。更好地了解免疫颠覆策略和巨噬细胞表型和功能反应是必要的……阅读更多»IκBζ 的苏氨酸磷酸化介导选择性促炎靶基因的抑制。发表时间:2020 年 2 月摘要:NF-κB 家族的转录因子起着至关重要的作用通过激活参与病原体清除的趋化因子、细胞因子和抗菌肽的表达来发挥免疫反应的作用。 IκBζ,一种非典型核 Iκ...阅读更多»Polycomb 组蛋白调节小鼠卵母细胞和早期卵母细胞的染色质结构Embryos。发布时间:2020 年 2 月摘要:在哺乳动物中,染色质组织在卵母细胞发育过程中经历了剧烈的重组。然而,在此过程中三维染色质结构的动力学特征很差。使用低输入 Hi-C(全基因组染色质 conf...阅读更多 »长链非编码 RNA uc.291 通过干扰 ACTL6A/BAF 复合体来控制上皮细胞分化。发布时间:2020 年 2 月摘要:调节表皮祖细胞状态和分化之间的转换尚不完全清楚。最近的研究结果表明,染色质重塑 BAF 复合物(Brg1 相关因子复合物或 SWI/SNF 复合物)和……阅读更多 »Tissue alarmins and adaptive cytokine induce dynamic and distinct组织驻留的上皮内细胞毒性 T 淋巴细胞的转录反应。发表时间:2020 年 2 月摘要:组织警报蛋白白细胞介素 (IL)-15 和干扰素 β (IFNβ) 的各自作用,T 细胞产生的 IL-21 对导致乳糜泻组织破坏的细胞毒性 T 淋巴细胞 (CTL) 重编程的作用知之甚少……阅读更多 »H3K27me3 在哺乳动物细胞中的复制稀释和平衡启动子的作用。已发表: 2020 年 1 月摘要:Polycomb 抑制复合物 2 (PRC2) 将 H3K27me3 置于发育基因处,并与保持二价基因沉默有因果关系。目前尚不清楚这种沉默是否需要最低 H3K27me3 水平以及该标记如何忠实地跨 ma 传递……阅读更多 »抑制组蛋白去乙酰化可挽救 Birk-Barel 智力障碍综合征小鼠模型的表型。发布时间:2020 年 1 月摘要:突变印记 KCNK9 基因的积极表达的母系等位基因导致 Birk-Barel 智力障碍综合征 (BBIDS)。使用 BBIDS 小鼠模型,我们在这里确定了 BBIDS 样行为和神经元苯酚的部分拯救……阅读更多»miR-155 抑制线粒体通过抑制 PINK1 的伴侣蛋白 BAG5 进行吞噬。发布时间:2020 年 1 月摘要:去除功能失调的线粒体是维持正常细胞生理学的重要步骤,线粒体中的选择性自噬(称为线粒体自噬)在线粒体质量控制中起着关键作用。在多种疾病和衰老中,d...阅读更多 »在 T 细胞激活过程中,染色质开放需要由共刺激诱导的 AP-1 活性。发布时间:2020 年 1 月摘要:T 细胞的激活取决于有组织和及时的染色质的打开和关闭。在此,我们将 AP-1 确定为指导大部分重塑的转录因子。染色质可及性分析显示 c 的快速打开……阅读更多»对表型可区分、基因相同的雌性和雄性水蚤进行综合表观基因组分析。发表时间:2020 年 1 月摘要:背景:水蚤物种通过涉及两个 s 的周期性孤雌生殖进行繁殖性繁殖和无性繁殖。后代的性别由环境决定,并通过母亲的内分泌信号介导。有趣的是,男性和女性……阅读更多»LPS 或 PolyIC 暴露后猪肺泡巨噬细胞基因调控区 H3K27ac 的变化。发表时间:2020 年 1 月摘要:染色质结构的变化,尤其是组蛋白修饰 (HMs) 的变化,与染色质可及性相关对于转录机制,被认为在转录调控中发挥重要作用。肺泡巨噬细胞 (AM) 是重要的……阅读更多 »通过天然染色质免疫沉淀法分析啮齿动物胰岛中的组蛋白修饰。发表时间:2020 年 1 月摘要:朗格汉斯岛是分散在整个胰腺中的细胞簇,可产生多种激素,这些激素对于控制各种代谢过程,包括葡萄糖稳态和脂质代谢。研究转录本...阅读更多 »TIP60/P400/H4K12ac 在乳腺癌中作为异染色质备用骨架发挥作用。发表时间:2020 年 1 月摘要:背景/目的:在乳腺癌中,癌变的启动导致表观遗传失调,例如可能导致异染色质骨架 SUV39H1/H3K9me3/HP1 或假设的二级骨架 TIP60/P400/H4K12ac/BRD ...阅读更多 »DZNEP 或 SiRNA 对组蛋白甲基转移酶 EZH2 的抑制表明其参与 MGMT、TRA2A、RPS6KA2 和 U2AF1 基因前列腺癌的监管。发布时间:2019 年 12 月摘要:在法国,前列腺癌是男性最常见的癌症(Bray 等人,2018 年)。此前,我们的团队曾报道过前列腺癌中表观遗传因素的参与 (Ngollo et al., 2014, 2017)。组蛋白 3 赖氨酸 27 三甲基化(H3K27m...阅读更多 »通过结合结构和功能基因组学绘制活化 B 细胞的顺式调节组图。发布时间:2019 年 12 月摘要:顺式调节组es 潜在的免疫细胞特异性基因组状态已通过基于结构的染色质分析进行了广泛分析。通过将此类方法与高通量增强子筛选(自转录活性调节区序列)相结合……阅读更多»揭示 H3K4 三甲基化和 lncRNA HOTAIR 在 SATB1 和 DUSP4 依赖性巨噬细胞结核分枝杆菌存活中的作用发表于:12 月, 2019 摘要:染色质的修饰影响细菌感染期间的宿主转录程序,有时会扭曲平衡以支持病原体存活。为了测试染色质修饰在结核分枝杆菌感染过程中的作用,...阅读更多 »等位基因 H3K27me3 到等位基因 DNA 甲基化开关在胚外细胞中维持非典型印记 发表时间:2019 年 12 月摘要:忠实维持基因组印记对哺乳动物发育至关重要。而种系 DNA 甲基化依赖性(典型)印记nting 在发育过程中相对稳定,最近发现卵母细胞衍生的 H3K27me3 介导的 n...阅读更多»使用组蛋白标记芯片序列功能注释马基因组中的调控元件。发布时间:2019 年 12 月摘要:主要目标之一动物基因组功能注释 (FAANG) 计划旨在描述动物基因组内的组织特异性调控。为此,我们使用染色质免疫沉淀和测序 (ChIP-Seq) 来……阅读更多 »H3K4me1 支持由全身炎症诱导的记忆样 NK 细胞。发表时间:2019 年 12 月摘要:自然杀伤 (NK) 细胞是独特的参与者在先天免疫中,因此是免疫治疗的一个有吸引力的目标。 NK 细胞在某些模型中显示出免疫记忆特性,但 NK 细胞在全身炎症后的长期状态……阅读更多 »抑制组蛋白去甲基化酶 LSD1 和 UTX 调节乳腺癌中的 ERα 信号。发布时间:12 月 20 日19 摘要:在乳腺癌中,赖氨酸特异性去甲基化酶 1 (LSD1) 和其他赖氨酸去甲基化酶 (KDM),例如赖氨酸特异性去甲基化酶 6A,也称为泛在转录四肽重复序列、X 染色体 (UTX),是共表达和共表达的。 -locali...阅读更多 »训练有素的免疫调节炎症诱导的纤维化。发布时间:2019 年 12 月摘要:慢性炎症和纤维化可能是由巨噬细胞介导的不当激活的免疫反应引起的。巨噬细胞可以获得类似记忆的特征以响应抗原暴露。在这里,我们展示了 BCG 或……阅读更多 »Mkt1 是裂殖酵母中 RNAi 介导的沉默和异染色质建立所必需的。发表时间:2019 年 12 月摘要:抑制性异染色质的组成域通过裂殖酵母基因组维持涉及组蛋白甲基化和小 RNA 的自我强化机制。由异色 r 产生的非编码 RNAegions 正在处理……阅读更多 »一项关于高级别浆液性卵巢癌起源的研究表明 SOX18 转录因子在肿瘤发展中的作用。发表时间:2019 年 12 月摘要:输卵管分泌性上皮细胞 (FTSECs) 可能是卵巢癌的主要前体细胞类型高级别浆液性卵巢癌 (HGSOC),但这些肿瘤也可能起源于卵巢表面上皮细胞 (OSEC)。我们分析了全球景观 ...阅读更多 »USP22 依赖性 HSP90AB1 表达促进了乳腺癌和结直肠癌对 HSP90 抑制的抵抗力。发表时间:2019 年 12 月摘要:作为 11 基因\"癌症死亡”基因表达特征的成员,泛素特异性蛋白酶 22 (USP22) 的过度表达与各种人类恶性肿瘤的不良预后有关。研究 USP22 在癌症中的功能……阅读更多 »SIRT1/2 协调 DNA 甲基化的获取和组蛋白 H3 激活标记的丢失,以防止炎症过早激活巨噬细胞中的 atory 基因。发布时间:2019 年 12 月摘要:Sirtuins 1 和 2 (SIRT1/2) 是两种 NAD 依赖性脱乙酰酶,在炎症中起主要作用。除了使组蛋白和其他蛋白质去乙酰化外,SIRT1/2 介导的调节还与其他表观遗传酶相结合。在这里,我们调查……阅读更多 »丙戊酸钠和 5-aza-2\'-脱氧胞苷差异调节 G1 期阻滞和增殖性 HeLa 细胞中的 DNA 去甲基化。发表时间:2019 年 12 月摘要:丙戊酸钠/丙戊酸 (VPA) ,一种组蛋白脱乙酰酶抑制剂,和 5-aza-2-deoxycytidine (5-aza-CdR),一种 DNA 甲基转移酶 1 (DNMT1) 抑制剂,在多种细胞类型中诱导 DNA 去甲基化。在 HeLa 细胞中,尽管 VPA 导致减少……阅读更多 »Episo:通过亚硫酸氢盐处理的 RNA 的高通量测序在亚型水平上定量估计 RNA 5-甲基胞嘧啶。发表时间:2019 年 12 月摘要:动机:RNA 5-甲基胞嘧啶(m5C) 是一种后转录可能参与许多生物过程和肿瘤发生的局部修饰。 RNA m5C 可以通过对...的高通量测序以单核苷酸分辨率进行分析……阅读更多»MicroRNA-708 是髓样细胞中 Hoxa9 程序的新型调节剂。发表时间:2019 年 11 月摘要:MicroRNAs (miRNAs) 通常被解除管制在急性髓性白血病 (AML) 中,不仅通过直接靶向影响关键基因,还通过调节下游效应子来影响关键基因。同源盒 (Hox) 基因平衡自我更新、增殖、...阅读更多 »皮质 DNA 甲基化组的代内和代际变化对小鼠治疗性间歇性缺氧的反应。发布时间:2019 年 11 月摘要:我们实验室的最新证据记录了来自父母在繁殖前暴露于重复性缺氧条件 (RHC) 的未治疗小鼠对视网膜​​缺血性损伤的功能恢复能力。开始了解这个的表观遗传基础 ...阅读更多 »R-Loops 促进整个哺乳动物基因组的反义转录发表时间:2019 年 11 月摘要:广泛分布的反义长链非编码 RNA (lncRNA) 与哺乳动物中的许多蛋白质编码基因重叠,并源自基因启动子、增强子和终止区。然而,它们的起源和生物学目的仍不清楚。我们表明这些...阅读更多»低亲和力结合对 RCO 的自动调节调节细胞分裂素作用并塑造叶片多样性。发表时间:2019 年 11 月摘要:基因调控的进化导致形态多样性的机制在很大程度上尚不清楚。植物叶子之间巨大的形状变化为解决这个问题提供了诱人的机会。在十字花科植物中,RE...阅读更多»CREB5 促进前列腺癌对雄激素受体拮抗剂和雄激素剥夺的耐药性。发表时间:2019 年 11 月摘要:雄激素受体 (AR) 抑制剂,包括恩杂鲁胺,用于治疗所有我转移性去势抵抗性前列腺癌 (mCRPC)。然而,有些患者会产生耐药性或永远不会产生反应。我们发现转录因子 C...阅读更多 »复发性 SMARCB1 突变揭示了一个核小体酸性斑块相互作用位点,该位点增强了 mSWI/SNF 复合染色质重塑。发布时间:2019 年 11 月摘要:哺乳动物开关/蔗糖不可发酵 (mSWI/SNF)复合体是重塑染色质结构的多组分机器。需要对复杂活动的亚基和域特定贡献进行剖析,以推进机械和……阅读更多 »MicroRNAs 建立脊椎动物心脏偏侧通路的右手优势发表时间:2019 年 11 月摘要:尽管它们具有外部双侧对称性,脊椎动物具有最佳器官功能所需的内部左/右 (L/R) 不对称性。侧板中胚层 (LPM) 中 BMP 诱导的上皮间质转化 (EMT) 触发 L/R 不对称...阅读更多 »锂治疗可逆转辐射引起的啮齿动物神经祖细胞变化并恢复认知。发布时间:2019 年 11 月摘要:儿童颅脑放疗对年轻癌症幸存者的认知、情绪和社交能力有不利影响。利用海马神经发生的治疗目前在这方面具有重要意义。锂,一种众所周知的 mo...阅读更多 »男性不育症的精子 DNA 甲基化外突变生物标志物和 FSH 治疗反应性。发表时间:2019 年 11 月摘要:男性不育症正在增加,并被认为在生殖健康和疾病中发挥着关键作用。目前的主要诊断方法是评估与精子数量和活力减少相关的精子质量,这一直是他的……阅读更多»不同的 IL-1α 反应增强剂以分层方式促进染色质拓扑结构的急性和协调变化。发表: 2019 年 11 月摘要:细胞因子如何驱动变化染色质拓扑结构在炎症过程中被转化为基因调控回路仍不清楚。在这里,我们表明白细胞介素 (IL)-1α 诱导染色质可及性的急性和广泛变化 v...阅读更多»天然染色质蛋白质组学揭示了特定核孔蛋白在异染色质组织和维护中的作用。发布时间:2019 年 11 月摘要:空间和功能异染色质和常染色质的不同结构域在维持染色体稳定性和基因表达调控方面发挥着重要作用,但缺乏对其组成的全面了解。在这里,……阅读更多 »表观遗传重塑允许成人胆管细胞用于类器官形成和肝脏再生。发布时间:2019 年 11 月摘要:严重或慢性肝损伤后,成人导管细胞(胆管细胞)通过恢复肝细胞和胆管细胞促进再生。我们最近发现导管细胞克隆扩张作为自我更新的肝脏类器官,r...阅读更多»蛋氨酸在健康和癌症中的代谢:饮食和精准医疗的关系。发表时间:2019 年 11 月摘要:蛋氨酸摄取和代谢涉及许多细胞功能,包括甲基化反应,氧化还原维持、多胺合成和与叶酸代谢的偶联,从而协调核苷酸和氧化还原状态。这些 fu 中的每一个……阅读更多 »表观遗传跨代遗传异交病理学和精子 epimutations 的起源亲本等位基因传递发表于:2019 年 10 月摘要:表观遗传跨代遗传可能影响疾病病因、表型变异和进化。从营养到毒物,越来越多的环境因素已被证明可以促进表观遗传转基因……阅读更多 »谱系决定因子 GRHL2 与 FOXA1 合作建立内分泌治疗耐药 Bre 的靶向途径ast Cancer。发布时间:2019 年 10 月摘要:尽管内分泌疗法对雌激素受体-α (ERα) 阳性乳腺癌具有积极的临床影响,但新生和获得性耐药性限制了现有药物的治疗寿命。采取 resistan 的立场……阅读更多 »TET2 调节小胶质细胞的神经炎症反应。发布时间:2019 年 10 月摘要:表观基因组机制调节免疫细胞炎症反应的不同方面。尽管小胶质细胞在神经炎症和神经变性中起着核心作用,但人们对其炎症的表观基因组调节知之甚少……阅读更多 »秀丽隐杆线虫中 SET1/COMPASS 复合物成分 CFP-1 和 Sin3S HDAC 复合物之间的物理和功能相互作用。发布时间:2019 年 10 月摘要:CFP1 CXXC 锌指蛋白将 SET1/COMPASS 复合物靶向非甲基化富含 CpG 的启动子,以实现组蛋白 H3 Lys4 (H3K4me3) 的三甲基化。虽然H3K4me3 与基因表达、CFP1 损失的影响广泛相关...阅读更多 »CURLY LEAF 通过控制植物中 ARGONAUTE 1 的降解来调节微 RNA 活性。发表时间:2019 年 10 月摘要:CURLY LEAF (CLF) 编码甲基转移酶子- Polycomb Repressor Complex 2 (PRC2) 的单元,通过 H3K27 三甲基化调节靶基因的表达。我们使用遗传筛选分离出一个新的 CLF 突变等位基因 (clf-78)...阅读更多 »表观基因组学特征支持背根神经节感觉神经元的轴突再生能力。发布时间:2019 年 10 月摘要:轴突损伤导致再生成功或失败, 取决于轴突分别位于外周还是 CNS。本研究解决了背根神经节中的表观遗传特征是否区分再生……阅读更多»神经胶质瘤的转录改变主要是由 DNA 甲基化独立机制引起的。发表于:October, 2019 摘要:在癌细胞中,异常的 DNA 甲基化通常与转录改变相关,包括肿瘤抑制基因的沉默。然而,多种表观遗传机制,包括 polycomb 抑制标记,有助于基因 dere...阅读更多»分析 PRMT 及其底物的表观基因组功能。发布时间:2019 年 9 月摘要:在广泛且越来越多的已识别翻译后修饰(PTM)中), 精氨酸甲基化由蛋白质精氨酸甲基转移酶 (PRMT) 催化,并调节细胞中的基本过程,例如基因调节……阅读更多 »t(8;21) AML 中的 RUNX1-ETO 耗竭导致 C/EBPα- 和AP-1 介导的增强子-启动子相互作用的改变。发布时间:2019 年 9 月摘要:急性髓系白血病 (AML) 与损害髓系分化的转录和表观遗传调节基因突变有关。 t(8;21)(q22;q22) 易位产生 RUNX1-ETO融合蛋白,干扰下摆……阅读更多»生发中心 B 细胞中 CREBBP 和 EP300 乙酰转移酶的独特和共享表观遗传程序揭示了淋巴瘤中的可靶向依赖性。发表时间:2019 年 9 月摘要:CREBBP 和 EP300 乙酰转移酶的失活突变是弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL) 和滤泡性淋巴瘤 (FL) 中最常见的遗传改变之一。在这里,我们检查了这两种酶之间的关系……阅读更多»与波兰人群结直肠癌相关的低外显率风险变异 rs6702619/1p21.2 的功能分析。发表时间:2019 年 9 月摘要:几项研究采用了基因组单核苷酸多态性 (SNP) 的全关联 (GWA) 分析,以确定结直肠癌 (CRC) 的易感区域。然而,探索 SNP 与……相关联作用的功能研究阅读更多»骨质疏松症和骨关节炎之间的关系基于 DNA 甲基化的 s 发表时间:2019 年 9 月摘要::本研究的目的是通过分析骨质疏松症和骨关节炎中的 DNA 甲基化来研究骨质疏松症和骨关节炎之间的关系。从总共 12 名住院患者中收集了松质骨标本……阅读更多»通过同源重组改进 COL7A1 编辑的双切口策略发布时间:2019 年 9 月摘要:目前用于治疗隐性营养不良性大疱性表皮松解症 (RDEB) 的基因编辑方法,一种遗传性、严重形式的水疱性皮肤病,效率低下且存在安全隐患,使临床研究的实施复杂化……阅读更多 »通过同源重组改进 COL7A1 编辑的双切口策略。发布时间:2019 年 9 月摘要:当前基因- 治疗隐性营养不良性大疱性表皮松解症 (RDEB) 的编辑方法,RDEB 是一种遗传性、严重的水疱性皮肤病,患有低效率和安全问题使临床 s 的实施复杂化……阅读更多 »β-葡聚糖诱导的训练免疫可预防巴西利什曼原虫感染:IL-32 的关键作用。发布时间:2019 年 9 月摘要:美国皮肤利什曼病是一种载体-由利什曼原虫引起的传播性寄生虫病。先天免疫细胞经历长期功能重编程以响应感染或卡介苗 (BCG) 疫苗接种 vi...阅读更多 »KLF4 在人类头颈部鳞状细胞癌中重新激活超级增强子。发布时间:2019 年 9 月摘要: 头颈部鳞状细胞癌 (HNSCC) 是一种发病率和死亡率都很高的疾病,很少在早期诊断出来。尽管有广泛的遗传和基因组特征,但 HNSCC 的靶向治疗和诊断标记物...阅读更多»为血浆无细胞 DNA 的甲基化组分析准备 cfMeDIP-seq 文库。已发表:Au阵风,2019 年摘要:循环游离 DNA (cfDNA) 包含源自正常和肿瘤组织的小 DNA 片段,这些片段会释放到血液中。最近,cfDNA 的甲基化分析作为一种液体活检工具越来越受到重视,因为 pr...阅读更多 »BET 蛋白靶向抑制三阴性乳腺癌中的 PD-1/PD-L1 通路并引发抗肿瘤免疫response.Published: August, 2019Abstract: 旨在利用抗肿瘤免疫力的治疗策略正在被深入研究,因为它们在癌症治疗中显示出有希望的结果。 PD-1/PD-L1 通路是恢复功能性抗肿瘤免疫反应的重要目标……阅读更多 »视网膜发育过程中的核组学动力学。发表时间:2019 年 8 月摘要:超过 8,000 个基因作为祖细胞被打开或关闭细胞在发育过程中产生 7 类视网膜细胞类型。数以千计的增强子也活跃在发育中的视网膜中,许多具有 fe细胞和发育阶段的特征-...阅读更多 »通过启动子高甲基化和 HNF4A 缺陷沉默肾细胞癌中的肿瘤抑制 NR_023387。发表时间:2019 年 8 月摘要:长链非编码 RNA (lncRNA) 的表观遗传状态失调具有与包括人类癌症在内的多种人类疾病有关。然而,lncRNA 的全基因组甲基化概况和这些 lnc 的精确作用……阅读更多 »Slc6a8 介导的肌酸摄取和积累通过调节细胞因子反应重新编程巨噬细胞极化。发布时间:2019 年 8 月摘要:巨噬细胞极化是伴随着 L-精氨酸代谢的剧烈变化。两种 L-精氨酸催化酶,iNOS 和精氨酸酶 1,是经典和交替激活的巨噬细胞的标志性分子,分别……阅读更多»表观转录组学将 mC 添加到 HIV-1 转录物中调节病毒基因表达。出版时间:八月, 2019 摘要:mRNA 核糖核苷酸的共价修饰(称为外转录组修饰)如何改变 mRNA 功能仍不清楚。一个问题是难以量化这些修改。使用纯化的 HIV-1 基因组 RNA,我们 sh...阅读更多 »游离血红素通过 NRF2-抗氧化反应信号调节胎盘生长因子。发表时间:2019 年 8 月摘要:游离血红素激活成红细胞表达和分泌胎盘生长因子 (PlGF), VEGF 家族的血管生成肽。 PlGF 的高循环水平与实验动物和镰状细胞病患者相关...阅读更多»转运放大细胞协调小鼠切牙间充质干细胞的激活。发表时间:2019 年 8 月摘要:干细胞 (SCs) 从周围的微环境和细胞。有限的分子证据已将组织特异性间充质干细胞 (MSC) 与间充质转运扩增细胞 (MTAC) 联系起来).使用鼠标门牙……阅读更多 »Sox9-Kcnj2 基因座的功能剖析确定了 TAD 架构的非必要和指导性作用。发布时间:2019 年 8 月摘要:基因组以称为拓扑关联域 (TAD) 的三维单元组织,通过依赖于黏连蛋白和 DNA 结合因子 CTCF 的协同作用的过程。 TAD 的基因组重排已显示……阅读更多 »通过 LINE-1 元素激活神经元基因在人类神经祖细胞中的全局 DNA 去甲基化。发表时间:2019 年 7 月摘要:DNA 甲基化有助于维持体细胞基因组的完整性,部分是通过转座因子的沉默。在这项研究中,我们使用 CRISPR-Cas9 技术删除 DNMT1,DNA 甲基化的 DNA 甲基转移酶关键……阅读更多»I 类 TCP 转录因子靶向赤霉素生物合成基因 GA20ox1 和生长促进基因 HBI1 和 PRE6 在热期间拟南芥的形态发生生长。发布时间:2019 年 7 月摘要:植物通过增加叶柄和下胚轴的生长来响应环境温度的升高。在这项工作中,我们表明拟南芥 I 类 TEOSINTE BRANCHED 1、CYCLOIDEA、PCF (TCP) 转录因子 TCP14 和 TCP15 是必需的……阅读更多 »印迹 lncRNA MEG8 的异常表达导致滋养层功能障碍和流产。发表时间:7 月, 2019摘要:长链非编码RNA(lncRNA)是一组核苷酸长度大于200bp的非编码RNA。以往的研究表明,它们在许多发育过程和生物通路中发挥着重要的调节作用。然而,...阅读更多»小鼠 Müller 胶质细胞的发育和表观遗传可塑性。发布时间:2019 年 7 月摘要:在某些物种中发现了在受伤后再生整个视网膜和恢复失明的能力,并且主要依赖于 Müller 的表观遗传可塑性胶质细胞。要了解哺乳动物 Müller 胶质细胞作为 progen 来源的作用...阅读更多»弓形虫效应器 TEEGR 通过 EZH2 调节 NF-κB 信号来促进寄生虫持久性。发表时间:2019 年 7 月摘要:原生动物寄生虫弓形虫与其共同进化恒温宿主(包括人类)策略驱动其在宿主中的准无症状持久性,从而优化传播到新宿主的机会。持久性,这...阅读更多»升高的环 AMP 通过抑制 YAP-TEAD 活性和 HDAC 介导的组蛋白去乙酰化来抑制由 cAMP (EPAC1) 激活的交换蛋白的表达。发布时间:2019 年 6 月摘要:配体诱导的交换激活cAMP-1 (EPAC1) 激活蛋白涉及许多生理和病理过程,包括已检测到 EPAC1 表达变化的心脏纤维化。然而,鲜为人知……阅读更多»酒精使用障碍受试者的全基因组甲基化:暗示对皮质边缘糖皮质激素受体 (NR3C1) 的表观遗传调控的研究。发表时间:2019 年 6 月摘要:环境因素,包括药物滥用和压力,通过表观遗传机制导致大脑基因表达调控的长期变化,例如如 DNA 甲基化。我们检查了 p 中的全基因组 DNA 甲基化模式……阅读更多»警报 S100A9 通过降低 RANK 的表达来阻碍破骨细胞与人类循环前体的分化。发表时间:2019 年 6 月摘要:警报 S100A8/A9 与无菌性炎症有关-诱导骨吸收,并已显示可增加成熟破骨细胞的骨吸收能力。在这里,我们研究了 S100A9 对破骨细胞从 h 分化的影响……阅读更多»探讨 BAP1 在 CRISPR 工程人类肝脏类器官中的肿瘤抑制功能。发表时间:2019 年 6 月摘要:去泛素化酶 BAP1 是一种肿瘤抑制因子,其中其他人参与曾患胆管癌。 BAP1 有许多提议的分子靶标,而其果蝇同系物已知可使组蛋白 H2AK119 去泛素化。我们介绍 BAP1 功能丧失……阅读更多 »Twist2 在横纹肌肉瘤中的扩增通过重定向 MyoD DNA 结合抑制肌生成并促进肿瘤生成。发表时间:2019 年 6 月摘要:横纹肌肉瘤 (RMS) 是一种由成肌细胞样细胞组成的侵袭性儿科癌症.最近,我们发现了一种以 Twist2 转录因子表达为标志的独特肌肉祖细胞。 258 例 RMS 患者肿瘤的基因组分析未……阅读更多 »预制染色质拓扑有助于肢体发育过程中的转录稳健性。发表时间:2019 年 5 月摘要:长程基因调控涉及增强子和启动子之间的物理接近度,以生成精确的基因表达模式空间和时间。然而,在某些情况下,接近度与基因激活同时发生,而在其他情况下,预成型……阅读更多 »Ep雪旺细胞 400 缺乏会导致早期发育调节因子的持续表达和周围神经病变。发表时间:2019 年 5 月摘要:雪旺细胞确保周围神经系统有效的神经冲动传导。它们的发育伴随着明确的染色质变化,包括变异组蛋白沉积和重新分布。研究变异 hi 的重要性……阅读更多 »终生 AAV 介导的 CRISPR 基因组编辑在营养不良性心脏中改善心肌病而不会对 mdx 小鼠造成严重损伤。发布时间:2019 年 5 月摘要:其他人和我们之前的研究已经证明CRISPR 基因组编辑可以提供一种有前途的治疗策略,以恢复 Duchenne 肌营养不良症 (DMD) 小鼠骨骼肌和心脏中肌营养不良蛋白的表达和功能……阅读更多 »醋酸盐在葡萄糖限制期间促进 T 细胞效应器功能。发表时间:2019 年 5 月摘要: 争夺葡萄糖等营养素可以代谢限制 T 细胞并导致其在癌症期间的低反应性。因此,对周围微环境的代谢适应是维持适当细胞乐趣的关键……阅读更多»普遍的 H3K27 乙酰化导致 ERV 表达和 H3K27M 神经胶质瘤的治疗脆弱性。发表时间:2019 年 5 月摘要:由组蛋白 3 K27M 定义的高级神经胶质瘤驱动突变表​​现出 H3K27 三甲基化的整体丧失和 H3K27 乙酰化的相互增加,分别形成抑制性和活性染色质景观。我们生成了肿瘤衍生的同基因体……阅读更多 »BCL2 扩增子丢失和转录重塑驱动 B 细胞淋巴瘤模型中的 ABT-199 耐药性。发表时间:2019 年 5 月摘要:耐药性\"持久性”肿瘤细胞是耐药克隆出现的基础并促进复发和疾病进展。在这里,我们报告了在套细胞淋巴瘤和双喜模型中对 BCL-2 靶向药物 ABT-199 的耐药性……阅读更多 »心脏重编程因子协同激活全基因组心源性阶段特异性增强剂。发布时间:2019 年 5 月摘要:心源性转录因子 (TF) Mef2c、Gata4 和 Tbx5 可以直接将成纤维细胞重编程为诱导的类心肌细胞 (iCLM),呈现心脏修复的潜在细胞来源。虽然 H 增强了这些 TF 的活动……阅读更多»Ezh2-dCas9 和 KRAB-dCas9 能够以上下文相关的方式对表观遗传记忆进行工程化。发布时间:2019 年 5 月摘要:背景:表观基因组的重写已经上升为有希望替代精准医学的基因编辑。在自然界中,表观遗传沉默可导致多次有丝分裂中靶基因表达的完全减弱。然而……阅读更多 »ETV5、RBPJ 和 TCF3 的互补活动驱动幼稚多能性的形成性转变。发表时间:2019 年 5 月摘要:幼稚小鼠胚胎干细胞的基因调控网络 (GRN)(ESC)必须重新配置以启用谱系承诺。 TCF3 通过抑制 ESC 转录因子电路的组件来制裁重新布线。然而,TCF3 耗尽……阅读更多 »染色质因子 HNI9 和延长的下胚轴 5 在高氮供应下维持 ROS 稳态。发表时间:2019 年 5 月摘要:活性氧 (ROS) 会在细胞中积累过量,导致氧化还原失衡状态和潜在的氧化应激,这可能对植物细胞的分子成分产生破坏性影响。几个环境条件...阅读更多»拓扑关联域之间的远程相互作用在分化过程中塑造了四维基因组。发表时间:2019 年 5 月摘要:基因组信息在分化过程中被选择性地用于指导空间和时间基因表达。拓扑关联域 (TAD) 之间以及染色质和核层之间的相互作用组织和定位染色体。..阅读更多 »硬连线 3D 染色质景观在两种原始多能性状态下的表观遗传调制。发表时间:2019 年 5 月摘要:增强子激活的潜在机制以及增强子-启动子重新布线对时空基因表达的贡献程度尚不清楚。使用综合和时间分辨分析,我们表明广泛的转录……阅读更多 »Bromodomain 抑制共激活剂 CBP/EP300 促进细胞重编程。发布时间:2019 年 5 月摘要:体细胞类型特异性基因的沉默是一个关键但尚未对重新编程的步骤知之甚少。为了揭示维持细胞身份的途径,我们使用染色质因子抑制剂进行了重编程筛选。在这里,我们识别...阅读更多 »无浆细胞核小体的 ChIP-seq 识别细胞源基因表达程序发布时间:2019 年 5 月摘要:无血细胞 DNA (cfDNA) 源自垂死细胞中的碎片染色质。作为因此,它仍然与组蛋白相关,组蛋白可能保留存在于起源细胞中的共价修饰。直到现在,这种丰富的表观遗传信息仍然存在……阅读更多»Canonical PRC1 控制着 Polycomb 介导的基因沉默的序列独立传播。发表时间:2019 年 4 月摘要:Polycomb 组 (PcG) 蛋白在细胞命运的表观遗传中起着关键作用。 Polycomb Repressive Complexes PRC1 和 PRC2 催化不同的染色质修饰以强制基因沉默,但转录抑制如何……阅读更多 »PML 调节 H3.3 靶向小鼠成纤维细胞中的端粒和着丝粒重复序列。发布时间:2019 年 4 月摘要:靶向沉积组蛋白变体 H3.3 进入染色质对于正确调节染色质完整性至关重要,特别是在包括重复的异染色质区域。我们最近表明,早幼粒细胞白血病 (PML) 蛋白 p...阅读更多 »基于单细胞 RNA 测序的 CRISPRi 筛选解决了早期人类内胚层发育的分子驱动因素。发布时间:2019 年 4 月摘要:脊椎动物研究概述了定形内胚层 (END) 发育的保守分子控制。然而,最近的研究还表明,人类 END 调控的关键分子方面甚至与啮齿动物不同。人类胚胎的分化...阅读更多»长基因间非编码 RNA 调节人肺成纤维细胞功能:对特发性肺纤维化的影响。发表时间:2019 年 4 月摘要:肺成纤维细胞的表型变化被认为有助于特发性肺纤维化的发展(IPF),一种进行性和致命性肺部疾病。长基因间非编码 RNA (lincRNA) 已被确定为新型调节剂 ...阅读更多 »定义支持维持人类结肠癌 DNA 甲基化和致癌特性的 UHRF1 域。发布时间:2019 年 4 月摘要:UHRF1 有助于建立和维护甲基化哺乳动物细胞中的 lation 模式。定义了建立域,包括 E3 连接酶功能,但维护域的特征很差。在这里,我们展示了……阅读更多»TET3 通过 Snrpn 的非催化作用防止成人 NSC 的终末分化。发表时间:2019 年 4 月摘要:十-十一易位 (TET) 蛋白催化 DNA 羟基化,发挥重要作用在哺乳动物 DNA 的去甲基化中。值得注意的是,尽管小鼠大脑中的羟甲基化水平很高,但 TET 蛋白在 adu 中的潜在作用……阅读更多 »剖析 H3K27 乙酰化和甲基化在 PRC2 介导的细胞身份控制中的作用。发表时间:2019 年 4 月摘要:Polycomb抑制复合物 PRC1 和 PRC2 在靶基因上非冗余地起作用,以维持转录程序并确保细胞身份。 PRC2 甲基化组蛋白 H3 (H3K27me) 上的赖氨酸 27,而 PRC1 单泛素化组蛋白 H2A 在 ...阅读更多 »Essential 人类多能干细胞的基因图谱识别未表征的基因和底物依赖性。发表时间:2019 年 4 月摘要:人类多能干细胞 (hPSC) 为疾病建模提供了宝贵的工具,并为再生医学带来希望。为了理解多能性和谱系分化机制,关键的第一步涉及系统地……阅读更多 »甘油磷酸胆碱脂质的三羧酸循环活动和重塑支持细胞因子诱导响应真菌模式。发表时间:2019 年 4 月摘要:糖酵解增加与免疫细胞激活平行,但丙酮酸的作用在很大程度上仍未得到探索。我们发现用真菌替代酵母聚糖刺激树突状细胞会导致丙酮酸、柠檬酸、衣康酸和 &alpha 的减少……阅读更多»ADGRE5 的鉴定作为区分 Burkitt 淋巴瘤和弥漫性大 B 细胞淋巴瘤的 MYC 靶标。发布时间:4 月, 2019摘要: 背景:MYC 是一种异源表达的转录因子,在细胞增殖和分化等许多生物过程中发挥着多功能作用。它还与许多类型的癌症有关,包括恶性肿瘤……阅读更多»FZD7-TWIST1 轴负责卵巢癌的抗失巢凋亡和肿瘤发生。发表时间:2019 年 4 月摘要:Frizzled 家族受体 7 (FZD7),一种 Wnt信号受体,与干细胞特性的维持和癌症进展有关。 FZD7 已成为一个潜在的治疗靶点,因为它能够转导两种典型的...阅读更多 »Cdc7p 通过 H4 K16 乙酰化和染色质组装因子 CAF-1 的磷酸化调节基因沉默。发布时间:2019 年 4 月摘要:CAF -1 是一种进化上保守的 H3/H4 组蛋白伴侣,在复制偶联染色质组装中起着关键作用,并通过与 PCNA 的相互作用靶向复制叉,which,如果被破坏,会导致表观遗传缺陷。在 ,...阅读更多 »Kdm6b 调节环境依赖性造血干细胞自我更新和白血病发生。发表时间:2019 年 4 月摘要:组蛋白去甲基化酶 KDM6B (JMJD3) 在血液疾病中上调,表明它可能具有重要的致病功能。在这里,我们检测了 Kdm6b 在造血干细胞 (HSC) 中的功能,以评估其作为治疗药物的潜力……阅读更多 »类人动物特异性转座元件和 KZFP 促进人类胚胎基因组激活和控制原始人类胚胎干细胞中的转录。发布时间:3 月, 2019 摘要:转座因子 (TE) 的扩展与基因表达的进化变化相吻合。 TE 经常包含转录调节因子的结合位点,从而使物种和背景特异性 g 的全基因组协调激活……阅读更多 »PDX1 反式激活域中的点突变损害人类 β 细胞的发育和功能。Pub发表日期:2019 年 3 月摘要:目的:PDX1 编码区存在数百个错义突变;然而,这些突变是否会导致糖尿病尚不清楚。方(PCa) 对患有早期疾病的患者有益,但随着 PCa 进展到去势抵抗状态 (CRPC) 而变得无效。最初 CRPC 仍然依赖于雄激素受体 (AR) 信号,...阅读更多»PKCλ/ι 缺陷促进丝氨酸和单碳通路代谢促进神经内分泌前列腺癌。发表时间:2019 年 3 月摘要:针对雄激素受体的治疗越来越有效反常地促进了神经内分泌前列腺癌 (NEPC) 的发病率,神经内分泌前列腺癌是最致命的阉割亚型离子耐药性前列腺癌 (PCa),对此没有效果……阅读更多 »Bcl2 的关键调节因子通过与 T 细胞分化相关的 lncRNA 的系统转录物发现揭示。发表时间:2019 年 3 月摘要:正常 T 细胞分化需要一个复杂的调控网络来支持一系列成熟步骤,包括谱系定型、T 细胞受体 (TCR) 基因重排以及胸腺阳性和阴性选择。然而,在……阅读更多 »低甲基化增强子 DNA 中存储的胚胎增强子和基因记忆的广泛恢复。发布时间:2019 年 3 月摘要:发育中和成人组织使用不同的顺式调节元件。尽管一些退役的胚胎增强子中的 DNA 在成体细胞中甲基化不足,但尚不清楚这种假定的表观遗传记忆是否完整且可恢复。我们发现……阅读更多 »TCF3 作为母细胞肾母细胞瘤潜在主调节因子的作用。发布时间:2019 年 3 月摘要行为:肾母细胞瘤是最常见的小儿肾脏肿瘤类型。虽然患者的总体预后良好,但术前化疗后表现出母细胞亚型的肿瘤预后较差。为了降低风险...阅读更多 »lncRNA KHPS1 通过表观基因组调节因子的三重依赖性招募激活稳定的增强子。发布时间:2019 年 3 月摘要:原癌基因 SPHK1 的转录受 KHPS1 调节,KHPS1 是一种激活 SPHK1 表达的反义 RNA通过在 SPHK1 增强子处形成三螺旋 RNA-DNA-DNA 结构。 Triplex 介导的 KHPS1 与其靶基因的束缚是重新……阅读更多 »R-Loops 增强发育调节基因子集的 Polycomb 抑制。发表时间:2019 年 3 月摘要:R-loops 是形成的三链核酸结构在转录过程中,特别是在活性基因的未甲基化富含 CpG 的启动子上。在小鼠胚胎干细胞 (mESCs) 中,富含 CpG 的发育调节因子或基因被抑制...阅读更多»Ezh2 控制自然杀伤 T 细胞的发育,这会导致自发性哮喘样病理。发表时间:2019 年 3 月摘要:背景:自然杀伤 T (NKT) 细胞表达 T 细胞受体识别内源性和环境糖脂抗原。已经确定了 NKT 细胞的几个子集,包括产生 IFN-γ 的 NKT1 细胞、产生 IL-4 的 NKT2 细胞……阅读更多 »成年小鼠视网膜色素上皮细胞再生视网膜组织能力受损的表观遗传学基础。已发表:2019 年 3 月摘要:两栖动物视网膜色素上皮细胞 (RPE) 的表观遗传可塑性使它们能够再生整个视网膜,这是哺乳动物所不具备的已知特征。在这项研究中,我们研究了成年小鼠 RPE 的表观遗传可塑性,以确定 po...阅读更多 »H3K27me3 是一种表观遗传屏障,而 KDM6A 过度表达可提高核重编程效率。发表时间:2019 年 3 月Abstract:异常的表观遗传重编程是克隆胚胎发育失败的一个主要因素。组蛋白 H3 赖氨酸 27 三甲基化 (H3K27me3) 是转录抑制的组蛋白标记,在哺乳动物胚胎发育中起着重要作用……阅读更多 »系统性红斑狼疮外周血单核细胞中 6-甲基腺嘌呤 DNA 的全基因组分析。发布时间:3 月, 2019摘要:目的:本文旨在探讨6-甲基腺嘌呤(6mA)DNA的表达,阐明其在系统性红斑狼疮(SLE)中的基因调控作用。方法:20 名 SLE 患者和 20 名正常对照健康个体 (HCs) 是……阅读更多»环境毒物诱导的前列腺病理学和间质上皮细胞表观基因组和转录组改变的表观遗传跨代遗传:前列腺疾病的祖先起源。发表时间:2 月, 2019摘要:前列腺疾病包括前列腺癌,是男性发病率第二高的疾病肿瘤和良性前列腺增生 (BPH),影响大约 50% 的男性。前列腺疾病的发病率正在增加,其中一些增加了 m...阅读更多»CBX7 通过规范和非规范相互作用诱导人类正常和恶性造血干细胞和祖细胞的自我更新。发布时间:2019 年 2 月摘要:在在这项研究中,我们证明,在所有五种 CBX Polycomb 蛋白中,只有 CBX7 具有控制人类造血干细胞和祖细胞 (HSPC) 自我更新的能力。 CBX7 过表达 HSPC 的异种移植导致我……阅读更多 »释放免疫调节性埃博拉病毒糖蛋白的微泡被 Tetherin 以物种特异性方式抑制。发表时间:2019 年 2 月摘要:埃博拉病毒糖蛋白 (EBOV-GP) 形式含有 GP 的微泡,即所谓的病毒体,由表达 GP 的细胞分泌。然而,GP 病毒体释放的决定因素及其功能性知之甚少。我们的特征是……阅读更多 »EZH2 在过渡性前浆细胞中过度表达,并参与人类浆细胞分化。发布时间:2019 年 2 月摘要:浆细胞 (PC) 在宿主生物体抵御病原体的防御中发挥重要作用。我们已经表明,可以使用多步培养系统对 PC 生成进行建模,该系统可再现体内发生的连续细胞分化。 Usin...阅读更多»细胞周期协调的聚合酶 II 转录区室包含全球基因组激活前的基因表达。发表时间:2019 年 2 月摘要:大多数后生动物胚胎开始发育时具有快速、转录沉默的细胞分裂,基因组激活延迟到中期-囊胚转变(MBT)。然而,一组基因逃脱了全局抑制并在 MBT 之前被激活……阅读更多»复制时间和表观基因组重塑与染色体重排的性质有关癌症中的元素。发表时间:2019 年 1 月摘要:众所周知,DNA 复制时间有助于表观基因组的建立,但是,复制时间与癌症基因组和表观基因组变化之间的密切联系在很大程度上仍未得到表征。在这里,我们执行 Repli-...阅读更多»基于染色质的遗传异质性 AML 分类为具有不同干性表型的两种不同亚型。发表时间:2019 年 1 月摘要:急性髓性白血病 (AML) 组蛋白标记的全球调查仍然有限。通过综合转录和染色质标记分析对 38 个 AML 样本进行分析,揭示了 2 种主要亚型。一种亚型由患有&nb...阅读更多»高通量 ChIPmentation:可自由扩展,单日 ChIPseq 数据从极低的细胞数生成。发布时间:2019 年 1 月摘要:背景:染色质免疫沉淀与测序相结合(ChIP-seq ) 广泛用于映射组蛋白修饰化和转录因子在全基因组水平上的结合。结果:我们提出了高通量 ChIPmentation (HT-ChIPmentation) th...阅读更多»视黄酸受体 Alpha 抑制 Th9 转录和表观基因组程序以减少过敏病理学。发表时间:2019 年 1 月摘要:CD4 T 辅助细胞 (Th) 分化是受多种输入调节,包括维生素 A 代谢物视黄酸 (RA)。 RA 通过其受体 RARα 抑制炎性细胞因子的转录,但对于 Th-media 也是必不可少的……阅读更多 »非典型畸胎瘤/横纹肌样肿瘤染色质状态的综合分析确定了 SWI/SNF 和 Polycomb 在基因调控中的不同作用. 发表时间:2019 年 1 月摘要:编码 SWI/SNF 染色质重塑复合体成员的 SMARCB1 双等位基因失活是非典型畸胎样横纹肌样瘤 (ATRT) 的标志性遗传畸变。在这里,我们报告了 SMARCB1 的丢失如何影响这些 tu 中的表观基因组...阅读更多 »细胞周期调节和肿瘤抑制 RNA 的超编辑促进恶性祖细胞的繁殖。发布时间:2019 年 1 月摘要:与 RNA1 (ADAR1) 相关的腺苷脱氨酶失调导致许多恶性肿瘤的治疗耐药性。在这里,我们表明 ADAR1 诱导的正常人类造血祖细胞的过度编辑会损害 miR-26a 的成熟,这代表……阅读更多»Wnt 驱动的 Mll1 表观基因组调节唾液腺和头颈癌。发表时间:2019 年 1 月摘要:我们确定了一个调节系统,该系统在唾液腺和头颈癌中作用于 Wnt/β-连环蛋白信号通路的下游。我们在小鼠肿瘤模型中展示了 K14-Cre 诱导的 Wnt/β-catenin 功能获得和 Bmpr1a 功能丧失……阅读更多 »组蛋白甲基转移酶 DOT1L 是适当的 DNA 损伤反应、DNA 修复所必需的,并调节化疗反应性。发布时间:2019 年 1 月摘要:背景:干扰素端粒沉默 1-like (DOT1L) 是一种非 SET 结构域,含有甲基转移酶,已知可催化组蛋白 3 在赖氨酸 79 (H3K79me) 上的单甲基化、二甲基化和三甲基化。 DOT1L 介导的 H3K79me 与 chrom 有关……阅读更多 »慢性淋巴细胞白血病中 DNA 羟甲基化和 DNA 甲基化的全球分布。发表时间:2019 年 1 月摘要:背景:慢性淋巴细胞白血病 (CLL) 一直是一个很好的模型系统来理解5-甲基胞嘧啶 (5-mC) 在癌症进展中的功能作用。最近,一种氧化形式的 5-mC、5-羟甲基胞嘧啶 (5-hmC) 获得了很多……阅读更多 »优化 CRISPR/Cas9 递送至人类造血干细胞和祖细胞以进行治疗性基因组重排。发表时间:1 月, 2019摘要:编辑造血干细胞中的β-珠蛋白位点是β-地中海贫血和镰状细胞病基因治疗的另一种治疗方法。使用 CRISPR/Cas9 系统,我们生成etically modified human hematopoietic stem and p...阅读更多 »伽马辐射诱导斑马鱼和大西洋鲑鱼中组蛋白修饰富集的位点特异性变化。发表时间:2019 年 1 月摘要:电离辐射是一种公认​​的基因毒剂,然而,人们对其知之甚少DNA 的功能形式在这些过程中的作用。组蛋白的翻译后修饰控制染色质的组织,因此继续……阅读更多»鉴定雌激素受体 alpha 的 ChIP-seq 和 RIME 级抗体。发表时间:2019 年 1 月摘要:雌激素受体 alpha (ERα) 起着重要作用在大多数乳腺癌中,它是临床使用的内分泌治疗的目标,作为表达该受体的乳腺癌女性的标准治疗。这两种方法 ChIP-seq(chro...阅读更多 »通过 mC RNA 免疫沉淀进行全转录组映射 5-甲基胞嘧啶,然后在植物中进行深度测序。发布时间:201 年 1 月9 摘要:转录组范围内的映射 RNA 修饰对于理解 RNA 修饰的分布和功能至关重要。在这里,我们描述了一种在植物中通过 RNA 免疫沉淀在转录组范围内映射 5-甲基胞嘧啶 (mC) 的方案……阅读更多 »垂体促性腺激素对高血糖的敏感性导致表观遗传畸变和促卵泡激素水平降低。已发布:2018 年 12 月摘要:新陈代谢与生殖功能之间的联系已得到广泛认可,我们假设产生促黄体激素和促卵泡激素 (FSH) 的垂体促性腺激素直接通过……介导某些影响阅读更多» DeltaNp63 依赖性超级增强子通过相互关联的转录因子网络定义胰腺癌的分子身份。发表时间:2018 年 12 月摘要:癌症的分子分型为优化抗癌的精准肿瘤学方法提供了巨大希望癌症治疗。胰腺癌研究的最新进展揭示了肿瘤表达鳞状细胞的各种分子亚型……阅读更多»突变体 p63 通过重新连接增强景观影响表皮细胞身份。发表时间:2018 年 12 月摘要:转录因子 p63 是表皮角质形成细胞增殖的关键调节因子和差异化。 p63 DNA 结合域的突变与畸形、外胚层发育不良和唇裂/腭裂 (EEC) 综合征有关。然而,...阅读更多 »恶性疟原虫配子体感染的红细胞不粘附在人类原代成红细胞上。发表时间:2018 年 12 月摘要:恶性疟原虫配子体是负责疟疾寄生虫传播的有性阶段,在附近的人骨髓实质中发育到成红细胞岛。然而,配子体与 th 相互作用的机制……阅读更多»Snail2 durin 对 E-cadherin 表达的表观遗传抑制g 结直肠癌的转移。发表时间:2018 年 12 月摘要:背景:转录因子 Snail2 是癌变过程中 E-钙粘蛋白表达的抑制因子;然而,在人类结直肠癌 (CRC) 中参与这一过程的具体机制在很大程度上仍然未知。方法:我们检查了前...阅读更多 »SIRT7 依赖性原纤维蛋白去乙酰化控制细胞周期中组蛋白 H2A 甲基化和 rRNA 合成。发表时间:2018 年 12 月摘要:原纤维蛋白 (FBL) 是一种双功能核仁蛋白,可催化 2 \'-rRNA 前体的 O 甲基化和组蛋白 H2A 在谷氨酰胺 104 (H2AQ104me) 的甲基化。调节 FBL 活动的机制尚未探索。在这里,我们证明 FBL 是王牌……阅读更多 »Peril lincRNA 基因座中的增强子调节远距离而非局部基因。发表时间:2018 年 12 月摘要:背景:最近,很明显一些启动子作为远程调节器发挥作用的基因表达。然而,直接长基因间非编码 RNA (lincRNA) 或 mRNA 基因体的增强子活性的 t 和定量评估具有……阅读更多 »人​​视黄酸调节的 CD161 调节性 T 细胞支持肠粘膜的伤口修复。发表时间:2018 年 12 月摘要:修复在炎症过程中受损的组织是恢复局部稳态和恢复上皮完整性的关键。在这里,我们将 CD161 调节性 T (T) 细胞描述为一种独特的、高度抑制的 T 细胞群,我...阅读更多 »线粒体 DNA 能否被 CRISPRized:Pro 和 Contra。发布时间:2018 年 12 月摘要:线粒体代表大分子的嵌合体编码在细胞器基因组、mtDNA 或核基因组中。如果蛋白质靶向线粒体不同亚区室的途径得到了相对较好的研究,则导入小...阅读更多»基态多能性的基因组完整性。发表时间:2018 年 12 月摘要:多能细胞似乎在早期开发过程中处于过渡状态。这些细胞具有转变为胚胎干细胞 (ESC) 的能力。据报道,在化学成分确定的培养基中培养的小鼠多能细胞 ...阅读更多 »祖传 DDT 暴露后跨代精子 DNA 甲基化外突变的发育起源。发表时间:2018 年 11 月摘要:种系的表观遗传改变可由许多从饮食到毒物的不同环境因素。这些环境诱导的种系变化可以促进疾病和 p 的表观遗传跨代遗传……阅读更多 »删除内含子 HIF-2α 结合位点抑制缺氧诱导的 WT1 表达。发布时间:2018 年 11 月摘要:缺氧诱导因子 (HIF)通过与基因组中的缺氧反应元件 (HRE) 相互作用,在适应低氧环境中发挥关键作用。 HIF-2α 转录因子亚基的细胞水平影响组织病理学和 ...阅读更多 »用髓样细胞特异性纳米生物制剂抑制炎症促进器官移植接受。发表时间:2018 年 11 月摘要:在没有慢性免疫抑制的情况下诱导移植物接受仍然是器官移植中难以实现的目标。使用实验性移植小鼠模型,我们证明通过 dectin-1 和 toll 样受体激活局部巨噬细胞……阅读更多 »使用无浆细胞 DNA 甲基化组进行敏感的肿瘤检测和分类。发布时间:2018 年 11 月摘要:使用用于癌症检测和管理的液体活检正迅速受到重视。目前检测循环肿瘤 DNA 的方法涉及使用无细胞 DNA 对体细胞突变进行测序,但这些方法的敏感性……阅读更多»综合蛋白质组学分析揭示 PRC2 依赖的表观遗传串扰维持基态多能性。发表时间:11 月, 2018摘要:多能地状态被定义为不受影响谱系规范的表观遗传限制的基础状态。虽然幼稚胚胎干细胞 (ESC) 在生长时可以通过开放染色质保持低甲基化状态……阅读更多 »RRAD、IL4I1、CDKN1A 和 SERPINE1 基因可能由 NF-κB 和 p53 转录因子共同调节暴露于高剂量电离辐射的细胞。发布时间:2018 年 11 月摘要:背景:细胞对电离辐射的反应涉及 p53 依赖性通路的激活和非典型 NF-κB 通路的激活。这两个转录网络之间的串扰包括共同基因的(共同)调节……阅读更多 »TET2 通过调节 caspase-4 抑制乳腺癌细胞的肿瘤发生。发表时间:2018 年 11 月摘要:表观遗传调节因子已被证明会影响乳腺癌的进展.然而,TET2 在肿瘤发生中发挥抑制作用的详细机制仍不清楚完全理解。我们采用 RT-qPCR 和 westernblot 来检查……阅读更多 »转录因子驱动 Tet2 介导的增强子去甲基化以重新编程细胞命运。发布时间:2018 年 11 月摘要:在这里,我们使用 C/EBPα 报告核苷酸分辨率下的 DNA 甲基化和羟甲基化动力学-增强 B 细胞重编程为诱导多能细胞 (iPSC)。我们在增强子处观察到连续的羟甲基化波,...阅读更多»顺序作用的 SOX 蛋白协调星形胶质细胞和少突胶质细胞特异性基因表达。发表时间:2018 年 11 月摘要:SOX 转录因子在星形胶质细胞和少突胶质细胞发育过程中具有重要作用,但胶质细胞如何基因以特定于子谱系的方式被指定和激活仍然未知。在这里,我们定义了 t 中的胶质细胞特异性基因表达……阅读更多»TRPS1 是乳腺癌中的一种谱系特异性转录依赖性。发表时间:2018 年 10 月摘要:扰动的表观遗传学mic 程序在肿瘤发生中起着关键作用,染色质调节剂是各种人类癌症类型的候选治疗靶点。定义对 DNA 和组蛋白修饰符和转录事实的单一和共享依赖性……阅读更多 »SUMO 通过强制不同的染色质状态来保护体细胞和多能细胞身份发布时间:2018 年 10 月摘要:理解保护细胞身份的一般原则应该揭示对共同点的重要见解不同细胞类型规范的潜在机制。在这里,我们表明 SUMO 修饰在多种情况下起到稳定细胞命运的作用……阅读更多»着丝粒许可酵母染色体臂的有丝分裂凝聚。发表时间:2018 年 10 月摘要:在有丝分裂期间,染色质凝聚使染色体分离、刚性、和紧凑的姐妹染色单体以促进它们的分离。在这里,我们表明,与野生型酵母染色体不同,非染色体 DNA 环和染色体缺乏...R阅读更多»精子中的氧化应激影响早期胚胎发育的表观遗传重编程。发表时间:2018 年 10 月摘要:背景:众所周知,活性氧 (ROS) 诱导的氧化应激在男性不育症中起着重要作用。精子对 ROS 的破坏作用很敏感,因为随着雄性生殖细胞形成成熟的精子,它们会逐渐失去能力……阅读更多 »促进二价性有利于胚胎干细胞中开放的染色质结构。发表时间:2018 年 10 月摘要:在胚胎干细胞中(ESCs ), 发育基因启动子的特点是它们的二价染色质状态,同时被 MLL2 和 Polycomb 复合物修饰。尽管对胚胎发生至关重要,但二价性在功能上不是我们……阅读更多»PWWP2A 结合不同的染色质部分并与 MTA1 特异性核心 NuRD 复合体相互作用。发表时间:2018 年 10 月摘要:染色质结构和功能受识别 h 的阅读器蛋白调节单蛋白修饰和/或组蛋白变体。我们最近发现 PWWP2A 与含有 H2A.Z 的核小体紧密结合,并参与有丝分裂进程和……阅读更多»SOX4 可以以上下文相关的方式重定向 TGF-β 介导的 SMAD3 转录输出,以促进肿瘤发生。已发布: 2018 年 10 月摘要:转录因子 SOX4 的表达通常在人类癌症中升高,通常与肿瘤进展和不良疾病结果相关。 SOX4 表达的减少导致肿瘤发生率和转移减少。 ...阅读更多 »血管紧张素 II 诱导的 CSF1 转录由血管内皮细胞中不同表观遗传因子之间的串扰介导。发表时间:2018 年 10 月摘要:内皮衍生集落刺激因子 (CSF1) 在一系列人类病理学中起着关键作用.血管紧张素 II (Ang II) 已被记录为刺激 CSF1 转录,尽管潜在的表观遗传机制还不清楚。这里 w...阅读更多 »H3K79 的差异甲基化揭示了体内小脑中 DOT1L 靶基因和功能。发布时间:2018 年 10 月摘要:端粒沉默 1 样 (DOT1L) 的干扰因子介导组蛋白 H3 在赖氨酸 79 位的甲基化(H3K79)。小鼠小脑颗粒细胞 (Dot1l-cKO) 中 Dot1l 的条件性敲除导致更小的外部颗粒层和更少的 p...阅读更多 »小鼠和人类原始生殖细胞中可及染色质的准确注释。发布时间:2018 年 10 月摘要:广泛在原始生殖细胞 (PGC) 发育过程中,准确的染色质重塑对于遗传信息的跨代延续至关重要。在这里,我们报告了由 DNase I-hyp 标记的远端顺式调节元件 (CREs)...阅读更多 »H3K79 的差异甲基化揭示了体内小脑中的 DOT1L 靶基因和功能。发布时间:2018 年 10 月摘要:破坏者端粒沉默素g 1-like (DOT1L) 介导组蛋白 H3 在第 79 位赖氨酸 (H3K79) 的甲基化。小鼠小脑颗粒细胞 (Dot1l-cKO) 中 Dot1l 的条件性敲除导致更小的外部颗粒层和更少的 p...阅读更多 »SOX4 通过诱导 Hes5 表达抑制体外胚胎神经干细胞少突胶质细胞分化发表时间:2018 年 10 月摘要: SOX4 已被证明可以促进成年和胚胎神经祖细胞的神经元分化。异位 SOX4 表达也被证明可以抑制小鼠少突胶质细胞分化,但是其潜在的分子机制……阅读更多 »细胞周期抑制剂 Cdkn1c 的细胞定位控制成人骨骼肌干细胞的生长停滞发布时间:2018 年 10 月摘要:成人骨骼肌维持和再生取决于高效的肌肉干细胞 (MuSC) 功能。协调细胞周期与 MuSC 激活、更新和分化的机制仍然存在n 知之甚少。在这里,我们调查了……阅读更多»DNA 甲基化谱和基因表达谱的综合分析确定了中国宣威肺癌的新标志物。发表时间:2018 年 10 月摘要:背景:癌症中经常发生异常 DNA 甲基化。本研究的目的是通过整合的全基因组 DNA 甲基化和基因表达研究来鉴定中国宣威肺癌的新甲基化标志物。方法...阅读更多 »PRC2 靶向治疗是针对 EZ 评分定义的高危多发性骨髓瘤患者并克服对 IMiD 的耐药性的治疗策略。发表时间:2018 年 10 月摘要:背景:多发性骨髓瘤 (MM) 是一种恶性浆细胞疾病,具有存活率低,其特征是骨髓内骨髓瘤细胞 (MMC) 的积累。 MM 中的表观遗传修饰不仅与癌症发展有关……阅读更多 »细胞周期抑制剂 Cdkn1c 控制 gr 的细胞定位成人骨骼肌干细胞的停滞发布时间:2018 年 10 月摘要:成人骨骼肌的维持和再生取决于高效的肌肉干细胞 (MuSC) 功能。协调细胞周期与 MuSC 激活、更新和分化的机制仍然知之甚少。在这里,我们调查了……阅读更多 »NRF2/SKN-1 对 AMPK/aak-2 的抑制下调了长时间氧化应激期间的自噬。发表时间:2018 年 10 月摘要:NF-E2 相关因子 2 (NRF2) 转录因子作为氧化和亲电子应激反应的主要调节剂之一,在细胞稳态维持中具有基础性作用。以前的研究表明,监管连接 exi...阅读更多»衣康酸途径是连接先天免疫耐受和训练免疫的中央监管节点发布时间:2018 年 10 月摘要:脓毒症涉及免疫系统的同时过度激活和免疫麻痹,导致两者器官功能障碍功能和增加对继发感染的易感性。髓样细胞的急性激活诱导衣康酸合成,从而产生……阅读更多 »小鼠胚胎干细胞多轴自组织特性转化为类原肠胚。发布时间:2018 年 10 月摘要:多轴的出现是建立过程中的一个基本要素哺乳动物的身体计划。这个过程发生在子宫内胚胎植入后不久,并依赖于基因调控网络的活动……阅读更多»缝隙连接蛋白 Connexin-43 是体内 N-钙粘蛋白的直接转录调节因子。发布时间:9 月, 2018摘要:连接蛋白是间隙连接的主要成分,在许多生理过程中提供细胞间的直接联系。在这里,我们证明除了这种规范作用外,连接蛋白还充当转录调节因子。我们表明……阅读更多 »组蛋白变体 H2A.Z 沉积和乙酰化指导 ca非 Notch 信号转导反应。发表时间:2018 年 9 月摘要:Notch 信号转导的一个基本但尚未完全理解的特征是从抑制到激活的转录转变,这取决于转录因子 RBP-J 和相关辅助因子介导的染色质调节。 Incorp...阅读更多 »UCP1 反式抑制在体内棕色脂肪和盐皮质激素受体抗热作用。发表时间:2018 年 9 月摘要:目标:盐皮质激素受体 (MR),一种激素激活的转录因子,除了它在控制水电解中的作用体内平衡,发挥促脂肪生成和抗生热作用,抑制线粒体解偶联蛋白……阅读更多»腺病毒 E1A 激活域调节 H3 乙酰化影响不同病毒启动子转录的不同步骤。发布时间:2018 年 9 月摘要:组蛋白乙酰化如何促进转录不是很清楚。在这里,我们确认一个interap300 和腺病毒 2 大 E1A 激活结构域 (AD) 之间的作用,并通过观察 i 处的共定位来绘制 E1A 中的相互作用区域……阅读更多»人类败血症对主要组织相容性复合体的 CCCTC 结合因子相关单核细胞转录反应的影响II 组分。发布时间:2018 年 9 月摘要:背景:主要组织相容性复合体 II 类 (MHC-II) 分子在单核细胞表面向 T 细胞呈递抗原是病原体识别和有效宿主反应的基础。因此,主要组织相容性 Com 的丧失……阅读更多 »MIWI2 靶向从 piRNA 依赖性区域转录的 RNA,以驱动小鼠原精原细胞中的 DNA 甲基化。发表时间:2018 年 9 月摘要:Argonaute/Piwi 蛋白可以通过 RNA 降解和平移调节来调节基因表达使用小 RNA 作为指导。它们还促进在不同生物体的重复序列上建立抑制性表观遗传标记。我n 小鼠...阅读更多 »绘制人类骨骼个体发育和多能干细胞衍生的关节软骨细胞的分子标志。发布时间:2018 年 9 月摘要:组织特异性基因表达定义细胞特性和功能,但早期人类发育的知识有限,阻碍细胞疗法的应用。在这里,我们在单个胎儿阶段分析了 5 种不同的细胞类型,以及……阅读更多 »体细胞核移植胚胎中 H3K27me3 印记的丢失会破坏植入后发育。发布时间:2018 年 9 月摘要:动物克隆可以通过以下方式实现体细胞核移植(SCNT),虽然活产率相对较低。最近的研究已经确定供体细胞中的 H3K9me3 和异常 Xist 激活是阻碍 SCNT 的表观遗传障碍……阅读更多»mGlu1 受体通过表观遗传下调 mGlu5 受体垄断小脑浦肯野细胞的突触控制。出版时间:9 月,2018 年摘要:在小脑浦肯野细胞 (PC) 中,1 型代谢型谷氨酸 (mGlu1) ​​受体在运动学习中发挥关键作用,并在出生后发育过程中推动突触神经支配的精细化。成熟 PC 中不存在同源 mGlu5 受体 ...阅读更多 »转录延伸可以影响基因组 3D 结构。发布时间:2018 年 9 月摘要:转录如何影响基因组 3D 组织尚不清楚。我们发现在甲型流感 (IAV) 感染期间,猖獗的转录会迅速重组宿主细胞染色质相互作用。这些变化发生在高度转录的末端……阅读更多»RNA 测序和通路分析确定了与 Wiedemann-Steiner 综合征患者的多毛症和智力障碍有关的重要通路。发布时间:2018 年 9 月摘要:越来越多的组蛋白修饰符是参与人类神经发育障碍,表明染色质状态的适当调节对于中枢神经系统的发育。其中,杂合子 de novo 变体……阅读更多»Polycomb 抑制复合物 1 塑造核小体景观,但不影响目标基因的可及性。发表时间:2018 年 8 月摘要:Polycomb 组 (PcG) 蛋白是转录抑制因子,在调节基因中起重要作用动物发育过程中的表达。体外实验表明,PcG 蛋白复合物可以压缩染色质以限制活性 ...阅读更多 »祖细胞超极化调节发育中的新皮层中神经元亚型的顺序生成。发布时间:2018 年 8 月摘要:在皮质生成过程中,心室区祖细胞顺序生成神经元的不同亚型,解释了新皮质细胞的多样性及其形成的回路。虽然活动依赖过程对于不同的...阅读更多»核受体 Nur77 通过 Tran 限制巨噬细胞炎症反应线粒体代谢的脚本重编程。发布时间:2018 年 8 月摘要:炎症刺激对巨噬细胞的激活诱导线粒体代谢的重编程,以支持促炎细胞因子和一氧化氮的产生。这种代谢重新布线的标志是 α-ketogl 的下调……阅读更多»SETDB1 的丢失部分地通过重新激活 IL1RAPL1 基因中的增强子来分解非活性 X 染色体。发布时间:2018 年 8 月摘要:背景:剂量补偿的产物在雌性哺乳动物中是不活跃的 X 染色体 (Xi)。 Xi 兼性异染色质分为两种不同类型,其中一种由第 9 位赖氨酸三甲基化的组蛋白 H3 (H3K9me3) 定义。 Th...阅读更多 »阿尔茨海默病相关的 TREM2 基因受 p53 肿瘤抑制蛋白调控。发表时间:2018 年 8 月摘要:TREM2 突变引起神经退行性疾病,最近该基因的遗传变异与此相关会增加患阿尔茨海默病的风险。源自 TREM2 膜受体的信号级联包括其结合伙伴……阅读更多»拟南芥 LDL1/2-HDA6 组蛋白修饰复合物在生物钟基因的调节中与 CCA1/LHY 在功能上相关。发表时间:2018 年 8 月摘要:在拟南芥生物钟中央振荡器基因是产生和维持昼夜节律的重要细胞成分。早晨表达的 CCA1(昼夜节律时钟相关 1)/LHY(LAT...阅读更多 »Canonical PRC2 功能对乳腺发育至关重要,并影响乳腺类器官的染色质压实。发表时间:2018 年 8 月摘要:不同的转录状态是通过染色质的组织来维持的,染色质是由许多抑制性和活性组蛋白修饰的总和产生的,进入紧密包装的异染色质与更容易接近的常染色质。...阅读更多 »铜绿假单胞菌的新型双重调节剂对生产性生物膜和毒力至关重要。发布时间:2018 年 8 月摘要:铜绿假单胞菌的基因调控网络很复杂。对于相对较大的基因组 (6.2 Mb),有很大一部分基因已被证明或预测为转录调节因子。其中许多调节器已被证明......阅读更多 »自甲基化诱导的 Clr4 构象转换 (Suv39h) 维持表观遗传稳定性。发表时间:2018 年 8 月摘要:组蛋白 H3 赖氨酸 9 甲基化 (H3K9me) 介导异染色质基因沉默,对基因组很重要稳定性和基因表达的调控。异染色质的建立和表观遗传维护涉及招募 o...阅读更多»HIV-2/SIV 病毒蛋白 X 抵消 HUSH 抑制复合物。发表时间:2018 年 8 月摘要:为了逃避宿主免疫防御,人类免疫缺陷病毒 1 型和 2 型(HIV -1 和 HIV-2) 有 evoLved 辅助蛋白靶向细胞限制因子。来自 HIV-2/SIVsmm 谱系的病毒蛋白 X (Vpx) 通过拮抗剂增强病毒感染……阅读更多 »鼻病毒引起的喘息后的特应性哮喘与 SMAD3 基因启动子中的 DNA 甲基化变化有关。发表时间:2018 年 8 月摘要:患有鼻病毒引起的严重早期喘息的儿童在以后的生活中患哮喘的风险增加。这种关联的确切分子机制仍然大部分未知。识别转录的潜在变化……阅读更多»转录因子 ZEB1 抑制前列腺癌中的 Syndecan 1 表达。发表时间:2018 年 7 月摘要:Syndecan 1 (SDC-1) 是一种细胞表面蛋白聚糖,在细胞中具有重要作用粘附,维持上皮完整性。 SDC1 表达与前列腺癌 (PCa) 的侵袭性呈负相关。在上皮到间充质的转运过程中……阅读更多 »MTF2 招募 Polycomb Repressive Complex 2 通过螺旋形状选择性 DNA 结合。发布时间:2018 年 7 月摘要:摘要:Polycomb 介导的基因表达抑制对发育至关重要,组蛋白 H3 赖氨酸 27 (H3K27me3) 的三甲基化起着关键作用,它是由 Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) 沉积。 wh 的机制...阅读更多»TSPYL2 调节神经元中 EZH2 靶基因的表达发表时间:2018 年 7 月摘要:睾丸特异性蛋白,Y 编码样 2 (TSPYL2) 是几个基因座中的 X 连锁基因神经发育障碍。我们之前已经表明,Tspyl2 基因敲除小鼠的学习和感觉运动门控受损,而 TSPYL2 促进……阅读更多 »Forskolin 通过蛋白激酶 A 使人急性髓系白血病细胞对 H3K27me2/3 去甲基化酶 GSKJ4 抑制剂敏感。发布时间:2018 年 7 月摘要:急性髓系白血病 (AML) 是一种侵袭性血液系统恶性肿瘤,常发生于老年人,预后较差,具体取决于对疾病的快速进展和耐药性的发生。因此,新的治疗方法是……阅读更多 »人​​类乳腺癌中 H3 和 H4 组蛋白乙酰化的 SIRT1 依赖性表观遗传调控发布时间:2018 年 7 月摘要:乳腺癌是全球女性最常诊断出的恶性肿瘤。众所周知,致癌的复杂性涉及影响肿瘤发生过程的深刻的表观遗传失调。解除管制的 H3 和 ... 阅读更多 »雄激素受体的体细胞获得性增强剂是晚期前列腺癌的非编码驱动因素。发表时间:2018 年 7 月摘要:雄激素受体 (AR) 活性增加导致晚期前列腺癌的治疗耐药性。最常见的抗性机制是可能靶向 AR 基因的基因座的扩增。在这里,我们识别和描述 aso...阅读更多»TRPM7 通过张力调节控制乳腺癌细胞的间充质特征n of SOX4。发布时间:2018 年 7 月摘要:机械诱导的信号通路是肿瘤进展的重要驱动因素。然而,机械信号是否以及如何影响转移或治疗反应仍然知之甚少。我们之前发现通道激酶 TRPM7,一种调节剂……阅读更多 »通过组蛋白修饰 ChIP-Seq 用于大规模表观遗传学研究的一种集成和半自动微尺度分析顺式调控元件的方法。发布时间:2018 年 6 月摘要:染色质免疫沉淀后测序 (ChIP-Seq) 是绘制组蛋白修饰图和鉴定整个基因组中的顺式调控 DNA 元件的首选方法。已经描述了多种方法来提高效率……阅读更多»肠道类器官分化的综合多组学分析发布时间:2018 年 6 月摘要:肠道类器官准确地概括了体内上皮稳态,从而代表了一个强大的体外系统来研究吃了谱系规范和细胞分化。在这里,我们在干细胞-e 上应用了多组学框架……阅读更多 »附加型 HBV 在转录的宿主核染色质区室中的持久性涉及 HBx。发布时间:2018 年 6 月摘要:背景:在肝细胞核中,乙型肝炎病毒 (HBV)基因组以共价闭合环状 DNA (cccDNA) 的形式出现。 HBV X 蛋白 (HBx) 是启动和维持 HBV 复制所必需的。 ccc 的功能性核定位...阅读更多 »由 RNAi 和组蛋白 H3K9 甲基化偶联介导的表观遗传。发表时间:2018 年 6 月摘要:组蛋白翻译后修饰 (PTM) 与构成细胞基础的表观遗传状态相关-类型特异性基因表达。一旦建立,组蛋白 PTM 可以通过涉及识别酶的正反馈来维持……阅读更多 »一种基于定量质谱的方法来监测内源性染色质-ass 的动态结合蛋白复合物。发布时间:2018 年 6 月摘要:了解复杂网络中内源性蛋白质-蛋白质相互作用的动力学对于破译疾病机制至关重要。为了能够深入分析染色质相关蛋白复合物中的蛋白质相互作用,我们有 prev...阅读更多»先驱因子 CEBPA 对维生素 D 信号的调节。发布时间:2018 年 6 月摘要:骨髓主调节器 CCAAT 增强剂-结合蛋白 α (CEBPA) 被称为先驱因子。在这项研究中,我们报告了用维生素 D 受体 (VDR) 配体 1α,25-dih 刺激后 THP-1 人单核细胞的 CEBPA cistrome...阅读更多 »SS18-SSX 融合癌蛋白劫持 BAF 复合物靶向和功能驱动滑膜肉瘤。发表时间:2018 年 6 月摘要:滑膜肉瘤 (SS) 由标志性 SS18-SSX 融合癌蛋白定义,它使 BAF 复合物以两种方式异常:SS18 亚基获得 SSX 并伴随丢失BAF47 亚基组装。在这里,我们证明 SS18-SSX gl...阅读更多»细胞周期蛋白 G 和 Polycomb 抑制复合物 PRC1 和 PR-DUB 合作实现发育稳定性发布时间:2018 年 6 月摘要:在果蝇中,短细胞周期蛋白 G 亚型的普遍表达会产生极端的发育噪音通过波动不对称性 (FA) 进行估计,提供了一个解决发育稳定性问题的模型。这种转录细胞周期蛋白与染色质相互作用...阅读更多»确定四尿草履虫中 5-甲基胞嘧啶的存在。发布时间:2018 年 6 月摘要:5-甲基胞嘧啶 DNA 甲基化在广泛的真核生物中调节基因表达和发育编程。然而,它在纤毛虫中的存在和潜在作用,复杂的单细胞真核生物具有种系体细胞基因组 specializ...阅读更多»SETBP1 通过充当表观遗传中心来诱导发育基因网络的转录。发布时间:2018 年 6 月摘要:SETBP1变异发生r 作为几种血液系统恶性肿瘤的体细胞突变,例如非典型慢性粒细胞白血病和 Schinzel-Giedion 综合征中的新生种系突变。在这里,我们表明 SETBP1 在富含 AT 的启动子中与 gDNA 结合...阅读更多 »The Polycomb-Dependent Epigenome Controls β Cell Dysfunction, Dedifferentiation, and Diabetes.Published: June, 2018Abstract: To date, it remains largely clear to what extreme染色质机制有助于复杂疾病的易感性和进展。在这里,我们将深度表观基因组图谱与单细胞转录组学相结合,以挖掘染色质的证据……阅读更多 »Immunity drivesregulation in cancer through NF-κB.Published: June, 2018Abstract: Ten-11 translocation enzymes (TET1, TET2, and TET3) 通过将 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 转化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC) 来诱导 DNA 去甲基化和基因调控,通常在癌症中被下调。我们发现,在基底样乳腺中……阅读更多»免疫驱动es TET1 通过 NF-kB 调节癌症 发表时间:2018 年 6 月摘要:11 种易位酶(TET1、TET2 和 TET3)通过将 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 转化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC) 来诱导 DNA 去甲基化和基因调控, 通常在癌症中下调。我们发现,在基底样乳腺中……阅读更多»慢性淋巴细胞白血病的参考表观基因组和调节染色质景观发布时间:2018 年 6 月摘要:慢性淋巴细胞白血病 (CLL) 是一种常见的血液肿瘤,其中潜在的表观遗传改变仅被部分了解.在这里,我们分析了七种原发性 CLL 的参考表观基因组和调节染色质景观……阅读更多»实验性糖尿病中组蛋白脱乙酰酶依赖性机制对血管 NADPH 氧化酶表达和活性氧物质产生的表观遗传调控。发表时间:2018 年 6 月摘要:由上调的 NADPH 氧化酶 (Nox) 产生的活性氧 (ROS)) 有助于糖尿病血管壁的结构功能改变。组蛋白乙酰化等表观遗传机制成为 ge 的重要调节因子……阅读更多»H3K9 甲基化增加和原钙粘蛋白表达受损与 Kleefstra 综合征的认知功能障碍有关。发表时间:2018 年 6 月摘要:Kleefstra 综合征,一种疾病智力障碍、自闭症谱系障碍和其他发育缺陷在人类中是由 EHMT1 的单倍体不足引起的。尽管 EHMT1 及其旁系同源物 EHMT2 被证明是组蛋白甲基转移酶……阅读更多»组蛋白 H3 赖氨酸 36 甲基转移酶动员 NER 因子调节裂殖酵母对烷基化损伤的耐受性。发表时间:2018 年 6 月摘要:Set2 甲基转移酶及其靶标组蛋白H3 赖氨酸 36 (H3K36) 在 DNA 双链断裂的转录和修复过程中影响染色质结构。 Set2 还赋予对烷化剂、甲基甲硫磺...阅读更多 »UTX 介导的增强子和染色质重塑通过 ETS 和 GATA 程序的非催化逆向调节抑制髓样白血病发生。发表时间:2018 年 6 月摘要:组蛋白 H3 Lys27 特异性去甲基化酶 UTX(或 KDM6A)是多种癌症中功能丧失突变的靶向。在这里,我们证明 UTX 通过非催化功能抑制髓样白血病发生,这是与其催化作用共有的特性……阅读更多 »雌激素受体 α 依赖性调节雌激素相关受体 β 及其在乳腺癌细胞周期中的作用。发表时间:2018 年 5 月摘要背景:乳腺癌 (BC) 具有高度异质性,约 60-70% 的雌激素受体阳性 BC 患者对抗激素治疗有反应。雌激素受体 (ER) 在乳腺癌的进展和治疗中起着重要作用。 Es...阅读更多 »组蛋白去甲基化酶 Phf2 作为分子检查点来防止 NAFLD progressi在肥胖期间发表。发表时间:2018 年 5 月摘要:据报道,异常的组蛋白甲基化谱与肥胖期间 NAFLD 的发生和进展相关。然而,对这一过程中涉及的特定表观遗传修饰因子的鉴定仍然知之甚少。在这里,我们...阅读更多»Notch-Collagen V-CALCR 的相互信号将肌肉干细胞保留在它们的利基中。发表时间:2018 年 5 月摘要:细胞微环境对干细胞维护至关重要,包含细胞和非细胞- 细胞成分,包括分泌的生长因子和细胞外基质。尽管 Notch 和其他信号通路具有……阅读更多 »Polycomb 抑制复合物 2 减弱了拟南芥基因 NRT2.1 的非常高的表达。发表时间:2018 年 5 月摘要:PRC2 是真核生物基因表达的主要调节因子。它催化抑制性染色质标记 H3K27me3,导致目标基因的表达非常低。 NRT2.1,编码es 是拟南芥中的关键根硝酸盐转运体,目标是 b...阅读更多 »HMGB2 衰老进入后的丢失会破坏基因组组织并诱导跨细胞类型的 CTCF 聚类。发表时间:2018 年 5 月摘要:细胞衰老等过程的特点是复杂的事件给予上升到异质细胞群。然而,驱动这种级联反应的早期分子事件仍然难以捉摸。我们假设衰老进入是由...触发阅读更多»不同的表观遗传景观是胰腺癌亚型病理生物学的基础。发表时间:2018 年 5 月摘要:最近的研究提供了对全基因组表达模式的充分洞察,以定义胰腺导管腺癌( PDAC) 亚型,尽管仍然缺乏关于 PDAC 的潜在表观基因组学的知识。在这里,我们执行 mul...阅读更多 »Bcl11b,一种新型 GATA3 相互作用蛋白,抑制 Th1,同时限制 Th2 细胞分化。发表时间:2018 年 5 月摘要:GATA 结合蛋白 3 (GATA3) 作为 2 型 T 辅助 (Th2) 细胞分化和功能的主要转录因子。然而,GATA3 功能如何在 Th2 细胞中被精确调节仍然是个谜。在这里,我们展示了转录……阅读更多»前列腺癌中由 JMJD3 和 EZH2 调节的新代谢基因特征。发布时间:2018 年 5 月摘要:组蛋白甲基化对于基因表达控制至关重要。组蛋白 3 (H3K27me3) 的三甲基化赖氨酸 27 受 JMJD3 脱甲基酶和 EZH2 甲基转移酶活性之间的平衡控制。这个表观遗传标记已经显示......阅读更多»The Ftx Noncoding Locus Controls Independent of Its RNA Products.Published: May, 2018Abstract: Accumulation of the Xist long noncoding RNA (lncRNA) on a X chromosome is the trigger for雌性哺乳动物的 X 染色体失活 (XCI)。需要严格控制的 Xist 表达涉及一个顺式作用区域,即 X-inactiva...阅读更多 »新型 BET 溴结构域抑制剂 BI 894999 抑制超增强子相关转录并与 AML 中的 CDK9 抑制协同作用。发表时间:2018 年 5 月摘要:溴结构域和额外末端 (BET) 蛋白抑制剂已被报道为治疗药物临床前模型中急性髓性白血病 (AML) 的选择,目前正在临床试验中进行评估。这项工作提出了一种新的有效和选择性……阅读更多»远程远端增强子控制神经元前体中 PAX6 表达的时间微调。发表时间:2018 年 4 月摘要:适当的胚胎发育依赖于对空间和时间基因的严格控制以高度调控的方式表达谱。一个很好的例子是转录因子 PAX6 的开/关切换,它控制着神经元的重要步骤……阅读更多»促炎细胞因子通过间充质基质/干细胞的表观遗传变化激活缺氧诱导因子 3α。发布时间:4 月, 2018摘要:人间充质基质细胞/干细胞 (hMSCs) 成为一种有前途的缺血性疾病治疗工具,因为它们能够再生受损组织、促进血管生成和减少炎症,导致令人鼓舞,但仍然有限……阅读更多 » Meg3 非编码 RNA 表达通过防止顺式转录上调来控制印记。发布时间:2018 年 4 月摘要:尽管许多长的非编码 RNA (lncRNA) 都被印记,但它们的作用通常仍然未知。 Dlk1-Dio3 结构域在母体染色体上表达 lncRNA Meg3 和多个 microRNA 和小核仁 RNA (snoRNA),并构成 ep...阅读更多 »犬传染性性病肿瘤消退的分子特征。发表时间:2018 年 4 月摘要:犬传染性性病肿瘤 (CTVT) 是一种克隆传染性癌症,可自发消退或在长春新碱治疗后消退,但我们对消退机制知之甚少。我们表现ormed global transcriptional, methylatio...阅读更多 »UHRF1 介导的 DNMT1 激活在维持 DNA 甲基化中的结构和机制洞察。发表时间:2018 年 4 月摘要:UHRF1 在 DNA 复制过程中调节 DNMT1 介导的 DNA 甲基化维持中起着多重作用。 UHRF1 C 端 RING 指充当泛素 E3 连接酶,在 Lys18 和/或 Lys23 处建立组蛋白 H3 泛素化,这是……阅读更多»CLK3-HMGA2 替代剪接轴影响人类造血干细胞分子身份在整个发育过程中。发布时间:2018 年 4 月摘要:虽然基因表达动力学在成人造血分化过程中得到了广泛的分类,但对人类造血干细胞 (HSC) 在发育过程中的转录组多样性知之甚少。 To characterize transcription...阅读更多»表观遗传学和早期驯化:不同红原鸡之间下丘脑 DNA 甲基化的差异根据对人类的高或低恐惧而选择。发布时间:2018 年 4 月摘要:背景:动物的驯化会在较短的进化时间内导致大量的表型改变。这种改变是由基因组变异引起的,但如果它们是原因的话,修饰性状的流行率高于预期……阅读更多»免疫细胞的比较分析揭示了一个保守的监管词典。发布时间:2018 年 3 月摘要:最明确的增强剂被深深保存。相比之下,稳态系统的全基因组比较研究表明,只有一小部分活性增强子是保守的。为了更好地了解增强子活性的保护...阅读更多»特定的 PfEMP1 在恶性疟原虫子孢子中表达并在肝细胞感染中发挥作用。发表时间:2018 年 3 月摘要:异染色质在免疫逃避过程、发病机制中起着核心作用, 以及疟疾寄生虫 Plasmodium falciparum duri 的传播ng 血液阶段感染。在这里,我们使用 ChIP 测序来证明来自 mos 的子孢子……阅读更多»表观遗传修饰剂促进线粒体生物发生和氧化代谢,从而增强神经祖细胞的分化。发表时间:2018 年 3 月摘要:在神经发育过程中,染色质乙酰化的表观遗传调节是将多能神经祖细胞的命运引向特定谱系的动态、顺序和关键过程的一部分。 Pan-HDAC 抑制剂 (HDCis) 触发神经元……阅读更多 »铜诱导 Crassostrea gigas 胚胎早期发育基因的表达和甲基化变化。发表时间:2018 年 3 月摘要:铜污染在沿海地区普遍存在,并对海洋生物产生不利影响比如软体动物。在太平洋牡蛎中,铜会在早期生命阶段引起严重的发育异常;然而,潜在的痣……阅读更多»PDX1靶基因的全基因组分析在人类胰腺祖细胞中。发表时间:2018 年 3 月摘要:目的:编码同源框转录因子 (TF) PDX1 的基因中的纯合子功能丧失突变导致胰腺发育不全,而杂合子突变可导致年轻人的成熟期发病糖尿病4(MODY4)。尽管...阅读更多 »PRDM9 甲基转移酶活性对其结合位点的减数分裂 DNA 双链断裂形成至关重要。发布时间:2018 年 3 月摘要:数百个 DNA 双链断裂 (DSB) 的程序化形成对于适当的减数分裂至关重要减数分裂和生育能力。在小鼠和人类中,这些断裂的位置由减数分裂特异性蛋白 PRDM9 决定,通过 DNA 结合 sp...阅读更多»转录因子 Runx3 和 ThPOK 交叉调节人类 Th1 淋巴细胞获得细胞毒性功能。发表时间:2018 年 2 月摘要:细胞毒性 CD4 (CD4) T 细胞正在成为抗病毒和抗肿瘤免疫的重要组成部分,b但对其发展的分子基础仍知之甚少。在人类巨细胞病毒感染的背景下,一个重要的比例……阅读更多»SNF2 样染色质重塑剂 SMARCAD1 的 CUE1 域介导其与 KRAB 相关蛋白 1 (KAP1) 和 KAP1 靶基因的关联。发布时间:2018 年 2 月摘要:胚胎干细胞 (ESC) 中的染色质与体细胞中的染色质明显不同,ESC 表现出更开放的染色质结构。因此,依赖 ATP 的染色质重塑复合物是 ESC 稳态的重要调节因子。 ...阅读更多 »尿路上皮癌发生分子病因中甲基代谢的异常甲基化关键基因。发表时间:2018 年 2 月摘要:尿路上皮癌 (UC) 是最常见的膀胱癌,会导致严重的发病率和死亡率,例如欧盟每年约有 40.000 人死亡,并且由于需要长期隔离,给卫生系统带来了可观的成本treatmen...阅读更多»SETD1A 的非催化功能调节细胞周期蛋白 K 和 DNA 损伤反应。发布时间:2018 年 2 月摘要:MLL/SET 甲基转移酶催化组蛋白 3 赖氨酸 4 的甲基化,并在发育和癌症中发挥关键作用。我们评估了 MLL/SET 蛋白,发现 SETD1A 是急性髓性白血病 (AML) 细胞存活所必需的。诱变...阅读更多 »Ezh2 和 Runx1 突变协作在早期胸腺祖细胞中引发淋巴髓系白血病。发表时间:2018 年 2 月摘要:淋巴髓系限制性早期胸腺祖细胞 (ETP) 被假定为 ETP 白血病的起源细胞, 一种与 EZH2 和 RUNX1 失活突变的频繁同时发生相关的治疗耐药性白血病,并且组成性地...阅读更多»等位基因特异性染色质募集和 ESR1 激活突变的治疗脆弱性。发表时间:2018 年 2 月摘要:雌激素受体 α (ER) 配体结合域in (LBD) 突变存在于大量内分泌治疗耐药的转移性 ER 阳性 (ER) 乳腺癌中。我们调查了染色质募集、转录网络、……阅读更多 »Micro-ribonucleic acid-155 是 Meis1 的直接目标,但不是急性髓性白血病的驱动因素发布时间:2018 年 2 月摘要:Micro-ribonucleic acid-155 (miR- 155) 是最早描述的致癌 miRNA 之一。虽然已经确定了 miR-155 的多个直接靶标,但尚不清楚它如何促进急性髓性白血病的发病机制。我们发现 miR-1...阅读更多 »甲基转移酶 Setd7 的抑制允许体外扩增具有改善治疗潜力的生肌干细胞。发表时间:2018 年 2 月摘要:用于修复受损或患病骨骼肌的细胞疗法的发展受到阻碍由于无法在培养中显着扩增未成熟的可移植成肌干细胞 (MuSC)。为了克服这个局限性,深度……阅读更多 »Miz1 通过 H3K36me2 去甲基化酶 Kdm8 控制雪旺细胞增殖以防止周围神经脱髓鞘 发表时间:2018 年 1 月摘要:雪旺细胞分化和髓鞘形成取决于染色质重塑、组蛋白乙酰化和甲基化,这些都会影响雪旺细胞增殖。我们之前报道过 POZ(POxvirus 和 Zinc finger)结构域的缺失……阅读更多 »通过甲羟戊酸途径对训练免疫进行代谢诱导。发表时间:2018 年 1 月摘要:先天免疫细胞可以在刺激后形成长期记忆感染或疫苗接种期间的微生物产品。在这里,我们报告代谢信号可以诱导训练有素的免疫力。药理学和遗传实验表明该行为...阅读更多 »BCG 疫苗接种通过诱导与受过训练的免疫力相关的细胞因子来防止人类实验性病毒感染。发布时间:2018 年 1 月摘要:T结核病疫苗卡介苗 (BCG) 对非相关感染具有异源有益作用。这些影响的基础在人类身上的探索很少。在随机安慰剂对照的人类挑战中...阅读更多»与衰老相关的重编程促进癌症干性。发表时间:2018 年 1 月摘要:细胞衰老是一种应激反应性细胞周期停滞程序,可终止(预- ) 恶性细胞。衰老机制的关键信号成分,如 p16、p21 和 p53,以及 lysi 的三甲基化……阅读更多»STAT5BN642H 是 T 细胞肿瘤的驱动突变发表时间:2018 年 1 月摘要:STAT5B 通常在造血系统恶性肿瘤中发生突变。最常见的 STAT5B 突变是 Asp642His (N642H),已在 90 多名白血病和淋巴瘤患者中发现。在这里,我们使用 Vav1 启动子生成转基因小鼠模型,表达……阅读更多»全基因组分析是黑杨昼/夜 DNA 甲基化差异的研究。发表时间:2018 年 1 月摘要:DNA 甲基化是表观遗传修饰的重要机制。应激反应和发育过程中的甲基化变化已得到充分研究;然而,它们在植物适应昼/夜周期中的作用却鲜为人知……阅读更多»常见疾病相关位点内 DNA 甲基化组的强制性和促进性等位基因变异发表时间:2018 年 1 月摘要:将表观遗传数据与全基因组关联相结合研究 (GWAS) 结果可以揭示疾病机制。 Thegenome sequence itself alsoshapes the epigenome, with CpG density and transcription factor binding sites (TFBSs) strongly e...阅读更多 »MLL2 在卵母细胞中传递转录独立的 H3K4 三甲基化 发表时间:2018 年 1 月摘要:组蛋白 3 K4 三甲基化(沉积 H3K4me3 标记)是通常与活跃的启动子相关,但反常地发生在未转录的域。描述靶向 H3K4 甲基转移酶的机制的研究正在进行中。卵母细胞...阅读更多 »基于 RNA 的 dCas9–VP64 系统提高了冷冻保存的哺乳动物细胞的活力发布时间:2018 年 1 月摘要:再生疗法需要大量健康细胞来源的可用性,这可以通过有效的冷冻保存技术来实现。在这里,我们建立了一种新方法,使用基于 mRNA 的 dCas9-...阅读更多»环境毒物诱导卵巢病理学和颗粒细胞表观基因组和转录组改变的表观遗传跨代遗传:多囊卵巢综合征和原发性卵巢的祖先起源卵巢功能不全。发布时间:2018 年 1 月摘要:影响女性生育能力和健康的两种最普遍的卵巢疾病是原发性卵巢功能不全 (POI) 和多囊卵巢综合征 (PCOS)。先前的研究表明,暴露于多种环境onmental toxicants can ...阅读更多 »癌细胞通过强制细胞内酸化特异性抑制 Wnt/β-catenin 信号。发布时间:2018 年 1 月摘要:使用 II 型糖尿病药物二甲双胍与适度降低癌症发病风险有关许多肿瘤实体。研究与二甲双胍的肿瘤抑制作用相关的分子变化,我们发现肿瘤……阅读更多»新生儿暴露于高氧环境会导致小鼠模型中与 NOS3 和 STAT3 相关的肺组蛋白特征持续紊乱。发表时间:1 月, 2018 年摘要:背景:早期肺氧暴露是支气管肺发育不良 (BPD) 发展的最重要因素之一。方法:在这里,我们分析了新生儿高氧对 NOS3 和 STAT3 实验的短期和长期影响……阅读更多»赤霉素 A3 (GA3) 叶面喷施烟草后 DNA 甲基化组和转录组分析分析na tabacum L. 发表时间:2018 年 1 月摘要:本研究调查了 DNA 甲基化组的全基因组景观及其与赤霉素 A3 (GA3) 叶面喷施在茄科植物模型 Nicotiana tabacum L. Me 的实际田间条件下的转录组关系。 ..阅读更多 »BRACHYURY 在中胚层发育过程中将组蛋白乙酰化引导至目标位点。发布时间:2018 年 1 月摘要:T-box 转录因子在脊椎动物发育的多个方面发挥着重要作用。在这里,我们表明 BRACHYURY (T) 与组蛋白修饰酶的协同作用对于小鼠胚胎发生至关重要。单点突变(...阅读更多 »(Po)STAC(多顺反子 SunTAg 修饰的 CRISPR)可实现多个基因的活细胞和固定细胞超分辨率成像发表时间:2017 年 12 月摘要:基于 CRISPR/dCas9 的标记允许直接活细胞中基因组区域的可视化。然而,标记效率和信号到b背景比率限制了其在使用超分辨率可视化基因组组织方面的应用 ...阅读更多 »Cockayne 综合征 A 和 B 蛋白通过促进 ATF3 降解来调节基因毒性应激后的转录停滞发布时间:2017 年 12 月摘要:Cockayne 综合征 (CS) 是由突变引起的在 CSA 和 CSB 中。 CSA 和 CSB 蛋白与促进转录偶联修复和恢复 DNA 损伤后的转录有关。我们表明紫外线应激会阻止转录 o...阅读更多 »L1 粘附分子使 Rett 综合征衍生的神经前体细胞中的神经发生正常化发布时间:2017 年 12 月摘要:治疗干预是改善 Rett 综合征 (RTT) 严重后果的重要需求,一种由 X 连锁基因甲基 CpG 结合蛋白 2 (MeCP2) 突变引起的神经系统疾病。按照之前观察到的 morp...阅读更多»雌激素受体-α 结合 FOXP3 启动子并调节s 调节性 T 细胞在人类宫颈癌中的功能发布时间:2017 年 12 月摘要:雌激素通过一种被认为涉及雌激素受体α (ERα) 的机制控制调节性 T 细胞(Treg 细胞)中的 Foxp3 表达,但 ERα 信号传导的分子基础和功能影响在 Treg 细胞中仍不清楚。我们 ...阅读更多 »双重 SIRT1 表达模式强烈表明其在人类乳腺癌中的二价作用发布时间:2017 年 12 月摘要:乳腺癌是女性最常见的癌症,也是全球女性癌症死亡的主要原因。 SIRT1(沉默交配型信息调节 2 同系物)1 是一种 III 类组蛋白去乙酰化酶,参与细胞凋亡调节、DNA 修复……阅读更多 »EZH2 组蛋白甲基转移酶和 JMJD3 组蛋白去甲基化酶对前列腺癌的影响发布时间:2017 年 12 月摘要:阅读更多 »针对早期鸡胚功能丧失的 CRISPR/Cas9 基因组编辑优化发布时间:12 月,2017 年摘要:CRISPR/Cas9 的出现使几乎任何生物体的基因组编辑成为可能,包括那些以前不适合基因操作的生物体。在这里,我们提出了 CRISPR/Cas9 的优化,用于早期禽胚胎,具有 imp...阅读更多»单细胞绝对接触概率检测揭示染色体由多个低频但特定的相互作用组织发布:2017 年 11 月摘要:在从千到兆碱基对尺度,真核基因组被分成自相互作用模块或拓扑相关域 (TAD),这些域关联形成核区室。在这里,我们结合了高内涵超分辨率显微镜……阅读更多»组蛋白代码阅读器 Spin1 控制骨骼肌发育发布时间:2017 年 11 月摘要:虽然几项研究将组蛋白代码阅读器 Spin1 的表达增加与肿瘤形成或生长相关联,但很少已知蛋白质的生理功能。我们在成肌细胞前体中生成了 Spin1 消融的 Spin1M5 小鼠……阅读更多»DNA 甲基化特征遵循心肌细胞中预先形成的染色质隔室发布时间:2017 年 11 月摘要:在受限核空间中存储染色质需要密集包装,同时确保 DNA 可访问性。因此,存在不同层次的染色质组织和表观遗传控制机制。全基因组染色质相互作用图揭示了 lar...阅读更多 »FBXO32 在肿瘤转移和大脑发育过程中通过 CtBP1 促进上皮-间质转化的微环境发表时间:2017 年 11 月摘要:将贴壁上皮细胞转化为迁移细胞的一系列事件是众所周知的上皮-间质转化 (EMT)。 EMT 参与发育过程,例如,触发神经嵴迁移和病原体……阅读更多»原位固定重新定义骨骼肌干细胞的静止和早期激活发表时间:2017 年 11 月摘要:摘要 最先进的技术已经开发出来,用于分离和分析来自各种组织的细胞,旨在捕获它们的体内状态。然而,大多数细胞分离方案涉及冗长的机械和酶促……阅读更多»GATA2/3-TFAP2A/C 转录因子网络将人类多能干细胞分化与滋养外胚层结合,抑制多能性发表时间:2017 年 11 月摘要:阐明分子基于 BMP4 诱导的人类多能干细胞 (PSC) 向具有滋养外胚层特征的后代分化的基础,我们制作了转录组、表观基因组 H3K4me3、H3K27me3 和滋养层 CpG 甲基化图谱……阅读更多 »拟南芥中的 5-甲基胞嘧啶 RNA 甲基化已发表: 2017 年 11 月摘要:5-甲基胞嘧啶 (m5C) 是一种特征明确的 DNA 修饰,也主要在原核生物和真核生物的大量非编码 RNA 中报道。然而,m5C 在植物 mRNA 中的分布和生物学功能仍然很大……阅读更多 »药物可调多维合成基因控制使用可诱导的 degron 标记的 dCas9 效应器发布时间:2017 年 10 月摘要:CRISPR-Cas9 蛋白 (dCas9) 的核酸酶失活变体融合到异源反式激活结构域的 RNA 可以作为哺乳动物细胞中基因表达的有效引导 RNA 序列导向诱导剂或阻遏物。在这样的系统中,长期……阅读更多 »胎盘甲基化组的改变与母体肥胖和代谢调节的证据发布时间:2017 年 10 月摘要:孕妇肥胖引起的炎症和代谢紊乱会产生不利的宫内环境,增加妊娠率并发症和不良胎儿结局,并为胎儿制定肥胖和代谢综合征的程序……阅读更多»N-α-乙酰转移酶 10 蛋白在 DNA 甲基化和基因组印记中的作用发布时间:10 月 2 日017摘要:基因组印记是一种等位基因表达现象,主要受印记控制区(ICR)等位基因特异性DNA甲基化控制,但其潜在机制尚不清楚。 N-α-乙酰转移酶 10 蛋白……阅读更多 »混合谱系白血病 4 (MLL4) 甲基转移酶复合物参与转化生长因子 β (TGF-β) 激活的基因转录。发布时间:2017 年 10 月摘要:Sma 和 Mad 相关(SMAD) 介导的转化生长因子 β (TGF-β) 和骨形态发生蛋白 (BMP) 信号是各种细胞过程所必需的。激活的异源三聚体 SMAD 蛋白复合物与细胞核相关……阅读更多»快速交流:组蛋白修饰与参与猪脂肪组织积累的关键基因表达之间的相关性。发表时间:2017 年 10 月摘要:组蛋白修饰是一种很好的-参与基因 e 调节的已知表观遗传机制表达;然而,它在猪的脂肪组织中的研究很少。了解脂肪组织发育和功能的分子背景……阅读更多 »TET2 和 TDG 介导的变化是获得骨髓细胞不同终末分化中不同组蛋白修饰所必需的 发表时间:2017 年 9 月摘要:骨髓细胞的可塑性是通过多种功能来说明,包括它们作为巨噬细胞 (MAC) 的先天免疫效应器和作为破骨细胞 (OC) 的骨重塑的作用。 TET2,一种甲基胞嘧啶双加氧酶,在……中高度表达……阅读更多»从 ChIP-Seq 时间过程数据预测刺激依赖性增强子-启动子相互作用发布时间:2017 年 9 月摘要:我们开发了一种机器学习方法来预测刺激依赖性增强子-启动子相互作用使用基因组蛋白质占有率随时间变化的证据。雌激素受体α(ERα)的占据,RNA polymerase ...阅读更多 »反式配对切口触发无缝基因组编辑,无需双链 DNA 切割发布时间:2017 年 9 月摘要:精确的基因组编辑涉及供体 DNA 和染色体序列之间的同源重组,这些序列受到可编程核酸酶的双链 DNA 断裂。理想情况下,基因组编辑应该高效、特异和准确。然而……阅读更多 »CDK8/19 介质激酶增强 NFκB 对转录的诱导 发布时间:2017 年 9 月摘要:核因子-κB (NFκB) 转录因子家族与炎症性疾病、病毒感染和癌症有关。大多数抑制 NFκB 的药物都显示出明显的副作用,可能是由于持续……阅读更多»组蛋白 H4K20 在晚期发射起源处的三甲基化确保及时的异染色质复制发布时间:2017 年 9 月摘要:在其他目标中,蛋白质赖氨酸甲基转移酶 PR -Set7 诱导s 组蛋白 H4 赖氨酸 20 单甲基化 (H4K20me1),它是 Suv4-20h 甲基转移酶进一步甲基化的底物。尽管这些酶有牵连……阅读更多 »ELL2 增强子多态性介导 5q15 多发性骨髓瘤的遗传易感性发表时间:2017 年 9 月摘要:多发性骨髓瘤 (MM) 是浆细胞的恶性肿瘤。全基因组关联研究表明,5q15 的变异会影响 MM 风险。在这里,我们试图破译 5q15 的因果变异及其影响肿瘤的机制……阅读更多 »基因内 CpG 岛的 DNA 甲基化取决于它们在分化和疾病期间的转录活性发表时间:2017 年 9 月摘要:人类基因组包含约 30,000 个 CpG 岛 (CGI)。虽然与启动子相关的 CGI 几乎总是保持未甲基化,但位于基因体内的约 9,000 个 CGI 中的许多在发育和分化过程中被甲基化。两个p ... Read 更多»生酮饮食揭示了肝脏和肠道时钟的独特昼夜节律特征发布时间:2017 年 9 月摘要:生物钟协调生理和行为的节律,使机体适应日常环境变化。虽然食物摄入对肝脏的昼夜节律有深远的影响,但营养挑战是如何不同的……阅读更多»导致脂肪营养不良的核纤层蛋白 A 突变体改变了抗脂肪生成 MIR335 位点的构象和表观遗传调控发表时间:2017 年 9 月摘要:核纤层蛋白突变A/C (LMNA) 基因编码的核 LMNA 引起核纤层蛋白病,包括与代谢综合征相关的部分脂肪营养不良。脂肪营养不良相关的 LMNA p.R482W 突变已知会损害脂肪形成的不同......阅读更多»活化 T 细胞中的染色体接触识别自身免疫性疾病候选基因发表时间:2017 年 9 月摘要:背景:自身免疫性疾病相关变异更受欢迎主要存在于免疫细胞的调节区,尤其是 CD4+ T 细胞。将此类调控区域与疾病相关细胞环境中的基因启动子联系起来有助于识别……阅读更多»达尔文雀的城市和农村种群之间的表观遗传变异发表时间:2017 年 8 月摘要:背景进化变化的分子基础被认为是遗传变异。然而,越来越多的证据表明,DNA 甲基化等表观遗传机制也可能与快速适应新环境有关。一个……阅读更多 »一个 lncRNA 微调涉及 Lin28、let-7 和从头 DNA 甲基化的细胞状态转变的动力学发布时间:2017 年 8 月摘要:多能性的执行需要从以小鼠胚胎干细胞为代表的幼稚状态进展( ESCs)到一个有能力进行谱系规范的状态。这种转变在多个层面进行协调。非编码 RNA 可能会……阅读更多 »Myc 调节 ChromB 细胞激活过程中的蛋白分解和核结构发布时间:2017 年 8 月摘要:50 年前,Vincent Allfrey 及其同事发现淋巴细胞激活会触发染色质的大量乙酰化。然而,驱动表观遗传可及性的分子机制仍然未知。我们在这里显示刺激的淋巴细胞……阅读更多»腺病毒 CRISPR/Cas9 在人类原代细胞中高效基因失活发布时间:2017 年 8 月摘要:使用人类原代细胞的表型分析是药物发现中目标发现和验证的非常有价值的工具。这些测定中此类目标的表达敲低 (KD) 允许调查它们在疾病过程模型中的作用...阅读更多»心肌细胞染色质构象的高分辨率映射揭示了心力衰竭表观基因组的结构重塑发表于:2017 年 8 月摘要: 背景 - 心血管疾病与听力的表观基因组变化有关t,然而心肌细胞染色质的内源性结构从未被确定。方法 - 研究表观基因组功能在他...阅读更多»肝脏中的昼夜节律重编程确定衰老的代谢途径发表时间:2017 年 8 月摘要:衰老过程和昼夜节律密切相关,但外围时钟如何参与其中代谢稳态对衰老的贡献仍然未知。重要的是,热量限制 (CR) 延长了几种生物体的寿命,并且……阅读更多 »TGF-β1 诱导的肺癌上皮-间质转化中 H3K79 的三甲基化降低发表时间:2017 年 8 月摘要:背景:上皮细胞间充质转化 (EMT) 使上皮癌细胞获得间充质特征,并有助于转移和对治疗的抵抗。这个过程涉及基因表达的表观遗传重编程……阅读更多»孕产妇肥胖计划增加了 lep通过表观遗传修饰以库特异性方式在大鼠雄性后代中表达锡基因 发表时间:2017 年 8 月摘要:目的:根据健康和疾病的发育起源 (DOHaD) 概念,母体肥胖和新生儿加速生长使后代易产生白色脂肪组织(WAT) 积累。在啮齿类动物中,脂肪生成主要发展……阅读更多 » 一种新型 FOXA1/ESR1 相互作用途径:Oncomine™ 乳腺癌微阵列研究发布时间:2017 年 8 月摘要:叉头盒蛋白 A1 (FOXA1) 对乳腺上皮细胞的生长和分化至关重要, 并且在乳腺癌 (BC) 中有良好的结果。 BC 中升高的 FOXA1 表达也促进了雌激素受体的激素反应(……阅读更多»PWWP2A 与 H2A.Z 的多价结合调节有丝分裂和神经嵴分化发表时间:2017 年 8 月摘要:用特殊组蛋白变体替代典型组蛋白促进染色质改变结构和功能。基本组蛋白变体 H2A.Z 通过知之甚少的机制影响各种基于 DNA 的过程。在这里,我们确定……阅读更多 »可卡因自我给药后大鼠海马体中 5-羟甲基化水平升高 发表时间:2017 年 7 月摘要:戒断可卡因期间的药物渴望和复发风险被认为是由转录的持续变化引起的和染色质调节。尽管这些过程涉及多个大脑区域,但海马体似乎起着……阅读更多 »组蛋白 H3K9me 状态在 RNAi 和可遗传的转录沉默中的独特作用发表时间:2017 年 7 月摘要:异染色质 DNA 域在调控中具有重要作用通过沉默重复 DNA 元件和转座子来表达基因和维持基因组稳定性。从裂殖酵母到哺乳动物,DNA 重复处的异染色质组装……阅读更多 »Krox20 后脑调节结合顺式作用元件之间的多种合作模式发布时间:2017 年 7 月摘要:发育基因可以包含多个转录增强子,这些增强子同时或连续起作用以实现稳健和精确的时空表达。然而,顺式作用元件之间合作的潜在机制是 poo...阅读更多»抑制性组蛋白修饰 H3K9me2 的异位应用在拟南芥中建立合子后生殖隔离发表时间:2017 年 7 月摘要:由于种间或倍体间杂交是植物生殖隔离的主要机制。这种机制体现在胚乳中,胚乳是一种支持胚胎生长的剂量敏感组织。 Dereg...阅读更多 »血小板功能被巨核细胞超级增强子中的常见序列变异所修饰发表时间:2017 年 7 月摘要:将非编码遗传变异与疾病或疾病风险相关联目标基因的相关性状是实现 GWAS 在引入精准医学中潜力的关键步骤。在这里,我们着手确定机制……阅读更多 »17q21.31 微缺失和微复制综合征的小鼠模型突出了 Kansl1 对认知的重要性发布时间:2017 年 7 月摘要:Koolen-de Vries 综合征 (KdVS) 是一种多系统疾病以智力障碍、友好行为和先天畸形为特征。该综合征是由 17q21.31 染色体区域的微缺失或变体引起的...阅读更多»维生素 C 通过 Kdm3a/b 诱导小鼠胚胎干细胞中 H3K9me2 的特异性去甲基化发表时间:2017 年 7 月摘要:背景组蛋白甲基化模式调节基因表达并且在开发过程中是高度动态的。组蛋白甲基化的擦除是通过组蛋白去甲基化酶进行的。我们之前已经表明维生素 C 增强了……阅读更多 »TET 催化的 5-Hydr双能肝祖细胞分化过程中的羟甲基化先于 HNF4A 启动子选择发布时间:2017 年 7 月摘要:了解控制肝祖细胞分化的过程对于针对慢性肝病的策略设计具有重要意义,因此肝组织的再生至关重要。尽管 DNA 甲基化 (5mC...阅读更多 »在分泌前体去分化为 Lgr5+ 肠干细胞期间染色质可及性特征的动态重组发表时间:2017 年 7 月摘要:复制 Lgr5+ 干细胞和静止 Bmi1+ 细胞在体内表现为肠干细胞 (ISC)。破坏 Lgr5+ ISC 触发 Bmi1+ 细胞、分泌或吸收祖细胞以及潘氏细胞前体的上皮更新……阅读更多 »RNA 解旋酶 DHX9 建立核仁异染色质,胚胎干细胞分化需要这种活性发表时间:2017 年 7 月摘要:长非编码 RNA (lncRNA) 与染色质构象和表观遗传模式的调节有关。 lncRNA 表达水平被广泛用作功能特性的指标。然而,RNA 加工在 mo 中的作用……阅读更多 »Pramel7 通过蛋白酶体-表观遗传联合途径介导基态多能性。发表时间:2017 年 7 月摘要:在植入前外胚层中建立了幼稚多能性。胚胎干细胞 (ESC) 代表幼稚多能性的永生化。 2i 文化优化了这种状态,导致基因特征和 DNA 低甲基化密切比较……阅读更多 »小鼠 T 细胞系中的染色质免疫沉淀 (ChIP) 发表时间:2017 年 6 月摘要:信号通路通过调节基因表达程序不同水平的染色质结构,例如通过组蛋白尾部的翻译后修饰 (PTM)、典型组蛋白与组蛋白变体的交换,...​​阅读更多 »BIX-01294 对组蛋白 H3K9 甲基化的抑制促进应激诱导的小孢子全能性并增强胚胎发生启动发布时间:2017 年 6 月摘要:小孢子胚胎发生是细胞重编程、全能性获得和胚胎发生启动的过程,通过应激处理在体外诱导并被广泛使用在植物育种中快速生产双单倍体,但其调节...阅读更多»神经肽 Y 表达标记小鼠和人类中部分分化的 β 细胞发表时间:2017 年 6 月摘要:β 细胞是通过内分泌祖细胞的分化在胚胎生命中形成的,在新生儿生命中通过复制扩展,然后过渡到功能成熟。在这项研究中,我们解决了 neurop 的潜在贡献……阅读更多»DNMT 和 HDAC 抑制剂诱导编码在长末端重复中的隐蔽转录起始位点发布时间:2017 年 6 月摘要:已经提出了几种作用机制DNA 甲基转移酶和组蛋白脱乙酰酶抑制剂(DNMTi 和 HDACi),主要基于候选基因方法。然而,人们对它们的全基因组转录和表观基因知之甚少……阅读更多»组蛋白脱乙酰酶抑制剂增强了结肠癌细胞的光动力疗法,其特征是染色质介导的 CDKN1AP 表观遗传调控发布时间:2017 年 6 月摘要:背景金丝桃素介导的光动力疗法 (HY -PDT)作为一种替代的微创抗癌治疗最近引起了越来越多的关注,尽管癌细胞可能会产生耐药性。因此,联合治疗 m...阅读更多 »HDAC1 将早期生活压力与精神分裂症样表型联系起来发布时间:2017 年 6 月摘要:精神分裂症是一种破坏性疾病,在遗传易感性和环境风险因素(例如早期生活压力)的背景下出现( EL)。在这项研究中,我们表明 ELS 诱导的小鼠精神分裂症样表型与……阅读更多»ICF 特异性 DNMT3B 功能障碍干扰 mRNA 转录和选择性剪接的基因内调节发表时间:2017 年 6 月摘要:DNA 甲基转移酶 DNMT3B 的亚型突变导致大多数罕见疾病免疫缺陷、着丝粒不稳定和面部异常综合征病例 (ICF1)。通过未指定的机制,突变体 DNMT3B 干扰淋巴特异性……阅读更多»Mll3 和 Mll4 促进增强子 RNA 的合成和转录,独立于 H3K4 MonomethylationPublished:2017 年 5 月摘要:组蛋白 H3 在赖氨酸 4 (H3K4me1) 和乙酰化的单甲基化赖氨酸 27 (H3K27ac) 的组蛋白 H3 与转录参与的增强子元件相关,但这些修饰对增强子活性的功能影响是……阅读更多»p63 的进化重新布线和角质形成细胞的表观基因组调控景观及其潜力对物种特异性基因表达和 p 的影响表型发表时间:2017 年 5 月摘要:尽管表皮角质形成细胞的发育和分化在人类和小鼠之间以相似的方式进行,但进化压力也造成了显着的物种特异性生理差异。这些物种之间的差异……阅读更多 »RNA 聚合酶 III 亚基 POLR3G 调节人类多能干细胞中 PolyA(+) 和 SmallRNA 转录组和剪接的特定子集。发表时间:2017 年 5 月摘要:POLR3G 在人类多能干细胞中高水平表达细胞 (hPSCs),并且需要通过尚不清楚的机制来维持干细胞状态。为了探索 POLR3G 如何调节干细胞状态,我们进行了深度测序……阅读更多 »CHD4 在启动和维持多种肿瘤抑制基因的表观遗传抑制方面具有致癌功能发布时间:2017 年 5 月摘要:CHD4 的致癌作用,一种 NuRD组件,被定义为启动和支持肿瘤抑制 gene (TSG) 在人类结直肠癌中的沉默。 CHD4 将抑制性染色质蛋白募集到 DNA 损伤修复部位,包括 DNA 甲基……阅读更多»视网膜在发育、重新编程和肿瘤发生过程中的动态表观遗传景观。发布时间:2017 年 5 月摘要:在发育中的视网膜中,多能神经祖细胞以精确的时空顺序进行单向分化。在这里,我们分析了小鼠和人类视网膜形成过程中发生的表观遗传和转录变化。 Altho...阅读更多»汞诱导的异常神经行为的表观遗传跨代遗传与斑马鱼的精子表观突变相关。发表时间:2017 年 5 月摘要:甲基汞 (MeHg) 是一种普遍存在的环境神经毒物,人类暴露主要来自鱼类消费。已知斑马鱼在发育过程中接触甲基汞会改变它们的神经行为。目前的研究调查了……阅读更多»关键 tDNA 甲基转移酶 1 的阈值水平需要维持人类癌细胞基因组中的 DNA 甲基化。发表时间:2017 年 4 月摘要:通过抑制 DNA 甲基转移酶 (DNMT) 逆转 DNA 甲基化异常和相关基因沉默是一种重要的潜在癌症治疗范例。最大限度地发挥这种潜力需要精确定义这些酶如何...阅读更多»单细胞藻类中 Polycomb 组标记 H3K27me3 的表征发表时间:2017 年 4 月摘要:Polycomb 组 (PcG) 蛋白通过催化 H3K27 甲基化和H2AK118/119 分别通过 Polycomb 抑制复合物 2 (PRC2) 和 PRC1 的活性进行单泛素化。 PcG 蛋白...阅读更多 »DNA 断裂和染色质结构变化增强自身免疫调节靶基因的转录发表时间:2017 年 4 月摘要:自身免疫调节蛋白 (AIRE) 是胸腺发育的关键因素通过促进胸腺髓质上皮中组织特异性基因的异位表达来负选择自身反应性 T 细胞。 AIRE 突变导致单基因自动...阅读更多 »人​​类糖皮质激素受体 (hGR) S-棕榈酰化在介导非基因组糖皮质激素作用中的作用发表时间:2017 年 4 月摘要:背景:许多快速非基因组糖皮质激素作用由膜介导 -结合糖皮质激素受体 (GR)。 S-棕榈酰化是一种脂质翻译后修饰,可介导某些类固醇受体的膜定位。 ...阅读更多 »小鼠滑膜成纤维细胞在 TNF 驱动的关节炎发生过程中的基因组反应极大地模仿了人类类风湿性关节炎的反应发表时间:2017 年 4 月摘要:目的:滑膜成纤维细胞 (SFs) 的异常激活是类风湿性关节炎发病机制的关键决定因素( RA)。我们的目标是制作一张基因表达和表观遗传变化的图谱疾病过程中的细胞类型……阅读更多 »拟南芥中的 H2A 单泛素化通常独立于 LHP1 和 PRC2 活性发布时间:2017 年 4 月摘要:背景:多梳群复合物 PRC1 和 PRC2 抑制真核生物染色质水平的基因表达。 Polycomb 组复合物的经典招募模型,其中 PRC2 介导的 H3K27 三甲基化为 H2A monoubi 招募 PRC1...阅读更多 »H3K27me3 作为前列腺癌进展中的表观遗传标记的全球分析发表时间:2017 年 4 月摘要:背景:H3K27me3 组蛋白标记塑造了抑制基因转录。在前列腺癌中,H3K27me3 标记的失调可能在前列腺肿瘤进展中发挥作用。方法:我们研究了全基因组 H3K27me3 组蛋白甲基化……阅读更多 »c-Myc 拮抗前列腺癌中影响关键的雄激素受体的转录活性Gene Networks 发表时间:2017 年 4 月摘要:前列腺癌 (PCa) 是最常见的癌症男性常见的非皮肤癌。雄激素受体 (AR) 是一种配体激活的转录因子,是该病晚期病例的主要药物靶点。然而,各种其他 transcriptio...阅读更多 »XPC DNA 修复复合物在体细胞和多能干细胞中对 DNA 去甲基化的调节。发表时间:2017 年 4 月摘要:将体细胞的表观遗传记忆忠实重置为多能状态细胞重编程期间需要 DNA 甲基化以沉默体细胞基因表达和动态 DNA 去甲基化以激活多能基因转录……阅读更多 »表观遗传驱动的滑膜成纤维细胞的解剖学多样性指导关节特异性成纤维细胞功能发布时间:2017 年 3 月摘要:许多人类疾病,如关节炎和动脉粥样硬化,包括特定解剖位置的特征性病理学。在这里,我们显示了来自不同关节位置的滑膜成纤维细胞的转录组学差异和那个 HOX 基因 ... 阅读更多 »针对核纤层蛋白 A/C 组蛋白结合位点的抗体显微注射可阻止有丝分裂进入并揭示与 HP1、CenpB 和 PML 的独立染色质相互作用。发布时间:2017 年 3 月摘要:核纤层蛋白形成衬里的支架结合染色质并有助于空间基因组组织的细胞核;然而,由于核纤层蛋白的许多其他功能,敲除或改变核纤层蛋白聚合物的研究无法清楚地区分两者……阅读更多 »β-连环蛋白赖氨酸 49 的三甲基化和乙酰化代表 ESC 多能性中的关键元素发布时间:2017 年 3 月摘要:通过诱导中胚层分化和抑制神经元分化,胚胎干细胞 (ESC) 的多能性需要 Wnt/β-连环蛋白信号传导;然而,β-连环蛋白如何反调节这些分化途径是未知的……阅读更多»Chd7 通过激活神经元分化对于哺乳动物大脑发育是不可或缺的程序发布时间:2017 年 3 月摘要:染色质修饰基因的突变通常与神经发育疾病有关。我们在此证明,经常与 CHARGE 综合征相关的染色质域解旋酶 DNA 结合蛋白 7 (Chd7) 对于 n...阅读更多 »强效和选择性 KDM5 抑制剂可阻止 H3K4me3 在转录起始位点的细胞去甲基化和 MM1S 的增殖骨髓瘤细胞发表时间:2017 年 3 月摘要:组蛋白尾部赖氨酸残基的甲基化是一种动态的表观遗传修饰,在染色质结构和基因调控中起着关键作用。 KDM5(也称为 JARID1)子家族的成员是 2-oxoglutarate (2-OG) 和 Fe2+-dependen...阅读更多 »结直肠癌中 DNA 甲基化和基因间 LINE-1 启动子活性的解偶联出版时间:3 月, 2017 年摘要:癌症中 LINE-1 重复序列的低甲基化被认为是其激活背后的主要机制;这个假设然而,on 是基于早期研究的结果,这些研究偏向于年轻和换位活跃的元素。他...阅读更多 »miR-30a 通过调节特发性肺纤维化中的 Drp-1 启动子羟甲基化靶向 TET1 作为潜在治疗剂发表时间:2017 年 3 月摘要:最近的几项研究表明,miR-30a 在各种生物过程中起着关键作用,疾病。然而,miR-30a 参与特发性肺纤维化 (IPF) 调节的机制尚不明确。我们之前的研究……阅读更多»ERK 诱导的 SRF 辅因子 TCF 家族激活启动与转录相关的染色质修饰级联发表时间:2017 年 3 月摘要:我们研究了 ERK 信号、组蛋白修饰和转录因子活性之间的关系,重点是ERK 调节的 SRF 伙伴蛋白的三元复合因子家族。在 MEF 中,通过 TPA 刺激诱导 ERK 激活……阅读更多e »Connexin43 在集体细胞迁移过程中控制 N-cadherin 转录发布时间:2017 年 3 月摘要:连接蛋白是间隙连接的主要成分,在许多生理过程中提供细胞之间的直接联系,包括细胞迁移和癌症转移。缝隙连接究竟如何控制细胞迁移仍然是个谜……阅读更多»肥胖、胰岛素抵抗状态下升高的成纤维细胞生长因子 21 (FGF21) 被小鼠中的合成类视黄醇芬维A胺正常化发布时间:2017 年 3 月摘要:成纤维细胞生长因子 21 (FGF21) 已成为葡萄糖和脂质稳态的重要有益调节剂,但其水平在啮齿动物和人类的胰岛素抵抗状态下也会异常升高。合成类视黄醇 Fenretinid...阅读更多 »Krüppel 样转录因子 KLF10 通过负反馈机制抑制 TGFβ 诱导的上皮-间质转化发表时间:2017 年 3 月摘要:TGFβ-SMAD 信号传导发挥背景效应,在上皮肿瘤发生的早期抑制恶性生长,但在后期促进转移。解决这种功能二分法的长期挑战可能会发现新的战略……阅读更多»评估细胞中的组蛋白去甲基化酶抑制剂:经验教训发布时间:2017 年 3 月摘要:背景组蛋白赖氨酸去甲基化酶 (KDM) 由于其在染色质中的调节作用而成为药物靶标组织及其与包括癌症和精神障碍在内的疾病的紧密联系。第一个 KDM 抑制剂……阅读更多 »阻塞性睡眠呼吸暂停小鼠模型中的主动脉巨噬细胞炎症和表观遗传变化:CD36 的潜在作用。发表时间:2017 年 2 月摘要:阻塞性睡眠呼吸暂停 (OSA) 影响 8-10%人口,以慢性间歇性缺氧(CIH)为特征,并与心血管疾病发病率有因果关系。在 CIH 暴露的小鼠中,密切模仿慢性人类 OSA 的 ity, inc...阅读更多 »H3.Y 区分 HIRA 和 DAXX 伴侣复合物,并揭示了对人类 DAXX-H3.3-H4 结合和沉积要求的意外见解发布时间:2017 年 2 月摘要:组蛋白伴侣防止混杂的组蛋白相互作用染色质组装前。它们保证了典型组蛋白和功能特化的组蛋白变体在空间和时间受限的 ma 中忠实沉积到染色质中……阅读更多»RNF40 以表观遗传背景相关的方式调节基因表达发布时间:2017 年 2 月摘要:背景:H2B 的单泛素化(H2Bub1) 是一种很大程度上神秘的组蛋白修饰,与转录延伸有关。由于这种关联,人们普遍认为 H2Bub1 是一种完全积极的交流……阅读更多 »Jmjd2c/Kdm4c 在胚胎干细胞分化开始时促进必需增强子蛋白复合物的组装Published:2017 年 2 月摘要:Jmjd2 H3K9 去甲基化酶协同促进小鼠胚胎干细胞 (ESC) 的鉴定。然而,关于它们在 ESC 多能性退出时的重要性知之甚少。在这里,我们发现 Jmjd2c 通过稳定装配来促进这一过程……阅读更多»自闭症谱系障碍 (ASD) 受试者额叶皮层 (FC) 中 RELN 和 GAD1 的表观遗传调控发表时间:2017 年 2 月摘要:两者 Reelin (RELN)和谷氨酸脱羧酶 67 (GAD1) 与自闭症谱系障碍 (ASD) 的病理生理学有关。我们之前已经表明,通过一种机制,ASD 受试者的小脑 (CB) 中的两种 mRNA 都减少了……阅读更多»非编码变体 rs1800734 通过远程相互作用增强 DCLK3 表达并促进结直肠癌进展。发布时间:2 月, 2017 摘要:全基因组关联研究已经确定了大量结直肠癌 (CRC) 的非编码风险变异。托达请注意,这些变体中的大多数尚未进行功能研究。等位基因特异性转录因子的鉴定……阅读更多 »Menin 通过 Akt/Ezh2 介导的 H3K27 组蛋白修饰调节 Inhbb 表达发布时间:2017 年 2 月摘要:尽管 Men1 是众所周知的抑癌基因,但人们对它的功能知之甚少Menin,它编码的蛋白质。几年以来,许多出版物支持 Menin 在控制表观遗传学基因调控中的主要作用。而...阅读更多 »一种新型 DLX3-PKC 集成信号网络驱动角质形成细胞分化发布时间:2017 年 2 月摘要:表皮稳态依赖于对角质形成细胞增殖和分化的明确转录控制,这对于预防特应性皮炎等皮肤病至关重要、牛皮癣或癌症。我们最近表明 ho...阅读更多»H3K23me1 是一种与 CG DNA m 相关的进化保守的组蛋白修饰拟南芥中的乙基化 发布时间:2017 年 2 月摘要:组蛋白的氨基末端尾部是多种翻译后修饰的目标,其组合作用可能构成一个代码,该代码将被细胞蛋白质读取和解释以定义特定的转录状态。在这里,我们...阅读更多»热性惊厥后癫痫易感性增强的代际传播发布时间:2017 年 2 月摘要:发育早期的环境暴露在以后的生活中对疾病的易感性起作用。在这里,我们证明大鼠幼崽暴露于高温环境引起的长时间热性惊厥增强了癫痫发作的易感性……阅读更多 »拟南芥种子发芽阶段四种主要组蛋白修饰的全基因组分析发表时间:2017 年 2 月摘要:BackgroundHybrid优势(杂种优势)几十年来一直用于种植农业,尤其是玉米和水稻的生产,因为使用杂交品种在植物生物量和种子产量方面超过其亲本。杂种的分子基础...阅读更多 »启动子的基因组特征和动态甲基化促进 H2A 变体、H2A.1 和 H2A.2 在肝细胞各种病理生理状态下的转录调节发表时间:2017 年 2 月摘要:H2A 同态变体的差异表达组蛋白 H2A.1 和 H2A.2 家族与肝细胞癌和肝细胞未分化状态的维持有关。然而,对 transcriptio 知之甚少……阅读更多 »四聚化小分子抑制剂对 RUNX1/ETO 致癌活性的抑制发表时间:2017 年 2 月摘要:RUNX1/ETO,t(8;21) 染色体易位的产物, 是急性髓性白血病 (AML) 最常见形式之一的发作和维持所必需的。 RUNX1/ETO 具有模块化结构,除了 DN A 绑定域(运行...阅读更多 »在第一次喂食时喂养不同维生素水平的幼年虹​​鳟鱼的肌肉分解代谢能力和整体肝脏表观基因组发生了变化发表时间:2017 年 2 月摘要:基于哺乳动物营养规划的概念,我们测试了第一次喂食期间是否存在短期高维生素刺激或低维生素刺激- 喂养可以引起虹鳟鱼营养代谢的长期变化。 Trout alevins 在……阅读更多 »应用 INTACT 方法纯化胚乳核并生成亲本特异性表观基因组图谱。发布时间:2017 年 2 月摘要:双子叶植物的早期胚乳组织很难通过人工解剖分离。该协议详细说明了如何应用 INTACT(在特定细胞类型中标记的细胞核分离)系统分离拟南芥的早期胚乳细胞核……阅读更多»DNA 甲基转移酶 1 的药理学抑制促进啮齿动物和人类鼻嗅干/祖细胞的神经元分化细胞l cultures 发表时间:2017 年 2 月摘要:鼻嗅干细胞和神经祖细胞 (NOS/PC) 被认为是神经退行性疾病再生干细胞疗法的可能工具。神经发生是一个复杂的过程,由外在和内在信号调节,包括……阅读更多»青春期化疗后成人精子中的差异 DNA 甲基化区域:表观遗传的潜力。发表时间:2017 年 2 月摘要:背景:青春期化疗的潜力研究了影响种系的表观遗传编程以影响成年后的生育能力和促进表观遗传的遗传。以前的研究表明麻木……阅读更多»DNA 甲基化异质性定义了尤文肉瘤的疾病谱发布时间:2017 年 1 月摘要:儿童和年轻人的发育性肿瘤几乎没有遗传改变,但它们具有不同的临床表现。专注于尤文肉瘤,我们试图确定遗传学中表观遗传异质性的普遍性和特征……阅读更多»MLL-AF9 和 MLL-AF4 融合蛋白结合一个独特的增强子库并针对 11q23 急性髓性白血病中的 RUNX1 程序。发布时间:2017 年 1 月摘要:在 11q23 白血病中,混合谱系白血病 (MLL) 基因的 N 端部分与 >60 种不同的伴侣基因融合。为了定义一组核心的 MLL 重排目标,我们研究了 MLL-AF9 和 MLL-AF 的全基因组结合……阅读更多 »Snail2 和 Zeb2 抑制 P-钙粘蛋白以定义鸡胚胎中的胚胎区域发表: 2017 年 1 月摘要:Snail 和 Zeb 转录因子通过直接抑制 E-钙粘蛋白转录诱导胚胎和成人组织中的上皮间质转化 (EMT)。 EMT 诱导剂 Snail1 和 Zeb2 p 对 E-钙粘蛋白转录的抑制……阅读更多 »Praja1 E3 泛素连接酶通过促进骨骼肌生成p38α 激活后 EZH2 的 gh 降解发表时间:2017 年 1 月摘要:Polycomb 蛋白是通过转录抑制调节干细胞分化的关键染色质修饰剂。在骨骼肌祖细胞中,zeste 同系物 2 (EZH2) 的增强子、Polycomb 抑制复合物 2 的催化亚基……阅读更多 »小鼠肠神经系统祖细胞的分化受内皮素 3 控制,需要通过 SOX10 和 ZEB2 对 Ednrb 进行调节已发表: January, 2017Abstract: Background & AimsMaintenance and differentiation of progenitor cells in the developing enteric nervous system (ENS) are controlled by moleculars such as the signaling protein endothelin 3 (EDN3), its receptor (the endothelin receptor type B……阅读更多»记忆 T 细胞的快速回忆能力编码在它们的表观基因组中发布时间:2017 年 1 月摘要:尽管 T 细胞受体 (TCR) 刺激和协同刺激足以激活 both naïve 和记忆 T 细胞,记忆细胞能够比 na&i 更快地产生谱系特异性细胞因子……阅读更多»来自小鼠胚胎干细胞和大脑的 poly(A) RNA 中不同的 5-甲基胞嘧啶谱发表时间:一月, 2017 年摘要:背景 最近的工作确定并绘制了 mRNA 中的一系列转录后修饰,包括腺嘌呤中 N6 和 N1 位置的甲基化、假尿苷化和胞嘧啶中碳 5 (m5C) 的甲基化。然而,knowl...阅读更多»HMCan-diff:一种检测具有不同遗传特征的细胞中组蛋白修饰变化的方法发布时间:2017 年 1 月摘要:比较癌症和正常状态或不同肿瘤样本之间的组蛋白修饰谱,可以提供深入了解癌症的发生、进展和对治疗的反应。癌症的 ChIP-seq 组蛋白修饰数据……阅读更多 »H 的高分辨率甲基化分析oxA5在发育过程中实验室小鼠不同体细胞组织中的调控区域发表时间:2017年1月摘要:同源框基因编码一组DNA结合调控蛋白,其关键功能发生在胚胎发育和分化过程中基因组的时空组织。这些 Hox 基因在个体发生过程中的作用使其成为……阅读更多»拟南芥 SWI/SNF 染色质重塑复合物结合启动子和终止子以调节基因表达发表时间:2016 年 12 月摘要:ATP 依赖性染色质重塑复合物是基因表达的重要调节因子在真核生物中。在植物中,SWI/SNF 型复合物已被证明对关键发育过程、生长和应激反应的转录控制至关重要……阅读更多 »组蛋白 H3 K27M 和 BRAF V600E 突变在儿科中线 I 级神经胶质瘤中的共同发生发表于:12 月, 2016 摘要:神经节胶质瘤 (GG) 是一种以 al 为特征的 I 级肿瘤MAPK 通路中的突变,包括 BRAF V600E 突变。最近,具有 H3 K27M 突变的弥漫性中线胶质瘤作为新的 IV 级实体被添加到 WHO 2016 分类中。作为...阅读更多 »表观遗传应激反应通​​过 Hoxa9 发育信号诱导肌肉干细胞衰老发表时间:2016 年 12 月摘要:干细胞的功能在衰老过程中下降,这种下降导致组织再生和功能中与衰老相关的损伤。发育途径的改变与干细胞功能的下降有关……阅读更多»一氧化氮通过抑制组蛋白脱乙酰酶调节应激基因的组蛋白乙酰化发表时间:2016 年 12 月摘要:组蛋白乙酰化,这是调节基因表达的重要机制, 由组蛋白乙酰转移酶 (HAT) 和组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 的相反作用控制。在动物中,一些 HDACs 受...阅读更多 »Glutaminolysis 和富马酸盐积累在受训免疫中整合免疫代谢和表观遗传程序发布时间:2016 年 12 月摘要:受训免疫(先天免疫记忆)的诱导由免疫和代谢途径的激活介导,从而导致细胞功能程序的表观遗传重新布线。通过转录组学和代谢组学的网络级整合……阅读更多»FOXA1 通过甲基转移酶 MLL3 的招募在增强子处引导 H3K4 单甲基化发表时间:2016 年 12 月摘要:FOXA1 是一个先驱因子,它与富含 H3K4 单核和增强子的增强子区域结合二甲基化(H3K4me1 和 H3K4me2)。我们对 ERα-po 中的内源性蛋白质 (RIME) 屏幕进行了 FOXA1 快速免疫沉淀质谱分析……阅读更多 »BCG 诱导的训练免疫中的免疫代谢途径发布时间:2016 年 12 月摘要:结核病疫苗卡介苗的保护作用( BCG)对无关感染s 被认为是由长期代谢变化和染色质重塑介导的,通过先天免疫细胞中的组蛋白修饰,例如……阅读更多 »转录因子脉冲可以为可遗传的转录记忆启动染色质发表时间:2016 年 12 月摘要:短期和长期术语转录记忆是这样一种现象,即基因诱导的动力学或强度在前一个诱导期后得到增强。短期记忆在一代细胞或有丝分裂后细胞中持续存在,w...阅读更多»BET bromodomains 的强效和选择性二价抑制剂发布时间:2016 年 12 月摘要:bromodomain 和 extraterminal (BET) 家族的蛋白质,特别是 bromodomain含有蛋白质 4 (BRD4) 的蛋白质作为生物学靶标非常受关注。 BET 蛋白包含两个独立的 bromodomains,现有的抑制剂与它们结合 mo...阅读更多»Lhx2 与 NuRD 复合体相互作用并调节皮质神经元亚型决定因素Fezf2 和 Sox11 发布时间:2016 年 12 月摘要:在发育中的大脑皮层中,顺序转录程序将神经上皮细胞从增殖的祖细胞转变为具有独特分子特性的分化神经元。 p 染色质中发生的调节变化...阅读更多»ING1 通过改变核仁染色质结构和 mTOR 定位来调节 rRNA 水平发布时间:2016 年 11 月摘要:核仁中的表观遗传、转录和信号传导过程调节 rRNA 转录和细胞生长。我们在此报告肿瘤抑制因子 ING1b 结合 rDNA,调节 rDNA 染色质修饰并影响核仁定位 ...阅读更多»Jarid2 结合单泛素化 H2A 赖氨酸 119 以介导 Polycomb 复合物 PRC1 和 PRC2 之间的串扰发布时间:2016 年 11 月摘要:Polycomb 镇压PRC1 和 PRC2 复合物在多细胞生物的发育基因调控中起着核心作用。 PRC1 和 PRC2 修改y 染色质通过催化组蛋白 H2A 赖氨酸 119 泛素化 (H2AK119u1) 和 H3 赖氨酸 27 甲基...阅读更多 »从 Geminin 和 Zic1 的全基因组染色质关联获取神经细胞命运的基因调控网络发表时间:2016 年 11 月摘要:神经细胞命运获得由新生神经外胚层中表达的转录因子介导,包括 Geminin 和 Zic 转录因子家族的成员。然而,发生这种情况的监管网络并未明确定义……阅读更多 »小鼠胚胎干细胞中逆转录转座因子的 TET 依赖性调节发布时间:2016 年 11 月摘要:背景:十一易位 (TET) 酶氧化 DNA 甲基化作为一部分一个活跃的去甲基化途径。尽管对 TET 在基因组调控中的作用进行了广泛的研究,但人们对它们对转座因子的影响知之甚少……阅读更多 »人​​类免疫细胞表观遗传和转录变异的遗传驱动因素 P发表时间:2016 年 11 月摘要:表征遗传和表观遗传因素对疾病表型的多方面贡献是人类遗传学和医学领域的一项重大挑战。我们在 thr 中进行了高分辨率遗传、表观遗传和转录组学分析……阅读更多»β-葡聚糖逆转 LPS 诱导的免疫耐受的表观遗传状态发布时间:2016 年 11 月摘要:先天免疫记忆是先天免疫细胞等的现象因为单核细胞或巨噬细胞在接触脂多糖 (LPS) 等微生物成分后会进行功能重编程。我们应用集成的表观基因组图...阅读更多 »EPOP 在多能干细胞中将 Elongin 和 Polycomb 功能联系起来发布时间:2016 年 11 月摘要:多能干细胞的细胞可塑性被认为是由显示活性和抑制染色质特性的基因组区域维持的。这些区域表现出低水平的基因表达,但机制ms 控制这些……阅读更多 »造血转录因子 RUNX1 和 ERG 预防 AML1-ETO 致癌基因过度表达和 t(8;21) AML 中细胞凋亡程序的启动发布时间:2016 年 11 月摘要:t(8;21) 急性髓系白血病 (AML) 相关癌蛋白 AML1-ETO 破坏正常的造血分化。在这里,我们研究了它对 t(8,21) 患者细胞中转录组和表观基因组的影响。发现 AML1-ETO 结合 ...阅读更多 »阅读器域特异性和赖氨酸脱甲基酶 4 家族功能发布时间:2016 年 11 月摘要:KDM4 组蛋白脱甲基酶是与发育、精子发生和肿瘤发生相关的保守表观遗传调节因子。然而,KDM4 家族如何靶向特定染色质区域在很大程度上是未知的。在这里,一个广泛的组蛋白肽 micr...阅读更多»通过改进 gRNA、Cas9 核酸酶和供体 DNA 的设计和交付来增强 CRISPR/Cas9 介导的精确基因组编辑发布时间:11 月 20 日16 摘要:虽然在哺乳动物细胞中基于 CRISPR 的基因敲除已被证明非常有效,但通过细胞同源定向修复 (HDR) 途径精确插入遗传元件仍然是无缝基因组编辑的限速步骤。在 ...阅读更多 »TET2 结合雄激素受体,损失与前列腺癌有关发布时间:2016 年 11 月摘要:与前列腺癌 (PCa) 相关的遗传改变可以通过对转移性肿瘤基因组进行测序来识别此致死阶段的分子标记的疾病。以前,我们描述了转移性肿瘤的体细胞改变......阅读更多 »果蝇胚胎的染色质制备和染色质免疫沉淀发布时间:2016 年 11 月摘要:该协议提供了有关如何从果蝇胚胎进行染色质免疫沉淀 (ChIP) 的具体细节。 ChIP 允许将蛋白质或组蛋白修饰与特定基因组区域相匹配。甲醛交联剂s-linked chromatin ...阅读更多 »迭代片段化提高了对非活性组蛋白标记的 ChIP-seq 峰的检测发布时间:2016 年 10 月摘要:随着染色质免疫沉淀 (ChIP) 测序正成为研究染色质修饰的主要技术,新的协议浮出水面改进方法。生物信息学对于分析和理解结果也是必不可少的,并且 pr...阅读更多»8q24.21 肾癌易感位点的遗传变异影响 HIF 与 MYC 增强子的结合发表时间:2016 年 10 月摘要:透明细胞肾细胞癌 (ccRCC)其特征是 von Hippel-Lindau 肿瘤抑制因子 (VHL) 的功能丧失和缺氧诱导转录因子 (HIF) 的无限制激活。遗传和表观遗传决定因素有...阅读更多»慢性压力导致小鼠扣带皮层中神经肽-Y 和大麻素 CB1 受体基因的表观遗传失调发布时间:2016 年 10 月摘要行为:持续的压力会触发多种机制,最终可能导致与焦虑和抑郁相关的疾病的发生。表观遗传修饰代表了慢性压力介导长期影响的一种机制。在这里,……阅读更多 »PHD 指蛋白 Phf5a 对多能性和细胞分化的转录延伸的调节发布时间:2016 年 10 月摘要:多能胚胎干细胞 (ESC) 自我更新或分化为发育中的胚胎和细胞的所有组织-特异性因子是平衡基因表达所必需的。在这里,我们描述了 PHD-finger 蛋白 5a(Phf...阅读更多»新生儿单核细胞表现出独特的组蛋白修饰景观发表时间:2016 年 9 月摘要:背景新生儿抑制了促炎细胞因子的表达并难以清除病原体。这使得它们对感染特别敏感,但调节新生儿特异性免疫的因素反应很难理解……阅读更多 »BRD4 定位到谱系特异性增强子与独特的转录因子库相关发布时间:2016 年 9 月摘要:基因表达的适当时间表观遗传调控对于细胞命运决定和组织发育至关重要。 Bromodomain-containing Protein-4 (BRD4) 之前被证明可以控制定义的基因子集的转录……阅读更多 »PRC1 蛋白的协调重新部署抑制果蝇发育过程中的肿瘤形成发表时间:2016 年 9 月摘要:Polycomb 组蛋白形成两个主要复合物 PRC2 和 PRC1,它们通常共同调节其靶基因。在这里,我们显示 PRC1 组件作为肿瘤抑制因子独立于 PRC2 功能。通过绘制 PRC 的分布图……阅读更多 »组蛋白去甲基化酶 Fbxl10 的过度表达导致小鼠胚胎成纤维细胞迁移增强。发布时间:2016 年 9 月Abstract:细胞迁移是多细胞生物发育和维持的核心过程。胚胎发育过程中的组织形成、伤口愈合、免疫反应和侵袭性肿瘤都需要细胞的协调运动……阅读更多 »非洲爪蟾胚胎中转座子的异色组蛋白修饰发表时间:2016 年 9 月摘要:转座元件是寄生基因组元件,可以对宿主基因功能和基因组完整性有害。异色组蛋白修饰参与转座子的抑制。然而,这些喜...阅读更多 »组蛋白修饰 H3K4me3 在哺乳动物早期发育中的等位基因重编程发布时间:2016 年 9 月摘要:组蛋白修饰是控制许多关键细胞过程的基本表观遗传调节因子 1。然而,这些标记能否从哺乳动物的配子传给下一代,是一个长期存在的问题仍然未解决的问题……阅读更多 »使用邻近连接测定法检测蛋白质-蛋白质相互作用和翻译后修饰:在 SUMO 途径研究中的应用。发表时间:2016 年 9 月摘要:通过成像技术检测蛋白质-蛋白质相互作用通常需要过度表达用荧光分子标记的感兴趣的蛋白质,这会影响它们的生物学特性,随后,在……中进行缺陷实验阅读更多»富马酸盐是一种表观遗传修饰剂,可引发上皮-间充质转化发布时间:2016 年 8 月摘要:三羧酸循环酶富马酸水合酶的突变导致遗传性平滑肌瘤病和肾细胞癌 1。富马酸水合酶缺陷型肾癌具有高度侵袭性和转移性,即使在很小的时候也会转移,导致非常差的 cl...阅读更多»非编码体细胞和遗传性单核苷酸变异会聚以促进 ESR1 在乳腺中的表达cer 发布时间:2016 年 8 月摘要:雌激素受体-α (ESR1) 的持续表达导致三分之二的乳腺癌并定义了 ESR1 阳性亚型。 ESR1 在雌激素刺激下参与增强子以建立致癌表达程序 1。体细胞拷贝数...阅读更多 »通过营养状况和膳食碳水化合物对葡萄糖不耐受虹鳟鱼 (Oncorhynchus mykiss) 的肝脏表观遗传景观进行重塑。发布时间:2016 年 8 月摘要:虹鳟鱼是一种肉食性鱼类,显示\"葡萄糖” - 当喂食高碳水化合物饮食 (HighCHO) 时,持续的高血糖显示出不耐受的表型。表观遗传学是指基因活动的可遗传变化,并且与……阅读更多»H3.3 划定富含 GC 的编码和亚端粒区域,并作为恶性疟原虫毒力基因表达的潜在记忆标记发布时间:2016 年 8 月摘要:组蛋白,通过包装并将 DNA 组织成染色质,se作为真核生命的基本组成部分。染色质的基本结构由四种典型组蛋白(H2A、H2B、H3 和 H4)建立,而组蛋白变体是……阅读更多»间变性神经节胶质瘤的临床、影像学、组织病理学和分子特征发表时间:2016 年 8 月摘要:间变性神经胶质瘤(AGG) 是一种罕见的恶性神经节胶质瘤变体。根据世界卫生组织2016年版分类,其组织病理学分级标准仍不明确。本研究的目的是……阅读更多 »开发具有多西环素依赖性 gRNA 表达的病毒介导的 CRISPR/Cas9 系统,用于诱导性体外和体内基因组编辑。发布时间:2016 年 8 月摘要:RNA 引导的 Cas9 核酸酶,来自 II 型原核成簇规则散布短回文重复序列 (CRISPR) 适应性免疫系统,已被科学家改编并用于编辑 euk 的基因组无核细胞。在这里,我们重新……阅读更多 »reChIP-seq 揭示了 CD4(+) 记忆 T 细胞中 H3K4me3 和 H3K27me3 的广泛二价性发表时间:2016 年 8 月摘要:共定位染色质修饰和调节剂的组合作用决定染色质结构和功能。然而,以高通量方式识别共定位染色质特征仍然是一项技术挑战。在这里,我们 ...阅读更多 »HDAC1 以依赖于经验的方式负向调节小清蛋白中间神经元成熟所需的 Bdnf 和 Pvalb 发布时间:2016 年 8 月摘要:在出生后早期发育过程中,神经回路由外部环境提供的感官体验塑造。这种依赖于经验的电路发展调节巩固了兴奋性抑制 (E/I) ne 的平衡……阅读更多»抗 RAINBOW 染料特异性抗体作为通用工具在蛋白质印迹和蛋白质印迹中可视化预染蛋白质分子量标记分析发表时间:2016 年 8 月摘要:Western blotting 是分子生物学和生物化学中使用最广泛的技术之一。预染蛋白质用作蛋白质电泳中的分子量标准。然而,在化学发光蛋白质印迹分析中,这些……阅读更多»表型可塑性通过黑腹果蝇进化热点基因 tan 的转录调控发表:2016 年 8 月摘要:表型可塑性是给定基因型产生不同表型响应的能力到不同的环境条件。表型可塑性可以是适应性的。此外,它被认为可以促进进化。尽管表型...阅读更多 »通过细胞融合介导的多能重编程对染色质进行有序改变和人类 X 染色体重新激活发布时间:2016 年 8 月摘要:将体细胞转化为多能性需要擦除表观遗传记忆。重新激活失活的 X 染色体(Xi) 已被用于模拟小鼠的表观遗传重编程,但人类研究受到 Xi 表观遗传学 instab 的阻碍……阅读更多 »MEF2C 在应激造血过程中保护骨髓 B 淋巴祖细胞发表时间:2016 年 8 月摘要:DNA 双链断裂 (DSB) ) 修复对于 B 细胞受体的产生至关重要,而 B 细胞受体是 B 细胞祖细胞存活的先决条件。然而,促进 B 细胞 DSB 修复的转录因子尚不清楚。我们在这里展示 MEF...阅读更多 »Toxoplasma gondii TgIST 共同选择宿主染色质阻遏物抑制 STAT1 依赖性基因调控和 IFN-γ 介导的宿主防御发布时间:2016 年 8 月摘要:弓形虫感染的早期标志是快速控制通过强大的多方面先天免疫反应对寄生虫种群进行控制,该免疫反应涉及驻留和归巢免疫细胞以及促炎和抗炎细胞因子。在 t...阅读更多 »cohesin 复杂组件 STAG2 或 STAG3 con 的丢失黑色素瘤对 BRAF 抑制产生抗性 发表时间:2016 年 8 月摘要:蛋白激酶 B-Raf 原癌基因丝氨酸/苏氨酸激酶 (BRAF) 是黑色素瘤的致癌驱动因素和治疗靶点。 BRAF (BRAFi) 抑制剂在患有黑色素瘤的黑色素瘤患者中显示出高反应率和延长的生存期……阅读更多 »促氧化白藜芦醇对氧化还原环境的激素转变保护细胞免受压力发表时间:2016 年 8 月摘要:白藜芦醇获得了巨大的收益由于多项报告的健康有益影响而引起关注。然而,白藜芦醇的潜在关键作用机制仍然存在很大争议。在这里,我们证明在生理相关的情况下……阅读更多»增强剂退役由 Snail1 诱导的 TCF7L2 竞争性置换和转录激活因子的下调导致 EPHB2 沉默发表时间:2016 年 8 月摘要:转录沉默是失活的主要原因转或抑制基因,然而,其潜在机制知之甚少。 EPHB2 基因编码一种受体酪氨酸激酶,它控制上皮细胞迁移和...阅读更多»正常基质通过 JMJD1a 介导的转录的机械敏感调节抑制癌细胞增殖发表时间:2016 年 8 月摘要:组织稳态依赖于特定细胞的受控定位类型和细胞外基质的正确组成。虽然癌症间质在肿瘤进展中的作用已得到很好的表征,但具体的续...阅读更多»缺乏 RNA 结合蛋白 ZFP106 的小鼠严重肌肉萎缩和去神经支配发布时间:2016 年 8 月摘要:运动神经元对骨骼肌的神经支配通过神经肌肉接头发生,神经肌肉接头是正常肌肉生长和功能所必需的胆碱能突触。神经肌肉信号缺陷会导致各种神经肌肉疾病,并伴有……阅读更多»作用CREB ​​对肾上腺细胞中血红素加氧酶 1 诱导的影响:PI3K 通路的参与发表时间:2016 年 8 月摘要:除了 ACTH 作为肾上腺类固醇生成的主要调节因子这一众所周知的功能外,我们之前已经证明了它对转录刺激的影响HO-1 表达,细胞抗氧化防御系统的一个组成部分...阅读更多»单核细胞到巨噬细胞分化的表观遗传动力学发表时间:2016 年 7 月摘要:背景:单核细胞到巨噬细胞的分化涉及主要的生化和结构变化。为了阐明基因调控变化在此过程中的作用,我们使用高通量测序来分析完整的转录……阅读更多»ICF 综合征中的会聚疾病基因:ZBTB24 控制哺乳动物 CDCA7 的表达发表时间:2016 年 7 月摘要: 对于遗传异质性疾病,更好地了解潜在基因缺陷如何在功能上相互关联对剖析疾病病因很重要。免疫缺陷、着丝粒不稳定性、面部异常(IC...阅读更多 »Dnmt3a 和 Dnmt3b 与增强剂联合调节人类表皮干细胞稳态发布时间:2016 年 7 月摘要:成体干细胞中内源性 Dnmt3a 和 Dnmt3b 的全基因组定位和功能未知。在这里,我们表明在人表皮干细胞中,这两种蛋白质以组蛋白 H3K36me3 依赖性方式结合到最活跃的增强子 ...阅读更多 »Osr1 与 Wt1 协同作用以调节肾脏器官发生发表时间:2016 年 7 月摘要:肾发育不全是儿科肾功能衰竭和几种成人发病疾病的常见原因。最近的研究将 OSR1 基因的变体与杂合子中新生儿肾脏大小和功能的减少以及新生儿致死率相关联......阅读更多 »H3K4 乙酰化,乳腺肿瘤分子亚型中的 H3K9 乙酰化和 H3K27 甲基化发表时间:20 年 7 月16 摘要:目的:在这里,我们研究了 St Gallen 乳腺分子亚型如何显示不同的组蛋白 H3 谱。患者和方法:192 例乳腺肿瘤分为五种 St Gallen 分子亚型(luminal A、luminal B HER2-、luminal B HER...阅读更多 »DNA 甲基化组和转录组的联合分析揭示了对牛金黄色葡萄球菌亚临床乳腺炎易感性的新候选基因发布时间:2016 年 7 月摘要:亚临床乳腺炎是泌乳牛广泛传播的疾病。其主要病原体是金黄色葡萄球菌 (S. aureus)。在这项研究中,我们对 DNA 甲基化和转录表达进行了全基因组综合分析,以确定……阅读更多 »5-羟甲基胞嘧啶标记成年和发育中的脊椎动物中枢神经系统有丝分裂后神经细胞发表时间:2016 年 7 月摘要:表观遗传标记 5 -羟甲基胞嘧啶 (5hmC) 是一种胞嘧啶修饰,在大脑中枢神经系统中含量丰富mmals,它是由 TET 酶氧化 5-甲基胞嘧啶引起的。建议这样的标记在...中发挥关键作用阅读更多»MEIS2 是 AML1-ETO 阳性 AMLP 中的致癌伙伴发布时间:2016 年 7 月摘要:已知同源框基因是白血病发生的关键因素。尽管 TALE 家族同源域因子 Meis1 与恶性肿瘤有关,但 MEIS2 的作用尚不清楚。在这里,我们证明 MEIS2 在患者中高水平表达 ...阅读更多 »miR-29 家族对人类体细胞重编程中 DNA 甲基化景观的调节发布时间:2016 年 7 月摘要:OCT4、SOX2 过表达后重编程为多能性、KLF4 和 MYC 伴随着全球基因组和表观基因组的变化。诱导多能干细胞 (iPSC) 中的组蛋白修饰和 DNA 甲基化状态已被证明可以...阅读更多 »丝氨酸蛋白酶 HTRA1 驱动多倍体的表观遗传沉默发布时间:2016 年 7 月摘要:背景:增加d 数和不正确定位的中心体、非整倍体或多倍体以及染色体不稳定性是癌细胞经常观察到的特征。虽然这些事件的某些方面和检查点机制……阅读更多»Sox9 和 Oct4 启动子的甲基化及其与实验室小鼠睾丸发育过程中基因表达的相关性发布时间:2016 年 7 月摘要:Sox9 和 Oct4 是涉及的两个重要调节因子在哺乳动物发育中。 Sox9 是 E Sox 转录因子家族的成员,在泌尿生殖系统的发育中起着至关重要的作用,而 Oct4 通常被称为 o...阅读更多»卵巢癌患者输卵管中的癌前 SOX2 过度表达:发现和验证研究发表时间:2016 年 7 月摘要:目前的卵巢癌筛查方法只能检测晚期疾病。事实证明,较早的检测很困难,因为天然过程中涉及的分子前体病史不详。为了识别早期驱动突变,我...阅读更多»干细胞分化过程中 Polycomb 复合体的动态相互作用组和基因组靶标发布时间:2016 年 7 月摘要:尽管 Polycomb 组 (PcG) 复合体的核心亚基已得到很好的表征,但人们对它知之甚少这些蛋白质复合物在细胞分化过程中的动力学。我们使用定量相互作用蛋白质组学和全基因组 profili...阅读更多»DZNep、NaBu 和 SAHA 在管腔和间充质样乳腺癌亚型细胞中的表观遗传修饰发表时间:2016 年 7 月摘要:背景/目的:大量研究表明乳腺癌和表观遗传机制具有非常强大的交互关系。 MCF7 细胞系,代表 luminal 亚型和 MDA-MB 231 细胞系,代表间充质-l...阅读更多 »来自南非的糖尿病和前驱糖尿病混合血统个体的全基因组 DNA 甲基化发布时间:2016 年 6 月摘要:目标。在 2 型糖尿病患者、糖尿病前期患者中进行全基因组 DNA 甲基化,并控制来自南非的混合血统个体。方法。我们使用外周血进行全基因组 DNA 甲基化和...阅读更多»慢性淋巴细胞白血病的染色质可及性图识别亚型特异性表观基因组特征和转录调控网络发布时间:2016 年 6 月摘要:慢性淋巴细胞白血病 (CLL) 的特点是大量临床异质性,尽管基因改变相对较少。为研究 CLL 中的表观基因组失调提供基础,我们在此展示全基因组染色质可及性……阅读更多 »帕金森氏病相关基因α-突触核蛋白的表达受神经元细胞命运决定因子 TRIM32 的调控发布时间:2016 年 6 月摘要: α-突触核蛋白是一种丰富的神经元蛋白,与生理过程有关像突触功能、神经发生和神经元分化,但也与病理性神经变性有关。事实上,α-突触核蛋白 (snca) ...阅读更多 »管腔雄激素受体中的分子和表观遗传生物标志物:三阴性乳腺癌亚型发表时间:2016 年 6 月摘要:阅读更多 »Dnmt2/Trdmt1 作为 RNA 聚合酶 II 转录活性在心脏中的介体Growth 发布时间:2016 年 6 月摘要:Dnmt2/Trdmt1 是一种甲基转移酶,已被证明可使 tRNA 甲基化。据报道,缺陷突变体在发育和 RNA 介导的表观遗传方面表现出各种看似无关的缺陷。在这里,我们报告了一种独特的作用……阅读更多»热休克通过 TIF-IA 失活和 lncRNA 依赖性核小体定位变化来抑制 rRNA 合成发表时间:2016 年 6 月摘要:次优生长环境中核糖体生物合成的减弱对于细胞生长至关重要稳态和遗传完整性。在这里,我们表明rRNA 合成因温度升高而关闭是由 t...阅读更多 »作为人类癌症中 DNA 甲基化反馈回路的 CpG 去甲基化酶 TET1 的表观遗传失活发表于:2016 年 5 月摘要:启动子 CpG 甲基化是一个基本的监管基因表达的过程。 TET 蛋白是活性 CpG 去甲基化酶,可将 5-甲基胞嘧啶转化为 5-羟甲基胞嘧啶,失去 5 hmC 作为癌症的表观遗传标志,指示……阅读更多 »PHF13 是 H3K4me2/3 的分子阅读器和转录共调节剂发布时间:5 月, 2016 摘要:PHF13 是一种染色质附属蛋白,在分化、细胞分裂、DNA 损伤反应和更高的染色质顺序中具有功能性作用。为了深入了解 PHF13 调节这些过程的能力,我们阐明了目标机制……阅读更多 »通用 NF-κB 基序和亚型特异性 Sp1III 元件之间的功能不相容驱动了 foHIV-1 亚型 C 病毒启动子的 rmation 发表时间:2016 年 5 月摘要:在 HIV-1、HIV-2 和 SIV 的各种遗传亚型中,仅在 HIV-1 的 C 亚型中,发现了一个遗传变异的 NF-κB 结合位点病毒启动子的核心与亚型特异性 Sp1III 基序相关。亚型屁股如何...阅读更多 »mTOR 转录和转录后调节 Npm1 基因表达,以促进 Pten 失活细胞的增殖 发表时间:2016 年 5 月摘要:哺乳动物雷帕霉素靶标 (mTOR) 在调节中起着重要作用在正常和病理生长条件下与生长相关的过程,如蛋白质合成、细胞大小和新陈代谢。 mTOR 的这些功能是你……阅读更多»研究资源:急性 E2 治疗后小鼠肝脏基因表达和雌激素受体 cistrome 的变化。发表时间:2016 年 5 月摘要:雌激素受体 α (ER) ha 的转录调控s 主要在乳腺癌细胞系中进行了研究,但雌激素如 17β-雌二醇 (E2) 发挥了许多额外的生殖作用,特别是在 E2 e 的肝脏中……阅读更多 »miR-290-295 家族的 MicroRNAs 保持双价小鼠胚胎干细胞发表时间:2016 年 5 月摘要:小鼠胚胎干细胞 (ESC) 中的许多发育调节基因都具有活性 (H3K4me3) 和多梳组 (PcG) 介导的抑制性 (H3K27me3) 组蛋白修饰。这种二价状态被认为对 tr 很重要……阅读更多 »PKC 介导的 BCL11B 丝氨酸 2 磷酸化在 CD4+ T 细胞激活过程中负调节其与 NuRD 复合物的相互作用发表时间:2016 年 5 月摘要:转录因子 BCL11B/CTIP2 是一种涉及 T 细胞发育、功能和存活各个方面的主要调节蛋白。 MAPK 介导的磷酸化和 SUMOylation 调节 BCL11B 转录活性,切换 i...Re更多»EZH2 在肾上腺皮质癌中过度表达,并与疾病进展相关。发表时间:2016 年 5 月摘要:肾上腺皮质癌 (ACC) 是一种侵袭性肿瘤,预后不良。患者的常见改变包括组成型 WNT/β-连环蛋白信号传导和生长因子 IGF2 的过度表达。然而,这两种改变的结合……阅读更多»Kaiso 介导人类 ICR1 甲基化维持和 H19 转录精细调节发布时间:2016 年 5 月摘要:背景基因组印记在有袋动物和真兽类哺乳动物的共同祖先中进化,并确保发育重要基因的转录来自定义的亲本等位基因。印记基因的调节通常由 b...阅读更多 »胎儿酒精暴露后成年小鼠海马自由基清除网络中基因表达、DNA 甲基化和组蛋白甲基化的改变发表时间:2016 年 5 月摘要:分子 ba对胎儿酒精谱系障碍 (FASD) 的研究知之甚少;然而,表观遗传和基因表达的变化也有牵连。我们开发了一种以学习和记忆障碍为特征的 FASD 小鼠模型......阅读更多»PAFAH1B1 和 lncRNA NONHSAT073641 在人内皮细胞中维持血管生成表型发表时间:2016 年 4 月摘要:目的:血小板活化因子乙酰水解酶 1B1(PAFAH1B1 ,也称为 Lis1) 是一种主要参与神经发生的蛋白质,主要在神经系统中进行研究。当我们观察到 PAFAH1B1 在血管系统中的显着表达时...阅读更多»NR3C1 的三种新型杂合点突变导致糖皮质激素耐药性发表时间:2016 年 4 月摘要:普遍的糖皮质激素耐药性与糖皮质激素受体 (GR, NR3C1) 突变有关。在出现肾上腺意外的患者中发现了三种新的杂合错义 NR3C1 突变(R477S、Y478C 和 L672P)lomas, ...阅读更多 »来自固定临床组织的染色质免疫沉淀揭示了肿瘤特异性增强子概况。发表时间:2016 年 4 月摘要:在临床病理标本的常规组织固定过程中引入的广泛交联严重阻碍了染色质免疫沉淀,随后进行了下一代测序(ChIP-seq) 对存档组织样本的分析。这限制了 t...阅读更多 »拟南芥胚乳中 PRC2 介导的组蛋白修饰的亲本表观遗传不对称性发布时间:2016 年 4 月摘要:胚乳中的亲本基因组以差异 DNA 甲基化为标志,因此在表观遗传学上是不同的。这种表观遗传不对称性在配子中建立,并在受精后通过未知机制维持。在这份手稿中……阅读更多 »EZH2 通过抑制 p21 调节神经上皮结构和成神经细胞增殖发布时间:2016 年 4 月摘要:EZH2 作为转录抑制因子的功能很好特征化。然而,它在脊椎动物发育过程中的作用仍然知之甚少,特别是在神经发生中。在这里,我们揭示了 EZH2 在控制 th 的完整性中的作用……阅读更多»MPA 处理后的活性和抑制染色质相关蛋白质组以及中期因子在上皮单层渗透性中的作用发表时间:2016 年 4 月摘要:麦考酚酸 (MPA) 是规定用于维持器官移植患者的同种异体移植物。然而,胃肠道 (GI) 并发症,尤其是腹泻,经常被视为 MPA 治疗后的副作用。我们最近报道了……阅读更多 »使用 AGO-CLIP-seq 对人类巨细胞病毒感染期间的时间 miRNA 靶点进行基于 ACE 评分的分析 发表时间:2016 年 4 月摘要:尽管已知感染过程中基因表达的时间调控是对于确定宿主-病毒相互作用的结果至关重要,在生产性病毒感染 h...阅读更多 »半胱天冬酶 7 的过度表达依赖于 ERα,通过靶向 p21(Cip)影响乳腺癌细胞的增殖和细胞生长发表时间:2016 年 4 月摘要:半胱天冬酶 7 (CASP7) 表达在细胞过程中具有重要作用某些癌细胞的周期进程和细胞生长,也参与牙齿组织的发育和分化。然而,CASP7 在乳腺癌中的功能……阅读更多 »CHO 细胞的综合基因组和表观基因组表征,以响应进化压力和随时间推移发布时间:2016 年 4 月摘要:CHO 细胞最显着的特征是它们的适应性,这使得高效蛋白质的产生以及在各种培养条件下的生长,但也会导致基因组和表型不稳定。调查……阅读更多 »3/16 环境污染湖泊鳄鱼的表观遗传编程改变。发布时间:4 月il, 2016 摘要:之前对佛罗里达州湖泊中鳄鱼的生殖健康进行的研究表明,各种发育和健康影响可归因于环境质量和环境污染物暴露的结合。 ...阅读更多 »BRCA1 通过靶向乳腺癌中的 EZH2 来限制 FOXO3 基因甲基化和表观遗传沉默,从而正向调节 FOXO3 表达:2016 年 4 月摘要:BRCA1 突变或耗竭与乳腺癌的基底样表型和不良预后相关,但根本原因仍然难以捉摸。一组乳腺癌细胞系的 RNA 和蛋白质分析显示 BRCA1 缺陷与……阅读更多 »硫酸乙酰肝素磺基转移酶 3-OST3A (HS3ST3A) 是一种新型肿瘤调节剂和乳腺癌预后标志物发布时间:2016 年 4 月摘要: 硫酸乙酰肝素 (HS) 蛋白多糖链是乳腺肿瘤微环境的关键成分,对影响癌细胞的行为。已证实 HS 的异常合成和加工在肿瘤中起着重要作用……阅读更多»曼氏血吸虫外突变的频率和有丝分裂遗传性发表时间:2016 年 4 月摘要:曼氏血吸虫是一种寄生性扁形动物,可导致肠道血吸虫病。它有一个复杂的生命周期,先感染 Biomphalaria 属的淡水蜗牛,然后再感染哺乳动物宿主。曼氏血吸虫迅速适应新的(allop...阅读更多 »PIAS1 结合 p300 并作为转录因子 c-Myb 的共激活因子或辅助抑制因子,依赖于 SUMO 状态发布时间:2016 年 3 月摘要:PIAS 蛋白(激活 STAT 的蛋白质抑制剂) constitute a family of multifunctional nuclear proteins operating as SUMO E3 ligases and being involved in multiple of interactions. They participate in a range of biological processes, a...阅读更多 »GATA-1 通过 DNA 和组蛋白抑制 PU.1 基因H3K9 甲酯Its Distal Enhancer in Erythroleukemia 发表时间:2016 年 3 月摘要:GATA-1 和 PU.1 是两个重要的造血转录因子,它们在祖细胞中相互抑制,分别引导进入红系或髓系。 PU.1 在骨髓细胞生成过程中控制其自身的表达 ...阅读更多 »序列特征准确预测体内全基因组 MeCP2 结合发布时间:2016 年 3 月摘要:甲基 CpG 结合蛋白 2 (MeCP2) 对于大脑的正常发育至关重要,并在接近- 神经元中的组蛋白水平,但其基因组定位的机制仍然知之甚少。使用高分辨率的 MeCP2 结合数据,我们 sh...阅读更多»Zbtb20 在新皮质发育过程中促进星形细胞生成发布时间:2016 年 3 月摘要:多能神经前体细胞 (NPC) 在哺乳动物新皮质发育的后期产生星形胶质细胞。许多调节星形细胞生成的信号通路直接诱导 eGFAP 的表达,一种终末分化的标记……阅读更多 »位点特异性 DNA 甲基化和羟甲基化之间的动态相互作用调节前列腺癌发生中不同的生物学途径发表时间:2016 年 3 月摘要:背景尽管前列腺癌组织中 DNA 羟甲基化标记在全球范围内显着丢失, 羟甲基化在前列腺肿瘤发生中的位点特异性作用尚不清楚。我们描述了羟甲基化和甲基化 m...阅读更多 »Annexin 基因的作用及其在斑马鱼尾鳍再生过程中的调控发布时间:2016 年 3 月摘要:由于其在哺乳动物中的复杂性和局限性,epimorphic 再生的分子机制难以捉摸。表观遗传调控机制在发育和再生中起着至关重要的作用。这项调查试图揭示......阅读更多»二酰甘油激酶α的表观遗传调控促进辐射诱导的纤维化发表于:三月,2016 年摘要:放射疗法是癌症治疗的基本组成部分,但其使用受到正常组织中晚期不良反应(尤其是辐射诱发的纤维化)发作的限制。由于纤维化的分子原因在很大程度上是未知的,我们分析...阅读更多»TET1–TDG–BER 依赖性活性 DNA 去甲基化的生化重建揭示了一种高度协调的机制发表时间:2016 年 3 月摘要:CpG 二核苷酸中的胞嘧啶甲基化是一种表观遗传 DNA由 DNA 甲基转移酶和去甲基化酶动态建立和维持的修饰。活性 DNA 去甲基化的分子机制最近才开始浮出水面……阅读更多»microRNA-365-3p 的羟甲基化通过 Kcnh2 调节伤害性行为发表时间:2016 年 3 月摘要:十-十一易位甲基胞嘧啶催化的 DNA 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC)双加氧酶 (TET) 大量存在于哺乳动物的神经元中。然而,TET 之间的体内因果关系失调和痛觉调制尚未……阅读更多 »ArrayNinja:用于统一规划和分析微阵列实验的开源平台发布时间:2016 年 3 月摘要:基于微阵列的蛋白质组学平台已成为研究蛋白质功能各个方面的宝贵工具,特别是在染色质生物化学领域。微阵列技术本身在可打印方面基本上不受限制……阅读更多»TET1-TDG-BER 依赖性活性 DNA 去甲基化的生化重组揭示了一种高度协调的机制发表时间:2016 年 3 月摘要:CpG 二核苷酸中的胞嘧啶甲基化是动态的表观遗传 DNA 修饰由 DNA 甲基转移酶和去甲基化酶建立和维持。活性 DNA 去甲基化的分子机制最近才开始浮出水面……阅读更多»KMT2D 通过组蛋白 H3 赖氨酸 4 二甲基化调节心脏发育的特定程序发布时间:2016 年 3 月 Ab摘要:编码组蛋白 H3K4 甲基转移酶的 KMT2D 与歌舞伎综合征背景下的人类先天性心脏病有关。然而,其在心脏发育中的作用尚不清楚。在这里,我们展示了对 KMT2D 的要求 ...阅读更多 »BPA 诱导的表观遗传模式失调:对雌性斑马鱼繁殖的影响发布时间:2016 年 2 月摘要:双酚 A (BPA) 是全球最常见的内分泌干扰物化合物之一。它可能通过诱导表观遗传机制的放松管制来干扰脊椎动物的繁殖。确定其对雌性生殖生理学的影响...阅读更多»小型猪乳牙胚发育的全基因组 DNA 甲基化谱发表时间:2016 年 2 月摘要:背景:DNA 甲基化是一种重要的表观遗传修饰,对基因表达的调控至关重要在开发过程中。迄今为止,关于 DNA 甲基化在牙齿发育中的作用知之甚少。t 在大型动物模型中。因此,...阅读更多 »哺乳动物内源性逆转录病毒的甲基化 DNA 免疫沉淀分析。发布时间:2016 年 2 月摘要:内源性逆转录病毒是哺乳动物基因组中大量发现的重复序列,能够调节宿主基因表达。尽管如此,大多数内源性逆转录病毒拷贝都受到组蛋白抑制的严格表观遗传控制……阅读更多»GRHL2-miR-200-ZEB1 通过转录调节和组蛋白修饰维持卵巢癌的上皮状态发表时间:2016 年 2 月摘要:上皮-间质转化(EMT) 是一种生物学过程,通过该过程,极化的上皮细胞转化为间充质表型,与上皮性卵巢癌 (EOC) 的分子异质性有关。在这里,我们重新……阅读更多 »雌激素受体 β 通过与胸腺嘧啶 DNA 糖基化酶的相互作用调节特定基因组位点的表观遗传模式。已发表:2016 年 2 月摘要: 背景:DNA 甲基化是编码表观遗传信息的一种方式,在胚胎发育过程中调节基因表达中起着至关重要的作用。 DNA 甲基化标记由 DNA 甲基转移酶建立,最近,我...阅读更多 »表观遗传调控因子表征的化学生物学方法发表时间:2016 年 2 月摘要:化学生物学方法是功能表征表观遗传调控因子(如组蛋白修饰)的有力手段酵素。我们概述了细胞表征和使用\"化学...阅读更多»精子携带的 miRNA 和内切 siRNA 对受精和植入前胚胎发育很重要的实验方案和最佳实践。发布时间:2016 年 2 月摘要:尽管据信哺乳动物精子在受精过程中携带小的非编码 RNA (sncRNA) 进入卵母细胞,这些精子携带的 sncRNA 是否真的有任何功能仍然未知在受精和植入前胚胎去...阅读更多»前列腺癌中的 JMJD3 组蛋白去甲基化酶和 EZH2 组蛋白甲基转移酶发布时间:2016 年 2 月摘要:前列腺癌是男性最常见的癌症。已经明确的是,组蛋白 3 赖氨酸 27 三甲基化 (H3K27me3) 的遗传和表观遗传改变是前列腺癌中的常见事件。这个标记在前列腺癌中被解除管制……阅读更多»在鸟类模型中去除蛋白与产前蛋白质营养不良相关的基因和 DNA 甲基化的差异表达发表时间:2016 年 2 月摘要:以前,对体重和生殖性能的长期影响有通过去除蛋白在产前蛋白质营养不良的鸡模型中得到证实。这种表型持续改变的引入表明稳定的 c...阅读更多 »MOZ-TIF2 癌蛋白在小鼠中的表达抑制衰老。发布时间:2016 年 2 月Abstr作用:将 MOZ(单核细胞白血病锌指蛋白)组蛋白乙酰转移酶 (HAT) 与核共激活因子 TIF2 融合的 MOZ-TIF2 易位与急性髓性白血病的发展有关。我们最近表明,在 t...阅读更多 »生长停滞和 DNA 损伤诱导的作用,Beta 在饮酒行为中的作用发布时间:2016 年 2 月摘要:背景:组蛋白乙酰化和 DNA 甲基化等表观遗传因素对在过去几年中,对饮酒行为的监管越来越受到重视。 GADD45b 是一种蛋白质,经证明可...阅读更多 »甲基化 DNA 免疫沉淀 (MeDIP) 分析方案发布时间:2016 年 2 月摘要:DNA 甲基化是通过将染色质结构修改为抑制状态或干扰基因表达沉默的基本表观遗传机制转录因子的结合。 DNA 甲基化主要发生在...阅读更多»TET 催化的基因内 5-甲基胞嘧啶氧化调节 CTCF 依赖性可变剪接。发表时间:2016 年 2 月摘要:基因内 5-甲基胞嘧啶和 CTCF 介导对 pre-mRNA 剪接的相反作用:CTCF 通过 RNA 聚合酶 II 暂停促进弱上游外显子的包含,而 5-甲基胞嘧啶逐出 CTCF,导致外显子排除。然而,mec...阅读更多 »双特异性磷酸酶 2 基因在人类癌症中高度甲基化,并受表观遗传机制调控 发表时间:2016 年 2 月摘要:双特异性磷酸酶是一类参与 MAP 负调节的肿瘤相关蛋白激酶通路。在癌症中已经报道了双特异性磷酸酶 2 (DUSP2) 的下调。表观遗传 si...阅读更多»RNA 生物化学。 RNA 羟甲基胞嘧啶的转录组分布和功能。发表时间:2016 年 1 月摘要:羟甲基胞嘧啶在 DNA 中有详细描述,也存在于核糖核酸。在这里,我们表明羟甲基胞嘧啶优先标记聚腺苷酸化 RNA,并由 Tet 沉积在果蝇中。我们绘制了转录组范围内的羟甲基化景观,...阅读更多»RNA 羟甲基胞嘧啶的转录组范围分布和功能发布时间:2016 年 1 月摘要:羟甲基胞嘧啶在 DNA 中得到了很好的描述,也存在于 RNA 中。在这里,我们表明羟甲基胞嘧啶优先标记聚腺苷酸化 RNA,并由 Tet 沉积在果蝇中。我们绘制了转录组范围内的羟甲基化景观图,...阅读更多 »用于鉴定拟南芥蛋白质-DNA 体内相互作用的染色质免疫沉淀测定发布时间:2016 年 1 月摘要:错综复杂的基因调控网络协调植物的生物过程和发育转变。基因的选择性转录激活和沉默介导植物对环境信号和发育线索的反应……阅读更多 »De novo DNA甲基化驱动小鼠受精卵中的 5hmC 积累发表时间:2016 年 1 月摘要:合子表观遗传重编程需要全基因组 DNA 去甲基化,伴随着 Tet 甲基胞嘧啶双加氧酶 3 (Tet3) 驱动的 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 氧化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC;参考文献,,,).我们在这里展示 ...阅读更多 »组蛋白去甲基化酶 JMJD2A/KDM4A 将核糖体 RNA 转录与营养物质和生长因子可用性联系起来发布时间:2016 年 1 月摘要:组蛋白赖氨酸残基甲基化和去甲基化之间的相互作用是基因表达调控的重要组成部分,并且有对阐明所涉及蛋白质的作用非常感兴趣。在这里,我们报告组蛋白 de...阅读更多 »DOT1L 活性促进增殖并保护皮层神经干细胞免受 ATF4-DDIT3 介导的体外 ER 应激的激活发布时间:2016 年 1 月摘要:越来越多的证据表明赖氨酸甲基转移酶 DOT1L/KMT4 在发育和疾病中的干细胞增殖、存活和分化中具有重要作用。我们研究了 DOT1L 在神经干细胞中的功能(NSC……阅读更多 »导致 Chrousos 综合征的 hGRαT556I 的功能特征发表时间:2016 年 1 月摘要:背景:Chrousos 综合征是一种罕见的病理状况,其特征是靶组织对糖皮质激素,由人类糖皮质激素受体 (hGR) 基因的失活突变引起。一个新病例 ...阅读更多»MLL-重排急性淋巴细胞白血病通过 H3K79 甲基化激活 BCL-2,并对 BCL-2 特异性拮抗剂 ABT 敏感-199 发表时间:2015 年 12 月摘要:旨在利用侵袭性癌症中特定分子通路的靶向疗法是当前研究的一个令人兴奋的领域。混合谱系白血病 (MLL) 突变,例如 t(4;11) 易位,会导致难治性侵袭性白血病。 ..关于ad more »cChIP-seq:一种用于研究组蛋白修饰的稳健的小规模方法发布时间:2015 年 12 月摘要:背景 ChIP-seq 被广泛用于映射组蛋白修饰,这些组蛋白修饰可提供有关基因调控和基因组注释的信息。例如,将 ChIP-seq 应用于 H3K4me1 等组蛋白修饰有助于产生表观基因……阅读更多 »胚胎转录受母体定义的染色质状态控制发布时间:2015 年 12 月摘要:细胞身份和谱系承诺需要组蛋白修饰酶,然而,人们对胚胎发育过程中表观基因组的调控起源知之甚少。在这里,我们生成了一套全面的表观基因组参考图,...阅读更多»恢复到胚胎选择性剪接程序可增强白血病干细胞自我更新。发表时间:2015 年 12 月摘要:形成性研究表明,人类胚胎干细胞特异性替代方案剪接基因被肌盲样 (MBNL) RNA 结合蛋白抑制的调节网络参与细胞重编程。在这项研究中,RNA sequencin...阅读更多»类圆线虫中的种系组织揭示了其他分化和调节机制。发布时间:2015 年 12 月摘要:类圆线虫属的线虫是包括人类在内的脊椎动物的重要寄生虫。目前,人们对它们的种系组织或生殖生物学及其如何影响它们的寄生生活策略知之甚少。在这里,我们分析...阅读更多»独立机制将 SMCHD1 靶向三甲基化组蛋白 H3 赖氨酸 9-修饰染色质和非活性 X 染色体发表时间:2015 年 12 月摘要:染色体蛋白 SMCHD1 在不同位点的表观遗传沉默中起着重要作用,包括不活跃的 X 染色体、印迹基因和面肩肱肌营养不良位点。虽然与规范的 SMC 家族同源……阅读更多 »DNA 甲基化分析:全基因组测序方法与 Infinium 人类甲基化 450 微珠芯片的比较发布时间:2015 年 12 月摘要:目的:比较四种基于序列和一种微阵列方法的 DNA 甲基化分析方法的性能。方法:DNA 来自通过还原代表性亚硫酸氢盐测序、甲基捕获测序(SS-Met...阅读更多»高度保守的 NF-κB 反应增强子对小鼠 Aire 的胸腺表达至关重要发表时间:2015 年 12 月摘要:自身免疫调节剂( Aire) has a unique expression pattern in thymic medullary epithelial cells (mTECs), which it plays a critical role in the activation of tissue-specific antigens. The expression of Aire in mTECs is activated by receptor act...阅读更多»氧化小鼠精子染色体中的 DNA 损伤:大小很重要。发表时间:2015 年 12 月摘要:正常的胚胎和胎儿发育以及后代的健康状况大多受到影响取决于配子核的完整性。在本研究中,为了更准确地描述小鼠精子中氧化 DNA 损伤的特征,我们使用了两种小鼠模型 ...阅读更多 »短暂性全身性糖皮质激素超敏反应发表时间:2015 年 12 月摘要:背景:短暂性全身性糖皮质激素超敏反应是一种罕见的疾病,其特征是增加组织对糖皮质激素的敏感性和下丘脑-垂体-肾上腺轴的代偿性低激活。条件 itsel...阅读更多 »恶性疟原虫 SURFIN4.2 的细胞质区域是从 Maurer 裂隙到红细胞表面的运输所必需的出版日期:2015 年 12 月摘要:背景:疟原虫是疟疾的病原体,可将许多蛋白质输出到受感染的红细胞 (iRBC) 的表面,以便将其修改为更适合寄生虫发育和生存的结构。一个这样的出口公关……阅读更多»组蛋白修饰的动态变化卵母细胞中的阳离子先于从头 DNA 甲基化发布:2015 年 12 月摘要:种系中 DNA 甲基化的擦除和随后恢复,尤其是在印迹 CpG 岛 (CGI) 中,对于哺乳动物的胚胎发生至关重要。 DNA 甲基化建立的机制仍然知之甚少,但一个 nu...阅读更多»Brg1 在视网膜发生过程中协调多个过程,并且是视网膜母细胞瘤中的肿瘤抑制因子发表时间:2015 年 12 月摘要:视网膜发育需要细胞周期退出的精确时间和空间协调,细胞命运规范、细胞迁移和分化。当这个过程被破坏时,就会形成视网膜母细胞瘤,一种视网膜的发育性肿瘤。 ...阅读更多 »糖皮质激素受体和核因子 kappa-b 影响三维染色质组织发布时间:2015 年 12 月摘要:背景:糖皮质激素受体和核因子等信号依赖性转录因子的影响或 kappa-b,关于染色质的三维组织仍然是一个讨论的话题。可能的场景范围从重新……阅读更多 »脂肪祖细胞中高葡萄糖对炎症反应基因的表观遗传启动发布时间:2015 年 11 月摘要:细胞代谢赋予调节决定细胞状态的转录网络所需的广泛表观遗传修饰。间充质基质细胞对代谢信号有反应,包括循环葡萄糖水平和……阅读更多»选择性靶向 BRG/PB1 溴结构域会损害胚胎和滋养层干细胞的维护发表时间:2015 年 11 月摘要:哺乳动物 SWI/SNF [也称为 Brg/Brahma-相关因子 (BAF)] 是进化上保守的染色质重塑复合物,在发育和干细胞分化过程中调节基因转录程序。 BAF 复合物包含一个 ATP ...阅读更多 »S 上磷酸化 RNA 聚合酶 II 的占据水痘带状疱疹病毒基因 9、51 和 66 上的 erine 5 (RNAP S5P) 和 RNAP S2P 独立于基因内的转录本丰度和聚合酶位置发表时间:2015 年 11 月摘要:水痘带状疱疹病毒 (VZV) 中基因转录的调控,一种普遍存在的人类嗜神经性 alphaherpesvirus,需要将多个宿主和病毒蛋白协调结合到病毒基因组的特定区域。染色质免疫沉淀...阅读更多 »通过 dNTP 饥饿抑制 WEE1 选择性地杀死组蛋白 H3K36me3 缺陷型癌症发表时间:2015 年 11 月摘要:组蛋白 H3K36 三甲基化 (H3K36me3) 在多种癌症类型中经常丢失,将其确定为重要的治疗靶点。在这里,我们确定了一种合成致死相互作用,其中 H3K36me3 缺陷癌症对 WE 非常敏感……阅读更多 »CRISPR 介导的人类诱导多能干细胞基因靶向发布时间:2015 年 11 月摘要:CRISPR/Cas9 核酸酶系统可以产生双 s转录的 DNA 在特定序列处断裂,以高效、精确地破坏、切除、突变、插入或替换基因。然而,人类胚胎干细胞和诱导多能干细胞 (iPSC)...阅读更多 »人​​类 B 细胞终末分化为浆细胞期间 DNA 甲基化组的细胞周期依赖性重构发布时间:2015 年 11 月摘要:终末分化的分子机制B 细胞转变为浆细胞是适应性免疫的主要决定因素,但仍只是部分了解。在这里,我们展示了细胞亚群的转录和表观基因组景观……阅读更多»同源蛋白 DLX3 和肿瘤抑制因子 p53 共同调节细胞周期进程和鳞状肿瘤生长发表时间:2015 年 11 月摘要:表皮稳态取决于角质形成细胞的协调控制循环。这种平衡的分化和改变可导致肿瘤发展。在这里,我们报告了一种新颖的 DLX3 依赖限制表皮的 t 网络...阅读更多 »Polycomb 和 Trithorax 复合物之间的空间相互作用控制 T 淋巴细胞的转录活性发布时间:2015 年 11 月摘要:Trithorax 组 (TrxG) 和 Polycomb 组 (PcG) 蛋白是两种相互拮抗的染色质修饰复合物,但是,它们如何共同介导转录反调节仍然未知。全基因组分析显示结合...阅读更多»Sox4 表达赋予膀胱癌干细胞特性并预测患者预后不佳发表时间:2015 年 11 月摘要:遗传和表观遗传改变已被确定为直接或间接促成过渡性膀胱癌的产生膀胱细胞癌 (TCC-UB)。我们之前发现染色体 6p22 的扩增是 sig...阅读更多»基因表达特征识别瞬时 DNMT1 耗竭是黑色素瘤中癌症胚系基因激活的一个因果因素Published:2015 年 10 月摘要:许多人类肿瘤表现出一组种系特异性基因的异常激活,称为癌症种系 (CG) 基因,其中一些似乎发挥致癌功能。尽管肿瘤中 CG 基因的激活与启动子 DNA 去...阅读更多»Nurr1 和维甲酸 X 受体配体刺激多巴胺神经元中的 Ret 信号并可以减轻 α-突触核蛋白破坏的基因表达发表时间:2015 年 10 月摘要:α-突触核蛋白,一种富含路易体的蛋白质,与帕金森病的神经毒性密切相关,分布在神经末梢和细胞核中。在这里,我们展示了 α-突触核蛋白的核衍生物诱导……阅读更多 »甲基化 DNA 免疫沉淀的优化方法发布时间:2015 年 10 月摘要:甲基化 DNA 免疫沉淀 (MeDIP) 是最广泛使用的评估 DNA 甲基化的方法之一全基因组规模,并涉及甲基化物的捕获d 由甲基胞嘧啶特异性抗体提取的 DNA 片段。 MeDIP...阅读更多 »EZH2 缺失导致乳腺早熟发育和 STAT5 依赖基因激活发布时间:2015 年 10 月摘要:催乳素通过转录因子 STAT5A 和 STAT5B (STAT5) 控制孕期乳腺泡的建立和分化, 这也调节乳腺特征基因的时间激活。这项研究解决了……阅读更多 »用于 CRISPR/Cas9 介导的植物基因组编辑的基于双生病毒的向导 RNA 传递系统发布时间:2015 年 10 月摘要:CRISPR/Cas 已成为一种有效的基因组编辑技术,并已成功应用于许多生物体,包括几种植物。然而,基因组编辑试剂的递送在植物中仍然是一个挑战。在这里,我们报告了一个 virus-ba...阅读更多»RUNX3 与强直性脊柱炎的遗传关联可以通过对 IRF4 rec 的等位基因特异性效应来解释改变基因表达的规则发布时间:2015 年 10 月摘要:作者试图确定 RUNX3 启动子上游单核苷酸多态性 (SNP) 与强直性脊柱炎 (AS) 的遗传关联的功能基础。他们对遗传关联进行了条件分析...阅读更多»VEGF 介导的非小细胞肺癌细胞存活:对 VEGF 受体表观遗传靶向作为治疗方法的影响发表时间:2015 年 10 月摘要:目的:评估潜在的治疗方法组蛋白脱乙酰酶抑制剂 (HDACi) 在非小细胞肺癌中靶向 VEGF 受体的效用。材料和方法:筛选非小细胞肺癌细胞的 VEGF 受体……阅读更多 »ClpX 刺激线粒体展开哺乳动物细胞中的蛋白质反应 (UPRmt) 发布时间:2015 年 10 月摘要:蛋白质稳态对生命至关重要,由细胞伴侣和蛋白酶维持。一种主要的线粒体 p蛋白酶是 ClpXP 复合体,由催化 ClpX 亚基和蛋白水解 ClpP 亚基组成。基于两个独立的观察者……阅读更多 »拟南芥 CMT3 活性受 AtSIZ1 介导的苏木化作用的正向调控发布时间:2015 年 10 月摘要:哺乳动物 DNA 和组蛋白甲基转移酶的活动受磷酸化和苏木化等翻译后修饰的调控;然而,目前尚不清楚这些酶的活性在翻译后是如何被调节的……阅读更多 »KMT2D 的破坏扰乱了生发中心 B 细胞的发育并促进了淋巴瘤的发生 发表于:2015 年 10 月摘要:编码 KMT2D 的基因突变(或MLL2) 甲基转移酶是高度复发的,并且在弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL) 和滤泡性淋巴瘤 (FL) 的肿瘤发生早期发生。然而,这些突变的功能后果……阅读更多»Polycomb 抑制复合物 PRC1 在空间上限制小鼠胚胎nic 干细胞基因组发布时间:2015 年 10 月摘要:Polycomb 抑制复合物 PRC1 和 PRC2 通过沉默谱系特异性发育调节基因来维持胚胎干细胞 (ESC) 的多能性。新出现的证据表明 Polycomb 复合物通过控制空间基因组起作用...阅读更多 »内皮 Msx1 将血液动力学变化转导为动脉重塑反应。发表时间:2015 年 9 月摘要:侧支重塑对于外周动脉疾病的血流恢复至关重要,并由以下因素触发增加先前存在的侧支动脉中的流体剪切应力。到目前为止,还没有这种机械转导的动脉特异性介质重新……阅读更多»小鼠卵母细胞转录组的深度测序和从头组装定义了转录对 DNA 甲基化景观的贡献发表时间:2015 年 9 月摘要:背景:以前,一个角色在 i 处获得 DNA 甲基化时证明用于转录卵母细胞中的印迹控制区。全基因组方法对卵母细胞 DNA 甲基化组的定义表明,大多数满足……阅读更多»一种研究复杂组织中染色质结构的高分辨率成像方法发布时间:2015 年 9 月摘要:我们介绍 ChromATin,一种定量高分辨率成像研究复杂组织中染色质组织的方法。这种方法结合了免疫染色对表观遗传修饰的分析、特定 DNA 序列的定位……阅读更多»表观遗传读取器 MeCP2 的肾上腺素能抑制促进慢性心力衰竭的心脏适应发布时间:2015 年 9 月摘要:基本原理:在慢性心力衰竭中,肾上腺素能激活增加有助于结构重塑和改变基因表达。虽然肾上腺素能信号改变组蛋白修饰,但未知的是,它是否也影响其他表观基因……阅读更多 »氧化的免疫组织化学检测胚胎和成人脑组织中 5-甲基胞嘧啶的 ms 发表时间:2015 年 9 月摘要:DNA 甲基化(5-甲基胞嘧啶,5mC)是与基因抑制相关的真核基因组的主要表观遗传修饰。 11-11 易位蛋白 (Tet1/2/3) 可将 5mC 氧化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC)、5-甲酰胞嘧啶(...阅读更多 »全基因组 p63 调节的基因表达在分化表皮角质形成细胞中发表时间:2015 年 9 月摘要: The transcription factor p63 is a key regulator in epidermal keratinocyte proliferation and differentiation.However,在这些过程中p63在基因调控中的作用尚不清楚。为了调查这一点,我们最近生成了基因……阅读更多»染色质装配因子CAF -1 抑制植物防御反应基因的启动 发布时间:2015 年 9 月摘要:植物已经进化出有效的防御系统来对抗通常依赖于特定转录反应的病原体。启动是一部分防御综合症,通过建立防御基因的过敏状态,例如在第一次遭遇后...阅读更多»曼氏血吸虫的表观基因组提供了关于尾蚴如何转录直到感染的见解发表时间:2015 年 8 月摘要:背景:染色质结构可以控制基因表达并可以定义特定的转录状态。例如,组蛋白 H3K4 和 H3K27 的二价甲基化与脊椎动物胚胎干细胞 (ESC) 中的稳定转录有关。它……阅读更多 »ERα 阳性乳腺癌细胞中雌激素反应性转录的时空控制。发表时间:2015 年 8 月摘要:针对异常基因表达的靶向启动子的转录机制的招募已得到充分研究,但潜在的控制是由遥远的作用增强剂在癌症发展中的作用尚不清楚。我们之前的研究表明……阅读更多 »通过 Cas9 prot 进行快速高效的哺乳动物细胞工程ein 转染。发布时间:2015 年 8 月摘要:CRISPR-Cas9 系统提供了一个高效基因组编辑平台,可实现哺乳动物细胞工程的创新应用。然而,Cas9 的传递和向导 RNA (gRNA) 的合成仍然是限制过度的步骤……阅读更多»Polycomb RING1A- 和 RING1B 依赖的组蛋白 H2A 单泛素化在着丝粒周围区域促进 S 期进展发表时间:2015 年 8 月摘要: polycomb 产品的功能超出了其作为转录调节器的众所周知的活动,包括基因组复制过程。 DNA 复制和 DNA 损伤修复过程中的 Polycomb 活动尚不清楚,尤其是在没有...阅读更多 »C/EBPα 在诱导的前 B 细胞转分化和骨髓生成过程中激活预先存在的巨噬细胞增强剂和从头开始的巨噬细胞增强剂发表时间:2015 年 8 月摘要:亮点 C/EBPα激活 B 细胞中两类预期的骨髓增强子增强子受 PU.1 约束,并被 C/EBPαC/EBPα 过度激活,作为先驱因子,在...上具有延迟动力学。阅读更多 »全基因组羟甲基胞嘧啶模式发生变化以响应氧化应激发表时间:2015 年 8 月摘要:The TET 酶将甲基胞嘧啶转化为新发现的碱基羟甲基胞嘧啶。虽然最近的报告表明 TET 可能在应对氧化应激方面发挥作用,但这种作用仍然不确定,并且结果缺乏体内模型。这里...阅读更多»凝缩素靶向并减少与有丝分裂染色体凝缩中的转录相关的未缠绕 DNA 结构发表时间:2015 年 7 月摘要:染色体凝缩是真核生物有丝分裂的标志,是将遗传物质忠实分离到子细胞的先决条件。在这里,我们表明凝缩蛋白对于组装浓缩染色体至关重要,它有助于预……阅读更多»慢性淋巴细胞非编码复发突变leukaemia.Published: July, 2015Abstract: 慢性淋巴细胞白血病 (CLL) 是一种常见的疾病,其中决定临床生物学行为的遗传改变尚不完全清楚。在这里,我们描述了对 452 个 CLL 病例的基因组景观的综合评估 ...阅读更多 »破译控制恶性疟原虫 clag3 基因相互排斥表达的原则 发表时间:2015 年 7 月摘要:恶性疟原虫基因 clag3.1 和clag3.2 通过确定溶质转运到受感染的红细胞中,在疟疾寄生虫生物学中起着重要作用。两个 clag3 基因的表达是相互排斥的,这样……阅读更多 »单核小体分辨率下天然酵母菌株之间表观基因组变异的复杂模式。发表时间:2015 年 7 月摘要:背景:人类和模型物种的表观基因组研究有揭示了组蛋白修饰谱的显着个体间差异。然而呃,这种变异的模式还没有被精确地描述出来,特别是关于……阅读更多 »肿瘤融合蛋白 FUS-ERG 靶向关键的造血调节因子并调节 t(16;21) 急性髓系细胞中的全反式维甲酸信号通路白血病。发布时间:2015 年 7 月摘要:ETS 转录因子 ERG 被认为是正常和异常造血的主要调节因子。在携带 t(16;21) 的急性髓性白血病中,ERG 功能因与 FUS/TLS 融合而失调,导致表达...阅读更多 »DNA 甲基化指导胰腺 β 细胞的功能成熟发表时间:2015 年 7 月摘要:胰腺 β细胞分泌胰岛素以响应餐后葡萄糖水平的升高以防止高血糖并在禁食条件下抑制胰岛素分泌以防止低血糖。 β 细胞缺乏这种功能性能力……阅读更多 »转录因子 p63 书签和调节动态 enha表皮分化过程中的神经细胞发表时间:2015 年 7 月摘要:转录因子 p63 在表皮角质形成细胞增殖和分化中起着关键作用。然而,p63 在分化过程中如何调节表皮基因尚不清楚。使用分化的表观基因组分析......阅读更多 »Gadd45b 和 N-甲基-D-天冬氨酸诱导有丝分裂后神经元中的 DNA 去甲基化。发表时间:2015 年 6 月摘要:目的:在非分裂神经元中检查 Gadd45b 在活性 5-甲基胞嘧啶 (5MC) 中的作用) 和 5-羟甲基胞嘧啶 (5HMC) 在与精神疾病和认知密切相关的基因启动子处去除,Bdnf.MATERIALS & METHODS: Mouse prima...阅读更多cells.Published: June, 2015Abstract: AIM: rRNA 的合成是正常和恶性细胞生长的关键决定因素,并受表观遗传调控。然而,表观基因组特征聚集在核仁组织区的 rDNA 阵列的本质在很大程度上是未知的。我们着手研究……阅读更多 »柠檬酸盐调节脂多糖诱导的单核细胞炎症反应。发布时间:2015 年 6 月摘要:柠檬酸盐是细胞代谢的核心成分,由于具有螯合钙的能力,因此是一种广泛使用的抗凝血剂。代谢柠檬酸盐的三磷酸腺苷 (ATP)-柠檬酸裂解酶已被证明对炎症至关重要,但是……阅读更多 »拟南芥基因组 DNA 甲基化和基因表达对多菌灵反应的基因芯片分析。发表时间:6 月, 2015 年摘要: 目的:研究多菌灵对拟南芥基因组 DNA 甲基化和基因表达的影响。结果:多菌灵引起基因位点甲基化和基因表达的广泛变化。使用 0.1 mM (D2) 和 0.2 mM (D3) 多菌灵...阅读更多 »局部核仁 DNA 损伤反应有助于招募同源定向代表独立于细胞周期阶段的空气机械。发布时间:2015 年 6 月摘要:DNA 双链断裂 (DSB) 通过两个主要途径修复:非同源末端连接和同源重组 (HR)。修复途径的选择被认为是由细胞周期时间和染色质背景决定的。核仁、突出的核...阅读更多 »ZFP57 的等位基因特异性结合在印迹和非印迹单等位基因表达的表观遗传调控中发表时间:2015 年 5 月摘要:背景:父母需要在植入前发育过程中选择性地维持基因组表观遗传印记印迹基因的起源特异性表达。 Kruppel 样锌指蛋白 ZFP57 是 f...阅读更多 »复合 macroH2A/NRF-1 核小体抑制噪声并在基因表达中产生稳健性。发表时间:2015 年 5 月摘要:组蛋白变体 macroH2A (mH2A) 具有与转录抑制有关,但共同作用的分子机制对全球 mH2A 依赖性基因组调控的贡献仍然难以捉摸。使用染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq...阅读更多 »STAT3 活性的强化将人类胚胎干细胞重新编程为幼稚样多能性。发表时间:2015 年 5 月摘要:白血病抑制因子 (LIF)/STAT3 信号是幼稚多能性的标志在啮齿动物多能干细胞 (PSC) 中,而成纤维细胞生长因子 (FGF)-2 和激活素/节点信号是维持人类 PSC 自我更新所必需的……阅读更多 »人​​类多能细胞中 X 染色体失活的侵蚀始于XACT 涂层并取决于特定的异染色质景观。发表时间:2015 年 5 月摘要:人类多能干细胞 (hPSC) 表现出广泛的表观遗传不稳定性,尤其是在 X 染色体上。在这项研究中,我们表明,在 hPSC 中,不活跃的 X 染色体具有一种特定的异染色质景观,使其易受侵蚀……阅读更多»招募程度DOT1L 到 MLL-AF9 的核苷酸定义了目标基因上 H3K79 二甲基化和三甲基化的水平以及转化潜力。发表时间:2015 年 5 月摘要:MLL 基因是人类白血病中发现的染色体易位的常见目标。 MLL 融合白血病的预后一直很差。最常见的易位伙伴之一是 AF9 (MLLT3)。 MLL-AF9 招募 DOT1L,一种组蛋白 3 赖氨酸 79...阅读更多 »lncRNA 通过建立特定于剪接的染色质特征来调节选择性剪接。发布时间:2015 年 5 月摘要:选择性前体 mRNA 剪接是一种高度细胞类型特异性的产生蛋白质多样性所必需的过程。然而,负责建立和维持可遗传细胞特异性可变剪接程序的机制是……阅读更多 »人​​类胚胎干细胞中 DNMT1、DNMT3A 和 DNMT3B 的靶向破坏。发表时间:2015 年 5 月摘要:DNA 甲基化是一种参与调节基因表达的关键表观遗传修饰ssion 并保持基因组的完整性。在这里,我们使用……阅读更多»分枝杆菌蛋白 Rv2966c 与宿主染色质的相互作用通过非 CpG 甲基化和组蛋白 H3/H4 结合介导,使人类胚胎干细胞 (ESC) 中的所有三种具有催化活性的 DNA 甲基转移酶 (DNMT) 失活。发布时间:2015 年 4 月摘要:为了有效调节受感染哺乳动物细胞内的基因表达,病原体结核分枝杆菌需要在适当的基因组位点进行表观遗传修饰。研究这个假设,我们在这个研究中展示了……阅读更多»确定调节 MCF7 乳腺癌细胞中无机焦磷酸酶 (PPA1) 的关键元素。发表时间:2015 年 4 月摘要:细胞溶质无机焦磷酸酶在细胞中起重要作用通过水解作为各种代谢反应的副产物形成的无机焦磷酸盐 (PPi) 进行代谢。已知无机焦磷酸酶与ciated with i...阅读更多 »CYP51A1 及其天然反义转录本 AluCYP51A1 在 37 型腺病毒感染的视网膜色素上皮细胞中的相反表达。发表时间:2015 年 4 月摘要:细胞色素 P450 家族成员 CYP51A1 是胆固醇生物合成中的关键酶,其失调是涉及多种疾病,包括视网膜变性。在这里,我们描述了 HAdV-37 感染导致 CYP51A1 表达下调……阅读更多 »破译 Polycomb 抑制复合物 1 (PRC1) 变体在调节拟南芥开花能力获得中的作用。发布时间:2015 年 4 月摘要:Polycomb Group (PcG) 蛋白在调节植物发育阶段转变中发挥重要作用;然而,对于 PcG 机制在调节从幼年期到成年期的转变中的作用知之甚少。在这里,我们表明 Ara……阅读更多 »造血细胞中 TET2 的缺失导致活性增强子的 DNA 超甲基化和白血病发生的诱导发表时间:2015 年 4 月摘要:DNA 甲基化在整个哺乳动物发育过程中受到严格调控,而改变的 DNA 甲基化模式是癌症的普遍标志。甲基胞嘧啶双加氧酶 TET2 在血液系统疾病中经常发生突变,包括急性髓细胞白血病……阅读更多 »A cohesin-OCT4 复合物介导 Sox 增强剂以启动早期胚胎谱系。发布时间:2015 年 4 月摘要:短尺度和长尺度内部和内部染色体间相互作用与基因转录有关,但人们对这些结构背后的分子事件以及它们如何影响胚胎发育过程中的细胞命运决定知之甚少。一个 ...阅读更多 »通过 KAP1/TRIM28 磷酸化开关从潜伏期释放人巨细胞病毒。发布时间:2015 年 4 月摘要:人巨细胞病毒 (HCMV) 是一种高度流行的病原体,主要通过建立潜伏期诱导终身感染造血干细胞(HSC)。重新激活的发作通常由免疫系统控制,但 c...阅读更多»NAD(+)-SIRT1 通过 MLL1 的昼夜节律去乙酰化控制 H3K4 三甲基化。发表时间:2015 年 4 月摘要:生物钟控制数百个基因的转录基因通过特定的染色质重塑事件。组蛋白甲基转移酶混合谱系白血病 1 (MLL1) 协调 CLOCK-BMAL1 激活剂复合物向染色质的募集……阅读更多 »鼻咽癌甲基化组的特征鉴定了关键信号通路和甲基化肿瘤抑制基因的异常破坏。发表时间:4 月, 2015年摘要:目的:鼻咽癌(NPC)是一种常见的肿瘤,与EB病毒感染持续相关,流行于包括香港在内的华南地区和东南亚。目前的基因组测序研究发现只有罕见的突变……阅读更多»全基因组 CIITA 结合概况识别序列偏好 t帽子决定功能与招聘发布时间:2015 年 3 月摘要:II 类反式激活因子 (CIITA) 对于主要组织相容性复合体 II 类 (MHC-II) 基因的表达至关重要;然而,CIITA 在 MHC-II 生物学之外的基因调控中的作用尚不完全清楚。全面地管理……阅读更多 »全基因组 CIITA 结合配置文件确定了决定功能与招募的序列偏好。发布时间:2015 年 3 月摘要:II 类反式激活因子 (CIITA) 对于主要组织相容性复合物 II 类的表达至关重要( MHC-II)基因;然而,CIITA 在 MHC-II 生物学之外的基因调控中的作用尚不完全清楚。要全面管理……阅读更多 »视黄酸对于 Th1 细胞谱系稳定性至关重要,并可防止过渡到 Th17 细胞程序。发布时间:2015 年 3 月摘要:CD4(+) T 细胞在抗原刺激后分化为表型不同的 T 辅助细胞。塑料监管这些 CD4(+) T 细胞谱系之间的 ticity 对于免疫稳态和自身免疫性疾病的预防至关重要。然而,th...阅读更多»在肿瘤生长和转移的小鼠模型中进行全基因组 CRISPR 筛选。发布时间:2015 年 3 月摘要:遗传筛选是识别负责不同表型的基因的强大工具。在这里,我们描述了全基因组 CRISPR/Cas9 介导的肿瘤生长和转移功能丧失筛选。我们诱变了一种非转移性小鼠癌症...阅读更多»人类疾病模型揭示了 NOTCH1 单倍剂量不足的综合转录和表观遗传机制。发表时间:2015 年 3 月摘要:转录因子单倍剂量不足改变人类细胞表观遗传和转录景观的机制致病原因不明。在这里,我们利用人类诱导多能干细胞 (iPSC) 衍生的内皮细胞……阅读更多 »使用 CRISPR/Cas9 系统作为细胞内防御 H人类细胞中的 IV-1 感染。发布时间:2015 年 3 月摘要:为了对抗敌对病毒、细菌和古生菌,进化出一种独特的抗病毒防御系统,该系统由成簇的规则间隔短回文重复序列 (CRISPR) 以及 CRISPR 相关基因 (Cas) 组成. CRISPR/Cas9 系统开发...阅读更多 »全基因组图谱揭示了鸡驯化后启动子 DNA 甲基化的保守性。发表时间:2015 年 3 月摘要:众所周知,环境会影响 DNA 甲基化,然而,可遗传 DNA 的范围动物驯化后的甲基化变异在很大程度上仍然未知。使用 meDIP 芯片,我们绘制了 23,316 个基因的启动子甲基化组图……阅读更多 »可诱导的慢病毒引导 RNA 平台能够在体内识别肿瘤必需基因和促肿瘤突变。发布时间:2015 年 3 月摘要:CRISPR/ Cas9 技术可以将基因组改变引入几乎任何生物体;然而呃,一直缺乏有效和可诱导的基因修饰系统,特别是对于必需基因的删除。在这里,我们描述了一个……阅读更多 »一个可诱导的慢病毒引导 RNA 平台能够在体内识别肿瘤必需基因和肿瘤促进突变发表时间:2015 年 3 月摘要:CRISPR/Cas9 技术能够将基因组改变引入几乎任何有机体;然而,一直缺乏有效和可诱导的基因修饰系统,特别是对于必需基因的缺失。在这里,我们描述了一个……阅读更多 »表观基因组图谱揭示了致癌融合蛋白 EWS-FLI1 的基因调控和广泛增强子重编程的不同模式。发布时间:2015 年 2 月摘要:转录因子融合蛋白可以通过诱导整体变化来转化细胞转录组,通常会造成致癌基因成瘾状态。在这里,我们研究了表观遗传机制在这个过程中的作用,重点是n Ewing sarco...阅读更多 »MCPH1 在慢性淋巴细胞白血病中维持 ANGPT2 的长期表观遗传沉默。发表时间:2015 年 2 月摘要:小脑蛋白基因 (MCPH1) [也称为人端粒酶逆转录酶 (hTERT) 表达抑制剂]是在功能上参与DNA损伤反应的肿瘤抑制基因。血管生成素 2 (ANGPT2) 是一个关键因素 ...阅读更多 »iASPP 的促凋亡功能通过抑制 BRMS1 E3 泛素连接酶活性稳定 p300 和 CBP。发表时间:2015 年 2 月摘要:p53 家族及其辅助因子是有效的细胞凋亡的诱导剂并形成癌症的屏障。在这里,我们研究了 p53 凋亡刺激蛋白 iASPP 的抑制成员对 p53 hom 活性的影响……阅读更多 »IL-1 诱导增强剂的激活取决于 TAK1 激酶活性和NF-κB p65。发布时间:2015 年 2 月摘要:炎症基因反应重新需要激活蛋白激酶 TAK1,但目前尚不清楚 TAK1 衍生信号如何协调基因组中的转录程序。我们确定了 TAK1 控制的 NF- 的全基因组结合...阅读更多 »5-甲酰基和 5-羧基胞嘧啶的单碱基分辨率分析揭示了启动子 DNA 甲基化动力学。发布时间:2015 年 2 月摘要:十十一易位 ( Tet) 蛋白质将 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 氧化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC)、5-甲酰基胞嘧啶 (5fC) 和 5-羧基胞嘧啶 (5caC)。 5fC 和 5caC 可进一步被胸腺嘧啶 DNA 糖基化酶 (Tdg) 切除。在这里,我们提出……阅读更多 »全基因组和单细胞分析揭示了 CBP 募集和基因表达之间的上下文相关关系。发表时间:2015 年 2 月摘要:组蛋白 H3K18 和 H3K27 乙酰转移酶的全基因组分布,CBP (CREBBP ) 和 p300 (EP300),用于映射增强子和启动子,但这些元素在功能上是否需要 CBP/p300 在很大程度上仍然不确定。我们在这里比较了 glo...阅读更多 »女性人类诱导多能干细胞中的稳定 X 染色体再激活。发布时间:2015 年 1 月摘要:在胎盘哺乳动物中,X 连锁基因的平衡表达是通过女性 X 染色体失活 (XCI) 实现的细胞。在人类中,随机 XCI 是在胚胎发育早期启动的。研究女性 h 的重编程是否...阅读更多»胚胎干细胞分化需要全长 Chd1。发布时间:2015 年 1 月摘要:ATP 依赖性染色质重塑因子对染色质动力学的调节已被认为是调节染色质动力学的重要机制平衡胚胎干细胞 (ESC) 的自我更新和多能性。在这里,我们研究了 ef...阅读更多 »格雷夫斯病的全基因组 DNA 甲基化分析。发表时间:2015 年 1 月摘要:作为一种自身免疫性疾病,格雷夫斯病 (GD) 与许多遗传和环境相关风险因素。虽然确切的机制尚不清楚,但表观遗传决定因素,如 DNA 甲基化,被认为是导致病原体的原因……阅读更多»用于稀有细胞群全基因组分析的超低输入原生 ChIP-seq 协议。已发布:2015 年 1 月摘要:染色质免疫沉淀和下一代测序 (ChIP-seq) 相结合,使众多细胞系和组织类型的全基因组表观遗传分析成为可能。 ChIP-seq 的一个主要限制,然而,是需要大量的细胞 t...阅读更多»用于稀有细胞群的超低输入本机 ChIP-seq 发布时间:2015 年 1 月摘要:染色质免疫沉淀和下一代测序相结合(ChIP-seq) 已经能够对众多细胞系和组织类型进行全基因组表观遗传分析。 ChIP-seq 的一个主要限制,然而,是需要大量的细胞 t...阅读更多»A vlincRNA 通过减轻 H2AZ 介导的参与衰老维持INK4 位点的抑制。发布时间:2015 年 1 月摘要:非编码 RNA (ncRNA) 在正确的染色质组织和功能中发挥重要作用。衰老是一种强烈的抗增殖过程和主要的抗癌屏障,与异染色质病灶中显着的染色质重组有关。 ...阅读更多 »整合酶辅助因子 LEDGF/p75 与 Iws1 和 Spt6 相关联,用于潜伏感染细胞中 HIV-1 基因表达的整合后沉默。发布时间:2015 年 1 月摘要:包含转录沉默但复制的潜在储库的持久性-能干的、整合的原病毒是根除艾滋病毒的严峻挑战。 HIV 整合在 LEDGF/p75 的控制下,病毒的细胞辅助因子 ...阅读更多 »组蛋白脱甲基酶 KDM3A 是乳腺癌中关键的雌激素受体调节剂。发表时间:2015 年 1 月摘要:内分泌治疗已成功用于治疗雌激素受体 (ER) 阳性乳腺癌r,但这总是会因癌症变得难以治疗而失败。新出现的证据表明,ER 协同调节亲的波动...阅读更多»TRIM28 抑制神经祖细胞中内源性逆转录病毒的转录。发布时间:2015 年 1 月摘要:TRIM28 是一种辅助抑制因子,通过建立局部异染色质来介导转录沉默。在这里,我们表明神经祖细胞 (NPC) 中 TRIM28 的缺失会导致两组内源性逆转录病毒的高水平表达……阅读更多»iRNA-seq:全基因组评估急性转录调控的计算方法RNA-seq 数据。发布时间:2015 年 1 月摘要:RNA-seq 是一种敏感且准确的技术,用于比较不同细胞状态之间 RNA 的稳态水平。然而,由于它本身不提供转录活动的说明,因此需要其他技术来更精确地确定……阅读更多 »CpG 信号,H2A.Z/H3 a鲸蜡基化和 microRNA 介导的延迟自我衰减协调胎儿 NOS3 表达。发表时间:2015 年 1 月摘要:背景:不利的宫内环境会导致永久性生理变化,包括血管张力调节,可能影响成人血管疾病的风险。因此,我们旨在监测响应性 NOS3 表达......阅读更多 »BAZ2A (TIP5) 参与前列腺癌的表观遗传改变,其过度表达可预测疾病复发。发表时间:2015 年 1 月摘要:前列腺癌是由遗传和/或表观遗传改变。在所有人类癌症中都经常观察到表观遗传改变,但人们对异常表观遗传特征是如何建立的知之甚少。在这里,我们展示了……阅读更多 »曲古抑素治疗后 HP1 蛋白的差异分布影响 HCT116 和 WI-38 细胞的染色体稳定性发表时间:2014 年 12 月摘要:摘要背景异染色质蛋白 1 (HP1) 在组成型异染色质的建立、繁殖和维持中很重要,尤其是在着丝粒周围区域。 HP1 可能参与招募和指导 Mis12...阅读更多 »紫杉醇耐药性通过上调 CAR 表达和功能失调的细胞周期控制来增加溶瘤腺病毒的功效。发表时间:2014 年 12 月摘要:卵巢癌中经常出现对紫杉醇化疗的耐药性。溶瘤腺病毒是一种治疗人类恶性肿瘤的新型疗法,目前正在早期试验中对其进行评估。然而,没有可靠的预测生物标志物……阅读更多 »将 SCAN 域锌指基因 ZNF449 鉴定为软骨形成的新因子。发布时间:2014 年 12 月摘要:转录因子 SOX9、SOX5 和 SOX6 对于生成和分化必不可少软骨细胞。然而,人们对诱导 SOX 基因的分子机制知之甚少。给一个解决这个问题,我们之前确定了人类……阅读更多»冷冻肠隐窝绒毛轴:一种研究从干细胞到分化细胞的表观遗传修饰动力学的离体方法发表时间:2014 年 12 月摘要:肠上皮细胞是一种特别有吸引力的生物成人模型,用于研究驱动成人干细胞更新和细胞分化的表观遗传机制。由于表观遗传修饰是动态的,我们开发了一种原始的离体……阅读更多»冷驯化导致大麻品种 COR 基因的染色质状态和转录水平发生明显变化,具有对比的冷驯化能力。发表时间:2014 年 12 月摘要:人们对大麻适应寒冷气候和发展抗冻能力的能力知之甚少。本研究调查了九个紫花苜蓿品种的冷驯化能力以及潜在的遗传和表观遗传反应。变量...阅读我ore » 同卵双胞胎中 2 型糖尿病易感位点的综合表观基因组分析。发布时间:2014 年 12 月摘要:DNA 甲基化对于理解 2 型糖尿病 (T2D) 等常见复杂性状的病因学具有巨大潜力。在这里,我们对来自 27 个全血来源的 DNA 进行全基因组甲基化 DNA 免疫沉淀测序 (MeDIP-seq) ...阅读更多 »远端基因座元件介导脂多糖刺激的 TNF 基因表达的 IFN-γ 启动。发布时间:12 月, 2014 摘要:干扰素 γ (IFN-γ) 启动使单核细胞和巨噬细胞对脂多糖 (LPS) 刺激敏感,导致包括 TNF 在内的一组基因的表达增强。在这里,我们证明了 LPS 刺激的 TNF 转录物的 IFN-γ 启动...阅读更多 »lncRNA 成熟以启动核仁中的异染色质形成是 ESC 退出多能性所必需的。发表时间:2014 年 12 月摘要:胚胎的开放染色质干当细胞退出多能状态时,细胞 (ESC) 凝结成抑制性异染色质。 3D 基因组组织如何在多能性和谱系规范中协调和牵连尚不清楚……阅读更多»核酸内切酶 G 优先切割 5-羟甲基胞嘧啶修饰的 DNA,从而为重组创造底物。发布时间:2014 年 12 月摘要:5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC) ) 被认为参与各种核酸交易和细胞过程,包括转录调节、5-甲基胞嘧啶的去甲基化和干细胞多能性。我们已经确定了……阅读更多 »cox5a 启动子的超甲基化与高脂肪饮食诱导的胰岛素抵抗大鼠骨骼肌中的线粒体功能障碍有关。发表时间:2014 年 12 月摘要:高脂肪饮食 (HFD) 是一种环境因素,有助于肥胖和 2 型糖尿病的发病机制。许多影响氧化磷酸化的基因(OXPHOS) 被发现在人类和 ra 的骨骼肌中被下调……阅读更多»人工锌指表观遗传调节剂的分析:广泛结合但监管有限。发表时间:2014 年 12 月摘要:人工转录因子 (ATF) 和基因组目前正在开发基于由多个锌指结构域组成的 DNA 结合平台的核酸酶,用于临床应用。然而,没有对他们的 bin 进行全基因组调查……阅读更多»急性耗竭重新定义了 DNA 甲基转移酶在人类基因组甲基化过程中的分工。发表时间:2014 年 11 月摘要:DNA 甲基化的全球模式,由 DNA 甲基转移酶介导( DNMTs)在所有癌症中都被很大程度上未知的机制破坏,阻碍了它们作为治疗靶点的发展。所有 DN 的组合急性耗竭……阅读更多 »全基因组鉴定 prenat 卵巢组织中异常甲基化的启动子雄激素化大鼠。发布时间:2014 年 11 月摘要:目的:鉴定参与多囊卵巢综合征 (PCOS) 发展的异常甲基化候选基因。设计:动物模型。设置:大学附属实验室。动物:Sprague-Dawley 大鼠。干预(S)...阅读更多»B 细胞靶向病毒通过增加全球 5-羟甲基胞嘧啶水平来破坏淋巴组织中潜在的保护性基因组甲基化模式发布时间:2014 年 10 月摘要:病毒调节免疫系统的机制包括宿主的变化基因组甲基化。 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC) 是 Tet(Ten-11 易位)酶家族的催化产物,可作为……的中间体阅读更多 »雌激素受体 α 调节的 lncRNA NEAT1 是前列腺癌的关键调节剂. 发布时间:2014 年 10 月摘要:雄激素受体 (AR) 在建立致癌级联反应中起着核心作用推动前列腺癌的进展。一些前列腺癌摆脱了雄激素依赖性,并且通常与侵袭性表型相关。雌激素 rec...阅读更多 »等位基因表达跨细胞谱系映射以确定非编码 SNP 的影响。发布时间:2014 年 10 月摘要:大多数复杂的疾病相关遗传变异位于非编码区域,因此被认为是监管性质。差异等位基因表达 (AE) 的关联映射是一种强有力的方法来识别单核苷酸多态性与直接...阅读更多»慢性脑灌注不足后白质束和神经胶质细胞相关的 5-羟甲基胞嘧啶变化。发表时间:2014 年 10 月摘要:白质异常由于与年龄相关的脑血管改变是与老年人功能障碍相关的常见病理标志,已在慢性低灌注小鼠中建模。 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 和它……阅读更多 »肥胖增加小鼠肝脏中 Tnfa 和 Ccl2 基因的 ses 组蛋白 H3 赖氨酸 9 和 18 乙酰化发布时间:2014 年 10 月摘要:肥胖导致非酒精性脂肪性肝病 (NAFLD) 的发展,其特征是两种关键炎症介质的表达上调:肿瘤坏死因子 (Tnfa) 和单核细胞趋化蛋白 1 (Mcp1; als...阅读更多 »哺乳动物受精卵中雄性和雌性原核 DNA 的主动和被动去甲基化。发表时间:2014 年 10 月摘要:哺乳动物精子和卵母细胞的表观基因组,以配子特异性 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 模式为特征,在早期胚胎发生过程中重新编程,以建立完整的发育潜力。以前的研究表明,模式……阅读更多 »自噬控制 BCG 诱导的训练免疫和对膀胱内 BCG 的反应Therapy for Bladder Cancer.Published: October, 2014Abstract: 抗结核疫苗卡介苗 (BCG) 是最广泛使用的sed 疫苗在世界上。除了对结核病的作用外,BCG 疫苗接种还对某些形式的恶性肿瘤产生非特异性有益作用……阅读更多 »PML 相关蛋白 DEK 调节染色质上 H3.3 负载的平衡,对端粒完整性很重要. 发布时间:2014 年 10 月摘要:组蛋白变体 H3.3 通过不同的分子伴侣沉积在染色质的活性位点、端粒和中心异染色质中,但分子伴侣介导的 H3.3 加载的调节和协调机制在很大程度上仍然未知。我们展示……阅读更多 »DZNep 在斑马鱼早期发育过程中对组蛋白甲基化谱的特定改变。发布时间:2014 年 9 月摘要:早期胚胎发育是研究表观遗传标记(包括组蛋白甲基化)获取的独特机会。这项研究调查了 3-deazaneplanocin A (DZNep) 的体内功能和特异性,一种有前途的抗癌药……阅读更多 »DNA 双链断裂反应期间的 SET8 甲基转移酶活性是招募 53BP1 所必需的 发表时间:2014 年 9 月摘要:DNA 双链断裂 (DSB) 激活称为 DNA 损伤反应 (DDR) 的信号通路,该通路通过蛋白质-蛋白质相互作用和翻译后修饰将信号蛋白(例如 53BP1)募集到 le...阅读更多 »SNAIL1 结合了 ASCL2 的竞争性置换和表观遗传机制,可快速沉默结直肠癌中的 EPHB3 肿瘤抑制因子。发表时间:2014 年 9 月摘要:EPHB3 是肠上皮细胞中的关键细胞引导因子,也是结直肠癌 (CRC) 中的重要肿瘤抑制因子,当肿瘤细胞变得具有侵袭性时,其表达在腺瘤-癌转变过程中经常丢失。 mo...阅读更多 »自发睡眠-觉醒周期和睡眠剥夺不同地诱导 Bdnf1、Bdnf4 和 Bdnf9a DNA 甲基化和转录 l大鼠基底前脑和额叶皮层的水平。发布时间:2014 年 9 月摘要:脑源性神经营养因子 (Bdnf) 调节神经元可塑性、慢波活动和睡眠稳态。环境刺激通过表观遗传机制控制 Bdnf 表达,但没有关于 Bdnf b 表观遗传调控的数据……阅读更多»结直肠癌 (MCC) 突变是 B 淋巴细胞中的一种新型致癌基因。发布时间:2014 年 9 月摘要:背景识别小说遗传风险因素对于更好地了解 B 淋巴瘤的发生和开发新的治疗策略是必不可少的。 TRAF3 是 B 细胞存活的关键调节因子,最近被认为是……阅读更多 »Pcgf6 是一种多梳组蛋白,可调节小鼠 ES 细胞的中胚层谱系分化并在 IPS 重编程中发挥作用。发布时间:2014 年 9 月摘要:多梳组 ( PcG) 蛋白包含具有以下基本功能的进化保守因子:胚胎发育和成体干细胞。 PcG 蛋白构成两个主要的多蛋白多梳抑制复合物(PRC1 和 PRC2),其作用...阅读更多 »通过高密度 ChIP 基因分型研究人类细胞中的等位基因染色质状态。发布时间:2014 年 9 月摘要:等位基因特异性 (AS)染色质评估有可能阐明特定的顺式调节机制,预计这些机制是大多数已知的复杂疾病遗传关联的基础。然而,染色质 la 的发育……阅读更多 »细胞因子 TGF-β 通过 STAT3-STAT4 共同选择信号以促进人类 TFH 细胞的分化。发表时间:2014 年 9 月摘要:了解滤泡辅助性 T 细胞的发育机制( TFH 细胞)在人类中与临床相关。然而,驱动人类 CD4(+) 辅助性 T 细胞分化为 TFH 细胞的因素在很大程度上仍未明确。他……阅读更多 »脑肿瘤治疗的差异m 细胞类型和胎儿神经干细胞在组蛋白修饰和 DNA 甲基化、修饰的广泛区域和二价启动子的焦点区域。发表时间:2014 年 8 月摘要:背景:异常的表观遗传标记被认为在建立异常特征中起主要作用癌细胞。针对表观遗传过程的药物的合理使用和开发需要了解范围、程度……阅读更多»长非编码 RNA TARID 通过 GADD45A 指导肿瘤抑制因子 TCF21 的去甲基化和激活。发表时间:2014 年 8 月摘要:DNA 甲基化是在发育和疾病期间控制基因表达的动态和可逆过程。已经记录了几个主动 DNA 去甲基化的例子,涉及全基因组和基因特异性 DNA 去甲基化。如何 deme...阅读更多»多梳蛋白 EED 是 ESC 分化时多能性基因沉默所必需的。发布时间:2014 年 8 月摘要:Eed(embry离子外胚层发育)是多梳抑制复合物 2 (PRC2) 的核心成分,它催化组蛋白 H3 赖氨酸 27 (H3K27) 的甲基化。三甲基化 H3K27 (H3K27me3) 可以作为 PRC1 在公关中募集的信号……阅读更多»未折叠蛋白反应和激活转录因子 2 在 β-葡聚糖产生的 il23a 反式激活中的磷酸化。发布时间:8 月, 2014 摘要:目前关于IL-23产生调控的观点主要集中在NF-κB联合其他转录因子对编码IL-23 p19的基因il23a的调控。 CHOP、XBP1、AP1、SMAD、C/EBPβ 和 CREB ​​参与了对 LPS 的反应……阅读更多 »KMTase Set7/9 是基因毒性应激时 E2F1 活性的关键调节因子。发表时间:2014 年 8 月摘要:在近年来赖氨酸甲基转移酶 Set7/9 ((Su(var)-3-9, Enhancer-of-Zeste, Trithorax) domain containing protein 7/9) 已成为不同 tra 的重要调节因子铭文因素。在这项研究中,我们报告了一个新功能……阅读更多»着丝粒的组蛋白变异组成受细胞周期中的中心异染色质状态控制。发表时间:2014 年 8 月摘要:正确的染色体分离需要着丝粒处独特的染色质环境和在他们附近。在这里,我们解决了如何在中心异染色质 (PHC) 处控制典型 H2A 和 H2A.Z 组蛋白变体的沉积。其中...阅读更多»表观遗传学和达尔文雀的进化。发表时间:2014 年 7 月摘要:进化分子基础的主流理论涉及基因突变,这些突变最终会产生可遗传的表型变异,而自然选择会在这些变异上发挥作用。然而,表型变异的表观遗传跨代遗传……阅读更多»小孢子重编程胚胎发生过程中组蛋白甲基化和乙酰化的变化与 Bn HKMT 和 Bn HAT 表达同时发生离子,并且与欧洲油菜的细胞全能性、增殖和分化相关。发布时间:2014 年 7 月摘要:为了应对压力处理,小孢子可以重新编程成为全能细胞,这些细胞遵循胚胎发生途径,产生单倍体和双单倍体胚胎,这些胚胎是植物育种中重要的生物技术工具。最近的研究……阅读更多 »神经元 3D 染色质组织的缺失会导致与血清素功能障碍相关的转录和行为缺陷。发表时间:2014 年 7 月摘要:神经元细胞核的内部是一个高度组织化的三维 (3D) 结构,其中区域线性相隔数百万个碱基的基因组建立了具有特殊功能的子结构。研究神经元 chr...阅读更多 »基于慢病毒载体的细胞融合活性非破坏性监测方法的开发。发布时间:2014 年 7 月摘要:细胞间融合可以通过 endo 进行量化分别具有潜在报告基因/蛋白质和这些基因/蛋白质激活剂的翼受体和供体细胞。实现这一目标的一种方法是使用二分体慢病毒载体 (LV)-bas...阅读更多 » Bye1 转录因子的 PHD 和 TFIIS 样域决定其多价基因组分布。发布时间:2014 年 7 月摘要:旁路Ess1 (Bye1) 蛋白是一种假定的酿酒酵母转录因子,与人类癌症相关的 PHF3/DIDO 蛋白家族同源。 Bye1 包含一个植物同源结构域 (PHD) 和一个类似 TFIIS 的结构域。 Bye1 PHD finger interac...阅读更多»产前暴露于 BPA 会改变大鼠乳腺的表观基因组并增加肿瘤发展的倾向。发表时间:2014 年 7 月摘要:暴露于环境雌激素(异种雌激素)可能在过去 50 年在欧洲和美国观察到的乳腺癌发病率增加。异雌激素双酚A(BPA) leaches from plastic food/b...阅读更多»MYC 与 trithorax 蛋白 ASH2L 的相互作用通过调节 H3K27 修饰促进基因转录。发表时间:2014 年 7 月摘要:大约 30,000 个人类基因的适当表达需要多层控制。癌蛋白 MYC 是一种转录调节因子,有助于许多已确定的控制机制,包括染色质、RN 的调节……阅读更多 » 胚胎干细胞 DNA 复制过程中参与表观遗传传递的大型蛋白质网络的鉴定。已发表: 2014 年 7 月摘要:胚胎干细胞 (ESC) 的多能性由转录活动和染色质内高度组织的染色质修饰复合物维持。尽管很多努力都集中在识别基因组结合位点上,但很少有人知道……阅读更多»启动子甲基化的全基因组筛选可识别饮食诱导的肥胖小鼠中的新标记。发布时间:201 年 7 月4摘要: 目的:研究全基因组启动子甲基化和基因表达,以鉴定肥胖的甲基化标志物。方法:使用高脂肪、饮食诱导的肥胖小鼠模型,我们进行了全面的 DNA 甲基化教授……阅读更多 »人​​类 7 号染色体高阶染色质组织背景下节段重复的分布。发布时间:2014 年 6 月摘要:背景:片段重复 (SD) 沿染色体分布不均匀。这种对 SD 插入的偏向易感性的原因知之甚少。 SDs 的积累与基因组不稳定性的增加有关,这导致……阅读更多»PADI4 对 DNMT3A 的瓜氨酸化调节其稳定性并控制 DNA 甲基化。发表时间:2014 年 6 月摘要:DNA 甲基化是哺乳动物的一种重要表观遗传修饰,具有重要作用在发育和疾病中。从头 DNA 甲基转移酶建立特定的 DNA 甲基化模式基因组内的区域通过保留便便的机制……阅读更多»对父母及其杂种的叶片甲基化组的分析为 Populus deltoides 的杂种活力提供了新的见解发表时间:2014 年 6 月摘要:背景具有杂种优势/杂种优势的植物比其亲本表现更好在许多特征中。然而,杂种优势背后的生物学机制仍不清楚。为了研究 DNA 甲基化对杂种优势的重要性,综合……阅读更多»暴露于海坎酮会改变曼氏血吸虫中特定基因功能和特定重复序列周围的染色质结构发表时间:2014 年 6 月摘要:曼氏血吸虫是一种寄生扁形动物,可导致肠道血吸虫病(或血吸虫病),一种影响全世界 6700 万人并造成重大经济负担的疾病。 The schistosomicides hycanthone, and its late...阅读更多H2AK119u1 在 PRC2 Recruitment 中的 le。发布时间:2014 年 6 月摘要:主要多梳组 (PcG) 复合体 PRC1 和 PRC2 被招募到脊椎动物细胞中目标位点的机制尚不清楚。基于最近确定 DNA 甲基化之间相互关系的研究...阅读更多»5-羧基胞嘧啶的瞬时积累表明活性去甲基化参与神经干细胞谱系规范。发表时间:2014 年 6 月摘要:5-甲基胞嘧啶 (5mC) 是一种表观遗传修饰,涉及分化过程中基因活性的调节。 Tet 双加氧酶将 5mC 氧化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC)、5-甲酰基胞嘧啶 (5fC) 和 5-羧基胞嘧啶 (5caC)。 5fC 和……阅读更多 »BET 溴结构域蛋白在去势抵抗性前列腺癌中的治疗靶向。发表时间:2014 年 6 月摘要:发生转移性去势抵抗性前列腺癌 (CRPC) 的男性总是死于该疾病。临雄激素消融治疗后向 CRPC 的退化主要是由失调的雄激素受体 (AR) 信号驱动的。尽管 suc...阅读更多»RNAi 介导的基因沉默在斑马鱼中由聚合转录触发。发布时间:2014 年 6 月摘要:基于 RNAi 的策略诱导基因沉默通常用于许多模式生物,但尚未广泛用于斑马鱼。我们发现在斑马鱼胚胎中引入含有会聚转录单位的转基因...阅读更多 »变体 PRC1 复合体依赖性 H2A 泛素化驱动 PRC2 招募和多梳结构域形成。发表时间:2014 年 6 月摘要:多梳抑制复合物 PRC1 和 PRC1 固有的染色质修饰活动PRC2 在基因调控、细胞分化和发育中发挥重要作用。然而,这些复合物识别其靶标的机制……阅读更多»肛门鉴定的精原细胞瘤和胚胎癌足迹生殖细胞癌细胞系的综合全基因组表观遗传和表达谱分析。发表时间:2014 年 6 月摘要:背景:起源于原始生殖细胞/生殖细胞,并通过称为原位癌 (CIS) 的前体病变发展,生殖细胞癌 ( GCC) 是年轻男性中最常见的癌症,分为精原细胞瘤 (SE) 和非精原细胞瘤 (NS)。 ...阅读更多 »Ezh2 调节 T-bet 的转录和翻译后表达,并促进介导小鼠再生障碍性贫血的 Th1 细胞反应。发表时间:2014 年 6 月摘要:获得性再生障碍性贫血 (AA) 是一种可能致命的骨髓 (BM) 衰竭综合征.产生 IFN-γ 的 Th1 CD4(+) T 细胞介导造血细胞的免疫破坏,它们是发病机制的核心。然而,分子甚至...阅读更多»DNMT3L 促进产后精原细胞祖细胞的静止。发表时间:2014 年 6 月摘要:成体干细胞处于静止状态的能力是对于防止干细胞库过早耗尽至关重要。然而,调节精原干细胞静止的内在表观遗传因素在很大程度上是未知的。 H...阅读更多 »膜结合甲基转移酶复合物 VapA-VipC-VapB 指导真菌发育的表观遗传控制。发表时间:2014 年 5 月摘要:必须协调基因表达的表观遗传和转录控制以响应外部信号以促进替代性多细胞发育程式。膜相关三聚体复合物 VapA-VipC-VapB 控制信号 tr...阅读更多»静默诱导的 LncRNAs 触发 H4K20 三甲基化和转录沉默。发表时间:2014 年 5 月摘要:调控通路的复杂网络将转录与细胞生长和增殖。在这里,我们表明细胞静止通过促进组蛋白 H4 在赖氨酸 20 (H4K20me3) 的三甲基化来改变染色质结构。与 peric 相比……阅读更多 »核 ARRB1在前列腺癌中诱导假性缺氧和细胞代谢重编程发布时间:2014 年 5 月摘要:肿瘤细胞通过代谢重编程维持其高增殖率,细胞代谢从氧化磷酸化转变为有氧糖酵解,即使在正常氧气水平下也是如此。缺氧诱导因子 1A (HIF1A) 是一种……阅读更多 »LIM 结构域蛋白 nTRIP6 将介体复合物招募到 AP-1 调节的启动子。发布时间:2014 年 5 月摘要:几种 LIM 结构域蛋白调节转录。它们被认为通过其 LIM 蛋白质-蛋白质相互作用结构域作为转录共调节因子募集的适配器起作用。一个有趣的例子是 nTRIP6,核 isofor...阅读更多»妊娠晚期的睡眠片段化诱导雄性成年后代小鼠脂联素基因表达的代谢扰动和表观遗传变化。发表时间:2014 年 5 月摘要:睡眠片段化 (SF) 是一种常见的疾病之间的条件孕妇,尤其是妊娠晚期。妊娠扰动促进后代肥胖和代谢疾病风险的出现,很可能是通过表观遗传修饰……阅读更多 »一氧化氮诱导的神经元到神经胶质谱系的命运变化取决于神经祖细胞中的 NRSF/REST 功能。发表时间:5 月, 2014 摘要:中枢神经系统组织的退化通常发生在多发性硬化症 (MS) 和神经外伤等神经炎症期间。在这种情况下,神经干/祖细胞 (NPC) 种群被建议提供新的细胞来去除...阅读更多»树突状细胞发育需要组蛋白脱乙酰酶活性。发表时间:2014 年 5 月摘要:DC 从多能祖细胞 (MPP) 发育而来,它致力于 DC 限制的常见树突细胞祖细胞 (CDP)。 CDP 进一步分化为经典 DC (cDC) 和浆细胞样 DC (pDC)。在这里,我们研究了组蛋白 ace 的影响……阅读更多 »Myostatin R调节心脏的能量稳态并预防心力衰竭。发布时间:2014 年 5 月摘要:原理:肌肉生长抑制素是骨骼肌质量的主要负调节剂,可引发多种代谢变化,包括增强胰岛素敏感性。然而,肌肉生长抑制素在心脏中的功能几乎不为人所知,尽管它是上调的……阅读更多»依赖于陷阱的组蛋白乙酰化专门调节细胞周期基因转录以控制神经祖细胞的命运决定。发表时间:2014 年 5 月摘要:命运决定在神经祖细胞通过多种途径协调,组蛋白乙酰化在这些决定中的作用被归因于促进基因激活的一般功能。在这里,我们表明组蛋白乙酰转移……阅读更多 »雌激素受体配体通过小鼠的非经典雌激素受体/肝 X 受体通路改善脂肪肝。发表时间:2014 年 5 月摘要:未标记:肝 X 受体 (LXR) 激活刺激抑制肝脏中甘油三酯 (TG) 的积累。多项证据表明雌二醇 17β (E2) 可降低肝脏中的 TG 水平;然而,E2 效应的分子机制……阅读更多 »使用小鼠体外受精模型来了解健康和疾病假设的发展起源。发表时间:2014 年 5 月摘要:健康和疾病的发展起源假设认为在发育的关键时期,体内平衡的改变会使个体容易患上成人期慢性疾病,例如糖尿病和代谢综合征。它仍然是……阅读更多»IL-13Rα2 介导 PNR 诱导的 ERα 阴性乳腺癌迁移和转移。发表时间:2014 年 4 月摘要:新出现的证据表明光感受器细胞特异性核受体 (PNR/NR2E3) 是一种孤儿核受体激素受体,对人类乳腺癌。 PNR 被证明是 ERα 阳性乳腺中雌激素受体-α (ERα) 的转录激活剂 ...阅读更多»由新型混合维甲酸-HDAC 抑制剂 MC2392 触发的急性髓性白血病细胞的背景选择性死亡。发布时间:2014 年 4 月摘要:HDAC 抑制剂 (HDACi) 在临床上广泛用于使致瘤细胞敏感,以便与其他抗癌化合物一起治疗。 HDACi 的主要缺点是广泛抑制过多的含 HDAC 复合物。在急性早发性骨髓瘤中...阅读更多 »LSD1 神经特异性选择性剪接控制癫痫小鼠模型中的神经元兴奋性。发布时间:2014 年 4 月摘要:大脑中的选择性剪接是动态的,有助于适应性变化对刺激的反应。赖氨酸特异性去甲基化酶 1 (LSD1/KDM1A) 是一种普遍表达的组蛋白 H3Lys4 去甲基化酶,可作为转录共抑制因子……阅读更多 »远缘硬骨鱼类的比较表观基因组学可识别在脊椎动物系统发育期活跃的保守顺式调节节点.发布时间:2014年4月A摘要:自 19 世纪冯贝尔的表述以来,个体发育和系统发育之间的复杂关系一直是人们关注和争论的主题。胚胎发生从进化枝的一般特征发展到物种的经典概念……阅读更多 »TAL 效应介导的基因组可视化 (TGV)。发表时间:2014 年 4 月摘要:细胞核内染色质的三维重塑被认为是基因组调控。染色体位点活体成像的最新技术进展开始探索 ch 运动的生物学作用……阅读更多»人类内源性 microRNA 的差异 RISC 关联预测了它们的抑制潜力。发表时间:2014 年 4 月摘要:以前假设microRNA (miRNA) 的普遍高稳定性反映了它们与 Argonaute (Ago) 蛋白的紧密联系,Argonaute (Ago) 蛋白是 RNA 诱导的沉默复合物 (RISC) 的重要组成部分。然而,最近的数据表明。..阅读更多 »叶酸刺激神经干细胞增殖与 PI3K/Akt/CREB ​​的甲基化谱改变有关。发表时间:2014 年 4 月摘要:神经系统的发育和修复需要神经干细胞 (NSC) 的增殖. NSC 体外扩增是使用 NSC 移植疗法治疗神经退行性疾病的必要步骤。叶酸 (FA) h...阅读更多 »A 型流感病毒感染后 ERVWE1 基因座的转录去抑制。发表时间:2014 年 4 月摘要:未标记:Syncytin-1,一种由 W 家族内源性逆转录病毒编码的融合蛋白 ( HERV-W) 元件 (ERVWE1),在胎盘的合体滋养层中表达。该基因座在成人组织中被转录抑制……阅读更多 »CSR-1 RNA 干扰通路对转录景观的全球影响。发表时间:2014 年 4 月摘要:Argonaute 蛋白及其小 RNA 辅助因子短于已知干扰 RNA 在转录和转录后水平抑制基因表达。在秀丽隐杆线虫中,Argonaute CSR-1 结合数以千计的内源性 siRNA...阅读更多 »骨髓肿瘤中持续的 STAT5 激活将 p53 招募到基因调控中。发表时间:2014 年 3 月摘要:STAT(信号转导和转录激活因子)转录因子是在大多数造血系统癌症中组成性激活。我们之前确定了一个目标基因,LPP/miR-28(LIM 域包含首选易位伙伴在……阅读更多»过度表达的同源框 B9 通过转化神经胶质瘤中的生长因子-β1 来调节致癌活性。发布时间:2014 年 3 月摘要:神经胶质瘤是中枢神经系统肿瘤相关死亡的主要原因。迄今为止,神经胶质瘤形成的机制仍然难以捉摸。同源框 B9 (HOXB9) 在基因表达和细胞存活的调节中起着至关重要的作用,但我……阅读更多 »An增加MECP2 剂量中的酶会损害神经管形成。发布时间:2014 年 3 月摘要:表观遗传机制是塑造中枢神经系统 (CNS) 活动的基础。甲基 CpG 结合蛋白 2 (MECP2) 作为甲基化 DNA 和负责分化程序的转录效应子之间的桥梁……阅读更多 »结直肠癌中的钙敏感受体沉默与组蛋白 3 的启动子高甲基化和乙酰化缺失有关。发表时间:2014 年 3 月摘要:钙敏感受体 (CaSR) 被认为可介导钙在结肠中的抗增殖作用。然而,在结直肠癌 (CRC) 中,CaSR 的表达被沉默,导致其丢失的潜在机制很差……阅读更多 »急性髓性白血病致癌蛋白的免疫逃避。发表时间:2014 年 3 月摘要:PML-RARA和 AML1-ETO 是重要的致癌融合蛋白,在向急性骨髓转化中起着核心作用id 白血病 (AML)。这些融合蛋白是否使肿瘤细胞具有免疫逃避特性尚不清楚。我们在这里展示 ...阅读更多 »Polycomb 结合先于 Avp 增强子的早期应激反应 DNA 甲基化。发表时间:2014 年 3 月摘要:小鼠的早期应激 (ELS) 导致下游 Avp 增强子持续低甲基化,随后过度表达下丘脑 Avp 和应激反应增加。存在导致 Avp 增强子甲基化的事件序列……阅读更多»过氧化物酶体增殖物激活受体 γ 和 C/EBPα 通过辅助加载协同激活关键代谢脂肪细胞基因。发表时间:2014 年 3 月摘要:过氧化物酶体增殖物激活受体 γ ( PPARγ) 和 CCAAT/增强子结合蛋白 α (C/EBPα) 是脂肪生成的关键激活剂。它们相互诱导彼此的表达,据报道在……阅读更多»H3K2成核原理胚胎发育过程中的 7 甲基化。发表时间:2014 年 3 月摘要:在胚胎发育过程中,细胞身份和谱系定型的维持需要 Polycomb 组 PRC2 复合物,该复合物催化组蛋白 H3 赖氨酸 27 三甲基化 (H3K27me3)。然而,这一规定的发展起源是你……阅读更多»在芸苔属物种的进化过程中,转座子对 E2F 转录因子结合位点的广泛扩增。发表时间:2014 年 3 月摘要:转座因子 (TEs) 是基因组进化的主要参与者.它们运动的影响各不相同,从基因敲除到更微妙的影响,如基因表达的变化。最近表明,TE 可能含有转录因子……阅读更多 »前列腺癌的表观遗传学:组蛋白 H3K27me3 生物标志物在肿瘤周围组织中的分布。发表时间:2014 年 3 月摘要:前列腺癌是癌症的第二大常见原因,癌症死亡的第六大原因在全世界的男性中(Ferlay 等人,2010 年)。遗传异常和突变是主要的致病因素,但表观遗传机制是 n...阅读更多»转录因子 Ikaros 对早期 B 细胞发育的阶段特异性控制。发表时间:2014 年 3 月摘要:转录因子 Ikaros 是 B 细胞发育的重要调节因子淋巴细胞生成。在这里,我们通过条件性失活 pro-B 细胞中编码 Ikaros (Ikzf1) 的基因来研究其 B 细胞特异性功能。 B 细胞发育在异常时被阻止……阅读更多 »围产期暴露于低剂量双酚 A 会影响大鼠的神经内分泌应激反应。发表时间:2014 年 3 月摘要:双酚 A (BPA) 是一种雌激素模拟内分泌干扰物。生命早期接触低剂量 BPA 会对动物的生殖和大脑生理产生长期影响。然而,人们对 BPA 对应激反应的影响知之甚少……阅读更多 »从 Rett 综合征患者中分化出的突变星形胶质细胞-特定的 iPSC 对野生型神经元有不良影响。发表时间:2014 年 2 月摘要:雷特综合征 (RTT) 的发病机制尚不清楚。 RTT 小鼠模型的研究表明星形胶质细胞在 RTT 发病机制中具有非细胞自主作用。然而,尚不清楚这是否也适用于人类 RTT 星形胶质细胞……阅读更多 »表观基因组改变定义了婴儿期致命的 CIMP 阳性室管膜瘤。发表时间:2014 年 2 月摘要:室管膜瘤是发生在整个神经系统中的常见儿童脑肿瘤, 但在儿科后脑中最常见。目前的标准疗法包括手术和放疗,但不包括细胞毒性化疗,因为它没有进一步……阅读更多 »EZH2 的药理学抑制作为胚胎 RM 的一种有前途的分化疗法发布时间:2014 年 2 月摘要:背景胚胎横纹肌肉瘤 (RMS) 是一种儿科软-源自肌原性前体的组织肉瘤,其特征是 g局部病变患者预后良好。相反,转移性肿瘤经常复发,导致……阅读更多»内源性 VEGF-A 的表观遗传上调减少小鼠心肌梗塞面积。发表时间:2014 年 2 月摘要:\"表观遗传疗法”改变靶向染色质的表观遗传状态并修改表达内源性治疗基因。在这项研究中,我们使用慢病毒在体内将小发夹 RNA (shRNA) 递送到小鼠梗塞模型的心脏中……阅读更多 »小鼠长期接触甲基苯丙胺会影响后代的行为和海马 DNA 甲基化。发布时间:二月, 2014 摘要:青壮年和育龄妇女滥用甲基苯丙胺 (METH) 的比例很高,因此确定甲基苯丙胺暴露对后代的长期影响势在必行。我们假设父母接触 METH 会调节后代……阅读更多»一种新的基于显微镜的高通量筛选方法来识别tify 调节全局组蛋白修饰水平的蛋白质。发布时间:2014 年 2 月摘要:组蛋白的翻译后修饰在真核生物基因表达和染色质结构的调节中起着重要作用。染色质因子沉积(写入)和去除(擦除)组蛋白标记之间的平衡调节...阅读更多»赖氨酸特异性脱甲基酶 1 调节滋养层干细胞的分化开始和迁移。发表时间:2014 年 1 月摘要:干细胞的繁殖和分化种群受到严格监管,以便在维持干细胞库的同时为组织形成提供足够的细胞数量。哺乳动物胎盘的胚胎部分是由分化产生的……阅读更多 »MeCP2 与 GAD1 和 RELN 启动子的结合增加可能由自闭症谱系障碍 (ASD) 小脑中 5-hmC 的富集介导。发布时间:2014 年 1 月摘要: 自闭症谱系障碍 (ASD) 是一种神经发育al 以与改变的社交互动/交流以及受限和重复行为相关的症状为特征的障碍。除了遗传风险外,表观遗传机制(包括……阅读更多 »SUPT6H 通过多种表观基因组机制控制雌激素受体活性和细胞分化。发表时间:2014 年 1 月摘要:雌激素受体α (ERα) 是导管的中央转录调节因子乳腺上皮谱系规范,是人类乳腺癌的重要预后标志物。尽管抗雌激素疗法最初效果很好……阅读更多»通过改进的 ChIP-qPCR 和 (h) 确定肝细胞核因子 4α 缺陷小鼠肝脏表观遗传特征的改变MeDIP-qPCR 检测。发布时间:2014 年 1 月摘要:肝细胞核因子 4α (HNF4α) 是一种富含肝脏的转录因子,对肝脏发育和功能至关重要。在肝细胞​​中,HNF4α 调节大量对 nu 重要的基因trient/xenobiotic metabolism and cell differentiati...阅读更多»过氧化物酶体增殖物激活受体 γ 通过功能不同的增强子类调节参与胰岛素/胰岛素样生长因子信号传导和脂质代谢的基因。发表时间:2014 年 1 月摘要:核受体过氧化物酶体增殖物激活受体 (PPAR) 是一种转录因子,其表达在脂肪形成过程中被诱导,并且是获得和控制成熟脂肪细胞功能所必需的。事实上,PPAR 诱导……阅读更多 »泛组蛋白去甲基化酶抑制剂同时靶向 Jumonji C 和赖氨酸特异性去甲基化酶显示出高抗癌活性。发表时间:2014 年 1 月摘要:在前列腺癌中,两种不同类型的组蛋白赖氨酸去甲基化酶 (KDM), LSD1/KDM1 和 JMJD2/KDM4 与雄激素受体共表达和共定位。我们设计并合成了混合 LSD1/JmjC 或\"泛 KDM”抑制剂 1-6,通过偶联……阅读更多 »静止的肝星状细胞通过 TLR3 在功能上促进肝脏先天免疫反应。发布时间:2014 年 1 月摘要:Toll 样受体 3 (TLR3) 是一种病原体模式识别受体,在先天免疫中起着关键作用。 TLR3 信号在肝脏中具有多种功能,无论是在健康还是在疾病中。在这里,我们报告 TLR3 由静止的肝细胞表达……阅读更多 »血液恶性肿瘤中替代 AWT1 启动子的超甲基化是急性髓性白血病的高度特异性标志物,尽管表达水平很高。发表时间:2014 年 1 月摘要:背景:Wilms 肿瘤 1 (WT1) 在许多癌症中相对于正常细胞过度表达,并且根据细胞环境具有肿瘤抑制或致癌作用。该基因与许多选择性剪接的转录有关……阅读更多»H19 lncRNA 通过招募 MBD1 控制印记基因网络的基因表达。发布时间:2013 年 12 月摘要:H19 基因控制印记基因网络 (IGN) 中多个基因的表达,参与胚胎的生长控制。然而,这种控制的潜在机制仍然难以捉摸。在这里,我们确定了甲基-CpG 结合 ...阅读更多 »HDAC 抑制剂赋予前列腺干细胞样细胞放射敏感性。发表时间:2013 年 12 月摘要:背景:放射疗法可以有效治疗前列腺癌,但放射复发肿瘤确实会发展.考虑到前列腺癌的异质性,我们假设原始干细胞样细胞可能构成抗辐射裂隙……阅读更多 »ZRF1 控制视黄酸途径并调节急性髓性白血病的致白血病潜力。发表时间:2013 年 12 月摘要:急性髓性白血病(AML) 通常与表观遗传异常和基因转录失调有关,这会导致异常细胞增殖和未分化前体细胞的积累。 ZRF1,最近表征的表观基因...阅读更多 »全基因组分析肝肿瘤中妊娠期砷暴露引起的 DNA 甲基化变化。发表时间:2013 年 12 月摘要:已知无机砷是一种人类致癌物。以前的研究报告说,DNA 甲基化变化与砷诱导的致癌作用有关,因此,砷诱导的肿瘤特有的 DNA 甲基化变化将 b...阅读更多»EZH2 在地幔中 HOX 基因的表观遗传沉默中的关键作用细胞淋巴瘤。发布时间:2013 年 12 月摘要:染色质修饰因子 EZH2 过表达,与套细胞淋巴瘤 (MCL) 的不良预后相关。最近,我们证明了与慢性淋巴细胞白血病 (CLL) 相比,MCL 中 HOX 基因的优先 DNA 甲基化,尽管 t...阅读更多 »c9FTD/ALS 中 C9orf72 基因表达减少是由组蛋白三甲基化引起的,这是一种可在血液中检测到的表观遗传事件。发表时间:2013年12月摘要:在在 C9orf72 基因中携带 (GGGGCC) 扩展重复序列的个体代表了很大一部分患有肌萎缩侧索硬化症 (ALS) 和额颞叶痴呆 (FTD) 的患者。阐明这些扩展的重复序列如何导致\"c9FT...阅读更多 »EpCAM 调节的骨形态发生蛋白基因家族在复发性子宫内膜癌中的启动子低甲基化。发表时间:2013 年 11 月摘要:目的:启动子甲基化的表观遗传调控在肿瘤发生中起着关键作用。我们的目标是研究是否改变了与致癌信号相关的 DNA 甲基化特征描述了预测子宫内膜的生物标志物可以……阅读更多»多梳蛋白 Ezh2 调节 CD4(+) T 辅助 1 型和 2 型细胞的分化和可塑性。发表: 2013 年 11 月摘要:CD4(+) T 细胞遇到抗原后,极化细胞因子会诱导控制分化的主要调节因子的表达。组蛋白甲基亚基失活ansferase Ezh2 被发现可特异性增强 T 辅助细胞 1 (Th1) 和 Th2 ...阅读更多 »5-羟甲基胞嘧啶在早期猪胚胎发生过程中的动态重编程。发表时间:2013 年 11 月摘要:DNA 活性去甲基化是在猪受精卵中观察到的一种重要的表观遗传现象, 但其分子起源尚不清楚。我们的结果表明,在第一个细胞周期中,5-甲基胞嘧啶 (5mC) 转化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC)……阅读更多 »血管紧张素原基因中 DNA 甲基化的动态 CCAAT/增强子结合蛋白相关变化。发表时间:11 月, 2013 年摘要:成人体细胞中维持 DNA 甲基化模式。然而,最近的研究结果表明,并非所有的甲基化模式都得以保留。我们证明刺激信号可以改变 CCAAT/增强子 bi 的 DNA 甲基化状态……阅读更多 »双相患者淋巴细胞中热休克因子和热休克蛋白表达的模式:HSP7 增加0-糖皮质激素受体异源复合物。发布时间:2013 年 11 月摘要:双相情感障碍 (BD) 是一种压力相关疾病,其特征是糖皮质激素受体 (GR) 信号传导发生改变。应激反应包括激活热休克因子 (HSF) 和随后的热休克蛋白 (HSP) 合成,从而调节 G...阅读更多 »荧光 TALEs 染色质动力学的实时可视化。发布时间:2013 年 11 月摘要:基因组的时空组织细胞核是调节基因组功能的新兴关键参与者。核组织动力学的实时成像将是揭示功能相关性和机制调节的突破……阅读更多»拟南芥中活性染色质标记与 RNA 指导的 DNA 甲基化之间的相互作用。发布时间:2013 年 11 月摘要:DNA 甲基化是一种表观遗传学与转座因子和蛋白质编码基因的转录抑制相关的标记。相反,转录iptionally active regulatory regions are strongly correlated with histone 3 lysine 4 di-...阅读更多»The Elongin Complex Antagonizes the Chromatin Factor Corto for Vein versus Intervein Cell Identity in Drosophila Wings.Published: October, 2013Abstract: Drosophila wings mainly consistent of two细胞类型、静脉和静脉间细胞。两种命运的获得取决于受多种信号通路控制的基因的特定表达。将信号转化为...的核机制阅读更多»热空气的靶向破坏导致同源异型转化和基因去抑制。发表时间:2013 年 10 月摘要:长链非编码 RNA (lncRNA) 被认为是基因表达的普遍调节因子,但其后果体内 lncRNA 失活率大多是未知的。在这里,我们表明靶向删除小鼠 Hotair lncRNA 会导致 h...阅读更多»富马酸二甲酯调节星形胶质细胞中组蛋白去乙酰化酶的表达。已发表:October,2013 年摘要:我们之前表明,富马酸二甲酯 (DMF) 可减少星形胶质细胞的炎症激活,涉及转录因子 Nrf2 的激活。然而,没有检查导致 Nrf2 激活的途径。我们现在表明 DMF 修改 expr...阅读更多»在两阶段肝癌发生模型中,胡椒基丁醚处理的小鼠肝脏的全局 DNA 甲基化筛选。发表时间:2013 年 10 月摘要:破坏性表观遗传基因控制已被证明参与致癌作用。为了识别胡椒基丁醚 (PBO) 诱导的肝癌发生中的关键分子,我们使用非新的 CpG 岛 (CGI) 微阵列搜索了高甲基化基因……阅读更多 »多梳基因和三胸基因的联合调节使 β 细胞复制恢复活力。发布时间:10 月, 2013 摘要:功能性 β 细胞质量不足是 1 型和 2 型糖尿病的基础。 β 细胞生长和再生也通过未完全了解的机制随着年龄的增长而减少了。 zeste 同系物 2 (EZH2) 增强子的年龄依赖性缺失可防止……阅读更多 »Epstein-Barr 病毒介导的 B 细胞转化诱导与增殖无关的全局染色质变化。发表时间:2013 年 10 月摘要:Epstein-Barr病毒 (EBV) 感染并转化人原代 B 细胞,诱导无限增殖。为了研究染色质机制在 EBV 介导的静息 B 细胞转化过程中的潜在参与,我们进行了一项...阅读更多»FSHD 肌营养不良症区域基因 1 结合 Suv4-20h1 组蛋白甲基转移酶并损害肌生成发布时间:2013 年 10 月摘要:面肩肱肌肉肌营养不良症 (FSHD) 是一种具有强烈表观遗传成分的常染色体显性遗传性肌病。它与导致附近基因过度表达的大卫星重复序列的删除有关。其中,我们专注于……阅读更多»三胸组蛋白 Kismet 和 ASH1 促进 H3K36 二甲基亚胺离子来抵消果蝇中的 Polycomb 组抑制。发布时间:2013 年 10 月摘要:Polycomb 组阻遏物和 trithorax 组激活剂的成员通过修饰核小体组蛋白或重塑染色质来维持转录的可遗传状态。尽管在定义 bioc 方面取得了巨大进展……阅读更多»全基因组 shRNA 筛选以确定介导小鼠胚胎干细胞中 Gata6 抑制的因素。发布时间:2013 年 10 月摘要:全基因组汇集 shRNA 文库在损失中的使用组织培养模型中的功能筛选提供了一种有效的方法来识别作用于感兴趣途径的新因子。胚胎干细胞 (ESC) 提供了一个独特的机会来 s...阅读更多 »转录终止和嵌合 RNA 的形成由拟南芥 FPA 控制。发表时间:2013 年 10 月摘要:替代裂解和聚腺苷酸化影响 mRNA 的编码和调节潜能以及在哪里特拉nscription 终止发生。虽然广泛存在,但鲜为人知的是该过程的调节剂。拟南芥蛋白 FPA 是一种 ra...阅读更多 »Lamin A/C 启动子相互作用指定染色质状态依赖性转录结果。发布时间:2013 年 10 月摘要:核层与真核细胞核的组织有关。核纤层蛋白与基因组的关联通过大染色质结构域发生,主要包括但不限于抑制基因。核纤层蛋白如何与...阅读更多 »拟南芥开花时间调控中不同组蛋白甲基化的组合功能。发表时间:2013 年 9 月摘要:拟南芥中的先前研究已经确定了几种组蛋白甲基化酶,包括拟南芥 TRITHORAX1 (ATX1)/SET DOMAIN GROUP 27 (SDG27), ATX2/SDG30, LSD1-LIKE1 (LDL1), LDL2, SDG8, SDG25, and CURLY LEAF (CLF)/SDG1, as regu...阅读更多 »Histone deacetylase complex1 expression level 滴定拟南芥中的植物生长和脱落酸敏感性。发布时间:2013 年 9 月摘要:组蛋白去乙酰化在植物胁迫反应期间调节基因表达,因此是植物胁迫敏感性表观遗传操作的一个有趣目标。不幸的是,核心酶(组蛋白脱乙酰酶)的过度表达……阅读更多 »miR-1/133a 簇通过在胚胎心脏发育过程中调节心肌素水平来协同指定心肌生成谱系。发表时间:2013 年 9 月摘要:miRNA 是指导许多发育过程的小 RNA processes by posttranscriptional regulation of protein-coding genes. We uncovered a new role for miR-1-1/133a-2 and miR-1-2/133a-1 clusters in the specification of embryonic cardiomyocytes allowing...阅读更多»长范围表观遗传沉默是一种跨物种机制,通过覆盖正常细胞的染色质结构域导致癌症特异性失调。发表时间:2013 年 8 月摘要行为:DNA 甲基化和染色质重塑经常与癌发生相关基因的沉默有关。远程表观遗传沉默 (LRES) 是一种基因失活机制,它会影响多个连续的 CpG 岛和 ha...阅读更多 »主要银屑病易感基因座的深入表征可识别 HLA-C 增强子元件内的候选易感等位基因。发布时间:2013 年 8 月摘要:银屑病是一种免疫介导的皮肤病,具有复杂的遗传特征。尽管全基因组关联扫描 (GWAS) 已经确定了 36 个疾病易感区域,但超过 50% 的遗传变异可归因于……阅读更多和 Tlr6 基因启动子在雌性 C57BL/6 小鼠的肝脏而非脾脏中。发表时间:2013 年 8 月摘要:通过 DNA 甲基化对宿主基因进行表观遗传重编程是我越来越多的人认为它对多种传染病的结果至关重要,但尚无关于疟疾的信息。在这里,我们研究了血液阶段 mala 的影响……阅读更多 »CDK6 的激酶独立功能将细胞周期与肿瘤血管生成联系起来。发布时间:2013 年 8 月摘要:与其密切同系物 CDK4 相比,细胞周期激酶CDK6 在淋巴恶性肿瘤中高水平表达。在 p185(BCR-ABL+)B 型急性淋巴细胞白血病模型中,我们表明 CDK6 是转录复合物的一部分,可诱导……阅读更多 »维生素 C 诱导 Tet 依赖性 DNA 去甲基化和囊胚样状态ES 细胞。发布时间:2013 年 8 月摘要:DNA 甲基化是一种可遗传的表观遗传修饰,涉及基因沉默、印记和逆转录转座子的抑制。整体 DNA 去甲基化发生在早期胚胎和种系中,并且可能由 Tet(ten eleven t...阅读更多 »VAL 和 AtBMI1 介导H2Aub 启动拟南芥从胚胎生长到发芽后生长的转变。发布时间:2013 年 7 月摘要:植物 B3 域转录因子在调节种子发育方面具有重要作用,尤其是种子成熟和发芽 [1]。在 B3 因子中,AFL(ABSCISIC ACID INSENSITIVE3 [ABI3]、FUSCA3 [FUS3] 和 LEAFY COTYLEDON2 [...阅读更多 »牛皮癣皮肤间充质干细胞的 DNA 甲基化:表观遗传失调基因的鉴定。发表时间:2013 年 7 月摘要:背景:间充质干细胞 (MSCs) 可能参与免疫相关疾病的病理过程,包括牛皮癣,因为它们具有免疫调节和促血管生成作用。DNA 甲基化在调节中起着重要作用……阅读更多 »周围印迹染色质DIRAS3 调节长链非编码 RNA GNG12-AS1 的选择性剪接。发表时间:2013 年 7 月摘要:印记基因簇受长链非编码 RNA (lncRNA)、CCCTC 结合因子 (CTCF)介导的边界和DNA甲基化。 DIRAS3(也称为 ARH1 或 NOEY1)是一种印记基因,编码一种属于 RAS superfa 的蛋白质……阅读更多 »转基因和基因座依赖性印记揭示等位基因特异性染色体构象。发表时间:2013 年 7 月摘要:当定位到整合素 α-6 基因,一种 Hoxd9lacZ 报告基因转基因,在小鼠胚胎中显示出亲本印记。虽然父系等位基因的表达与相同转基因出现在...阅读更多»环境诱导原始生殖细胞和随后的生殖系的跨代表观遗传重编程。发表时间:2013 年 7 月摘要:许多环境因素(例如毒物)已被证明可以促进疾病和表型变异的表观遗传跨代遗传。跨代遗传需要改变表观遗传的种系传递……阅读更多 »传代技术s 和 ROCK 抑制剂对人类胚胎干细胞系的形态学和多能性标记基因表达产生可逆影响。发布时间:2013 年 7 月摘要:人类胚胎干细胞 (hESC) 因其在再生医学中的潜在用途而闻名,而且还用于处理敏感性。已经付出了很多努力来优化 hESC 的培养方法。已经表明,Rho-associ 的使用……阅读更多 »孕激素受体通过有利于 RNA 聚合酶 II 延伸的基因内结合位点诱导 bcl-x 表达。发表时间:2013 年 7 月摘要:类固醇受体通常被描述为通过结合调节转录靶向基因启动子。然而,全基因组研究表明,类固醇受体结合位点主要位于基因内区域。确定角色……阅读更多 »染色体 9p21 上 ANRIL 非编码 RNA 中的 Alu 元素通过基因网络的反式调节调节动脉粥样硬化细胞功能。发表时间:7 月,2013 年摘要:冠状动脉疾病的染色体 9p21 (Chr9p21) 位点已在全基因组关联的第一次浪潮中被确定,是当今已知的动脉粥样硬化的最强遗传因素。 Chr9p21 编码长链非编码 RNA (ncRNA) 和...阅读更多 »疾病相关生长因子和胚胎信号通路调节 6q23.2 冠心病位点 TCF21 表达的增强子。发表时间:2013 年 7 月摘要:冠状动脉疾病心脏病 (CHD) 是全世界发达国家和发展中国家死亡的主要原因。全基因组关联研究 (GWAS) 现已确定 46 个独立的冠心病易感位点,然而,生物学和...阅读更多»二价染色质标记体内小鼠胚胎种系中的发育调节基因。发布时间:2013 年 6 月摘要:发育调节基因在胚胎干细胞 (ESC) 中具有激活 (H3K4me3) 和抑制 (H3K27me3) 组蛋白修饰。这二价配置被认为可以将谱系承诺程序维持在平衡状态。然而...阅读更多 »破译神秘的基因组:水稻病原体 Fusarium fujikuroi 的全基因组分析揭示了次级代谢和新代谢物的复杂调节。发表时间:2013 年 6 月摘要:真菌 Fusarium fujikuroi 导致水稻\"坏苗”病以其产生赤霉素 (GA) 的能力而闻名,但它也以产生有害的霉菌毒素而闻名。然而,整个天然化合物库的遗传能力和……阅读更多»细菌、古细菌和酵母中 5-甲基胞苷 RNA 修饰的转录组范围映射揭示了古细菌 mRNA 中的 m5C。发布时间:2013 年 6 月摘要:The 5-甲基胞苷 (m(5)C) 在多种生物体的 tRNA 和 rRNA 分子中的存在是在 40 多年前首次观察到的。然而,由于使用……阅读更多»深度测序数据的综合分析确定了雌激素受体早期反应基因并将 ATAD3B 与乳腺癌的低生存率联系起来。发表时间:2013 年 6 月摘要:鉴定对细胞外信号有反应的基因可以表征病理生理学上至关重要的生物过程。深度测序技术提供了一种强大的方法来识别响应基因,这需要……阅读更多 »UHRF1 的串联 Tudor 和 PHD 域的多价组蛋白参与是 DNA 甲基化的表观遗传所必需的。发表时间:6 月, 2013 年摘要:组蛋白翻译后修饰主要通过与通常包含多个组蛋白结合域的效应蛋白相互作用来调节染色质结构和功能。虽然在表征 ind 方面取得了重大进展……阅读更多»人类外周血 mon 中 DNA 甲基化组的表征及其个体间变异cytes.Published: June, 2013Abstract: AIM: 外周血单核细胞 (PBMs) 在免疫反应中起着多重和关键的作用,PBMs 的异常与多种人类疾病有关。然而,PBM 中的 DNA 甲基化景观在很大程度上是未知的。在此 ...阅读更多 »大 LINE-1 驱动的反义 RNA 的表达与癌症中转移抑制基因 TFPI-2 的表观遗传沉默有关。发表时间:2013 年 5 月摘要:LINE-1 反转录转座子是大量的重复元素病毒起源,在正常细胞中通过表观遗传机制保持静止。 LINE-1 的激活经常发生在癌症中,可以使 LINE-1 动员,但也有退缩……阅读更多 »面肩肱型肌营养不良症区域基因 1 的过度表达导致生肌干细胞的原发性缺陷。发表时间:2013 年 5 月摘要:过度表达小鼠、青蛙和蠕虫中的面肩肱肌营养不良区域基因 1 (FRG1) 会导致肌肉萎缩眼部和血管异常。尽管如此,遵循 FRG1 过度表达并最终导致肌肉缺陷的机制......阅读更多 »丘脑控制小鼠新皮质区域形成。发表时间:2013 年 5 月摘要:哺乳动物新皮质在发育过程中经历了巨大的转变,从看似同质的神经上皮细胞形成一个复杂的结构,该结构沿切向分为离散区域。这个过程被认为是控制……阅读更多»维甲酸相关孤儿受体 β 的同种型指导视网膜无长突和水平中间神经元的分化。发表时间:2013 年 5 月摘要:无长突和水平中间神经元整合视觉信息,因为它通过视网膜从光感受器到神经节细胞。生成这些神经元间网络的早期步骤仍不清楚。在这里,我们展示了一个 disti……阅读更多 »甲基供体补充剂可阻止母体高脂肪 di 的不利影响等关于后代生理学。发表时间:2013 年 5 月摘要:母亲在怀孕期间摄入高脂肪饮食会增加后代肥胖的风险。使用小鼠模型,我们之前已经表明,母体摄入高脂肪 (60%) 饮食会导致 DNA 的整体和基因特异性减少……阅读更多 »肝脏 x 受体可防止小鼠发生前列腺上皮内瘤变. 发布时间:2013 年 5 月摘要:LXR(肝脏 X 受体)充当调节胆固醇摄取、储存和流出的\"传感器”蛋白。已知 LXR 信号转导影响不同细胞类型的增殖,包括人前列腺癌 (PCa) 细胞系。这项研究显示...阅读更多 »差异转录异构体在斑马鱼中使用前和后合子基因组激活。发布时间:2013 年 5 月摘要:背景:斑马鱼胚胎在第 10 个细胞周期激活合子基因组之前是转录沉默的。转录开始后是 cel涉及细胞物种形成和原肠胚形成的细胞和形态学变化。上一页...阅读更多 »昆虫赤拟谷盗中 DNA 甲基化的第一个证据:异染色质内 DNA 甲基化的环境调控。发表时间:2013 年 5 月摘要:DNA 甲基化已在许多真核生物,特别是脊椎动物中进行了研究,并与发育有关和表型变异。 DNA 甲基化在无脊椎动物中的作用知之甚少,尽管昆虫是……阅读更多 »Kdm5c/SMCX 组蛋白去甲基化酶调节启动子和增强子功能对组蛋白 H3K4 甲基化状态的平衡。发布时间:2013 年 4 月摘要:功能组织真核基因组与组蛋白甲基化的特定模式相关。基因组中的调控区域(例如增强子和启动子)在赖氨酸 4 (H3K4) 组蛋白 H3 的甲基化程度不同,但 ...阅读更多 »Lys 的口服生物利用化学探针甲基转移酶 EZH2 和 EZH1。发布时间:2013 年 4 月摘要:EZH2 或 EZH1 是多梳抑制复合物 2 的催化亚基,可催化组蛋白 H3 赖氨酸 27 (H3K27) 的甲基化。 H3K27 (H3K27me3) 的三甲基化是一种转录抑制性翻译后修饰。 Overex...阅读更多 »发育表观基因组学工具箱:早期斑马鱼胚胎的 ChIP-seq 和 MethylCap-seq 分析。发布时间:2013 年 4 月摘要:DNA 甲基化和组蛋白修饰的全基因组分析回答了许多关于基因如何发生变化的问题在全球范围内受到监管,以及它们的表观遗传构成是什么。然而,人们对早期这些标记的功能知之甚少……阅读更多 »在胚胎干细胞分化过程中,外胚层和中胚层的正确诱导需要 Utx。发表时间:2013 年 4 月摘要:胚胎发育需要染色质重塑以进行动态调节基因表达模式以确保沉默素g 多能转录因子和发育调节因子的激活。组蛋白去甲基化 H3K27me3...阅读更多»LXRα 激活的全基因组分析揭示了人类动脉粥样硬化泡沫细胞中新的转录网络。发表时间:2013 年 4 月摘要:氧固醇的生理水平升高是发生动脉粥样硬化和心血管疾病的主要危险因素疾病。载脂巨噬细胞,称为泡沫细胞,在动脉粥样硬化斑块的早期发展过程中很重要。至 p...阅读更多 »MAGEA1 癌症种系基因内的表观遗传层次结构:启动子 DNA 甲基化决定局部组蛋白修饰。发表时间:2013 年 3 月摘要:基因 MAGEA1 属于一组依赖 DNA 甲基化的人类种系特异性基因体细胞组织中的抑制。这些基因中有许多被称为癌种系 (CG) 基因,在多种肿瘤中去甲基化并被激活,...阅读更多 »天真多能性 is 与全球 DNA 低甲基化有关。发布时间:2013 年 3 月摘要:幼稚多能胚胎干细胞 (ESC) 和胚胎生殖细胞 (EGC) 分别来源于植入前外胚层和原始生殖细胞 (PGC)。我们调查了 ESC 和 EGC 之间是否存在差异,鉴于……阅读更多 »哺乳动物神经发生中 5-羟甲基胞嘧啶和染色质标记的动力学。发表时间:2013 年 2 月摘要:哺乳动物的 DNA 甲基化在生殖细胞和植入前发育过程中高度动态但在体细胞组织的发育过程中相对静止。 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC),由 Tet 氧化 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 产生...阅读更多 »通过组蛋白八聚体侧面 H3K122 的乙酰化调节转录。发布时间:2013 年 2 月摘要:组蛋白修饰是染色质功能的关键调节剂。然而,鲜为人知的是组蛋白修饰能在多大程度上影响对染色质的影响。在这里,我们讨论了组蛋白球状结构域内的修饰如何调节 ch...阅读更多 »肠上皮细胞中的 DNA 甲基化分析-细胞分离对基因表达和甲基化谱的影响。发布时间:2013 年 2 月摘要:背景:表观遗传特征具有高度细胞类型特异性。因此,所有表观遗传学研究都需要分离不同的细胞群。然而,迄今为止,关于分离方案是否可能会感染的信息很少……阅读更多 »DNA 甲基化介导的基因表达控制对于冠瘿瘤的发展至关重要。发表时间:2013 年 2 月摘要:冠冕瘤在整合强毒农杆菌的 T-DNA 进入植物基因组。 T-DNA 编码的致癌基因的表达会触发转化植物细胞的增殖和分化。皇冠 ga...阅读更多 »组蛋白赖氨酸三甲基化或乙酰化乳腺癌细胞系中的植物雌激素、雌激素或抗 HDAC 可调节乳化。发表时间:2013 年 2 月摘要:目的:据报道,异黄酮染料木黄酮、黄豆苷元和牛尿酚(黄豆苷元代谢物)与表观遗传修饰相互作用,特别是肿瘤的高甲基化抑制基因。本研究的目的是分析和理解……阅读更多»KLF4 和 ZEB2/SIP1 在调节 E-钙粘蛋白表达中的相互作用发表时间:2013 年 1 月摘要:E-钙粘蛋白表达在诱导时被 ZEB2/SIP1 抑制通过 KLF4。来自文献的独立数据表明,这两个转录因子可以在 E-cadherin 基因启动子的近端区域彼此紧密结合。 ...阅读更多 »小鼠胚胎中的染色质特征和逆转录转座子分析揭示了 RNA 对 LINE-1 的调节。发布时间:2013 年 1 月摘要:在发育过程中如何维持和逆转更具塑性的染色质状态尚不清楚温。异染色质介导的重复元件沉默发生在分化细胞中。在这里,我们使用了重复元素,包括反转录转座子,...阅读更多»碳氢化合物(喷气燃料 JP-8)诱导肥胖、生殖疾病和精子外突变的表观遗传跨代遗传发表时间:2013 年 1 月摘要:环境化合物已被证明可促进表观遗传疾病的跨代遗传。当前的研究旨在确定涉及喷气燃料 (JP-8) 的碳氢化合物混合物是否促进表观遗传跨代遗传...阅读更多 »塑料衍生的内分泌干扰物(BPA、DEHP 和 DBP)诱导肥胖、生殖疾病和生殖疾病的表观遗传跨代遗传精子 Epimutations 发布时间:2013 年 1 月摘要:已知环境化合物会在胎儿性腺发育期间的祖先暴露后促进后代 (F1–F3) 成人发病疾病的表观遗传跨代遗传前决心。当前的研究旨在 d...阅读更多 »恶性疟原虫 SURFIN(4.1) 的 N 末端片段是通过内质网转运至红细胞胞质溶胶所必需的。发表时间:2012 年 12 月摘要:恶性疟原虫 SURFIN是一种 I 型跨膜蛋白,与感染多种疟疾寄生虫的红细胞 (RBC) 表面表达的分子共享域,例如 P. falciparum PfEMP1,P. vivax VI...阅读更多 »表观遗传学脂肪组织干细胞神经源性分化过程中巢蛋白表达的调控。发布时间:2012 年 12 月摘要:脂肪组织来源的干细胞 (ASC) 因其易于获取、扩展潜力和分化能力而受到广泛关注。 ASCs 被认为具有分化成神经元的潜力。然而,机制……阅读更多»MeCP2 与活跃基因和 Accessib 中丰富的 5hmC 结合神经系统中的染色质。发布时间:2012 年 12 月摘要:神经元基因组中存在高水平的 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC),这表明解释 CNS 中 5hmC 的机制可能与胚胎干细胞中存在的机制不同。在这里,我们展示了 5hmC 的定量全基因组分析,...阅读更多»结直肠肿瘤和匹配的正常组织的比较全基因组 DNA 甲基化分析发表时间:2012 年 12 月摘要:结直肠癌 (CRC) 中经常发生异常 DNA 甲基化。在我们的研究中,我们应用全基因组 DNA 甲基化分析方法 MethylCap-seq 来绘制 24 个肿瘤中的差异甲基化区域 (DMR) 并匹配正常结肠 sam...阅读更多 »Ezh2 维持肌肉卫星细胞的关键阶段扩张但不调节终末分化。发表时间:2012 年 11 月摘要:组织生成和修复需要细胞命运限制的逐步过程,以确保成体干细胞分化及时和适当的方式。 Polycomb 组 (PcG) 蛋白和 H3K27me3 重新发挥了重要作用……阅读更多 »Ash2 通过稳定组蛋白甲基转移酶 Trr 作为蜕皮激素受体共激活剂。发布时间:2012 年 11 月摘要:蜕皮激素蜕皮激素触发染色质通过对基因调控很重要的组蛋白修饰进行改变。在激素激活时,蜕皮激素受体 (EcR) 与包含组蛋白 H3 甲基转移酶 trithorax 的 SET 结构域结合-...阅读更多 »低细胞数 ChIP-seq 的局限性和可能性。发表时间:2012 年 11 月摘要:摘要:背景:染色质免疫沉淀结合高通量 DNA 测序 (ChIP-seq) 可提供高分辨率的全基因组 DNA-蛋白质相互作用分析。然而,当前的标准方法需要丰富的起始材料……阅读更多 »SUMO 通路中的蛋白质组修饰和协同作用,以 DNA 修复为例。已发表:2012 年 11 月摘要:SUMO 对蛋白质的修饰影响了广泛的蛋白质底物。令人惊讶的是,虽然 SUMO 通路突变体表现出强烈的表型,但单个 SUMO 修饰的功能通常是神秘的,SUMO 化缺陷突变体与...阅读更多»小白菊内酯对肿瘤促进的抑制作用:p21 的表观遗传调节。发表时间:2012 年 11 月摘要:表皮肿瘤发生多步骤过程中的促进阶段是 NF-кB 依赖性、表观遗传调控和可逆的,因此是化学预防的合适目标。我们调查了 NF-кB 抑制剂、小白菊内酯目前是否……阅读更多 »丘脑衍生分子促进发育中皮质神经元的存活和树突生长。发表时间:2012 年 10 月摘要:哺乳动物新皮质由各种类型的神经元组成,这些神经元反映它的层状和面状结构。有人提出,不仅是内在的,而且还有传入的外在因素在……期间参与神经元分化阅读更多 »IL-23 在非小细胞肺癌中受化疗促进增殖、表观遗传调节和调节。发表时间:2012 年 10 月摘要:背景:IL-23 是IL-6 超家族在癌症中起着关键作用。目前对 IL-23 在非小细胞肺癌 (NSCLC) 中的作用知之甚少。方法:使用 RT-PCR 和染色质免疫沉淀 (ChIP) ...阅读更多 »基因表达调控的新伙伴:trithorax 和 polycomb corto 的增强子通过其染色质域与甲基化核糖体蛋白 l12 相互作用。发布时间:2012 年 10 月摘要:染色质结构域存在于许多染色质结构调节器中,其中大多数识别组蛋白上的甲基化赖氨酸。在这里,我们研究了黑腹果蝇蛋白 Corto 的染色域的作用。 Trithorax 的增强剂和 ...阅读更多 »非遗传毒性致癌物暴露会引起明确的变化在 5-hydroxymethylome 中。发表时间:2012 年 10 月摘要:摘要:背景:通过暴露于非遗传毒性致癌物诱发和促进肝癌与表观遗传扰动相吻合,包括 DNA 甲基化的特定变化。在这里,我们研究了 5-hydro 的全基因组动力学……阅读更多»人类 β 细胞转录组分析揭示了组织特异性、动态调节和在 2 型糖尿病中异常表达的 lncRNA。发布时间:2012 年 10 月摘要:一个重要的基因组的一部分被转录为长链非编码 RNA (lncRNA),其中一些已知可控制基因表达。然而,疾病相关组织中 lncRNA 的所有组成部分和调控尚未系统地……阅读更多 »序列变异和 DNA 甲基化联合缺失导致的拟南芥重组景观特征。发表时间:2012 年 10 月摘要:速率减数分裂交叉 (CO) 沿 c 变化很大染色体,导致物理距离和遗传距离之间的明显扭曲。这种变异背后的原因正在被揭开,DNA 序列和染色质状态有...阅读更多»表观遗传跨代遗传的乙烯菌核唑诱导小鼠成年发病和相关的精子表观基因组生物标志物。发表时间:2012 年 10 月摘要:内分泌干扰物乙烯菌核唑以前有已被证明可促进大鼠成年发病的表观遗传跨代遗传。当前的研究旨在调查乙烯菌核唑对...的跨代作用阅读更多»UHRF1 与甲基化 H3K9 的关联指导 DNA 甲基化的维持。发表时间:2012 年 9 月摘要:哺乳动物生物学的一个基本挑战是阐明连接 DNA 甲基化和组蛋白翻译后修饰的机制。人类 UHRF1(泛素样 PHD 和 RING 手指结构域包含 1)具有多个结构域 tha...阅读更多 »卡介苗通过单核细胞的表观遗传重编程诱导依赖 NOD2 的非特异性保护免受再感染。发表时间:2012 年 9 月摘要:先天免疫的适应性特征,最近被描述为\"训练有素的免疫”,已在植物中得到证实、无脊椎动物和老鼠,但还没有在人类身上。在这里,我们展示健康志愿者接种卡介苗 (BCG) 疫苗……阅读更多 »p53 独立调节 p21Waf1/Cip1 表达和 PRMT6 的衰老。发布时间:2012 年 9 月摘要:p21 是一种有效的细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂在促进 G1 细胞周期停滞和细胞衰老中发挥作用。与这一作用一致,p21 是几种肿瘤抑制因子和致癌基因的下游靶标,它被下调……阅读更多»ERG 和 FLI1 结合位点划定了 AML1-ETO 在急性髓系白血病中异常表观遗传调控的靶标。发布时间:9 月, 2012摘要:ERG与FLI1 是转录因子 ETS 家族的密切相关成员,已被确定为正常造血干细胞功能和维持的必需因子。在这里,全基因组分析显示 ER...阅读更多»H4K20me1 有助于下调线虫剂量补偿的 X 连锁基因发表时间:2012 年 9 月摘要:秀丽隐杆线虫剂量补偿复合物 (DCC) 均衡 X 染色体基因XO 雄性和 XX 雌雄同体之间的剂量通过双倍抑制雌雄同体中的 X 连锁基因表达。 DCC 定位于 ... 中的 X 染色体 阅读更多 »Tet2 在 CEBPα 诱导的前 B 细胞转分化过程中促进骨髓靶基因的去阻遏。发表时间:2012 年 9 月摘要:甲基胞嘧啶羟化酶 Tet2 与造血分化和突变时形成髓系恶性肿瘤。研究 Tet2 在骨髓细胞生成中作用的理想系统sis 是 CEBPα 诱导的前转分化...阅读更多 »杀虫剂和驱虫剂混合物(氯菊酯和避蚊胺)诱导疾病和精子 Epimutations 的表观遗传跨代遗传。发表时间:2012 年 9 月摘要:已知环境化合物可促进表观遗传跨代遗传疾病。当前的研究旨在确定\"杀虫剂混合物”(杀虫剂氯菊酯和驱虫剂 N,N-二乙基-间甲苯酰胺,避蚊胺)是否支持……阅读更多 »肝脏伤口愈合反应的多代表观遗传适应。已发表: 2012 年 9 月摘要:我们调查了祖先肝损伤是否会导致雄性大鼠肝伤口愈合的遗传重编程。我们发现肝损伤的历史与纤维化的表观遗传抑制适应的传播相对应……阅读更多»染色质可及性、p300 和组蛋白乙酰化定义了 acut 中的 PML-RARα 和 AML1-ETO 结合位点e 骨髓性白血病。发布时间:2012 年 8 月摘要:染色质可及性在造血过程中调节细胞类型特异性基因表达方面起着关键作用,但也有人认为在白血病发生过程中受到异常调节。要了解我们分析的致白血病染色质特征...阅读更多 »白色念珠菌感染通过单核细胞的功能重编程提供防止再感染的保护。发表时间:2012 年 8 月摘要:脊椎动物的免疫记忆通常完全归因于 T 和 B 细胞功能。最近有人提出,在初始感染暴露后增强和持续的先天免疫反应也可能提供保护以防止……阅读更多 »T 细胞的组蛋白乙酰化和 DNA 去甲基化导致间变性大细胞淋巴瘤样表型。发布时间:8 月, 2012摘要:背景。间变性大细胞淋巴瘤的一个特征是显着抑制 T 细胞表达 pr克尽管它的 T 细胞起源。这种 T 细胞表型下调的原因仍然未知。设计和...阅读更多 »人​​类 EKC/KEOPS 复合体被人类肿瘤抗原 PRAME 招募到 Cullin2 泛素连接酶。发表时间:2012 年 8 月摘要:人类肿瘤抗原 PRAME(黑色素瘤中优先表达的抗原)在肿瘤发生过程中经常过度表达和高 PRAME 水平与多种癌症的不良临床结果有关。然而,分子通路 ...阅读更多 »发育中的小鼠皮层板中的尖锐钙粘蛋白 6 基因表达边界划定了未来的功能区域边界。发表时间:2012 年 8 月摘要:哺乳动物大脑皮层可以切向细分为数十个功能区具有不同细胞结构和神经回路的区域;然而,这些区域边界是如何在发展过程中从遗传上详细阐述的,仍然是难以捉摸的。 ...阅读更多 »核仁素的相互作用h 核糖体 RNA 基因及其在 RNA 聚合酶 I 转录中的作用。发表时间:2012 年 8 月摘要:核仁素是一种多功能核仁蛋白,是体内核糖体 RNA 基因 (rRNA) 转录所必需的,但核仁素调节 RNA 聚合酶的机制I (RNAAPI) 转录还不是很清楚。核仁素耗尽...阅读更多 »非洲爪蟾胚胎的染色质免疫沉淀分析发表时间:2012 年 8 月摘要:染色质免疫沉淀 (ChIP) 是研究细胞核中表观遗传调控和转录因子结合事件的强大技术。它基于表位的免疫亲和捕获,这些表位已在 vi 中与基因组 DNA 交联……阅读更多»H3K4me3 组蛋白去甲基化酶 Fbxl10 是趋化因子表达、细胞形态和成纤维细胞代谢组的调节因子发表时间:2012 年 7 月摘要: Fbxl10 (Jhdm1b/Kdm2b) 是 JHDM (JmjC-domain-containing hist) 的一个保守且普遍表达的成员一个去甲基化酶)家族。 Fbxl10 与 H3K4me3 或 H3K36me2 的去甲基化有关,从而去除活性染色质标记和……阅读更多 »拟南芥属中密切相关物种之间转录组和表观遗传状态的比较。发布时间:2012 年 7 月摘要:表达水平差异基因的变化是影响植物表型的因素之一。除了受遗传控制外,基因表达还受 DNA 甲基化和组蛋白修饰等表观遗传过程的调节。 W...阅读更多 »Ezh2 基因占有率的动态变化是其参与神经干细胞自我更新和向少突胶质细胞分化的基础发布日期:2012 年 7 月摘要:背景:多梳组蛋白 Ezh2 是一种表观遗传抑制因子,最初发现它可以防止过早发生多能胚胎干细胞的分化。我们之前证明 Ezh2 也以多能表达...阅读更多 »锥体虫非经典线粒体外膜蛋白导入系统的重要新成分。发表时间:2012 年 7 月摘要:线粒体外膜蛋白 Tom40 是基本上所有真核生物中导入蛋白质的一般入口门。然而,锥体虫缺乏 Tom40,而是使用一种称为线粒体外层古老转位酶的蛋白质……阅读更多 »脱氧核糖核酸的动态羟甲基化标记分化相关增强子。发表时间:2012 年 6 月摘要:增强子是发育控制的转录调控区域,其活动通过组蛋白修饰或组蛋白变体沉积进行调节。在这项研究中,我们通过全基因组图谱显示新发现的脱氧核糖核酸……阅读更多»广泛的启动子高甲基化和低甲基化与慢性淋巴细胞白血病中异常的 microRNA 表达有关。发布时间:2012 年 6 月摘要:失调的 microRN(miRNA) 表达有助于造血系统恶性肿瘤的发病机制,包括慢性淋巴细胞白血病 (CLL)。然而,对导致异常 miRNA 转录控制的机制的理解是……阅读更多 »识别 PR-SET7 和 EZH2 选择性抑制剂在人白血病 U937 细胞中诱导细胞死亡。发表时间:2012 年 6 月摘要:对某些双胞胎进行的化学操作(溴和二溴苯酚)化合物先前被我们报道为广谱表观遗传抑制剂,让我们能够识别对 PR-SET7 高度选择性的双(溴和二溴甲氧基苯基)衍生物 ...阅读更多 »全基因组 DNA 甲基化猪表层和深层背膘组织之间的变化发表时间:2012 年 6 月摘要:阅读更多 »ATM 对 Ser547 上 p65(RelA) 的磷酸化抑制基因毒性应激后特定基因的 NF-κB 依赖性转录发表时间:2012 年 6 月摘要:阅读更多 »组蛋白H2B单泛素化n 调节通路是多能干细胞分化所必需的。发布时间:2012 年 6 月摘要:翻译后组蛋白修饰的广泛变化伴随着干细胞分化过程中转录程序的重新布线。然而,控制特定染色质修饰及其功能变化的机制……阅读更多»全基因组定位和表达谱将 Sp2 确定为调节极其重要基因的序列特异性转录因子。发布时间:2012 年 6 月摘要:转录因子Sp2 对于小鼠早期发育和小鼠胚胎成纤维细胞在培养物中的增殖至关重要。然而,其作用机制及其靶基因在很大程度上是未知的。在这项研究中,我们结合了 RNA 间...阅读更多»将组蛋白脱乙酰酶 3 招募到干扰素-a 基因启动子减弱干扰素表达。发表时间:2012 年 6 月摘要:背景:I 型干扰素的诱导(IFN) 基因构成了在病毒感染期间导致先天免疫反应的重要步骤。 B 淋巴细胞 Namalwa 细胞的仙台病毒 (SeV) 感染瞬时诱导转录表达...阅读更多 »内含子 RNA 介导表观遗传目标的 EZH2 调节。发表时间:2012 年 6 月摘要:许多基因组位点的表观遗传失调是标志之一癌症。已提出一些 RNA 分子在将抑制性多梳复合物 PRC2 引导至特定染色质区域中的作用。在这里,我们使用体内交联……阅读更多 »2-氨基苯并苯胺衍生物作为有效和选择性 HDAC 抑制剂的设计、合成和生物学评价。发布时间:2012 年 5 月摘要:表观遗传调控是正常功能的重要过程的基因。因此,针对癌症的表观遗传失调可能是治疗这种严重疾病的有效治疗方法。组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) a...阅读更多 »Lysine 特异性去甲基化酶 1 (LSD1) 和组蛋白去乙酰化酶 1 (HDAC1) 协同抑制促炎细胞因子和经典补体途径成分发布时间:2012 年 5 月摘要:阅读更多 »RARRES1 的表观遗传抑制由近端启动子甲基化和 CTCF 结合缺失介导. 发表时间:2012 年 5 月摘要:背景:负责视黄酸受体反应器 1 (RARRES1) 甲基化表观遗传沉默的顺式作用启动子元件尚不清楚。同样,异常甲基化如何相互作用效应子,从而影响乳腺肿瘤……阅读更多 »研究雌激素受体活性的功能基因组方法。发表时间:2012 年 5 月摘要:雌激素受体 (ER) 是一种核受体,介导雌激素和他莫昔芬的作用. ER 在人类乳腺癌的主要部分中表达。最近,雌激素-ER 和他莫昔芬-ER 的基因组图谱已经发表。有趣的是……阅读更多»增强色度动力学锡标记标志着胚胎发生过程中从多能性向细胞特化的转变。发布时间:2012 年 5 月摘要:形成不同组织和器官的独特细胞类型的生成需要对基因表达进行精确的时间和空间控制。这取决于分布在其周围非编码 DNA 中的特定顺式调控元件……阅读更多 »组蛋白去甲基化酶 Kdm3a 对分化过程至关重要。发表时间:2012 年 5 月摘要:组蛋白去甲基化在调节基因表达和形成表观遗传记忆系统的一部分,该系统通过仍知之甚少的机制调节细胞命运和身份。在这里,我们检查了组蛋白去甲基化酶 K 的作用……阅读更多 »IBM1 组蛋白去甲基化酶基因内含子中的 DNA 甲基化稳定了染色质修饰模式。发表时间:2012 年 5 月摘要:表观遗传模式的稳定性对于基因组完整性和基因至关重要表达.这个高度协调的过程涉及影响不同表观遗传标记的相互关联的正负调节因子,包括 DNA 甲基化和……阅读更多 »环境诱导的卵巢疾病的表观遗传跨代遗传。发表时间:2012 年 5 月摘要:环境毒物和相关混合物在使用杀真菌剂、杀虫剂混合物、塑料混合物、二恶英和碳氢化合物对促进卵巢疾病的表观遗传跨代遗传进行了调查……阅读更多 »Lxrα 调节前列腺上皮中的雄激素反应。发布时间:2012 年 4 月摘要:良性前列腺增生是前列腺的非恶性肿大,通常发生在老年男性中。我们表明,肝 X 受体 (Lxr)-α 基因敲除小鼠 (lxrα(-/-)) 会发展为腹侧前列腺肥大,与过度积累相关……阅读更多 »GABAergic 中间神经元的表观遗传修饰与裂殖体相关小鼠产前应激诱导的类疝气表型。发表时间:2012 年 4 月摘要:人类研究表明,各种产前应激源与精神疾病相关的认知和行为异常的高风险有关(Markham 和 Koenig,2011)。最近,GABAergi 表达下调...阅读更多 »基态多能性的转录和表观基因组学基础。发表时间:2012 年 4 月摘要:在血清中生长的小鼠胚胎干 (ES) 细胞在多能性形态和表达方面表现出更大的异质性因子比在含有两种激酶(Mek 和 GSK3)抑制剂的确定培养基中培养的 ES 细胞高,这种情况被称为\"2i”pos...阅读更多 »IFN-γ/STAT1 表达 IL-31 受体和释放促炎因子激活的树突状细胞IL-31 治疗的介质。发表时间:2012 年 4 月摘要:IL-31 是一种 T 细胞衍生的细胞因子,通过由 IL-31Rα 和制瘤素 M 组成的异二聚体受体发出信号受体β。尽管一些研究旨在研究 IL-31 介导的作用,但这种细胞因子的生物学功能是……阅读更多»乳腺癌细胞诱导基质成纤维细胞通过表观遗传变化分泌 ADAMTS1 以进行癌症侵袭。发表时间:2012 年 4 月摘要:微环境在癌症发展中起着重要作用。我们已经报道,与邻近正常组织的基质细胞相比,与癌症相关的基质细胞表现出表型和功能变化。然而,分子机制...阅读更多 »HDAC1 调节小鼠的恐惧消退。发布时间:2012 年 4 月摘要:组蛋白乙酰化与神经精神疾病的发病机制有关,使用 HDAC 抑制剂靶向组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 被证明具有神经保护作用并启动神经再生过程。然而,litt……阅读更多»组蛋白甲基转移酶 ASH1 在肌纤维蛋白代谢过程中协调纤维化基因转录最后一次转分化。发表时间:2012 年 4 月摘要:背景和目的:肝星状细胞 (HSC) 转分化为肌成纤维细胞样表型是驱动肝纤维化的关键事件。 HSC 转分化需要基因表达的协调全局变化。在这里,我们有……阅读更多 »顺序 ChIP-亚硫酸氢盐测序能够直接在基因组规模研究染色质和 DNA 甲基化串扰。发表时间:2012 年 3 月摘要:DNA 甲基化和组蛋白修饰之间的串扰推动了复合表观遗传学的建立签名,传统上使用相关而不是直接方法进行研究。在这里,我们展示连续的 ChIP-亚硫酸氢盐序列……阅读更多 »C/EBPβ 和 RUNX2 协同降解软骨,以 MMP-13 为靶点,以 HIF-2α 为软骨细胞的诱导剂。发表时间:2012 年 3 月摘要:阐明骨骼过程中软骨内骨化过程的分子机制生长和骨关节炎 (OA) 的发展,我们检查了 CCAAT/增强子结合蛋白-β(C/EBPβ,由 CEBPB 编码)周围的信号网络……阅读更多 »血吸虫女性性染色体上卫星重复序列周围的染色质结构变化曼氏血吸虫及其在性染色体出现中的可能作用。发布时间:2012 年 2 月摘要:背景:在曼氏血吸虫寄生性扁形动物曼氏血吸虫中,雄性个体是同配子 (ZZ),而雌性个体是异配子 (ZW)。为了阐明导致性染色体出现的机制,我们比较了……阅读更多»环境化合物对生殖疾病的跨代作用和祖先暴露的表观遗传生物标志物的鉴定。发表时间:2012 年 2 月摘要:胎儿发育过程中的环境因素可以在种系(精子)中诱导永久性表观遗传变化,然后将成年发病疾病的表观遗传跨代遗传传递给没有任何后续暴露。 epi...阅读更多 »前体 B 细胞急性淋巴细胞白血病中紧密成簇 BTG1 缺失的起源和性质支持多克隆进化模型发表时间:2012 年 2 月摘要:阅读更多 »酵母中端粒的抗检查点通路发表时间:2012 年 2 月摘要:端粒隐藏(或\"盖住”)染色体末端以防止阻止细胞周期并促进修复的 DNA 损伤监测机制,但端粒的检查点状态尚不清楚。在这里,我们描述了 Saccharomyces cere 的反应......阅读更多»通过 Nanog 的等位基因调节控制基态多能性。发表时间:2012 年 2 月摘要:多能性是通过哺乳动物植入前发育过程中的全基因组重编程建立的,导致幼稚外胚层的形成。重新编程涉及表观遗传标记的重置和 plur 的激活……阅读更多 »RYBP-PRC1 Complexes 独立于 PRC2 和 H3K27me3 在 Polycomb 目标位点介导 H2A 泛素化。发布时间:2012 年 2 月摘要:Polycomb 抑制复合物 1 (PRC1) 在分化和发育过程中调节可遗传基因沉默中起着核心作用。 PRC1 募集通常归因于核心蛋白 Polycomb 染色域的相互作用 ...阅读更多 »野生和家养鸡之间基因表达和启动子甲基化的可遗传全基因组变异。发表时间:2012 年 2 月摘要:摘要:背景:变异由表观遗传机制介导的基因表达可能对动物产生广泛的表型效应。然而,表达变异和表观遗传修饰在多大程度上存在争议,例如模式……阅读更多»斑马鱼糖尿病代谢记忆的遗传传递与 DNA 低甲基化和异常基因表达相关。发表时间:2012 年 2 月摘要:代谢记忆(毫米)是血糖恢复后糖尿病并发症持续存在并进展的现象。在这里,我们提供的数据显示 MM 是可遗传的,并且传播与高血糖诱导的 DNA 相关...阅读更多 »转录和组蛋白甲基化变化与雄性生殖细胞中的印记获取相关。发表时间:2012 年 2 月摘要:哺乳动物的基因组印记由配子中获得的 DNA 甲基化印记控制,位于称为\"印记控制区”(ICR) 的基本序列元素处。男性生殖细胞中父系印记获得的信号是什么……阅读更多 »全球 DNA 低甲基化与乳腺癌中的抑制性染色质结构域形成和基因沉默相结合。发表时间:2012 年 2 月摘要:虽然基因突变是癌症的标志,但许多癌症也在肿瘤发生过程中获得表观遗传改变,包括肿瘤抑制因子的异常 DNA 高甲基化,以及染色质的变化在由遗传引起的修饰中 ...阅读更多 »组蛋白脱乙酰酶 6 (HDAC6) 是糖皮质激素诱导的肝糖异生的重要修饰剂。发表时间:2012 年 2 月摘要:在当前研究中,我们研究了组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 的重要性6 糖皮质激素受体介导的对葡萄糖代谢的影响及其作为预防糖皮质激素诱导的糖尿病的治疗靶点的潜力……阅读更多»果蝇细胞合成区域增强子 RNA 和染色质修饰的分子分析遗传结构。发表时间:2012 年 2 月摘要:阅读更多 »毛果杨基因组中的动态 DNA 胞嘧啶甲基化:组织水平变异和与基因表达的关系。发表时间:2012 年 1 月摘要:摘要:背景:DNA 胞嘧啶甲基化是一种表观遗传修饰,已涉及许多生物过程。然而,大规模的表观基因组研究已经已应用于极少数植物物种,以及甲基化的变异性……阅读更多»生长停滞和 DNA 损伤诱导,β (GADD45b)-介导的主要精神病 DNA 去甲基化。发表时间:2012 年 1 月摘要:异常的新皮质 DNA 甲基化有被认为是精神障碍的病理生理学因素。最近,生长停滞和 DNA 损伤诱导,β (GADD45b) 蛋白协调的 DNA 去甲基化途径,利用 cyti...阅读更多»SRY-HMG 盒转录因子 SOX4 的新转录靶点将其表达与发展联系起来小细胞肺癌。发表时间:2012 年 1 月摘要:参与神经元发育的 HMG 盒转录因子 SOX4 在一部分肺癌中被扩增和过表达,表明它可能是致癌基因。在这项研究中,我们试图通过定义来发展这一假设……阅读更多»高迁移率 A1 组蛋白:过氧化物酶体 Pro 的一种新的共调节因子liferator-Activated Receptor-γ-Mediated transrepression in the Vasculature.Published: December, 2011Abstract: Rationale: The nuclear receptor peroxisome proliferator-activated receptor-γ (PPARγ) is an important regulator of gene transcription in vascular cells and mediated the vascular protection 观察到与抗糖尿病格列酮类药物。目的:确定...阅读更多 »在合子基因组激活之前通过修饰的组蛋白对发育基因表达进行预模式化。发布时间:2011 年 12 月摘要:anamniote 脊椎动物发育的一个标志是胚胎转录独立细胞分裂之前的一个窗口合子基因组激活 (ZGA) 的开始。 ZGA 的染色质决定子尚未探索;然而,发育基因的标记……阅读更多 »小鼠肝脏中 LXR、RXR 和 PPARα 的全基因组分析揭示了结合位点的广泛共享。发表时间:2011 年 12 月摘要:肝脏 X 受体 (LXR) 是核受体,形成允许异二聚体s 与维甲酸 X 受体 (RXR) 一起,是肝脏脂质代谢的重要调节剂。我们最近表明 RXR 激动剂诱导的高甘油三酯血症...阅读更多»使用干细胞种子生物人工纳米复合材料进行气管支气管移植:一项概念验证研究。发布时间:2011 年 12 月摘要:背景:气管肿瘤可以通过手术切除但大多数在诊断时是无法手术的尺寸;因此,需要新的治疗选择。我们报告了干细胞气管支气管气道的临床移植……阅读更多»Tet 蛋白介导的 5-甲基胞嘧啶氧化的机制和功能。发表时间:2011 年 12 月摘要:十-十一易位 1-3 (Tet1-3 ) 最近在哺乳动物细胞中发现蛋白质是 DNA 羟化酶家族的成员,这些酶对胞嘧啶 5 位甲基标记具有酶活性(5-甲基胞嘧啶 [5...阅读更多 »独特的表观基因组特征s in End-Stage Failing Human Hearts 发表时间:2011 年 11 月摘要:背景——表观基因组是指基因组上的标记,包括 DNA 甲基化和组蛋白修饰,它们调节基础基因的表达。终末期心肌病基因表达变化的一致概况使我们产生了 hy...阅读更多 »前 B 细胞到巨噬细胞的转分化没有显着的启动子 DNA 甲基化变化。发表时间:2011 年 11 月摘要:转录因子诱导的谱系重编程或转分化实验对于了解分化细胞的可塑性至关重要。这些实验有助于确定转录因子在 conferr 中的特定作用……阅读更多 »干细胞中的二价组蛋白修饰为人类癌症中的 CpG 岛高甲基化平衡 miRNA 位点。发布时间:2011 年 11 月摘要:有人提出存在干细胞表观遗传模式赋予 CpG 岛 hy 更大的可能性癌症中肿瘤抑制编码基因的全甲基化。建议的机制基于 Polycomb 介导的甲基化 o...阅读更多 »PcG 复合物为复制前早期 S 期基因沉默的表观遗传奠定了基础。发表时间:2011 年 11 月摘要:Polycomb 组 (PcG) 蛋白是其中的一部分一种保守的细胞记忆系统,通过细胞分裂传递沉默转录状态的表观遗传。尽管有大量关于 PcG 机制控制的信息……阅读更多 »CTCF 促进的 RNA 聚合酶 II 暂停将 DNA 甲基化与剪接联系起来。发表时间:2011 年 10 月摘要:前信使 RNA 的选择性剪接是转录组扩展的一个关键特征真核细胞,但对其调控知之甚少。剪接体组装发生共转录,提高了 DNA 结构可能发生变化的可能性……阅读更多 »人​​类组蛋白 H3 补体 anno 2011。发布时间:10 月 20 日11 摘要:组蛋白是高度碱性的、相对较小的蛋白质,可与 DNA 复合以形成构成染色体拓扑结构基础的更高级结构。在四个核心组蛋白 H2A、H2B、H3 和 H4 中,H3 在翻译后修饰最重...阅读更多 »人​​类活性和非活性 X 染色体的 DNA 甲基化概况。发布时间:2011 年 10 月摘要:X -染色体失活 (XCI) 是一种剂量补偿机制,可使每个女性细胞中一条 X 染色体上的大多数基因沉默。为了表征伴随这一过程的表观遗传变化,我们测量了 4 中的 DNA 甲基化水平……阅读更多»大脑中的组蛋白尾部乙酰化在死后以不可预测的方式发生。发表时间:2011 年 9 月摘要:组蛋白乙酰化在调节基因转录。然而,尚不清楚死后脑组织是否适合组蛋白乙酰化分析。为了研究这个问题,核小体被分离出来m frontal co...阅读更多 »Sox3 和蜗牛转录因子之间的相互抑制定义了原肠胚形成时的胚胎区域。发布时间:2011 年 9 月摘要:在发育羊膜胚胎时,第一个上皮-间质转化 (EMT) 发生在原肠胚形成时,当外胚层细胞的一个子集移动到原条并经历 EMT 以内化并产生中胚层和内胚层。 ...阅读更多 »前列腺癌细胞中的谷胱甘肽-S-转移酶 pi 1 (GSTP1) 基因沉默被组蛋白脱乙酰酶抑制剂 depsipeptide 逆转。发表时间:2011 年 9 月摘要:通过表观遗传机制进行的基因沉默在前列腺癌 (PCA) 中很常见. DNA 高甲基化和组蛋白修饰之间的联系尚不完全清楚。我们选择了被高甲基化沉默的 GSTP1 基因来分析……阅读更多 »人​​类癌症中组蛋白甲基转移酶 EZH2 对 Kruppel 样因子 2 的沉默。发布时间:9 月, 2011 摘要:Kruppel 样因子 (KLF) 蛋白是多任务转录调节因子,具有扩展的肿瘤抑制功能。 KLF2 是该家族的重要成员之一,因为它在恶性肿瘤中的表达减少及其生长——我……阅读更多»组蛋白乙酰转移酶 MYST4 的破坏导致人类和小鼠的努南综合征样表型和过度激活的 MAPK 信号.Published: September, 2011Abstract: 基因表达的表观遗传调控,通过组蛋白的共价修饰,是控制生长发育的关键过程。因此,调节这些过程的转录因子是遗传疾病的重要目标。 ...阅读更多 »哺乳动物发育中高水平基因组 5-羟甲基胞嘧啶的谱系特异性分布。发布时间:2011 年 9 月摘要:胞嘧啶甲基化是一种与基因抑制相关的 DNA 修饰。最近,一种新的胞嘧啶修饰,5-羟基已发现 y 甲基胞嘧啶 (5-hmC)。在这里,我们检查哺乳动物发育过程中和细胞中的 5-hmC 分布……阅读更多»基因组结构和表观遗传因素对启动子 CpG 岛对异常 DNA 甲基化诱导的敏感性的影响。发布时间:2011 年 9 月摘要:异常 DNA 甲基化诱导于特异性启动子 CpG 岛 (CGI) 与突变形成对比。特异性受基因组结构和表观遗传因素的影响,但它们之间的关系仍然未知。在这项研究中,我们分离...阅读更多»GR 和 NFKB 的共激活改变了它们结合位点和靶基因的所有组成部分。发表时间:2011 年 9 月摘要:糖皮质激素受体 (GR) 部分通过拮抗促炎转录发挥抗炎作用核因子 kappa-b (NFKB) 等因子。在这里,我们评估激活的 GR 和 RELA 的串扰(p65,主要 NFKB 组件……阅读更多 »选择性自噬调节我酿酒酵母中 Ty1 逆转录转座子的插入诱变。发布时间:2011 年 8 月摘要:巨自噬(自噬)是细胞质成分的大量降解系统,在真核细胞中普遍存在。自噬在饥饿条件下被诱导,并通过降解不需要的细胞质基质来发挥细胞保护作用……阅读更多»肿瘤抗原 PRAME 是 Cul2 泛素连接酶的一个亚基,并与活性 NFY 启动子相关。发布时间:2011 年 8 月摘要:人类肿瘤抗原 PRAME(黑色素瘤的优先表达抗原)经常在肿瘤中过度表达。高 PRAME 水平与多种癌症的不良临床结果相关,但 PRAME 可能参与的机制……阅读更多 »IL-20 在 NSCLC 中受到表观遗传调节并下调 VEGF 的表达。发表时间:2011 年 8 月摘要:背景:IL-20 是 IL-10 家族的多效性成员,在皮肤生物学和d 造血细胞的发育。最近,IL-20 已被证明在非小细胞肺中具有潜在的抗血管生成作用……阅读更多 »转录起始平台和组织特异性增强子和启动子的 GTF 募集。发布时间:2011 年 8 月摘要:近期工作表明 RNA 聚合酶 (Pol) II 可以被招募到远端调节区并进行转录。在这里,我们通过 Pol II 的全基因组定位、一般转录因子(GT...阅读更多 »5-羟甲基胞嘧啶与人类胚胎干细胞中的增强子和基因体相关。发表时间:2011 年 6 月摘要:背景: 5-Hydroxymethylcytosine (5hmC) was recently found to be abundantly present in certain cell types, including embryonic stem cells. 越来越多的证据表明,将 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 转化为 5hmC 的 TET 蛋白发挥重要作用……阅读更多»表观遗传的早期形成小鼠结肠炎模型中的 ic 场缺陷,以及 T 细胞和 B 细胞在 DNA 甲基化诱导中的非必要作用。发表时间:2011 年 6 月摘要:癌化的表观遗传场参与人类癌症的发展,尤其是那些与炎症和多次出现。然而,目前还不清楚这种区域缺陷何时形成以及炎症的什么成分……阅读更多»Zeste 2 (EZH2) 增强子在恶性神经胶质瘤和神经胶质瘤干细胞样细胞中上调。发表时间:2011 年 6 月摘要: 目的:Polycomb 抑制复合物 2 (PRC2) 的蛋白质是表观遗传基因沉默子,参与肿瘤的发展。它们的致癌功能可能与其在干细胞维持中的作用有关。组蛋白甲基转移酶 E...阅读更多 »LSD1 调节人类胚胎干细胞自我更新和分化之间的平衡。发布时间:2011 年 6 月摘要:我们确定了 LSD1(赖氨酸特异性去甲基化酶 1;也称为 KDM1A和 AOF2)作为一个关键的组蛋白修饰剂,通过调节二价域参与维持多能性,调节区存在染色质环境……阅读更多»H3.5 是一种新的人类特异性组蛋白 H3 变体,它特别在人类睾丸的曲细精管中表达。发布时间:2011 年 6 月摘要:将组蛋白变体掺入染色质对于特定染色质状态的建立起着重要作用。迄今为止已知六种人类组蛋白 H3 变体,不包括 CenH3 变体:H3.1、H3.2、H3.3 和睾丸特异性……阅读更多 »秀丽隐杆线虫染色质相关蛋白 SET-2 和 ASH-2组蛋白 H3 赖氨酸 4 甲基化在胚胎和成体生殖细胞中的需求不同。发表时间:2011 年 5 月摘要:组蛋白 H3 赖氨酸 4 (H3K4me) 的甲基化,一种与基因激活相关的标记,由 SET1 和相关的混合谱系白血病介导 ( MLL) 组蛋白甲基转移酶 (HMT)跨物种。哺乳动物包含七个 H3K4 HMT,Set1A,Set1B,...阅读更多»人类 Y 染色体常染色质区域的表观遗传概况。发表时间:2011 年 5 月摘要:多细胞生物的基因组通过以下方式在不同细胞类型中获得各种功能能力不同染色质修饰和包装状态的方法。在早期发育过程中获得的细胞类型特异性表观基因型是 ma...阅读更多»通过 LIF 下游的 Yes-YAP-TEAD2 信号通路调节小鼠胚胎干细胞自我更新。发布时间:2011 年 4 月摘要:细胞质酪氨酸激酶 Yes 之前已被证明在通过白血病抑制因子 (LIF) 下游的未知途径和一个或多个因子维持小鼠和人类胚胎干 (ES) 自我更新方面具有重要作用……阅读更多 »涉及表观遗传开关激活先驱因子 FOXA1 依赖性增强子。发表时间:2011 年 4 月摘要:转录因子 (TF) b专门针对哺乳动物基因组的离散区域,称为顺式调控元件。其中包括增强子,它们在发育和分化过程中的基因表达调控中起着关键作用。尽管……阅读更多 »5-羟甲基胞嘧啶分布的全基因组分析揭示了其在小鼠胚胎干细胞转录调节中的双重功能。发表时间:2011 年 4 月摘要:最近的研究表明,十-十一易位 (Tet) 家族蛋白可将 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 酶促转化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC)。虽然 5mC 已被广泛研究,但对分布知之甚少……阅读更多 »重组工程、转染、Western、IP 和 ChIP 方法通过基因靶向或 BAC 转基因对蛋白质进行标记。发布时间:2011 年 4 月摘要:蛋白质标记提供了许多优势用于蛋白质组学和调节组学研究。理想情况下,蛋白质标记相当于为每个选择的对象都配备了高亲和力抗体蛋白质。然而,如果标记蛋白过高,这些优势就会受到损害……阅读更多»非小细胞肺癌中葡萄糖转运蛋白的表观遗传调控发表时间:2011 年 3 月摘要:由于其固有的缺氧环境,癌细胞通常诉诸于糖酵解,或葡萄糖厌氧分解形成 ATP 以满足其能量需求,称为 Warburg 效应。同时,胰岛素的过度表达...阅读更多 » 哺乳动物受精卵中的 5-羟甲基胞嘧啶与表观遗传重编程有关。发布时间:2011 年 3 月摘要:早期哺乳动物胚胎的表观基因组被广泛重编程以获得全能发育潜力。这种重新编程的主要初始事件是受精卵中 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 的主动丢失/去甲基化。在这里,我们 ...阅读更多 »通过激活的 PI3K/AKT 信号介导的表观遗传沉默在乳腺癌中的作用。发表时间:2011 年 3 月摘要:hist 的三甲基化一个 3 赖氨酸 27 (H3K27me3) 是维持基因沉默的关键表观遗传标记。目标位点 DNA 甲基化的额外积累被认为在 tu 期间协同支持这种表观遗传沉默……阅读更多»胚胎致死表型揭示了 TDG 在维持表观遗传稳定性方面的作用。发表时间:2011 年 2 月摘要:胸腺嘧啶 DNA 糖基化酶 (TDG) 是DNA 修复酶尿嘧啶 DNA 糖基化酶 (UDG) 超家族的成员。由于它在与鸟嘌呤错配时能够切除胸腺嘧啶,它被提议对抗 5-甲基胞嘧啶的可变性……阅读更多 »锌指基因 3\' 外显子矛盾染色质特征的表征。发表时间:2 月, 2011 年摘要:H3K9me3 组蛋白修饰通常存在于启动子区域,其作用是抑制转录。然而,我们之前已经表明,锌指基因 (ZNF) 的 3\' 外显子以高水平的 H3K9me3 为标志。我们哈现在进一步...阅读更多»马凡和非马凡胸主动脉瘤血管平滑肌细胞的表观遗传控制。发表时间:2011 年 2 月摘要:目的:人类胸主动脉瘤 (TAA) 的特征是细胞外基质分解与进行性相关平滑肌细胞 (SMC) 稀疏。这些特征存在于所有类型的 TAA 中:单基因形式 [主要是马凡综合征……阅读更多 »使用 MeDIP 芯片对哺乳动物组织中的 DNA 甲基化进行综合分析。发布时间:2011 年 2 月摘要:表观遗传变化的全基因组映射是对于理解细胞分化和胚胎发育过程中基因调控的机制至关重要。 DNA 甲基化是这些直接相关的关键表观遗传标记之一……阅读更多 »组蛋白甲基转移酶 Dot1 是盘基网柄菌 DNA 损伤修复和正常发育所必需的。发布时间:2011 年 1 月摘要:翻译后组蛋白修饰ns 在调节基因表达和染色质结构方面发挥重要作用。在这里,我们报告了简单真核生物盘基网柄菌中组蛋白 H3K79 二甲基化的鉴定。我们删除了……阅读更多 »抑制性 T 细胞因子 1 (TCF-1) 亚型在幼稚 CD4+ T 细胞中的抑制作用是由 IL-4/STAT6 信号传导介导的。发表时间:2011 年 1 月摘要:Wnt 通路转录因子 T 细胞因子 1 (TCF-1) 在几个发育过程的控制中起着重要作用,包括胸腺中的 T 细胞发育。尽管以前被认为仅在早期 T ce 期间需要...阅读更多»全基因组 PLZF/RARA 靶基因的特征。发表时间:2011 年 1 月摘要:由 t(11;17)( q23;q21) 易位在急性早幼粒细胞白血病 (APL) 中被认为是一种致癌转录调节因子,将表观遗传因子招募到对其转化很重要的基因中……阅读更多 »p53 丝氨酸 46 在 p53 靶基因调控中的作用。发布时间:2011 年 1 月摘要:肿瘤抑制因子 p53 在细胞生长控制中起着至关重要的作用,可诱导多种不同的反应途径。区分不同 p53 反应的分子机制在很大程度上仍然难以捉摸。在这里,我们有……阅读更多 »增强的染色质可及性和 JUNB 的募集介导了 NFAT1 缺陷 T 辅助细胞 2 细胞中持续的 IL-4 表达。发表时间:2011 年 1 月摘要:活化 T 细胞核因子 (NFAT) 是一个家族由五种蛋白质组成的转录因子。其中,NFAT1 是 CD4(+) T 细胞中的主要 NFAT 蛋白。 NFAT1 积极调节大量诱导 c 的转录……阅读更多 »基于微孔板的平台,用于结合染色质和 DNA 甲基化免疫沉淀分析。发表时间:2011 年 1 月摘要:未标记:摘要:背景:构成给定表达的过程n 基因比以前认为的要复杂得多,提出了需要开发新工具的前所未有的概念和机制挑战。染色质 st...阅读更多 »肺癌中 miR-212 表达的表观遗传调控。发表时间:2011 年 1 月摘要:许多研究表明,癌症中的 microRNA 表达可能受表观遗传事件的调控。最近,我们发现在肺癌中 miR-212 被强烈下调。然而,参与调节 miR-212 表达的机制是……阅读更多 »组蛋白修饰对淋巴肿瘤中 SOX11 的表观遗传激活。发表时间:2011 年 1 月摘要:最近的研究表明 SOX11 在各种类型的侵袭性 B 中的异常表达- 细胞肿瘤。为了阐明导致这种放松管制的分子机制,我们在……中进行了全面的 SOX11 基因表达和表观遗传学研究阅读更多 »人​​猪内吞 5\'-近端 CpG 岛的表观遗传调控nous 逆转录病毒亚组 A 受体 2/GPR172B。发布时间:2011 年 1 月摘要:猪内源性逆转录病毒 (PERV) 被认为是从猪异种移植到人类的主要风险之一。 PERV-A 有效利用人类 PERV-A 受体 2 (HuPAR-2)/GPR172B 感染人类细胞;然而,一直没有……阅读更多 »使用高密度微阵列在斑马鱼中平铺组蛋白 H3 赖氨酸 4 和 27 甲基化。发表时间:2010 年 12 月摘要:背景:通过染色质免疫沉淀和微阵列杂交(ChIP 芯片)揭示表观遗传状态对在基因组规模水平上对基因调控的理解做出了重大贡献。许多研究已经进行...阅读更多»H2A.Z 划分了由 H3K9ac 和 H3K4me3 动态标记的恶性疟原虫表观基因组的基因间区域。发表时间:2010 年 12 月摘要:表观遗传调控机制及其酶是治疗疟疾的有前途的目标互联网干预;然而,人们对恶性疟原虫基因表达的表观遗传成分知之甚少。表观遗传的动态或稳定关联 ...阅读更多 »组蛋白 H2A C 末端调节染色质动力学、重塑和组蛋白 H1 结合。发布时间:2010 年 12 月摘要:组蛋白的尾部是所有染色质介导过程的核心参与者。尽管 N 端组蛋白尾巴已被广泛研究,但对 H2A C 端的功能知之甚少。在这里,我们表明 H2A C 项……阅读更多»ZNF274 将组蛋白甲基转移酶 SETDB1 招募到 ZNF 基因的 3\' 端。发表时间:2010 年 12 月摘要:只有一小部分人类转录因子(例如与特定的分化程序)在给定的细胞类型中表达。因此,细胞命运主要取决于转录因子的细胞类型特异性沉默……阅读更多 »调节性 T 细胞和 T(H) 分化的控制17 细胞由 DNA 结合抑制剂 Id3 发表:2010 年 12 月摘要:在 CD4(+) T 细胞中指导转录因子 Foxp3 编码基因转录的分子机制仍不明确。我们在这里展示了 DNA 结合抑制剂 Id3 的缺失导致 Foxp3 的缺陷生成(...阅读更多»STAT6 转录因子是巨噬细胞和树突细胞中核受体 PPARγ 调节基因表达的促进剂。发布时间:11 月, 2010 摘要:过氧化物酶体增殖物激活受体 γ (PPARγ) 是一种脂质激活转录因子,可调节巨噬细胞和树突状细胞 (DC) 中的脂质代谢和炎症反应。这些免疫细胞暴露于不同的炎症环境中……阅读更多 »A model使用人类诱导多能干细胞进行神经发育和 Rett 综合征治疗。发表时间:2010 年 11 月摘要:自闭症谱系障碍 (ASD) 是复杂的神经发育疾病,其中h 基因突变的不同组合可能会影响表型。使用 Rett 综合征 (RTT) 作为 ASD 遗传模型,我们开发了一种培养系统,使用...阅读更多 »胚泡 Axin1(Fu) 基因座的组蛋白修饰标志着小鼠体外培养诱导的表观遗传改变的遗传力。已发表:2010 年 11 月摘要:对于要从一代传递到下一代的表观遗传表型,要求在表观遗传重编程的两个阶段不清除世代之间的表观遗传标记:哺乳动物配子发生和植入前发育……阅读更多»The组蛋白 H4 Lys 20 甲基转移酶 PR-Set7 调节哺乳动物细胞中的复制起点。发布时间:2010 年 11 月摘要:DNA 合成的启动受复制起点许可的控制,包括在起源于晚期 M 期和 G1 期。在后生动物中,功能性复制起点不显示 ...阅读更多 »H3 赖氨酸 9、27、36 和 79 甲基化对多能性相关基因的启动子-外显子关系。发布时间:2010 年 10 月摘要:证据表明多能性与由转录因子 Oct4、Nanog 组织的基因调控网络相关联和 Sox2。这些基因的表达受调控区域的表观遗传修饰控制。然而,关于概况知之甚少……阅读更多»TNF/p38α/polycomb 信号转导至卫星细胞中的 Pax7 位点将炎症与肌肉再生的表观遗传控制联系起来。发表时间:2010 年 10 月摘要:再生线索如何转化为表观遗传控制成体干细胞基因表达的信息目前尚不清楚。我们在肌肉干(卫星)细胞中发现了一种炎症激活信号,多梳细胞通过该信号...阅读更多»单亲二体个体的甲基化分析可识别 15 号染色体上新的差异甲基化区域。已发表:S2010 年 9 月摘要:母本和父本基因组具有独特的表观遗传标记,可在印迹位点区分它们。为了识别印记基因座,我们使用了一种新方法,利用单亲二体 (UPD) 提供系统的事实……阅读更多 »Ring1B 和 Suv39h1 在小鼠谱系早期承诺期间描绘了二价基因的不同染色质状态。已发布: 2010 年 8 月摘要:多能细胞在胚泡的内细胞团中发育,胚泡是被胚外层(滋养外胚层)包围的细胞镶嵌体。我们展示了一组携带 biv 的体细胞谱系调节剂(包括 Hox、Gata 和 Sox 因子)……阅读更多 »NoRC 复合物介导沉默 rRNA 基因和着丝粒重复序列的异染色质形成和稳定性发表时间:2010 年 7 月摘要:维护特定的异染色质结构域对于基因组的稳定性至关重要。在真核细胞中,一部分串联重复的核糖体 RNA (rRNA)基因以异色结构组织。 rDNA si 的主要决定因素……阅读更多 »ESCs 需要 PRC2 来指导分化细胞成功重编程为多能性。发表时间:2010 年 6 月摘要:胚胎干细胞 (ESCs) 具有多能性、自我更新能力,并且能够在细胞融合后将分化的细胞类型重新编程为多能性。 Polycomb 组 (PcG) 蛋白对于抑制不适当的表达很重要 ...阅读更多 »雌激素介导的大染色体区域的表观遗传抑制通过 DNA 循环。发表时间:2010 年 6 月摘要:表观遗传抑制的当前概念基于一个阻遏物一个沉默基因对应的单位。然而,这个概念不能充分解释在大染色体区域观察到的多个位点的同时沉默。远距离……阅读更多 »det1-1 通过 UVR3 和 PHR1 光解酶基因过度表达诱导 UV-C 低敏感性。发表:2010 年 5 月摘要:总结 植物等专性光合自养生物必须从阳光中获取能量,因此暴露于紫外线 (UV) 辐射的破坏性附带影响下,尤其是对 DNA。在这里,我们研究了 lig 之间的相互联系……阅读更多 »PKCbeta (I) 对组蛋白 H3T6 的磷酸化控制组蛋白 H3K4 的去甲基化。发表时间:2010 年 4 月摘要:赖氨酸特异性去甲基化酶 1 (LSD1) 在组蛋白 H3 中不同赖氨酸残基的去甲基化) 导致基因抑制或激活。作为共抑制复合物的一个组成部分,LSD1 通过去除单链和... 阅读更多 »由组蛋白 H3 Lys 4 乙酰化介导的染色质域开关调节异染色质组装。发布时间:2010 年 4 月摘要:染色质域蛋白(Chp1 /Chp2/Swi6/Clr4) 与甲基化 H3K9 (H3K9me) 结合并调节裂殖酵母中的中心周异染色质。 Chp1 和 Clr4 (H3K9-HMT),结合转录活性杂染色质,而 Chp2/Swi6(HP1 同系物)是 r...阅读更多»干细胞中印迹 Cdkn1c 基因的自主沉默发表时间:2010 年 4 月摘要:印迹基因的起源特异性表达依赖于差异 DNA 甲基化特定的基因组区域。差异甲基化区域 (DMR) 在配子发生(初级 DMR)期间或在 fer 之后获得 DNA 甲基化……阅读更多 »组蛋白去甲基化酶 LSD1/KDM1 的选择性剪接有助于哺乳动物神经系统神经突形态发生的调节。发布时间:2 月, 2010 摘要:多种染色质重塑复合物被认为可以协调转录程序,引导神经元前体从最早的承诺到终末分化。在这里,我们表明哺乳动物神经元具有专门的染色质重...阅读更多»PML-RARalpha/RXR 改变急性早幼粒细胞白血病的表观遗传景观。发表时间:2010 年 2 月摘要:许多 di不同的分子机制与造血祖细胞的 PML-RARalpha 依赖性转化有关。在这里,我们在急性早幼粒细胞白血病 (APL) 细胞系中确定了高置信度的 PML-RARalpha 结合位点,并且……阅读更多 »组蛋白变体 H2A.Z 刺激模拟开关 (ISWI) 类 ATP 依赖性重塑剂的染色质重塑。发布时间:2010 年 2 月摘要:ATP 依赖性染色质重塑复合物通过改变组蛋白八聚体周围 DNA 的位置来重新排列核小体。尽管染色质重塑剂和组蛋白变体 H2A.Z 在转录控制区共定位,但 H2A.Z 是否...阅读更多 »AGRONOMICS1:拟南芥转录组分析的新资源。发布时间:2010 年 2 月摘要:转录组分析已成为一种常规工具生物学。对于拟南芥(Arabidopsis thaliana),Affymetrix ATH1 表达阵列是最常用的,但它缺少大约三分之一的预注释基因送入参考菌株。 ...阅读更多 »使用甲基 DNA 免疫沉淀结合高通量测序对人类乳腺癌细胞异常甲基化进行全基因组分析。发表时间:2010 年 1 月摘要:背景:癌细胞的 DNA 甲基化模式发生巨大变化,导致在异常基因表达和恶性表型中。然而,甲基化组变化背后的机制尚不清楚,基因也不是……阅读更多»潜在卡波西肉瘤相关疱疹病毒基因组的表观遗传景观。发表时间:2010 年 1 月摘要:疱疹病毒潜伏期通常被认为受表观遗传控制修改,但病毒染色质在潜伏感染的早期时间点的动力学知之甚少。在这里,我们报告了一项全面的时空分析...阅读更多»小鼠杆状光感受器的体内染色质组织与组蛋白修饰相关。发布时间:1 月, 2010 摘要: 背景:将遗传信息折叠成染色质在许多核过程中起着重要的调节作用,尤其是在基因转录中。翻译后组蛋白修饰与特定染色质凝聚有关...阅读更多»核心结合因子 CBF 负调节骨骼肌终末分化。发表时间:2010 年 1 月摘要:背景:核心结合因子或 CBF 是由两个亚基组成的转录因子, Runx1/AML-1 和 CBF beta 或 CBFbeta。 CBF 最初被描述为造血调节剂。方法学/主要发现:我们在这里表明 CBF 是……阅读更多 »UPF2 是肝脏发育、功能和再生的关键调节因子。发表时间:2010 年 1 月摘要:背景:无义介导的 mRNA 衰变 (NMD) 是后-有助于识别和破坏带有过早终止密码子 (PTC) 的 mRNA 的转录 RNA 监视过程。这种PTC-containing (PTC+) mRNAs 可能来自...阅读更多 »全基因组保守的共有转录因子结合基序是超甲基化的。发表时间:2010 年 1 月摘要:背景:DNA 甲基化可以通过调节 DNA 和蛋白质之间的相互作用来调节基因表达或蛋白质复合物。人类基因组中存在保守的共识基序(\"预测的转录因子结合位点”:\"预测……阅读更多 »多能细胞、多能细胞和分化细胞中核心多能性相关基因的染色质状态。发表时间:2010 年 1 月摘要:Oct4,Nanog和 Sox2 构成控制多能性转录因子的核心。分化和重编程研究揭示了一些与 OCT4、NANOG 和 SOX 的表达状态相关的表观遗传修饰……阅读更多 »灵长类动物胚胎干细胞中的 DNA 甲基化编程和重编程.Published: December, 2009摘要:DNA甲基化是一个重要的epigenetic 机制,影响正常发育并在干细胞衍生过程中重编程表观基因组中发挥关键作用。在这里,我们报告了本地猴子胚胎干细胞中的 DNA 甲基化模式(ES……阅读更多 »雌激素受体-α 结合的人类染色质相互作用组。发布时间:2009 年 11 月摘要:基因组被组织成高级三维结构, 和由长基因组距离分隔的 DNA 元素原则上可以在功能上相互作用。许多转录因子与远离基因启动子的调节 DNA 元素结合……阅读更多»RNA 聚合酶 II 的存在,活跃或停滞,预测启动子 CpG 的表观遗传命运islands.Published: November, 2009Abstract: Induction of DNA methylation, as shown by methylation of specific CpG islands (CGIs) by specific inducers and in specific cancers. 然而,对所涉及的指导性因素知之甚少,invol除外。 ..阅读更多 ”组蛋白变体 macroH2A 是关键发育基因的表观遗传调节剂。发布时间:2009 年 10 月摘要:组蛋白变体 macroH2A1 和 macroH2A2 与雌性哺乳动物的 X 染色体失活有关。然而,人们对 macroH2A 蛋白在常染色体上的生理功能知之甚少。人类男性 pluri 中基于微阵列的分析...阅读更多 »甲基化 DNA 免疫沉淀-CpG 岛微阵列分析中用于定量评估的新输出值的开发。发布时间:2009 年 10 月摘要:在 DNA 甲基化微阵列分析中,中间甲基化的定量评估具有各种全球甲基化水平的样品中的水平仍然很困难。在这里,专门针对甲基化 DNA 免疫沉淀-CpG 岛 (CGI) 麦克风...阅读更多»恶性疟原虫异染色质蛋白 1 标记与输出毒力因子的表型变异相关的基因组位点。发表时间:2009 年 9 月摘要:表观遗传过程es 是真核生物表型变异的主要导体。疟疾寄生虫恶性疟原虫利用主要表面抗原 PfEMP1 的抗原变异,由 60 个 var 基因编码,以逃避获得性免疫反应……阅读更多 »组蛋白去亚胺化和去乙酰化之间的功能联系。发布时间:2009 年 9 月摘要:组蛋白甲基化作用调节染色质结构和功能的关键作用。最近鉴定的拮抗或去除组蛋白甲基化的酶提供了新的机会来了解 reg 中的组蛋白甲基化可塑性……阅读更多 »非洲爪蟾胚胎空间基因调控中 H3K4me3 和 H3K27me3 获取的层次结构。发表时间:2009 年 9 月摘要:表观遗传学机制将多细胞生物基因组中的活性区域和非活性区域分开,以在胚胎发生过程中产生不同的细胞命运。在这里,我们报告了原肠胚 X 期的表观遗传和转录组全基因组图谱e...阅读更多 »与 X 失活相关的表观遗传变化的高分辨率分析。发布时间:2009 年 8 月摘要:雌性小鼠 ES 细胞的分化通过 X 染色体失活 (XCI) 触发一条 X 染色体的沉默。免疫荧光研究表明,在 Xist RNA 涂层后不久,非活性 X (Xi) 会发生许多异染色质变化...阅读更多 »H3K64 三甲基化标记异染色质,并在发育重编程过程中进行动态重塑。发表时间:2009 年 7 月摘要:组蛋白修饰是调控的核心所有依赖 DNA 的过程。组蛋白 H3 (H3K64) 的 Lys64 位于球状结构域内的重要结构位置。我们将 H3K64 (H3K64me3) 的三甲基化鉴定为修饰 ...阅读更多 »组蛋白 H3 修饰与间充质脂肪干细胞的分化和长期培养相关。发表时间:2009 年 6 月摘要:间充质干细胞的长期培养导致分化能力的丧失,其分子机制仍不清楚。我们在这里表明,脂肪干细胞 (ASCs) 的扩增至晚期传代(复制衰老)是……阅读更多 »粗糙脉孢菌中重复诱导的点突变直接异染色质形成的遗迹。发表时间:2009 年 3 月摘要:两者都依赖于 RNAi和 - 独立机制与异染色质结构域的建立有关,异染色质结构域可以通过涉及染色质蛋白和组蛋白和 DNA 修饰的反馈回路来稳定。粗糙脉孢菌 s...阅读更多 »真核生物 DNA 甲基化的全基因组高通量分析。发布时间:2009 年 3 月摘要:胞嘧啶甲基化是典型的表观遗传标记。亚硫酸氢盐测序和甲基 DNA 免疫沉淀 (MeDIP) 这两种行之有效的方法适用于通过高通量测序对 DNA 甲基化进行全基因组分析……阅读更多 »运动神经元存活DNA 甲基化引起的 ene 2 沉默与脊髓性肌萎缩症的严重程度相关,可被组蛋白去乙酰化酶抑制绕过。发表时间:2009 年 1 月摘要:脊髓性肌萎缩症 (SMA) 是一种常见的神经肌肉疾病,是由存活运动神经元的纯合子缺失引起的基因 1 (SMN1),而疾病的严重程度主要受 SMN2 基因拷贝数的影响。这种相关性不是……阅读更多 »Tandem ChoRE 和 CCAAT 基序和相关因素调节 Txnip 表达以响应葡萄糖或含腺苷分子。发表时间:2009 年 1 月摘要:背景:硫氧还蛋白相互作用蛋白 (Txnip) 是一种多功能蛋白,涉及调节细胞周期事件和细胞代谢。已知 Txnip 的表达由葡萄糖、含腺苷分子和其他……阅读更多 »TBP2 是非洲爪蟾卵母细胞转录中 TBP 的替代品。发布时间:2009 年 1 月摘要:背景:TATA-box-结合蛋白 2 (TBP2/TRF3) 是 TBP 的脊椎动物特异性旁系同源物,与 TBP 共享高度保守的羧基末端结构域和结合 TATA 盒的能力。 TBP2 在卵母细胞中高度表达,而 TBP 则更多……阅读更多 »像异染色质蛋白 1 的染色域对于拟南芥发育过程中的 H3K27me3 结合和功能至关重要。发表时间:2009 年 1 月摘要:Polycomb 组 (PcG) 蛋白对于维持发育过程中的基因表达模式。 PcG 蛋白的转录抑制涉及动物和计划中的 Polycomb 抑制复合物 2 (PRC2) 对 H3K27 (H3K27me3) 的三甲基化……阅读更多 »TIPT2 和孪蛋白与基础转录因子相互作用,在转录调控中发挥协同作用。发表时间:2009 年 1 月摘要:背景:再复制抑制剂 Geminin 与多种转录因子结合,包括同源结构域蛋白,以及多梳和 SWI/SNF 复合体的成员。结果:在这里,我们描述了 TATA 结合蛋白样因子-intera...阅读更多»核糖体 RNA 基因的表观遗传工程增强蛋白质生产。发表时间:2009 年 1 月摘要:哺乳动物高产细胞系的选择仍然是生物制药的主要挑战制造业。核糖体 RNA (rRNA) 基因编码核糖体的主要成分,但许多 rRNA 基因拷贝未被转录,原因是……阅读更多 »甲基化 DNA 免疫沉淀和基于微阵列的分析:检测乳腺癌细胞系中的 DNA 甲基化。已发表: 2009 年 1 月摘要:甲基化 DNA 免疫沉淀微阵列 (MeDIP-chip) 是一种全基因组高分辨率方法,用于检测全基因组或 CpG(胞嘧啶碱基后接鸟嘌呤碱基)岛中的 DNA 甲基化。该方法利用抗甲基胞嘧啶 ...阅读更多 »面肩肱型肌营养不良症 (FSHD) 基因座染色质结构的重塑和 FSHD 的上调-相关基因 1 (FRG1) 在人类肌源性分化过程中的表达。发布时间:2009 年 1 月摘要:背景:面肩肱型肌营养不良症 (FSHD) 是一种常染色体显性神经肌肉疾病,与亚端粒内 3.3 kb D4Z4 DNA 重复序列的部分缺失有关4q 号染色体。许多 cand...阅读更多 »NF-Y 替代 H2A-H2B 在活跃的细胞周期启动子上:CoREST-KDM1 的招募和 H3 甲基化的微调。发表时间:2008 年 11 月摘要:CCAAT 盒是一个常见的启动子元素,如生物信息学分析所示,它与 NF-Y 结合,NF-Y 是一种具有 H2A-H2B 样亚基的三聚体。我们针对均质细胞群开发了基于 MNase I 的 ChIP 方案,以研究细胞周期 pr...阅读更多 »氯氮平和舒必利而非氟哌啶醇或奥氮平激活脑 DNA 去甲基化发表时间:2008 年 9 月摘要:皮质 GABA 能功能障碍,两者的标志精神分裂症 (SZ) 和躁郁症r (BP) 紊乱病理生理学可能与 GABAergic 基因启动子(即 reelin 和 GAD67)的超甲基化有关。由非典型组合引起的好处...阅读更多 »通过特定靶向染色质修饰剂使人类动粒失活发布时间:2008 年 4 月摘要:我们使用人类人工染色体 (HAC) 来操纵活性动粒内染色质的表观遗传状态. HAC 有一个二聚体 α-卫星重复序列,其中包含一个带有 CENP-B 结合位点的天然单体,一个完全是……阅读更多 »识别 CIITA 专门用于抗原呈递的调节基因模块。发布时间:2008 年 4 月摘要:该类II 反式激活因子 CIITA 是主要组织相容性复合体 (MHC) 基因表达所需的转录共激活因子。虽然后者的功能已经确立,CIITA 的全球目标基因特异性还没有……阅读更多»弗里德赖希共济失调 GAA 重复扩增突变在人类和转基因小鼠大脑和心脏组织中诱导类似的表观遗传变化。发布时间:2008 年 3 月摘要:Friedreich 共济失调 (FRDA) 是由 FXN 基因内含子 1 内的纯合 GAA 重复扩增突变引起的,导致 frataxin 蛋白表达减少。有证据表明该突变可能会引起表观遗传变化和异染色质……阅读更多 »MicroChIP——一种用于小细胞样本和活组织检查的快速微染色质免疫沉淀测定法。发表时间:2008 年 2 月摘要:染色质免疫沉淀 (ChIP) 是一种强大的研究技术蛋白质-DNA相互作用。然而,当前 ChIP 分析的缺点是需要大量细胞,这限制了 ChIP 对稀有细胞样本的适用性,和/或 ...阅读更多 »快速微染色质免疫沉淀分析 (microChIP)。发布时间:2008 年 1 月摘要:相互作用具有 DNA 的蛋白质介导许多关键的核功能。染色质免疫沉淀 (ChIP) i这是研究蛋白质-DNA 相互作用的可靠技术。然而,当前的 ChIP 分析需要大量细胞,这预……阅读更多 »上皮癌细胞中 11p15 粘蛋白基因(MUC2、MUC5AC、MUC5B、MUC6)的表观遗传调控(DNA 甲基化、组蛋白修饰)。已发表: 2007 年 10 月摘要:人类基因 MUC2、MUC5AC、MUC5B 和 MUC6 聚集在 11 号染色体上,编码大量分泌的凝胶形成粘蛋白。它们在癌症中的频繁沉默及其启动子富含 GC 的结构促使我们研究其影响……阅读更多 »Mallory 小体形成与体内肝细胞的表观遗传表型变化有关。发表时间:2007 年 10 月摘要:微阵列在喂食 DDC 10 周、停药 1 个月(DDC 致敏肝脏)并重新喂食 6 天的小鼠肝脏上进行,并与喂食对照饮食的小鼠进行比较。当喂食或重新喂食 DDC 时,大量基因的表达发生了变化。 V...阅读更多 »Identif新功能性 TBP 结合位点和一般因子库的信息发布时间:2007 年 2 月摘要:我们目前对三种哺乳动物 RNA 聚合酶转录中一般因子需求的了解是基于少量模型启动子。在这里,我们提出了全面的染色质免疫沉淀 (ChIP) 片上分析 f...阅读更多 »C/EBP delta 在人角质形成细胞中对 p63 的相互调节。发表时间:2007 年 1 月摘要:背景:遗传实验已经阐明 p63是控制多层上皮细胞建立和维持的关键转录因子。我们理解 p63 策略的关键是识别目标基因。我们执行...阅读更多»CTCF 在乳腺癌细胞中 Bax 表观遗传调控的新机制。摘要:我们之前报道了乳腺癌中多功能转录因子 CCCTC 结合因子 (CTCF) 水平升高的关联机智的细胞h CTCF特异性抗凋亡功能。了解分子机制……阅读更多 »使用 ChIP-Seq 技术生成组蛋白修饰的高分辨率图谱摘要:DNA 和组蛋白的动态修饰通过改变 DNA 的包装和修饰核小体表面。这些染色质状态,也称为表观基因组,对于……阅读更多»对早期哺乳动物胚胎中活性染色质修饰的分析揭示了 H2A.Z 乙酰化和 H3K36 三甲基化与胚胎基因组激活的解偶联摘要:早期胚胎发育的特点是细胞效力和染色质组织的显着变化。组蛋白变体在胚胎发生过程中染色质重塑背景下的作用仍在研究中。特别是,nu...阅读更多»人支气管上皮细胞恶性转化的实验研究甲基丙烯酸缩水甘油酯诱导人支气管上皮细胞(16HBE)恶性转化及其甲基化分析摘要:目的建立甲基丙烯酸缩水甘油酯(GMA)诱导人支气管上皮细胞(16HBE)恶性转化模型,明确不同阶段的不同甲基化基因。方法提取不同16...阅读更多 »结直肠肿瘤中 μ-原钙粘蛋白的表观遗传介导的下调摘要:癌发生涉及细胞相互作用和组织形态的改变,部分原因是钙粘蛋白的异常表达。粘蛋白样原钙粘蛋白与细胞间粘附有关,其表达在结直肠癌中被发现下降……阅读更多 »AAV 介导的体内碱基编辑的自灭活系统摘要:DNA 碱基编辑器已被用作人类令人兴奋的治疗平台疾病,并正在迅速进入人体临床试验。然而,通过腺相关病毒 (AAV) 递送的碱基编辑器的持续表达构成 con...阅读更多 »通过表观遗传修饰调节非小细胞肺癌中的 EP 受体。摘要:背景:环氧合酶 (COX)-2 在非小细胞肺癌 (NSCLC) 中经常过度表达,并导致增加前列腺素 E2 (PGE(2)) 的水平,这是一种与肿瘤发生有关的重要信号分子。 PGE(2) 发挥其作用……阅读更多 »Esculetin 通过降低 mRNA 的半衰期来下调 Kasumi-1 细胞系中 AML1-ETO 和 C-Kit 的表达摘要:急性髓系白血病中最常见的遗传畸变之一(AML) 是 21 号染色体上的 AML1/RUNX1 和 8 号染色体上的 ETO 基因之间的染色体易位,导致嵌合癌基因 AML1-ETO 的表达。尽管患者……阅读更多 »转录辅助抑制因子 CtBP1 在前列腺癌进展中的作用摘要:转录抑制因子和辅助抑制因子在细胞稳态中起着关键作用,并且在癌症中经常发生改变。 C端结合蛋白 1 (CtBP1),一种调节肿瘤抑制因子表达的转录辅助抑制因子...阅读更多 »丝状真菌中的染色质免疫沉淀分析。摘要:染色质免疫沉淀 (ChIP) 用于绘制蛋白质和 DNA 之间的相互作用活细胞中的特定基因组位点。蛋白质-DNA 复合物已经通过可逆交联在体内稳定,DNA 被剪切……阅读更多»通过 MeDIP 和 MBDCap 分析检测 DNA 甲基化:技术概述。摘要:DNA 甲基化已被表征为代表性示例表观遗传修饰并涉及许多生物过程,例如基因组印记和 X 染色体失活。 It primarily occurs at CpG dinucleotides in...阅读更多»甲硫氨酸腺苷转移酶的转录和转录后调节在肝癌进展中的作用摘要:肝脏特异性 MAT1Agene 的下调, 编码 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 合成同工酶 MATI/III, 并上调广泛表达的 MAT2A, 编码 MATII 同工酶, 称为 MAT1A:MAT2A 开关, 发生在肝细胞癌 (HCC...阅读更多 »BET 蛋白抑制使胶质母细胞瘤细胞对temozolomidetreatment by attenuating MGMT expressionAbstract: Bromodomain and extra-terminal tail (BET) proteins have been identified as potential epigenetic targets in cancer, including glioblastoma. 这些表观遗传修饰剂将组蛋白代码与基因转录联系起来,可以用小痣破坏……读更多»通过甲基化 DNA 的免疫沉淀进行全基因组甲基化分析摘要:我提供了一种基于甲基化 DNA 免疫沉淀的 DNA 甲基化分析方案,使用可特异性识别 5-甲基胞嘧啶的市售单克隆抗体。对 res 富集水平的量化...阅读更多 »甲基化 DNA 免疫沉淀(MeDIP) 来自少量细胞。摘要:甲基化 DNA 免疫沉淀 (MeDIP) 是一种免疫捕获方法,用于无偏向富集胞嘧啶上甲基化的 DNA。原理是基因组 DNA 通过超声处理随机剪切,并用抗体进行免疫沉淀……阅读更多»

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